MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 10658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_011981	TTTTTC	2	12	531247	531258	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	222102854
9002	NC_011981	CTTC	2	8	531288	531295	0 %	50 %	0 %	50 %	222102854
9003	NC_011981	AGG	2	6	531305	531310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102854
9004	NC_011981	AGC	2	6	531314	531319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102854
9005	NC_011981	GC	3	6	531325	531330	0 %	0 %	50 %	50 %	222102854
9006	NC_011981	GAC	2	6	531505	531510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102854
9007	NC_011981	ACG	2	6	531604	531609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102854
9008	NC_011981	CTGA	2	8	531640	531647	25 %	25 %	25 %	25 %	222102854
9009	NC_011981	GGC	2	6	531648	531653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102854
9010	NC_011981	CTG	2	6	531766	531771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102854
9011	NC_011981	TTCGAT	2	12	531907	531918	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222102854
9012	NC_011981	CCGA	2	8	531922	531929	25 %	0 %	25 %	50 %	222102854
9013	NC_011981	ACG	2	6	531937	531942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102854
9014	NC_011981	TCG	2	6	531944	531949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102854
9015	NC_011981	TGGC	2	8	531968	531975	0 %	25 %	50 %	25 %	222102854
9016	NC_011981	CG	3	6	532015	532020	0 %	0 %	50 %	50 %	222102854
9017	NC_011981	CCA	2	6	532082	532087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102854
9018	NC_011981	TAT	2	6	532128	532133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102854
9019	NC_011981	CCTG	2	8	532136	532143	0 %	25 %	25 %	50 %	222102854
9020	NC_011981	AGAT	2	8	532154	532161	50 %	25 %	25 %	0 %	222102854
9021	NC_011981	TCG	2	6	532274	532279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102854
9022	NC_011981	GC	3	6	532405	532410	0 %	0 %	50 %	50 %	222102854
9023	NC_011981	CGGG	2	8	532421	532428	0 %	0 %	75 %	25 %	222102854
9024	NC_011981	AAG	2	6	532477	532482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102854
9025	NC_011981	TTA	2	6	532788	532793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102854
9026	NC_011981	CAT	2	6	532825	532830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102854
9027	NC_011981	GTC	2	6	532964	532969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102855
9028	NC_011981	CTC	2	6	533042	533047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102855
9029	NC_011981	GCG	2	6	533142	533147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102855
9030	NC_011981	CGG	2	6	533205	533210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102855
9031	NC_011981	CGT	2	6	533230	533235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102855
9032	NC_011981	ACCC	2	8	533342	533349	25 %	0 %	0 %	75 %	222102855
9033	NC_011981	CCAT	2	8	533496	533503	25 %	25 %	0 %	50 %	222102856
9034	NC_011981	GCG	2	6	533551	533556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102856
9035	NC_011981	ACTG	2	8	533557	533564	25 %	25 %	25 %	25 %	222102856
9036	NC_011981	TCA	2	6	533602	533607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102856
9037	NC_011981	GGC	2	6	533691	533696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102856
9038	NC_011981	GCC	2	6	533715	533720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102856
9039	NC_011981	CGAGAT	2	12	533807	533818	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222102856
9040	NC_011981	CCA	2	6	533846	533851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102856
9041	NC_011981	GTCG	2	8	533853	533860	0 %	25 %	50 %	25 %	222102856
9042	NC_011981	GCC	2	6	533895	533900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102856
9043	NC_011981	GCTC	2	8	533903	533910	0 %	25 %	25 %	50 %	222102856
9044	NC_011981	CAA	2	6	533975	533980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102856
9045	NC_011981	CGG	2	6	534036	534041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102856
9046	NC_011981	GC	3	6	534135	534140	0 %	0 %	50 %	50 %	222102856
9047	NC_011981	TTC	2	6	534162	534167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102856
9048	NC_011981	GCGA	2	8	534356	534363	25 %	0 %	50 %	25 %	222102857
9049	NC_011981	TCA	2	6	534398	534403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102857
9050	NC_011981	ATC	2	6	534435	534440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102857
9051	NC_011981	CAG	2	6	534453	534458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102857
9052	NC_011981	CAG	2	6	534468	534473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102857
9053	NC_011981	GGCT	2	8	534484	534491	0 %	25 %	50 %	25 %	222102857
9054	NC_011981	TCG	2	6	534502	534507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102857
9055	NC_011981	TTC	2	6	534553	534558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102857
9056	NC_011981	TGC	2	6	534559	534564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102857
9057	NC_011981	ACC	2	6	534595	534600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102857
9058	NC_011981	GGA	2	6	534713	534718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102857
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9061	NC_011981	CTC	2	6	534780	534785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102857
9062	NC_011981	GGCA	2	8	534786	534793	25 %	0 %	50 %	25 %	222102857
9063	NC_011981	GCC	2	6	534889	534894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102857
9064	NC_011981	CG	3	6	534898	534903	0 %	0 %	50 %	50 %	222102857
9065	NC_011981	AAC	2	6	535098	535103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102857
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9069	NC_011981	TGGCA	2	10	535314	535323	20 %	20 %	40 %	20 %	222102858
9070	NC_011981	TGT	2	6	535397	535402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102858
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9080	NC_011981	CTG	3	9	535776	535784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102858
9081	NC_011981	CCAGC	2	10	535856	535865	20 %	0 %	20 %	60 %	222102858
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9085	NC_011981	GCC	2	6	536185	536190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102858
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9091	NC_011981	CTT	2	6	536403	536408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102858
9092	NC_011981	GT	3	6	536444	536449	0 %	50 %	50 %	0 %	222102858
9093	NC_011981	GCG	2	6	536476	536481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102858
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9109	NC_011981	ATG	2	6	537210	537215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102859
9110	NC_011981	CGG	2	6	537293	537298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102859
9111	NC_011981	ACGC	2	8	537343	537350	25 %	0 %	25 %	50 %	222102859
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9117	NC_011981	CAGGT	2	10	537698	537707	20 %	20 %	40 %	20 %	222102860
9118	NC_011981	TCCAT	2	10	537731	537740	20 %	40 %	0 %	40 %	222102860
9119	NC_011981	CCT	2	6	537753	537758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102860
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9363	NC_011981	GGC	2	6	553048	553053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102874
9364	NC_011981	TC	3	6	553062	553067	0 %	50 %	0 %	50 %	222102874
9365	NC_011981	CTC	2	6	553121	553126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102874
9366	NC_011981	GTC	3	9	553229	553237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102874
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9368	NC_011981	TGGC	2	8	553626	553633	0 %	25 %	50 %	25 %	222102875
9369	NC_011981	GCA	2	6	553722	553727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102875
9370	NC_011981	CATG	2	8	553773	553780	25 %	25 %	25 %	25 %	222102875
9371	NC_011981	TAT	2	6	553857	553862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102875
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9373	NC_011981	TGATC	2	10	554123	554132	20 %	40 %	20 %	20 %	222102875
9374	NC_011981	TC	3	6	554152	554157	0 %	50 %	0 %	50 %	222102875
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9377	NC_011981	GAT	2	6	554312	554317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102875
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9379	NC_011981	GCT	2	6	554432	554437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102875
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9484	NC_011981	GCG	2	6	560877	560882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102882
9485	NC_011981	GGC	2	6	560900	560905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102882
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9487	NC_011981	AT	3	6	560938	560943	50 %	50 %	0 %	0 %	222102882
9488	NC_011981	ATT	2	6	561003	561008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102882
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9491	NC_011981	GAC	2	6	561075	561080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102882
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