MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 22342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_011988	GCAC	2	8	1030692	1030699	25 %	0 %	25 %	50 %	222106964
18002	NC_011988	CGC	2	6	1030747	1030752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106964
18003	NC_011988	GGC	2	6	1030769	1030774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106964
18004	NC_011988	GGC	2	6	1030787	1030792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106964
18005	NC_011988	CGGC	2	8	1030825	1030832	0 %	0 %	50 %	50 %	222106964
18006	NC_011988	TCA	2	6	1030936	1030941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106964
18007	NC_011988	GCA	2	6	1030956	1030961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106964
18008	NC_011988	GC	3	6	1030971	1030976	0 %	0 %	50 %	50 %	222106964
18009	NC_011988	GCC	2	6	1031090	1031095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106964
18010	NC_011988	GCC	2	6	1031099	1031104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106964
18011	NC_011988	AGC	2	6	1031124	1031129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106964
18012	NC_011988	GCTGC	2	10	1031159	1031168	0 %	20 %	40 %	40 %	222106964
18013	NC_011988	TGATG	2	10	1031209	1031218	20 %	40 %	40 %	0 %	222106964
18014	NC_011988	ATC	2	6	1031229	1031234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106964
18015	NC_011988	GTG	2	6	1031262	1031267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106964
18016	NC_011988	CG	3	6	1031368	1031373	0 %	0 %	50 %	50 %	222106964
18017	NC_011988	GGC	2	6	1031420	1031425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106964
18018	NC_011988	CG	3	6	1031428	1031433	0 %	0 %	50 %	50 %	222106964
18019	NC_011988	CG	3	6	1031435	1031440	0 %	0 %	50 %	50 %	222106964
18020	NC_011988	GCA	2	6	1031442	1031447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106964
18021	NC_011988	TCA	2	6	1031497	1031502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106964
18022	NC_011988	TCC	2	6	1031516	1031521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106965
18023	NC_011988	CCTT	2	8	1032042	1032049	0 %	50 %	0 %	50 %	222106966
18024	NC_011988	ATCG	2	8	1032065	1032072	25 %	25 %	25 %	25 %	222106966
18025	NC_011988	GCC	2	6	1032086	1032091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106966
18026	NC_011988	TAA	2	6	1032225	1032230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106966
18027	NC_011988	CAG	2	6	1032302	1032307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106966
18028	NC_011988	CGC	2	6	1032356	1032361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106966
18029	NC_011988	CG	3	6	1032382	1032387	0 %	0 %	50 %	50 %	222106966
18030	NC_011988	GGT	2	6	1032413	1032418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106966
18031	NC_011988	GAT	2	6	1032500	1032505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106966
18032	NC_011988	TGC	2	6	1032531	1032536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106966
18033	NC_011988	CGC	2	6	1032577	1032582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106966
18034	NC_011988	AG	3	6	1032653	1032658	50 %	0 %	50 %	0 %	222106966
18035	NC_011988	CAC	2	6	1032728	1032733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106966
18036	NC_011988	GATCG	2	10	1032800	1032809	20 %	20 %	40 %	20 %	222106966
18037	NC_011988	AATGGC	2	12	1032917	1032928	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222106966
18038	NC_011988	GCA	2	6	1032969	1032974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106966
18039	NC_011988	GACG	2	8	1033019	1033026	25 %	0 %	50 %	25 %	222106966
18040	NC_011988	CAG	2	6	1033093	1033098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106967
18041	NC_011988	ATG	2	6	1033142	1033147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106967
18042	NC_011988	GCT	2	6	1033200	1033205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106967
18043	NC_011988	CG	3	6	1033317	1033322	0 %	0 %	50 %	50 %	222106967
18044	NC_011988	TCG	2	6	1033325	1033330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106967
18045	NC_011988	GGC	2	6	1033348	1033353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106967
18046	NC_011988	TGG	2	6	1033380	1033385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106967
18047	NC_011988	CAT	2	6	1033452	1033457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106967
18048	NC_011988	CGGT	2	8	1033508	1033515	0 %	25 %	50 %	25 %	222106967
18049	NC_011988	AGA	2	6	1033541	1033546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106967
18050	NC_011988	CGC	3	9	1033617	1033625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106967
18051	NC_011988	GGT	2	6	1033648	1033653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106967
18052	NC_011988	CGG	2	6	1033656	1033661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106967
18053	NC_011988	GGC	2	6	1033675	1033680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106967
18054	NC_011988	GTG	2	6	1033747	1033752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106967
18055	NC_011988	CGG	2	6	1033812	1033817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106967
18056	NC_011988	CAG	2	6	1033819	1033824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106967
18057	NC_011988	CAT	2	6	1033878	1033883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106967
18058	NC_011988	TTG	2	6	1033896	1033901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106967
18059	NC_011988	GGC	2	6	1033996	1034001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106967
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18062	NC_011988	GC	3	6	1034454	1034459	0 %	0 %	50 %	50 %	222106968
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18065	NC_011988	GCCAC	2	10	1034646	1034655	20 %	0 %	20 %	60 %	222106968
18066	NC_011988	GTC	2	6	1034686	1034691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106968
18067	NC_011988	CCG	2	6	1034758	1034763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106968
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18074	NC_011988	CGAC	2	8	1035436	1035443	25 %	0 %	25 %	50 %	222106969
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18083	NC_011988	AAG	2	6	1035773	1035778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106969
18084	NC_011988	GCGATT	2	12	1035954	1035965	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222106969
18085	NC_011988	TAG	2	6	1035975	1035980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106969
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18087	NC_011988	GCG	2	6	1036085	1036090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106969
18088	NC_011988	GCC	2	6	1036169	1036174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106969
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18092	NC_011988	GC	3	6	1036331	1036336	0 %	0 %	50 %	50 %	222106969
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18099	NC_011988	A	6	6	1036690	1036695	100 %	0 %	0 %	0 %	222106970
18100	NC_011988	ACC	2	6	1036738	1036743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106970
18101	NC_011988	GCCGAT	2	12	1036750	1036761	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222106970
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18103	NC_011988	GCC	2	6	1036865	1036870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106970
18104	NC_011988	CATC	2	8	1036881	1036888	25 %	25 %	0 %	50 %	222106970
18105	NC_011988	GCC	2	6	1036949	1036954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106970
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18110	NC_011988	TTCA	2	8	1037236	1037243	25 %	50 %	0 %	25 %	222106970
18111	NC_011988	CGAG	2	8	1037283	1037290	25 %	0 %	50 %	25 %	222106970
18112	NC_011988	GAAG	2	8	1037321	1037328	50 %	0 %	50 %	0 %	222106970
18113	NC_011988	CTT	2	6	1037455	1037460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106970
18114	NC_011988	TTG	2	6	1037465	1037470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106970
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18116	NC_011988	CGC	2	6	1037631	1037636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106970
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18118	NC_011988	CGA	2	6	1037706	1037711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106970
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18226	NC_011988	GACCT	2	10	1042665	1042674	20 %	20 %	20 %	40 %	222106973
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18233	NC_011988	ATGC	2	8	1043136	1043143	25 %	25 %	25 %	25 %	222106974
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18347	NC_011988	CGCA	2	8	1059093	1059100	25 %	0 %	25 %	50 %	222106978
18348	NC_011988	TTC	2	6	1059102	1059107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106978
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18450	NC_011988	TGCT	2	8	1064019	1064026	0 %	50 %	25 %	25 %	222106982
18451	NC_011988	AGCCG	2	10	1064052	1064061	20 %	0 %	40 %	40 %	222106982
18452	NC_011988	GGCA	2	8	1064062	1064069	25 %	0 %	50 %	25 %	222106982
18453	NC_011988	TCT	2	6	1064102	1064107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106982
18454	NC_011988	T	6	6	1064107	1064112	0 %	100 %	0 %	0 %	222106982
18455	NC_011988	GAC	2	6	1064116	1064121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106982
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18458	NC_011988	A	6	6	1064449	1064454	100 %	0 %	0 %	0 %	222106982
18459	NC_011988	TGCC	2	8	1064487	1064494	0 %	25 %	25 %	50 %	222106982
18460	NC_011988	CCA	2	6	1064499	1064504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106982
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18463	NC_011988	GCC	2	6	1064583	1064588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106982
18464	NC_011988	GCC	2	6	1064612	1064617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106982
18465	NC_011988	GCA	3	9	1064694	1064702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106982
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18481	NC_011988	GGCG	2	8	1065390	1065397	0 %	0 %	75 %	25 %	222106983
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18492	NC_011988	CTG	2	6	1065895	1065900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106983
18493	NC_011988	AGAT	2	8	1065904	1065911	50 %	25 %	25 %	0 %	222106983
18494	NC_011988	CAT	2	6	1065923	1065928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106983
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18497	NC_011988	GCG	2	6	1066168	1066173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106983
18498	NC_011988	A	6	6	1066198	1066203	100 %	0 %	0 %	0 %	222106983
18499	NC_011988	CTG	2	6	1066280	1066285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106983
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