MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 22342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_011988	GC	3	6	829477	829482	0 %	0 %	50 %	50 %	222106792
14502	NC_011988	TTC	2	6	829512	829517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106792
14503	NC_011988	GCG	2	6	829546	829551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106792
14504	NC_011988	CTGC	2	8	829565	829572	0 %	25 %	25 %	50 %	222106792
14505	NC_011988	CCG	2	6	829584	829589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106792
14506	NC_011988	TTG	2	6	829594	829599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106792
14507	NC_011988	TGG	2	6	829601	829606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106792
14508	NC_011988	CAT	2	6	829667	829672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106792
14509	NC_011988	GGC	2	6	829710	829715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106792
14510	NC_011988	TC	3	6	829724	829729	0 %	50 %	0 %	50 %	222106792
14511	NC_011988	GGT	2	6	829799	829804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106792
14512	NC_011988	GGC	2	6	829817	829822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106792
14513	NC_011988	C	6	6	829860	829865	0 %	0 %	0 %	100 %	222106792
14514	NC_011988	CAAT	2	8	829901	829908	50 %	25 %	0 %	25 %	222106792
14515	NC_011988	GTC	2	6	830234	830239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106793
14516	NC_011988	CCA	2	6	830291	830296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106793
14517	NC_011988	CAA	2	6	830366	830371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106793
14518	NC_011988	CCG	2	6	830391	830396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106793
14519	NC_011988	CAA	2	6	830417	830422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106793
14520	NC_011988	CAGA	2	8	830443	830450	50 %	0 %	25 %	25 %	222106793
14521	NC_011988	ACCAG	2	10	830493	830502	40 %	0 %	20 %	40 %	222106793
14522	NC_011988	AAT	2	6	830534	830539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106793
14523	NC_011988	GGA	2	6	830564	830569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106793
14524	NC_011988	CGC	2	6	830576	830581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106793
14525	NC_011988	GGCGTC	2	12	830585	830596	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222106793
14526	NC_011988	GGGC	2	8	830616	830623	0 %	0 %	75 %	25 %	222106793
14527	NC_011988	CCG	2	6	830666	830671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106793
14528	NC_011988	CG	4	8	830683	830690	0 %	0 %	50 %	50 %	222106793
14529	NC_011988	TGA	2	6	831082	831087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106794
14530	NC_011988	GCA	2	6	831090	831095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106794
14531	NC_011988	GCA	3	9	831120	831128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106794
14532	NC_011988	CAG	2	6	831161	831166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106794
14533	NC_011988	CGC	2	6	831175	831180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106794
14534	NC_011988	GAT	2	6	831182	831187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106794
14535	NC_011988	GCG	2	6	831215	831220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106794
14536	NC_011988	ATC	2	6	831261	831266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106794
14537	NC_011988	CAA	2	6	831272	831277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106794
14538	NC_011988	TCG	2	6	831292	831297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106794
14539	NC_011988	CGGCGT	2	12	831323	831334	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222106794
14540	NC_011988	GTC	2	6	831363	831368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106794
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14543	NC_011988	TGCGTG	2	12	831418	831429	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222106794
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14545	NC_011988	CGT	2	6	831455	831460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106794
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14547	NC_011988	GC	4	8	831492	831499	0 %	0 %	50 %	50 %	222106794
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14552	NC_011988	ACCG	2	8	831990	831997	25 %	0 %	25 %	50 %	222106795
14553	NC_011988	CGG	2	6	831998	832003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106795
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14555	NC_011988	TCTG	2	8	832137	832144	0 %	50 %	25 %	25 %	222106795
14556	NC_011988	GA	3	6	832159	832164	50 %	0 %	50 %	0 %	222106795
14557	NC_011988	TTCC	2	8	832205	832212	0 %	50 %	0 %	50 %	222106795
14558	NC_011988	TCG	2	6	832294	832299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106795
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14561	NC_011988	CGC	2	6	832505	832510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106795
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14564	NC_011988	GCC	2	6	832723	832728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106795
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14588	NC_011988	CTTC	2	8	833666	833673	0 %	50 %	0 %	50 %	222106795
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14591	NC_011988	CAAG	2	8	833762	833769	50 %	0 %	25 %	25 %	222106795
14592	NC_011988	CGA	2	6	833801	833806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106795
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14601	NC_011988	CTT	2	6	834365	834370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106795
14602	NC_011988	CAG	2	6	834396	834401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106795
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14605	NC_011988	AGCC	2	8	834518	834525	25 %	0 %	25 %	50 %	222106795
14606	NC_011988	ATG	2	6	834532	834537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106795
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14609	NC_011988	GATC	2	8	834935	834942	25 %	25 %	25 %	25 %	222106796
14610	NC_011988	T	6	6	834971	834976	0 %	100 %	0 %	0 %	222106796
14611	NC_011988	GGT	2	6	835029	835034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106796
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14853	NC_011988	CCAG	2	8	848920	848927	25 %	0 %	25 %	50 %	222106809
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14855	NC_011988	GAC	2	6	849056	849061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106809
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14974	NC_011988	CGAT	2	8	854881	854888	25 %	25 %	25 %	25 %	222106814
14975	NC_011988	AGCG	2	8	854892	854899	25 %	0 %	50 %	25 %	222106814
14976	NC_011988	CTT	2	6	854930	854935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106814
14977	NC_011988	GGC	2	6	854943	854948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106814
14978	NC_011988	CAC	2	6	855002	855007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106814
14979	NC_011988	CTTCG	2	10	855105	855114	0 %	40 %	20 %	40 %	222106814
14980	NC_011988	ATC	2	6	855183	855188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106814
14981	NC_011988	ATG	2	6	855414	855419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106814
14982	NC_011988	TGG	2	6	855476	855481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106814
14983	NC_011988	TCC	2	6	855486	855491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106814
14984	NC_011988	TGG	2	6	855523	855528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106814
14985	NC_011988	CGG	2	6	855538	855543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106814
14986	NC_011988	GGC	2	6	855557	855562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106814
14987	NC_011988	CGG	2	6	855611	855616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106814
14988	NC_011988	ATG	2	6	855643	855648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106814
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14990	NC_011988	TCG	2	6	855733	855738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106814
14991	NC_011988	GC	3	6	855777	855782	0 %	0 %	50 %	50 %	222106814
14992	NC_011988	CCTG	2	8	855828	855835	0 %	25 %	25 %	50 %	222106814
14993	NC_011988	GCG	2	6	855844	855849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106814
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14997	NC_011988	GCCA	2	8	856128	856135	25 %	0 %	25 %	50 %	222106814
14998	NC_011988	GCC	2	6	856172	856177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106814
14999	NC_011988	T	6	6	856189	856194	0 %	100 %	0 %	0 %	222106814
15000	NC_011988	GGA	2	6	856274	856279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106814

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