MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 19968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011313	ATC	2	6	214824	214829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809008
3502	NC_011313	TCT	2	6	214830	214835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809008
3503	NC_011313	CTGT	2	8	214851	214858	0 %	50 %	25 %	25 %	209809008
3504	NC_011313	AAT	2	6	214879	214884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809008
3505	NC_011313	TCG	2	6	214972	214977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809008
3506	NC_011313	ATT	2	6	214985	214990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809008
3507	NC_011313	ACG	2	6	215018	215023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809008
3508	NC_011313	TTA	2	6	215061	215066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809008
3509	NC_011313	TTC	2	6	215081	215086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809008
3510	NC_011313	ATA	2	6	215105	215110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809008
3511	NC_011313	CAA	2	6	215145	215150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809008
3512	NC_011313	CAG	2	6	215321	215326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809008
3513	NC_011313	GCA	2	6	215334	215339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809008
3514	NC_011313	AAT	2	6	215346	215351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809008
3515	NC_011313	TGT	2	6	215445	215450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809008
3516	NC_011313	AT	3	6	215523	215528	50 %	50 %	0 %	0 %	209809008
3517	NC_011313	CAA	2	6	215553	215558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809008
3518	NC_011313	TTA	2	6	215646	215651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809008
3519	NC_011313	GAA	2	6	215653	215658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809008
3520	NC_011313	AAT	2	6	215685	215690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809008
3521	NC_011313	GTT	2	6	216733	216738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809009
3522	NC_011313	TGC	2	6	216796	216801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809009
3523	NC_011313	TTAT	2	8	216823	216830	25 %	75 %	0 %	0 %	209809009
3524	NC_011313	CAATA	2	10	216898	216907	60 %	20 %	0 %	20 %	209809009
3525	NC_011313	CAA	2	6	216983	216988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809009
3526	NC_011313	TGG	2	6	217046	217051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809009
3527	NC_011313	TGAT	2	8	217073	217080	25 %	50 %	25 %	0 %	209809009
3528	NC_011313	TAA	2	6	217088	217093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809010
3529	NC_011313	GAT	2	6	217184	217189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809010
3530	NC_011313	AT	3	6	217500	217505	50 %	50 %	0 %	0 %	209809011
3531	NC_011313	GAT	2	6	217517	217522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809011
3532	NC_011313	TTG	2	6	217560	217565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809011
3533	NC_011313	GA	3	6	217574	217579	50 %	0 %	50 %	0 %	209809011
3534	NC_011313	GTCA	2	8	217590	217597	25 %	25 %	25 %	25 %	209809011
3535	NC_011313	CTA	2	6	217605	217610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809011
3536	NC_011313	TCA	2	6	217639	217644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809011
3537	NC_011313	TCA	2	6	217687	217692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809011
3538	NC_011313	GCCTA	2	10	217750	217759	20 %	20 %	20 %	40 %	209809011
3539	NC_011313	TG	3	6	217770	217775	0 %	50 %	50 %	0 %	209809011
3540	NC_011313	TTG	2	6	217818	217823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809011
3541	NC_011313	ATT	2	6	217964	217969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809011
3542	NC_011313	TGAG	2	8	218079	218086	25 %	25 %	50 %	0 %	209809011
3543	NC_011313	A	6	6	218128	218133	100 %	0 %	0 %	0 %	209809011
3544	NC_011313	GAA	2	6	218215	218220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809011
3545	NC_011313	TC	3	6	218223	218228	0 %	50 %	0 %	50 %	209809011
3546	NC_011313	A	7	7	218305	218311	100 %	0 %	0 %	0 %	209809011
3547	NC_011313	AAC	2	6	219043	219048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809012
3548	NC_011313	CTT	2	6	219065	219070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809012
3549	NC_011313	TCA	2	6	219098	219103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809012
3550	NC_011313	CTT	2	6	219113	219118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809012
3551	NC_011313	CAT	2	6	219230	219235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809012
3552	NC_011313	CAA	2	6	219239	219244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809012
3553	NC_011313	AAT	2	6	219289	219294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809012
3554	NC_011313	AC	3	6	219349	219354	50 %	0 %	0 %	50 %	209809012
3555	NC_011313	CGA	2	6	219367	219372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809012
3556	NC_011313	ACCA	2	8	219543	219550	50 %	0 %	0 %	50 %	209809012
3557	NC_011313	TCTT	2	8	219617	219624	0 %	75 %	0 %	25 %	209809012
3558	NC_011313	GTG	2	6	219656	219661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809012
3559	NC_011313	AG	3	6	219712	219717	50 %	0 %	50 %	0 %	209809012
3560	NC_011313	CT	3	6	219837	219842	0 %	50 %	0 %	50 %	209809012
3561	NC_011313	GAT	3	9	219912	219920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809012
3562	NC_011313	TAT	2	6	220037	220042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809012
3563	NC_011313	TG	3	6	220106	220111	0 %	50 %	50 %	0 %	209809012
3564	NC_011313	ATA	2	6	220146	220151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809012
3565	NC_011313	TCA	2	6	220195	220200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809012
3566	NC_011313	AGA	2	6	220248	220253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809012
3567	NC_011313	CAA	2	6	220316	220321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809012
3568	NC_011313	ATG	2	6	220324	220329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809012
3569	NC_011313	AAACG	2	10	220345	220354	60 %	0 %	20 %	20 %	209809012
3570	NC_011313	AAG	2	6	220382	220387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809012
3571	NC_011313	ATT	2	6	220414	220419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809012
3572	NC_011313	TTA	2	6	221359	221364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809013
3573	NC_011313	CTG	2	6	221395	221400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809013
3574	NC_011313	TTA	2	6	221401	221406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809013
3575	NC_011313	TAA	2	6	221420	221425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809013
3576	NC_011313	TTC	2	6	221440	221445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809013
3577	NC_011313	AGC	2	6	221471	221476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809013
3578	NC_011313	TAAA	2	8	221500	221507	75 %	25 %	0 %	0 %	209809013
3579	NC_011313	ATA	2	6	221512	221517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809013
3580	NC_011313	ATACA	2	10	221625	221634	60 %	20 %	0 %	20 %	209809013
3581	NC_011313	CTAA	2	8	221677	221684	50 %	25 %	0 %	25 %	209809013
3582	NC_011313	TGA	2	6	221794	221799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809014
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3588	NC_011313	GAT	2	6	222048	222053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809014
3589	NC_011313	CTTTGC	2	12	222101	222112	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	209809014
3590	NC_011313	TG	3	6	222193	222198	0 %	50 %	50 %	0 %	209809014
3591	NC_011313	AC	3	6	222221	222226	50 %	0 %	0 %	50 %	209809014
3592	NC_011313	ATA	2	6	222244	222249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809014
3593	NC_011313	ACC	2	6	222321	222326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809014
3594	NC_011313	TC	3	6	222333	222338	0 %	50 %	0 %	50 %	209809014
3595	NC_011313	GTGTTT	2	12	222544	222555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809015
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3597	NC_011313	CAT	2	6	222692	222697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809015
3598	NC_011313	ATG	2	6	222773	222778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809015
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3600	NC_011313	CA	3	6	222826	222831	50 %	0 %	0 %	50 %	209809015
3601	NC_011313	TAT	2	6	222844	222849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809015
3602	NC_011313	ATG	2	6	222863	222868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809015
3603	NC_011313	ATC	2	6	222902	222907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809015
3604	NC_011313	TAA	2	6	222918	222923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809015
3605	NC_011313	A	6	6	222922	222927	100 %	0 %	0 %	0 %	209809015
3606	NC_011313	TCTTT	2	10	222973	222982	0 %	80 %	0 %	20 %	209809015
3607	NC_011313	T	6	6	222987	222992	0 %	100 %	0 %	0 %	209809015
3608	NC_011313	AAG	2	6	223043	223048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809015
3609	NC_011313	AAAT	2	8	223056	223063	75 %	25 %	0 %	0 %	209809015
3610	NC_011313	TGA	2	6	223080	223085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809015
3611	NC_011313	TCT	2	6	223177	223182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809015
3612	NC_011313	CA	3	6	223260	223265	50 %	0 %	0 %	50 %	209809015
3613	NC_011313	AGA	2	6	223296	223301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809015
3614	NC_011313	ATT	2	6	223401	223406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809015
3615	NC_011313	CAT	2	6	223431	223436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809015
3616	NC_011313	G	6	6	223487	223492	0 %	0 %	100 %	0 %	209809015
3617	NC_011313	GAT	2	6	223500	223505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809015
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3621	NC_011313	TCGT	2	8	223733	223740	0 %	50 %	25 %	25 %	209809015
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3623	NC_011313	TTTC	2	8	223808	223815	0 %	75 %	0 %	25 %	209809015
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