MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 10658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_011981	ATC	2	6	415248	415253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102758
7002	NC_011981	TCAG	2	8	415399	415406	25 %	25 %	25 %	25 %	222102758
7003	NC_011981	AAGC	2	8	415442	415449	50 %	0 %	25 %	25 %	222102758
7004	NC_011981	GTCG	2	8	415476	415483	0 %	25 %	50 %	25 %	222102758
7005	NC_011981	AT	3	6	415502	415507	50 %	50 %	0 %	0 %	222102758
7006	NC_011981	CG	3	6	415508	415513	0 %	0 %	50 %	50 %	222102758
7007	NC_011981	GA	3	6	415576	415581	50 %	0 %	50 %	0 %	222102758
7008	NC_011981	CGG	2	6	415637	415642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102758
7009	NC_011981	CAG	2	6	415656	415661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102758
7010	NC_011981	ATA	2	6	415689	415694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102758
7011	NC_011981	GC	3	6	415752	415757	0 %	0 %	50 %	50 %	222102758
7012	NC_011981	CAC	2	6	415880	415885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102758
7013	NC_011981	TTC	2	6	415914	415919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102758
7014	NC_011981	CAG	2	6	415941	415946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102758
7015	NC_011981	CGT	2	6	415998	416003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102758
7016	NC_011981	ATG	2	6	416143	416148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102758
7017	NC_011981	ACG	2	6	416586	416591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102759
7018	NC_011981	TGGCTG	2	12	416627	416638	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222102759
7019	NC_011981	TTC	2	6	416680	416685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102759
7020	NC_011981	GGC	2	6	416742	416747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102759
7021	NC_011981	GGCGGT	2	12	416779	416790	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222102759
7022	NC_011981	GCC	2	6	416824	416829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102759
7023	NC_011981	AAG	2	6	416839	416844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102759
7024	NC_011981	GTG	2	6	416968	416973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102759
7025	NC_011981	TGA	2	6	417014	417019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102759
7026	NC_011981	CAC	2	6	417051	417056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102759
7027	NC_011981	TCCA	2	8	417313	417320	25 %	25 %	0 %	50 %	222102759
7028	NC_011981	GTG	2	6	417332	417337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102759
7029	NC_011981	GTG	2	6	417394	417399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102759
7030	NC_011981	ACA	2	6	417406	417411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102759
7031	NC_011981	CGG	2	6	417444	417449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102759
7032	NC_011981	TTG	2	6	417461	417466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102759
7033	NC_011981	CAA	2	6	417483	417488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102759
7034	NC_011981	GACC	2	8	417549	417556	25 %	0 %	25 %	50 %	222102759
7035	NC_011981	GGC	2	6	417559	417564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102759
7036	NC_011981	ATCC	2	8	417633	417640	25 %	25 %	0 %	50 %	222102759
7037	NC_011981	CGG	2	6	417821	417826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102760
7038	NC_011981	TCT	2	6	417902	417907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102760
7039	NC_011981	GCT	2	6	417972	417977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102760
7040	NC_011981	TGTT	2	8	418067	418074	0 %	75 %	25 %	0 %	222102760
7041	NC_011981	ATC	2	6	418084	418089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102760
7042	NC_011981	CAT	2	6	418159	418164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102760
7043	NC_011981	TGATCT	2	12	418238	418249	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222102760
7044	NC_011981	GGC	2	6	418307	418312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102760
7045	NC_011981	CAT	3	9	418329	418337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102760
7046	NC_011981	T	6	6	418389	418394	0 %	100 %	0 %	0 %	222102760
7047	NC_011981	ATG	2	6	418441	418446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102760
7048	NC_011981	TGC	2	6	418457	418462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102760
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7050	NC_011981	CT	3	6	418530	418535	0 %	50 %	0 %	50 %	222102760
7051	NC_011981	TGA	2	6	418588	418593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102760
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7053	NC_011981	ATG	2	6	418615	418620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102761
7054	NC_011981	CTG	2	6	418638	418643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102761
7055	NC_011981	CCA	2	6	418729	418734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102761
7056	NC_011981	GCCC	2	8	418767	418774	0 %	0 %	25 %	75 %	222102761
7057	NC_011981	GGC	2	6	418784	418789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102761
7058	NC_011981	CAT	2	6	418838	418843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102761
7059	NC_011981	CTGC	2	8	418844	418851	0 %	25 %	25 %	50 %	222102761
7060	NC_011981	ATC	2	6	418947	418952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102761
7061	NC_011981	TGG	2	6	418984	418989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102761
7062	NC_011981	GTG	2	6	419004	419009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102761
7063	NC_011981	TGA	2	6	419038	419043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102761
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7066	NC_011981	CACAT	2	10	419136	419145	40 %	20 %	0 %	40 %	222102761
7067	NC_011981	TGG	2	6	419227	419232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102761
7068	NC_011981	TGA	2	6	419263	419268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102761
7069	NC_011981	GAT	2	6	419273	419278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102761
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7072	NC_011981	GCTGT	2	10	419307	419316	0 %	40 %	40 %	20 %	222102761
7073	NC_011981	GCC	2	6	419343	419348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102761
7074	NC_011981	GC	3	6	419358	419363	0 %	0 %	50 %	50 %	222102761
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7080	NC_011981	TGC	2	6	419581	419586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102762
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7084	NC_011981	CGC	2	6	419656	419661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102762
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7087	NC_011981	CGG	2	6	419852	419857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102762
7088	NC_011981	CAGCGT	2	12	419859	419870	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222102762
7089	NC_011981	CGT	2	6	419888	419893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102762
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7091	NC_011981	A	6	6	419988	419993	100 %	0 %	0 %	0 %	222102762
7092	NC_011981	ACC	2	6	420003	420008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102762
7093	NC_011981	CT	3	6	420039	420044	0 %	50 %	0 %	50 %	222102762
7094	NC_011981	TGA	2	6	420064	420069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102762
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7101	NC_011981	GCG	2	6	420308	420313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102762
7102	NC_011981	AAGG	2	8	420405	420412	50 %	0 %	50 %	0 %	222102762
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7107	NC_011981	GCCGA	2	10	420641	420650	20 %	0 %	40 %	40 %	222102763
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7119	NC_011981	CGGCAC	2	12	421040	421051	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222102763
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7121	NC_011981	CCT	2	6	421082	421087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102763
7122	NC_011981	CCA	2	6	421142	421147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102763
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7124	NC_011981	GCA	2	6	421259	421264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102763
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7144	NC_011981	CTG	2	6	423227	423232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102765
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7233	NC_011981	ATCG	2	8	429482	429489	25 %	25 %	25 %	25 %	222102770
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7242	NC_011981	GGGTC	2	10	429833	429842	0 %	20 %	60 %	20 %	222102770
7243	NC_011981	TTC	2	6	429849	429854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102770
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7251	NC_011981	CGG	2	6	430352	430357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102770
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7272	NC_011981	ATC	2	6	432176	432181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102772
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7274	NC_011981	TGA	2	6	432336	432341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102772
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7484	NC_011981	TCG	2	6	442394	442399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102781
7485	NC_011981	GGC	2	6	442411	442416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102781
7486	NC_011981	CGA	2	6	442467	442472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102781
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