MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 19968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011313	AAAAG	2	10	1107	1116	80 %	0 %	20 %	0 %	209808848
2	NC_011313	ATTT	2	8	1154	1161	25 %	75 %	0 %	0 %	209808848
3	NC_011313	TTC	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808848
4	NC_011313	CAA	2	6	1289	1294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
5	NC_011313	ATT	2	6	1300	1305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808848
6	NC_011313	ACA	2	6	1309	1314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
7	NC_011313	CAA	2	6	1342	1347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
8	NC_011313	CAG	2	6	1358	1363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808848
9	NC_011313	TGC	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808848
10	NC_011313	TTA	2	6	1439	1444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808848
11	NC_011313	AATT	2	8	1454	1461	50 %	50 %	0 %	0 %	209808848
12	NC_011313	CAAGAA	2	12	1501	1512	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	209808848
13	NC_011313	TGA	2	6	1602	1607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808848
14	NC_011313	CAA	2	6	1631	1636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
15	NC_011313	CTGGG	2	10	1638	1647	0 %	20 %	60 %	20 %	209808848
16	NC_011313	ATA	2	6	1648	1653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808848
17	NC_011313	CAC	2	6	1667	1672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808848
18	NC_011313	ATC	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808848
19	NC_011313	TGA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808848
20	NC_011313	ATC	3	9	1820	1828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808848
21	NC_011313	GAT	2	6	1831	1836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808848
22	NC_011313	AAACGA	2	12	1847	1858	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	209808848
23	NC_011313	AAG	2	6	1909	1914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
24	NC_011313	GAATT	2	10	1958	1967	40 %	40 %	20 %	0 %	209808848
25	NC_011313	AAG	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
26	NC_011313	TA	3	6	2129	2134	50 %	50 %	0 %	0 %	209808848
27	NC_011313	ATG	2	6	2159	2164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808848
28	NC_011313	ATT	2	6	2166	2171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808848
29	NC_011313	CTT	2	6	2184	2189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808848
30	NC_011313	CCA	2	6	2197	2202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808848
31	NC_011313	CTT	2	6	2244	2249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808848
32	NC_011313	GACA	2	8	2274	2281	50 %	0 %	25 %	25 %	209808848
33	NC_011313	TGAG	2	8	2291	2298	25 %	25 %	50 %	0 %	209808848
34	NC_011313	CTCG	2	8	2311	2318	0 %	25 %	25 %	50 %	209808848
35	NC_011313	A	7	7	2364	2370	100 %	0 %	0 %	0 %	209808848
36	NC_011313	TTAT	2	8	2398	2405	25 %	75 %	0 %	0 %	209808848
37	NC_011313	GAA	2	6	2497	2502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
38	NC_011313	CAA	2	6	2558	2563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
39	NC_011313	GCC	2	6	2684	2689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209808848
40	NC_011313	CTG	2	6	2711	2716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808848
41	NC_011313	AGA	2	6	2763	2768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
42	NC_011313	TGC	2	6	2817	2822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808848
43	NC_011313	GAA	2	6	2833	2838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
44	NC_011313	TAA	2	6	2928	2933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808848
45	NC_011313	GGTAG	2	10	3060	3069	20 %	20 %	60 %	0 %	209808848
46	NC_011313	AATG	2	8	3650	3657	50 %	25 %	25 %	0 %	209808849
47	NC_011313	ATT	2	6	3734	3739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808849
48	NC_011313	ATAA	2	8	3770	3777	75 %	25 %	0 %	0 %	209808849
49	NC_011313	ATA	2	6	7475	7480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808850
50	NC_011313	ATC	2	6	7573	7578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808850
51	NC_011313	TTA	2	6	7669	7674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808850
52	NC_011313	ATCA	2	8	7682	7689	50 %	25 %	0 %	25 %	209808850
53	NC_011313	AT	3	6	7812	7817	50 %	50 %	0 %	0 %	209808851
54	NC_011313	GAT	2	6	7829	7834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808851
55	NC_011313	TTG	2	6	7872	7877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808851
56	NC_011313	GA	3	6	7886	7891	50 %	0 %	50 %	0 %	209808851
57	NC_011313	GTCA	2	8	7902	7909	25 %	25 %	25 %	25 %	209808851
58	NC_011313	CTA	2	6	7917	7922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808851
59	NC_011313	TCA	2	6	7951	7956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808851
60	NC_011313	TCA	2	6	7999	8004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808851
61	NC_011313	GCCTA	2	10	8062	8071	20 %	20 %	20 %	40 %	209808851
62	NC_011313	TG	3	6	8082	8087	0 %	50 %	50 %	0 %	209808851
63	NC_011313	TTG	2	6	8130	8135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808851
64	NC_011313	ATT	2	6	8276	8281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808851
65	NC_011313	TGAG	2	8	8391	8398	25 %	25 %	50 %	0 %	209808851
66	NC_011313	A	6	6	8440	8445	100 %	0 %	0 %	0 %	209808851
67	NC_011313	GAA	2	6	8527	8532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808851
68	NC_011313	TC	3	6	8535	8540	0 %	50 %	0 %	50 %	209808851
69	NC_011313	A	7	7	8617	8623	100 %	0 %	0 %	0 %	209808851
70	NC_011313	T	6	6	10769	10774	0 %	100 %	0 %	0 %	209808852
71	NC_011313	CTTG	2	8	10823	10830	0 %	50 %	25 %	25 %	209808852
72	NC_011313	TC	3	6	10839	10844	0 %	50 %	0 %	50 %	209808852
73	NC_011313	ATTGA	2	10	10865	10874	40 %	40 %	20 %	0 %	209808852
74	NC_011313	TTTC	2	8	10918	10925	0 %	75 %	0 %	25 %	209808852
75	NC_011313	TTA	2	6	10932	10937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808852
76	NC_011313	GATTG	2	10	10987	10996	20 %	40 %	40 %	0 %	209808852
77	NC_011313	T	6	6	11014	11019	0 %	100 %	0 %	0 %	209808852
78	NC_011313	TGA	2	6	11065	11070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808852
79	NC_011313	TCA	2	6	11085	11090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808852
80	NC_011313	AATG	2	8	11103	11110	50 %	25 %	25 %	0 %	209808852
81	NC_011313	TTGA	2	8	11193	11200	25 %	50 %	25 %	0 %	209808852
82	NC_011313	TTTC	2	8	11238	11245	0 %	75 %	0 %	25 %	209808852
83	NC_011313	TGCA	2	8	11297	11304	25 %	25 %	25 %	25 %	209808852
84	NC_011313	ATC	2	6	11318	11323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808852
85	NC_011313	CAAG	2	8	11384	11391	50 %	0 %	25 %	25 %	209808852
86	NC_011313	ATG	2	6	11424	11429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808852
87	NC_011313	CATT	2	8	11431	11438	25 %	50 %	0 %	25 %	209808852
88	NC_011313	CCA	2	6	11484	11489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808852
89	NC_011313	CCT	2	6	11499	11504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209808852
90	NC_011313	GA	3	6	11684	11689	50 %	0 %	50 %	0 %	209808852
91	NC_011313	TGA	2	6	11693	11698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808852
92	NC_011313	AAG	2	6	11715	11720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808852
93	NC_011313	GCG	2	6	11739	11744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808852
94	NC_011313	T	6	6	11872	11877	0 %	100 %	0 %	0 %	209808852
95	NC_011313	ATG	2	6	11964	11969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808852
96	NC_011313	GCTTT	2	10	11997	12006	0 %	60 %	20 %	20 %	209808852
97	NC_011313	TAA	3	9	12008	12016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808852
98	NC_011313	T	6	6	12032	12037	0 %	100 %	0 %	0 %	209808852
99	NC_011313	CAA	2	6	12073	12078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808852
100	NC_011313	TCT	2	6	12144	12149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808852
101	NC_011313	AG	3	6	12161	12166	50 %	0 %	50 %	0 %	209808852
102	NC_011313	TCT	2	6	12243	12248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808852
103	NC_011313	ATTT	2	8	12250	12257	25 %	75 %	0 %	0 %	209808852
104	NC_011313	CAAA	2	8	12259	12266	75 %	0 %	0 %	25 %	209808852
105	NC_011313	ATG	2	6	12299	12304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808852
106	NC_011313	GTG	2	6	12336	12341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808852
107	NC_011313	ACA	2	6	12363	12368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808852
108	NC_011313	AAAG	2	8	12555	12562	75 %	0 %	25 %	0 %	209808853
109	NC_011313	TTG	2	6	12595	12600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808853
110	NC_011313	GTT	2	6	12613	12618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808853
111	NC_011313	TGT	2	6	12680	12685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808853
112	NC_011313	CTT	2	6	12706	12711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808853
113	NC_011313	TCG	2	6	12718	12723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808853
114	NC_011313	AC	3	6	12737	12742	50 %	0 %	0 %	50 %	209808853
115	NC_011313	AAT	2	6	12821	12826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
116	NC_011313	TCT	2	6	12901	12906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808853
117	NC_011313	AAT	2	6	12916	12921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
118	NC_011313	TGC	2	6	12925	12930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808853
119	NC_011313	AAT	2	6	13028	13033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
120	NC_011313	ATA	2	6	13135	13140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
121	NC_011313	ACTG	2	8	13185	13192	25 %	25 %	25 %	25 %	209808853
122	NC_011313	AAG	2	6	13460	13465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808853
123	NC_011313	AAT	2	6	13502	13507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
124	NC_011313	ATGA	2	8	13533	13540	50 %	25 %	25 %	0 %	209808853
125	NC_011313	TCT	2	6	13633	13638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808853
126	NC_011313	TGGT	2	8	13749	13756	0 %	50 %	50 %	0 %	209808853
127	NC_011313	TGT	2	6	13765	13770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808853
128	NC_011313	TTC	3	9	13800	13808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808853
129	NC_011313	AAT	2	6	13815	13820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
130	NC_011313	T	6	6	13884	13889	0 %	100 %	0 %	0 %	209808853
131	NC_011313	GTAA	2	8	13927	13934	50 %	25 %	25 %	0 %	209808853
132	NC_011313	CGA	2	6	14033	14038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808853
133	NC_011313	AAT	2	6	14041	14046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
134	NC_011313	TTC	2	6	14086	14091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808853
135	NC_011313	ATC	2	6	14107	14112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808853
136	NC_011313	TGC	3	9	14190	14198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808853
137	NC_011313	A	6	6	14215	14220	100 %	0 %	0 %	0 %	209808853
138	NC_011313	TCA	2	6	14234	14239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808853
139	NC_011313	TAA	2	6	14277	14282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
140	NC_011313	GCA	2	6	14335	14340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808853
141	NC_011313	TTG	3	9	14373	14381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808853
142	NC_011313	ACC	2	6	14382	14387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808853
143	NC_011313	CTG	2	6	14424	14429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808853
144	NC_011313	CTT	2	6	14450	14455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808854
145	NC_011313	TTTG	2	8	14466	14473	0 %	75 %	25 %	0 %	209808854
146	NC_011313	TCT	2	6	14595	14600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808854
147	NC_011313	TTG	2	6	14624	14629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808854
148	NC_011313	TAA	2	6	14635	14640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808854
149	NC_011313	CTTC	2	8	14650	14657	0 %	50 %	0 %	50 %	209808854
150	NC_011313	AGG	2	6	14702	14707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209808854
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152	NC_011313	ACC	2	6	14771	14776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808854
153	NC_011313	AGA	2	6	14949	14954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808855
154	NC_011313	A	6	6	14960	14965	100 %	0 %	0 %	0 %	209808855
155	NC_011313	TCA	2	6	14967	14972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808855
156	NC_011313	CGA	2	6	15018	15023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808855
157	NC_011313	AGAAA	2	10	15066	15075	80 %	0 %	20 %	0 %	209808855
158	NC_011313	A	6	6	15193	15198	100 %	0 %	0 %	0 %	209808855
159	NC_011313	GTT	2	6	15214	15219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808855
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163	NC_011313	TAA	2	6	15507	15512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808856
164	NC_011313	A	6	6	15526	15531	100 %	0 %	0 %	0 %	209808856
165	NC_011313	CTGAA	2	10	15596	15605	40 %	20 %	20 %	20 %	209808856
166	NC_011313	TTG	2	6	15611	15616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808856
167	NC_011313	AATC	2	8	15638	15645	50 %	25 %	0 %	25 %	209808856
168	NC_011313	ATT	2	6	15687	15692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808856
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174	NC_011313	ATG	2	6	16013	16018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808856
175	NC_011313	TCCAT	2	10	16080	16089	20 %	40 %	0 %	40 %	209808856
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179	NC_011313	A	6	6	16192	16197	100 %	0 %	0 %	0 %	209808856
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192	NC_011313	A	6	6	16978	16983	100 %	0 %	0 %	0 %	209808857
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246	NC_011313	CAT	2	6	20344	20349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808859
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256	NC_011313	CTT	2	6	20853	20858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808860
257	NC_011313	T	6	6	20916	20921	0 %	100 %	0 %	0 %	209808860
258	NC_011313	CCG	2	6	20942	20947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209808860
259	NC_011313	TA	3	6	20949	20954	50 %	50 %	0 %	0 %	209808860
260	NC_011313	CTTC	2	8	20996	21003	0 %	50 %	0 %	50 %	209808860
261	NC_011313	ACC	2	6	21007	21012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808860
262	NC_011313	CAT	2	6	21015	21020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808860
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264	NC_011313	AG	3	6	21046	21051	50 %	0 %	50 %	0 %	209808860
265	NC_011313	GCTC	2	8	21146	21153	0 %	25 %	25 %	50 %	209808860
266	NC_011313	CTT	2	6	21159	21164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808860
267	NC_011313	AT	3	6	21202	21207	50 %	50 %	0 %	0 %	209808860
268	NC_011313	AAAT	2	8	21259	21266	75 %	25 %	0 %	0 %	209808860
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270	NC_011313	TA	3	6	21375	21380	50 %	50 %	0 %	0 %	209808860
271	NC_011313	T	7	7	21381	21387	0 %	100 %	0 %	0 %	209808860
272	NC_011313	AG	3	6	21485	21490	50 %	0 %	50 %	0 %	209808860
273	NC_011313	TCA	2	6	21614	21619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808860
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277	NC_011313	CAA	2	6	22412	22417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808861
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279	NC_011313	ATT	2	6	22429	22434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
280	NC_011313	TGAT	2	8	22436	22443	25 %	50 %	25 %	0 %	209808861
281	NC_011313	CGT	2	6	22497	22502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808861
282	NC_011313	TGA	2	6	22539	22544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
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286	NC_011313	CTG	2	6	22631	22636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808861
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292	NC_011313	CCA	2	6	23018	23023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808861
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294	NC_011313	ATT	2	6	23086	23091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
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297	NC_011313	GCG	3	9	23168	23176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808861
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