MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 22342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011988	GCA	2	6	378109	378114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106437
6502	NC_011988	GGC	2	6	378136	378141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106437
6503	NC_011988	GCC	2	6	378145	378150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106437
6504	NC_011988	CAA	2	6	378277	378282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106437
6505	NC_011988	GAT	3	9	378361	378369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106437
6506	NC_011988	TTG	2	6	378399	378404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106437
6507	NC_011988	GC	3	6	378551	378556	0 %	0 %	50 %	50 %	222106437
6508	NC_011988	CGG	2	6	378625	378630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106437
6509	NC_011988	AGC	2	6	378636	378641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106437
6510	NC_011988	ATC	2	6	378680	378685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106437
6511	NC_011988	GCT	2	6	378742	378747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106437
6512	NC_011988	GC	3	6	378757	378762	0 %	0 %	50 %	50 %	222106437
6513	NC_011988	TCA	2	6	378834	378839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106437
6514	NC_011988	TCG	2	6	378855	378860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106437
6515	NC_011988	GCC	2	6	378923	378928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106437
6516	NC_011988	CCA	2	6	378966	378971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106437
6517	NC_011988	GGC	2	6	379071	379076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106438
6518	NC_011988	GGA	2	6	379142	379147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106438
6519	NC_011988	CAC	2	6	379151	379156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106438
6520	NC_011988	TGA	2	6	379225	379230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106438
6521	NC_011988	CAC	2	6	379235	379240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106438
6522	NC_011988	GCC	2	6	379287	379292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106438
6523	NC_011988	GCCT	2	8	379317	379324	0 %	25 %	25 %	50 %	222106438
6524	NC_011988	GCC	2	6	379325	379330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106438
6525	NC_011988	GTG	2	6	379362	379367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106438
6526	NC_011988	GCG	2	6	379390	379395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106438
6527	NC_011988	CGC	2	6	379423	379428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106438
6528	NC_011988	CAA	2	6	379472	379477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106438
6529	NC_011988	CGTG	2	8	379498	379505	0 %	25 %	50 %	25 %	222106438
6530	NC_011988	AGC	2	6	379531	379536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106438
6531	NC_011988	GGT	2	6	379577	379582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106438
6532	NC_011988	GCG	2	6	379629	379634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106438
6533	NC_011988	ACG	2	6	379738	379743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106438
6534	NC_011988	GGC	2	6	379754	379759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106438
6535	NC_011988	CCA	2	6	379804	379809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106438
6536	NC_011988	GGC	2	6	379869	379874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106438
6537	NC_011988	ACG	2	6	379875	379880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106438
6538	NC_011988	GC	3	6	379891	379896	0 %	0 %	50 %	50 %	222106438
6539	NC_011988	GGC	2	6	379919	379924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106438
6540	NC_011988	GGT	2	6	379928	379933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106438
6541	NC_011988	CGG	2	6	379940	379945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106438
6542	NC_011988	GGC	2	6	380085	380090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106438
6543	NC_011988	GGC	3	9	380274	380282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106438
6544	NC_011988	ATC	2	6	380319	380324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106438
6545	NC_011988	CAC	2	6	380492	380497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106438
6546	NC_011988	GAT	2	6	380660	380665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106439
6547	NC_011988	GGC	2	6	380705	380710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106439
6548	NC_011988	ATG	3	9	380799	380807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106439
6549	NC_011988	GGC	2	6	380825	380830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106439
6550	NC_011988	CG	3	6	380894	380899	0 %	0 %	50 %	50 %	222106439
6551	NC_011988	TGG	3	9	380976	380984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106439
6552	NC_011988	ATTG	2	8	381008	381015	25 %	50 %	25 %	0 %	222106439
6553	NC_011988	TGT	2	6	381115	381120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106439
6554	NC_011988	GTG	2	6	381176	381181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106439
6555	NC_011988	G	7	7	381188	381194	0 %	0 %	100 %	0 %	222106439
6556	NC_011988	GCAG	2	8	381283	381290	25 %	0 %	50 %	25 %	222106439
6557	NC_011988	GCG	2	6	381399	381404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106439
6558	NC_011988	GCG	2	6	381414	381419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106439
6559	NC_011988	TTC	2	6	381494	381499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106439
6560	NC_011988	ACG	2	6	381501	381506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106439
6561	NC_011988	TGC	2	6	381518	381523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106439
6562	NC_011988	GCG	2	6	381558	381563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106439
6563	NC_011988	CAC	2	6	381571	381576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106439
6564	NC_011988	TGC	2	6	381582	381587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106439
6565	NC_011988	TTGCC	2	10	381612	381621	0 %	40 %	20 %	40 %	222106439
6566	NC_011988	GCT	2	6	381631	381636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106439
6567	NC_011988	GGC	2	6	381831	381836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106440
6568	NC_011988	GAC	2	6	381886	381891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106440
6569	NC_011988	AC	3	6	381890	381895	50 %	0 %	0 %	50 %	222106440
6570	NC_011988	ATG	2	6	381913	381918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106440
6571	NC_011988	GGCG	2	8	382032	382039	0 %	0 %	75 %	25 %	222106440
6572	NC_011988	CCA	2	6	382049	382054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106440
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6579	NC_011988	GC	3	6	382470	382475	0 %	0 %	50 %	50 %	222106440
6580	NC_011988	GGT	2	6	382483	382488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106440
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6583	NC_011988	TGG	2	6	382685	382690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106440
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6586	NC_011988	TGA	2	6	382938	382943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106441
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6589	NC_011988	ATC	2	6	383057	383062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106441
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6592	NC_011988	CAA	2	6	383290	383295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106441
6593	NC_011988	ACC	2	6	383315	383320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106441
6594	NC_011988	CGC	2	6	383322	383327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106441
6595	NC_011988	TGC	2	6	383328	383333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106441
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6601	NC_011988	CAA	2	6	383496	383501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106441
6602	NC_011988	TGA	2	6	383509	383514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106441
6603	NC_011988	TCC	2	6	383585	383590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106441
6604	NC_011988	ACC	2	6	383591	383596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106441
6605	NC_011988	ATG	2	6	383613	383618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106441
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6607	NC_011988	AAGGCC	2	12	383864	383875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106441
6608	NC_011988	GCTGAC	2	12	383914	383925	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222106441
6609	NC_011988	CAATC	2	10	383972	383981	40 %	20 %	0 %	40 %	222106441
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6612	NC_011988	CGG	2	6	384144	384149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106441
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6616	NC_011988	AAT	2	6	384411	384416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106441
6617	NC_011988	TGGGC	2	10	384457	384466	0 %	20 %	60 %	20 %	222106442
6618	NC_011988	ATCG	2	8	384557	384564	25 %	25 %	25 %	25 %	222106442
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6620	NC_011988	TGT	2	6	384617	384622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106442
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6742	NC_011988	CGG	2	6	391563	391568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106448
6743	NC_011988	GCT	2	6	391586	391591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106448
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6842	NC_011988	ATC	2	6	396277	396282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106452
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6847	NC_011988	CGAA	2	8	397010	397017	50 %	0 %	25 %	25 %	222106453
6848	NC_011988	GTC	2	6	397023	397028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106453
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6853	NC_011988	GCG	2	6	397360	397365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106453
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6862	NC_011988	GGC	2	6	397666	397671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106453
6863	NC_011988	GCA	2	6	397678	397683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106453
6864	NC_011988	TGA	2	6	397781	397786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106453
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6876	NC_011988	TATCGA	2	12	398759	398770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222106454
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6979	NC_011988	TCA	2	6	405203	405208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106460
6980	NC_011988	GGC	2	6	405225	405230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106460
6981	NC_011988	GCT	2	6	405231	405236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106460
6982	NC_011988	TGA	2	6	405254	405259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106460
6983	NC_011988	GTCG	2	8	405301	405308	0 %	25 %	50 %	25 %	222106460
6984	NC_011988	GA	3	6	405334	405339	50 %	0 %	50 %	0 %	222106460
6985	NC_011988	CCT	3	9	405372	405380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106460
6986	NC_011988	GGC	2	6	405390	405395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106460
6987	NC_011988	CCGTC	2	10	405534	405543	0 %	20 %	20 %	60 %	222106461
6988	NC_011988	TCG	2	6	405563	405568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106461
6989	NC_011988	GAT	2	6	405640	405645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106461
6990	NC_011988	TGT	2	6	405654	405659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106461
6991	NC_011988	ATG	2	6	405692	405697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106461
6992	NC_011988	CGC	2	6	405702	405707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106461
6993	NC_011988	GTC	2	6	405737	405742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106461
6994	NC_011988	ATC	3	9	405776	405784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106461
6995	NC_011988	GGGC	2	8	405795	405802	0 %	0 %	75 %	25 %	222106461
6996	NC_011988	GTG	2	6	405815	405820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106461
6997	NC_011988	TCA	2	6	405831	405836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106461
6998	NC_011988	CTT	2	6	405838	405843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106461
6999	NC_011988	CGC	2	6	405882	405887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106461
7000	NC_011988	TGC	2	6	406158	406163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106461

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