MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 3348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011984	GAG	2	6	158696	158701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083278
2502	NC_011984	GC	3	6	158789	158794	0 %	0 %	50 %	50 %	222083278
2503	NC_011984	GCC	2	6	158799	158804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083278
2504	NC_011984	ACG	2	6	158811	158816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083278
2505	NC_011984	GAT	2	6	158885	158890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083278
2506	NC_011984	T	6	6	158890	158895	0 %	100 %	0 %	0 %	222083278
2507	NC_011984	CAT	2	6	158951	158956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083278
2508	NC_011984	GAT	2	6	158983	158988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083278
2509	NC_011984	CAA	2	6	159049	159054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083278
2510	NC_011984	GCCT	2	8	159835	159842	0 %	25 %	25 %	50 %	222083279
2511	NC_011984	CTT	2	6	159937	159942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083279
2512	NC_011984	CATAGG	2	12	160134	160145	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222083279
2513	NC_011984	AAC	2	6	160176	160181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083279
2514	NC_011984	CGC	2	6	160317	160322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083279
2515	NC_011984	TGGC	2	8	160376	160383	0 %	25 %	50 %	25 %	222083279
2516	NC_011984	GCC	2	6	160441	160446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083279
2517	NC_011984	ATG	2	6	160456	160461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083279
2518	NC_011984	AGA	2	6	160513	160518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083279
2519	NC_011984	CCT	2	6	161256	161261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083280
2520	NC_011984	CCA	2	6	161276	161281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083280
2521	NC_011984	CGA	3	9	161283	161291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083280
2522	NC_011984	TCG	2	6	161318	161323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083280
2523	NC_011984	CCG	2	6	161355	161360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083280
2524	NC_011984	CTG	2	6	161383	161388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083280
2525	NC_011984	TCGGTA	2	12	161435	161446	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222083280
2526	NC_011984	GAT	2	6	161470	161475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083280
2527	NC_011984	CGG	2	6	161481	161486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083280
2528	NC_011984	GC	3	6	161502	161507	0 %	0 %	50 %	50 %	222083280
2529	NC_011984	GCG	2	6	161565	161570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083280
2530	NC_011984	GCC	4	12	161611	161622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083280
2531	NC_011984	GC	4	8	161645	161652	0 %	0 %	50 %	50 %	222083280
2532	NC_011984	GATA	2	8	161733	161740	50 %	25 %	25 %	0 %	222083280
2533	NC_011984	CGG	2	6	161742	161747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083280
2534	NC_011984	CGGCC	2	10	161763	161772	0 %	0 %	40 %	60 %	222083280
2535	NC_011984	CGA	2	6	161860	161865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083280
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2539	NC_011984	TTG	2	6	162000	162005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083280
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2541	NC_011984	TGA	2	6	162021	162026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083281
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2543	NC_011984	GCG	2	6	162083	162088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083281
2544	NC_011984	GC	3	6	162149	162154	0 %	0 %	50 %	50 %	222083281
2545	NC_011984	CGG	2	6	162173	162178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083281
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2550	NC_011984	GCAG	2	8	162375	162382	25 %	0 %	50 %	25 %	222083281
2551	NC_011984	GGC	2	6	162390	162395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083281
2552	NC_011984	GCG	2	6	162449	162454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083281
2553	NC_011984	GAA	2	6	162484	162489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083281
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2555	NC_011984	GTC	2	6	162552	162557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083281
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2557	NC_011984	AACG	2	8	162627	162634	50 %	0 %	25 %	25 %	222083281
2558	NC_011984	GAC	2	6	162717	162722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083281
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2565	NC_011984	CGG	2	6	164203	164208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083282
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2569	NC_011984	CGA	2	6	164339	164344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083282
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2572	NC_011984	TCGCG	2	10	164504	164513	0 %	20 %	40 %	40 %	222083282
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2583	NC_011984	CAA	2	6	165065	165070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083282
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2585	NC_011984	CG	3	6	165086	165091	0 %	0 %	50 %	50 %	222083282
2586	NC_011984	GC	3	6	165131	165136	0 %	0 %	50 %	50 %	222083282
2587	NC_011984	CG	3	6	165145	165150	0 %	0 %	50 %	50 %	222083282
2588	NC_011984	CGA	2	6	165175	165180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083282
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2592	NC_011984	GAT	2	6	165573	165578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083283
2593	NC_011984	GTC	2	6	165685	165690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083283
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2595	NC_011984	GCC	2	6	165709	165714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083283
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2597	NC_011984	GC	4	8	165934	165941	0 %	0 %	50 %	50 %	222083283
2598	NC_011984	GAG	2	6	165961	165966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083283
2599	NC_011984	CTGC	2	8	165974	165981	0 %	25 %	25 %	50 %	222083283
2600	NC_011984	TGG	2	6	167227	167232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083284
2601	NC_011984	AGGA	2	8	167348	167355	50 %	0 %	50 %	0 %	222083284
2602	NC_011984	ACG	2	6	167395	167400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083284
2603	NC_011984	GTC	2	6	167479	167484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083284
2604	NC_011984	GCG	2	6	167523	167528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083284
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2611	NC_011984	GACCC	2	10	168088	168097	20 %	0 %	20 %	60 %	222083284
2612	NC_011984	CGATC	2	10	168138	168147	20 %	20 %	20 %	40 %	222083284
2613	NC_011984	GCG	2	6	168370	168375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083285
2614	NC_011984	CA	3	6	168410	168415	50 %	0 %	0 %	50 %	222083285
2615	NC_011984	CCAG	2	8	168511	168518	25 %	0 %	25 %	50 %	222083285
2616	NC_011984	GC	3	6	168521	168526	0 %	0 %	50 %	50 %	222083285
2617	NC_011984	AG	3	6	168536	168541	50 %	0 %	50 %	0 %	222083285
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2620	NC_011984	TCT	2	6	168653	168658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083285
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2622	NC_011984	GCGA	2	8	168786	168793	25 %	0 %	50 %	25 %	222083285
2623	NC_011984	TCG	2	6	168805	168810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083285
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2625	NC_011984	GGCG	2	8	168908	168915	0 %	0 %	75 %	25 %	222083285
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2743	NC_011984	GGT	2	6	174779	174784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083289
2744	NC_011984	TGA	2	6	174856	174861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083289
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2864	NC_011984	CGC	2	6	182345	182350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083295
2865	NC_011984	ACC	2	6	182358	182363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083295
2866	NC_011984	GCT	3	9	182657	182665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083296
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2868	NC_011984	CGT	2	6	182735	182740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083296
2869	NC_011984	GCT	2	6	182879	182884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083296
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2880	NC_011984	GC	3	6	183550	183555	0 %	0 %	50 %	50 %	222083296
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2885	NC_011984	GC	3	6	183655	183660	0 %	0 %	50 %	50 %	222083296
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2969	NC_011984	CAGC	2	8	190134	190141	25 %	0 %	25 %	50 %	222083301
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2974	NC_011984	GCCT	2	8	190474	190481	0 %	25 %	25 %	50 %	222083302
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2981	NC_011984	GTT	2	6	191397	191402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083303
2982	NC_011984	GCATCG	2	12	191413	191424	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222083303
2983	NC_011984	TGA	2	6	191440	191445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083303
2984	NC_011984	CAT	2	6	191471	191476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083303
2985	NC_011984	TGG	2	6	191535	191540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083303
2986	NC_011984	ACCA	2	8	191565	191572	50 %	0 %	0 %	50 %	222083303
2987	NC_011984	CGT	2	6	191655	191660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083303
2988	NC_011984	TGCAGA	2	12	191705	191716	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222083303
2989	NC_011984	CGTA	2	8	191723	191730	25 %	25 %	25 %	25 %	222083303
2990	NC_011984	GCC	2	6	191762	191767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083303
2991	NC_011984	CCT	2	6	191770	191775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083303
2992	NC_011984	CGG	2	6	191948	191953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083303
2993	NC_011984	GTC	2	6	191973	191978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083303
2994	NC_011984	GCA	2	6	192063	192068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083303
2995	NC_011984	AGA	2	6	192136	192141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083303
2996	NC_011984	CGAT	2	8	192190	192197	25 %	25 %	25 %	25 %	222083303
2997	NC_011984	GAA	2	6	192263	192268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083303
2998	NC_011984	TGGC	2	8	192283	192290	0 %	25 %	50 %	25 %	222083303
2999	NC_011984	CGA	2	6	192392	192397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083303
3000	NC_011984	GCC	2	6	192463	192468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083303

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