MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 19968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011313	GTC	2	6	249881	249886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809040
4002	NC_011313	TTG	2	6	249890	249895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809040
4003	NC_011313	GAT	2	6	249904	249909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809040
4004	NC_011313	TC	3	6	249926	249931	0 %	50 %	0 %	50 %	209809040
4005	NC_011313	TCGT	2	8	249971	249978	0 %	50 %	25 %	25 %	209809040
4006	NC_011313	ATTA	2	8	250001	250008	50 %	50 %	0 %	0 %	209809040
4007	NC_011313	ATCA	2	8	250503	250510	50 %	25 %	0 %	25 %	209809041
4008	NC_011313	CCA	2	6	250532	250537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809041
4009	NC_011313	TTG	2	6	250595	250600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809041
4010	NC_011313	ATAA	2	8	250753	250760	75 %	25 %	0 %	0 %	209809041
4011	NC_011313	AGC	2	6	250781	250786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809041
4012	NC_011313	AAC	2	6	250845	250850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809041
4013	NC_011313	ATAAA	2	10	250936	250945	80 %	20 %	0 %	0 %	209809042
4014	NC_011313	AAAT	2	8	250997	251004	75 %	25 %	0 %	0 %	209809042
4015	NC_011313	TCT	2	6	251012	251017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809042
4016	NC_011313	GGCT	2	8	251029	251036	0 %	25 %	50 %	25 %	209809042
4017	NC_011313	GACTC	2	10	251070	251079	20 %	20 %	20 %	40 %	209809042
4018	NC_011313	AGA	3	9	251102	251110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809042
4019	NC_011313	ATC	2	6	251112	251117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809042
4020	NC_011313	ATG	2	6	251125	251130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809042
4021	NC_011313	AC	3	6	251131	251136	50 %	0 %	0 %	50 %	209809042
4022	NC_011313	TTA	2	6	251203	251208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809042
4023	NC_011313	ATGC	2	8	251253	251260	25 %	25 %	25 %	25 %	209809042
4024	NC_011313	A	7	7	251356	251362	100 %	0 %	0 %	0 %	209809042
4025	NC_011313	ATT	2	6	251448	251453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809042
4026	NC_011313	ATT	2	6	251520	251525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809042
4027	NC_011313	TAA	2	6	251551	251556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809042
4028	NC_011313	TAA	2	6	251582	251587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809042
4029	NC_011313	AAC	2	6	251611	251616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809042
4030	NC_011313	TGA	2	6	251630	251635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809042
4031	NC_011313	AAC	2	6	251636	251641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809042
4032	NC_011313	CACG	2	8	251871	251878	25 %	0 %	25 %	50 %	209809042
4033	NC_011313	CGA	2	6	251880	251885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809042
4034	NC_011313	TTA	2	6	251979	251984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809042
4035	NC_011313	CAGA	2	8	252021	252028	50 %	0 %	25 %	25 %	209809042
4036	NC_011313	TGA	2	6	252158	252163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809042
4037	NC_011313	AGCG	2	8	252196	252203	25 %	0 %	50 %	25 %	209809042
4038	NC_011313	GTTT	2	8	252514	252521	0 %	75 %	25 %	0 %	209809043
4039	NC_011313	TGC	2	6	252562	252567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809043
4040	NC_011313	GAT	2	6	252631	252636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809043
4041	NC_011313	TTGCA	2	10	252655	252664	20 %	40 %	20 %	20 %	209809043
4042	NC_011313	TAA	2	6	252709	252714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809043
4043	NC_011313	ACC	2	6	252718	252723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809043
4044	NC_011313	CAC	2	6	252738	252743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809043
4045	NC_011313	ACTAA	2	10	252761	252770	60 %	20 %	0 %	20 %	209809043
4046	NC_011313	GCT	2	6	252818	252823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809043
4047	NC_011313	GGTAAT	2	12	252835	252846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809043
4048	NC_011313	TTG	2	6	252867	252872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809043
4049	NC_011313	TGC	2	6	252952	252957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809043
4050	NC_011313	GAA	2	6	252970	252975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809043
4051	NC_011313	AAACC	2	10	253158	253167	60 %	0 %	0 %	40 %	209809043
4052	NC_011313	CTTT	2	8	253242	253249	0 %	75 %	0 %	25 %	209809043
4053	NC_011313	AAT	2	6	253348	253353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809043
4054	NC_011313	AG	5	10	253424	253433	50 %	0 %	50 %	0 %	209809043
4055	NC_011313	AAC	2	6	253501	253506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809043
4056	NC_011313	GAT	2	6	253553	253558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809043
4057	NC_011313	CTA	2	6	253560	253565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809043
4058	NC_011313	AAT	2	6	253610	253615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809043
4059	NC_011313	AAT	2	6	253678	253683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809043
4060	NC_011313	CGA	2	6	253686	253691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809043
4061	NC_011313	GAA	2	6	253698	253703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809043
4062	NC_011313	TCA	2	6	253716	253721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809043
4063	NC_011313	CAT	3	9	254109	254117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809044
4064	NC_011313	GTG	2	6	254140	254145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809044
4065	NC_011313	GTG	2	6	254170	254175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809044
4066	NC_011313	ACA	2	6	254286	254291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809044
4067	NC_011313	CCA	2	6	254310	254315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809044
4068	NC_011313	GTC	2	6	254326	254331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809044
4069	NC_011313	ATT	2	6	254335	254340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809044
4070	NC_011313	TTG	2	6	254386	254391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809044
4071	NC_011313	ATT	2	6	254394	254399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809044
4072	NC_011313	ATT	2	6	254424	254429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809044
4073	NC_011313	AT	3	6	254437	254442	50 %	50 %	0 %	0 %	209809044
4074	NC_011313	TCA	2	6	254477	254482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809044
4075	NC_011313	TGA	2	6	254510	254515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809044
4076	NC_011313	GTA	2	6	254542	254547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809044
4077	NC_011313	ACA	2	6	254552	254557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809044
4078	NC_011313	TTA	2	6	254607	254612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809044
4079	NC_011313	TGA	2	6	254624	254629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809044
4080	NC_011313	GTG	2	6	254637	254642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809044
4081	NC_011313	TGA	2	6	254645	254650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809044
4082	NC_011313	TGA	2	6	254659	254664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809044
4083	NC_011313	ATGG	2	8	254688	254695	25 %	25 %	50 %	0 %	209809044
4084	NC_011313	GA	3	6	254735	254740	50 %	0 %	50 %	0 %	209809044
4085	NC_011313	CAT	2	6	254761	254766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809044
4086	NC_011313	TAATT	2	10	254878	254887	40 %	60 %	0 %	0 %	209809044
4087	NC_011313	GTTT	2	8	255284	255291	0 %	75 %	25 %	0 %	209809045
4088	NC_011313	TATTG	2	10	255303	255312	20 %	60 %	20 %	0 %	209809045
4089	NC_011313	AAC	2	6	255326	255331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809045
4090	NC_011313	ACG	2	6	255334	255339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809045
4091	NC_011313	TAA	2	6	255390	255395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809045
4092	NC_011313	AAT	2	6	255401	255406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809045
4093	NC_011313	TCA	2	6	255474	255479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809045
4094	NC_011313	TCT	2	6	255520	255525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809045
4095	NC_011313	TAT	2	6	255544	255549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809045
4096	NC_011313	ATC	2	6	255578	255583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809045
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4098	NC_011313	AGCA	2	8	255693	255700	50 %	0 %	25 %	25 %	209809045
4099	NC_011313	CAG	2	6	255702	255707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809045
4100	NC_011313	GTC	2	6	255743	255748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809045
4101	NC_011313	GTTTTT	2	12	255759	255770	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	209809045
4102	NC_011313	AAT	2	6	255781	255786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809045
4103	NC_011313	GTC	2	6	255800	255805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809045
4104	NC_011313	ATT	2	6	255853	255858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809045
4105	NC_011313	CAT	2	6	255918	255923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809045
4106	NC_011313	TGTCG	2	10	256048	256057	0 %	40 %	40 %	20 %	209809045
4107	NC_011313	ATC	2	6	256142	256147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809045
4108	NC_011313	GAA	2	6	256158	256163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809045
4109	NC_011313	GAA	2	6	256186	256191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809045
4110	NC_011313	TTG	2	6	256196	256201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809045
4111	NC_011313	AAATC	2	10	256241	256250	60 %	20 %	0 %	20 %	209809045
4112	NC_011313	GCTT	2	8	256312	256319	0 %	50 %	25 %	25 %	209809045
4113	NC_011313	TAGT	2	8	256355	256362	25 %	50 %	25 %	0 %	209809045
4114	NC_011313	GTG	3	9	256372	256380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809045
4115	NC_011313	ATA	2	6	256384	256389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809045
4116	NC_011313	TAAAT	2	10	256408	256417	60 %	40 %	0 %	0 %	209809045
4117	NC_011313	GCC	2	6	256423	256428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209809045
4118	NC_011313	CCTC	2	8	256433	256440	0 %	25 %	0 %	75 %	209809045
4119	NC_011313	ACA	2	6	256457	256462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809045
4120	NC_011313	TGT	2	6	256479	256484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809045
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4122	NC_011313	T	6	6	256532	256537	0 %	100 %	0 %	0 %	209809045
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4369	NC_011313	CAA	3	9	273173	273181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809059
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4491	NC_011313	TCA	2	6	279878	279883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809063
4492	NC_011313	TTG	2	6	279901	279906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809063
4493	NC_011313	AT	3	6	280013	280018	50 %	50 %	0 %	0 %	209809063
4494	NC_011313	ATG	2	6	280360	280365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809064
4495	NC_011313	ACC	2	6	280573	280578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809064
4496	NC_011313	CACG	2	8	280624	280631	25 %	0 %	25 %	50 %	209809064
4497	NC_011313	CGC	2	6	280660	280665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209809064
4498	NC_011313	CAT	2	6	280744	280749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809064
4499	NC_011313	T	6	6	280749	280754	0 %	100 %	0 %	0 %	209809064
4500	NC_011313	CGG	2	6	280788	280793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209809064

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