MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 10658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_011981	CTT	2	6	500987	500992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102828
8502	NC_011981	GAT	2	6	501028	501033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102828
8503	NC_011981	CAG	2	6	501049	501054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102828
8504	NC_011981	A	6	6	501119	501124	100 %	0 %	0 %	0 %	222102828
8505	NC_011981	CGC	3	9	501898	501906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102829
8506	NC_011981	CAG	2	6	501996	502001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102829
8507	NC_011981	ACC	2	6	502033	502038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102829
8508	NC_011981	TCA	2	6	502111	502116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102829
8509	NC_011981	TCCG	2	8	502159	502166	0 %	25 %	25 %	50 %	222102829
8510	NC_011981	GAC	2	6	502203	502208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102829
8511	NC_011981	CA	3	6	502372	502377	50 %	0 %	0 %	50 %	222102829
8512	NC_011981	AAT	2	6	502404	502409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102829
8513	NC_011981	CCA	2	6	502466	502471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102829
8514	NC_011981	GGC	2	6	502520	502525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102829
8515	NC_011981	GAC	2	6	503469	503474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102830
8516	NC_011981	ACCG	2	8	503483	503490	25 %	0 %	25 %	50 %	222102830
8517	NC_011981	TTCA	2	8	503493	503500	25 %	50 %	0 %	25 %	222102830
8518	NC_011981	TGT	2	6	503521	503526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102830
8519	NC_011981	GC	3	6	503612	503617	0 %	0 %	50 %	50 %	222102830
8520	NC_011981	GAA	2	6	503640	503645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102830
8521	NC_011981	GGATGG	2	12	503696	503707	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	222102830
8522	NC_011981	TCCG	2	8	503794	503801	0 %	25 %	25 %	50 %	222102830
8523	NC_011981	GCT	2	6	503810	503815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102830
8524	NC_011981	CTG	2	6	503982	503987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102830
8525	NC_011981	CGC	2	6	503988	503993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102830
8526	NC_011981	GTT	2	6	504008	504013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102830
8527	NC_011981	TCG	2	6	504132	504137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102830
8528	NC_011981	GC	3	6	504191	504196	0 %	0 %	50 %	50 %	222102830
8529	NC_011981	AGC	2	6	504277	504282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102830
8530	NC_011981	GCAA	2	8	504353	504360	50 %	0 %	25 %	25 %	222102830
8531	NC_011981	GTG	2	6	504498	504503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102830
8532	NC_011981	CGC	2	6	504583	504588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102830
8533	NC_011981	GA	3	6	504592	504597	50 %	0 %	50 %	0 %	222102830
8534	NC_011981	GAA	2	6	504654	504659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102830
8535	NC_011981	A	6	6	504716	504721	100 %	0 %	0 %	0 %	222102830
8536	NC_011981	GGGC	2	8	504763	504770	0 %	0 %	75 %	25 %	222102830
8537	NC_011981	GGA	2	6	504780	504785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102830
8538	NC_011981	ATC	2	6	504789	504794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102830
8539	NC_011981	CGT	2	6	504863	504868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102830
8540	NC_011981	GAG	2	6	504993	504998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102830
8541	NC_011981	ATT	2	6	505045	505050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102830
8542	NC_011981	TAA	2	6	505067	505072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102830
8543	NC_011981	CAA	2	6	505091	505096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102830
8544	NC_011981	AACA	2	8	505109	505116	75 %	0 %	0 %	25 %	222102830
8545	NC_011981	GTT	2	6	505128	505133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102830
8546	NC_011981	GGC	2	6	505134	505139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102830
8547	NC_011981	CAAA	2	8	505165	505172	75 %	0 %	0 %	25 %	222102830
8548	NC_011981	CGC	2	6	505183	505188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102830
8549	NC_011981	A	7	7	505291	505297	100 %	0 %	0 %	0 %	222102830
8550	NC_011981	A	6	6	505306	505311	100 %	0 %	0 %	0 %	222102830
8551	NC_011981	GTC	2	6	505339	505344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102830
8552	NC_011981	ATA	2	6	505350	505355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102830
8553	NC_011981	TGA	2	6	505364	505369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102830
8554	NC_011981	TAA	2	6	505388	505393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102830
8555	NC_011981	A	6	6	505412	505417	100 %	0 %	0 %	0 %	222102830
8556	NC_011981	GAA	2	6	505652	505657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102831
8557	NC_011981	A	8	8	505656	505663	100 %	0 %	0 %	0 %	222102831
8558	NC_011981	CGA	2	6	505726	505731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102831
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8561	NC_011981	AGGA	2	8	506064	506071	50 %	0 %	50 %	0 %	222102831
8562	NC_011981	ATT	2	6	506091	506096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102831
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8564	NC_011981	TTA	2	6	506183	506188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102831
8565	NC_011981	TGA	2	6	506301	506306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102831
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8570	NC_011981	GCA	2	6	506523	506528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102831
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8572	NC_011981	A	6	6	506570	506575	100 %	0 %	0 %	0 %	222102831
8573	NC_011981	GAC	2	6	506601	506606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102831
8574	NC_011981	CTG	2	6	506623	506628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102832
8575	NC_011981	CAG	2	6	506638	506643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102832
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8578	NC_011981	GCT	2	6	506724	506729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102832
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8580	NC_011981	TAAA	2	8	506941	506948	75 %	25 %	0 %	0 %	222102832
8581	NC_011981	CCT	2	6	507005	507010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102832
8582	NC_011981	GCC	2	6	507032	507037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102832
8583	NC_011981	ATCG	2	8	507125	507132	25 %	25 %	25 %	25 %	222102832
8584	NC_011981	ATG	2	6	507139	507144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102832
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8588	NC_011981	CG	3	6	507323	507328	0 %	0 %	50 %	50 %	222102832
8589	NC_011981	TG	3	6	507420	507425	0 %	50 %	50 %	0 %	222102832
8590	NC_011981	AGAA	2	8	507430	507437	75 %	0 %	25 %	0 %	222102832
8591	NC_011981	GCT	2	6	507456	507461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102832
8592	NC_011981	CGGC	2	8	507475	507482	0 %	0 %	50 %	50 %	222102832
8593	NC_011981	GAC	2	6	507566	507571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102832
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8596	NC_011981	CTGA	2	8	507726	507733	25 %	25 %	25 %	25 %	222102832
8597	NC_011981	GCG	2	6	507747	507752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102832
8598	NC_011981	GCT	2	6	507754	507759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102832
8599	NC_011981	TA	3	6	507835	507840	50 %	50 %	0 %	0 %	222102832
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8605	NC_011981	CTT	2	6	508137	508142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102833
8606	NC_011981	CGC	2	6	508177	508182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102833
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8608	NC_011981	TCG	2	6	508386	508391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102833
8609	NC_011981	CGA	2	6	508399	508404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102833
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8611	NC_011981	TAC	2	6	508469	508474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102833
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8619	NC_011981	TG	3	6	509171	509176	0 %	50 %	50 %	0 %	222102834
8620	NC_011981	CGC	2	6	509182	509187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102834
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8985	NC_011981	CGGAA	2	10	530133	530142	40 %	0 %	40 %	20 %	222102853
8986	NC_011981	GGGAAT	2	12	530210	530221	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	222102853
8987	NC_011981	GTGGA	2	10	530275	530284	20 %	20 %	60 %	0 %	222102853
8988	NC_011981	CGG	2	6	530424	530429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102853
8989	NC_011981	GCC	2	6	530565	530570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102854
8990	NC_011981	T	6	6	530571	530576	0 %	100 %	0 %	0 %	222102854
8991	NC_011981	AAAG	2	8	530596	530603	75 %	0 %	25 %	0 %	222102854
8992	NC_011981	TGG	2	6	530652	530657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102854
8993	NC_011981	ACA	2	6	530696	530701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102854
8994	NC_011981	GC	4	8	530852	530859	0 %	0 %	50 %	50 %	222102854
8995	NC_011981	GGC	2	6	530936	530941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102854
8996	NC_011981	ACG	2	6	531022	531027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102854
8997	NC_011981	CGT	2	6	531051	531056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102854
8998	NC_011981	CTG	2	6	531106	531111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102854
8999	NC_011981	CAA	3	9	531126	531134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102854
9000	NC_011981	GAC	2	6	531165	531170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102854

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