MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 54558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011312	AACC	2	8	237606	237613	50 %	0 %	0 %	50 %	209693812
3502	NC_011312	A	6	6	237741	237746	100 %	0 %	0 %	0 %	209693812
3503	NC_011312	GTGA	2	8	237774	237781	25 %	25 %	50 %	0 %	209693812
3504	NC_011312	GCA	2	6	237816	237821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693812
3505	NC_011312	GTG	2	6	237853	237858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693812
3506	NC_011312	TATC	2	8	237862	237869	25 %	50 %	0 %	25 %	209693812
3507	NC_011312	TCG	2	6	237872	237877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693812
3508	NC_011312	AGCCAA	2	12	237954	237965	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209693812
3509	NC_011312	GAA	2	6	237971	237976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693812
3510	NC_011312	ATT	2	6	238043	238048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693812
3511	NC_011312	CGA	3	9	238069	238077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693812
3512	NC_011312	TTG	2	6	238090	238095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693812
3513	NC_011312	TGA	2	6	238103	238108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693812
3514	NC_011312	A	6	6	238140	238145	100 %	0 %	0 %	0 %	209693812
3515	NC_011312	TGA	2	6	238198	238203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693812
3516	NC_011312	ATT	2	6	238299	238304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693812
3517	NC_011312	CTAC	2	8	238365	238372	25 %	25 %	0 %	50 %	209693812
3518	NC_011312	CAT	2	6	238382	238387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693812
3519	NC_011312	TGGTT	2	10	238556	238565	0 %	60 %	40 %	0 %	209693812
3520	NC_011312	GTGAAA	2	12	238632	238643	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	209693812
3521	NC_011312	AATCA	2	10	238732	238741	60 %	20 %	0 %	20 %	209693812
3522	NC_011312	CAG	2	6	238746	238751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693812
3523	NC_011312	AAT	2	6	238809	238814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693812
3524	NC_011312	GCG	2	6	238827	238832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693812
3525	NC_011312	GTG	2	6	238837	238842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693812
3526	NC_011312	TGC	2	6	238847	238852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693812
3527	NC_011312	AAG	2	6	238869	238874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693812
3528	NC_011312	AT	3	6	239201	239206	50 %	50 %	0 %	0 %	209693813
3529	NC_011312	ATT	2	6	239214	239219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693813
3530	NC_011312	TAA	2	6	239298	239303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693813
3531	NC_011312	ATC	3	9	239394	239402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693813
3532	NC_011312	TTTTGA	2	12	239430	239441	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	209693813
3533	NC_011312	CATCA	2	10	239451	239460	40 %	20 %	0 %	40 %	209693813
3534	NC_011312	TGT	2	6	239500	239505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693813
3535	NC_011312	ATC	2	6	239508	239513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693813
3536	NC_011312	CGT	2	6	239535	239540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693813
3537	NC_011312	CTT	2	6	239571	239576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693813
3538	NC_011312	TTAAA	2	10	239701	239710	60 %	40 %	0 %	0 %	209693814
3539	NC_011312	A	6	6	239729	239734	100 %	0 %	0 %	0 %	209693814
3540	NC_011312	TCA	2	6	239756	239761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693814
3541	NC_011312	ACT	2	6	239801	239806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693814
3542	NC_011312	ATCC	2	8	239862	239869	25 %	25 %	0 %	50 %	209693814
3543	NC_011312	CT	3	6	239915	239920	0 %	50 %	0 %	50 %	209693814
3544	NC_011312	CTTG	2	8	240018	240025	0 %	50 %	25 %	25 %	209693814
3545	NC_011312	TTGC	2	8	240042	240049	0 %	50 %	25 %	25 %	209693814
3546	NC_011312	ACA	2	6	240111	240116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693814
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3548	NC_011312	TAAT	2	8	240177	240184	50 %	50 %	0 %	0 %	209693814
3549	NC_011312	CCA	2	6	240233	240238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693814
3550	NC_011312	CCA	2	6	240291	240296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693814
3551	NC_011312	TCA	2	6	240299	240304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693814
3552	NC_011312	CAA	2	6	240387	240392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693814
3553	NC_011312	ATGA	2	8	240427	240434	50 %	25 %	25 %	0 %	209693814
3554	NC_011312	ACCTTC	2	12	240448	240459	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	209693814
3555	NC_011312	AT	3	6	240912	240917	50 %	50 %	0 %	0 %	209693815
3556	NC_011312	GAT	2	6	240929	240934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693815
3557	NC_011312	TTG	2	6	240972	240977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693815
3558	NC_011312	GA	3	6	240986	240991	50 %	0 %	50 %	0 %	209693815
3559	NC_011312	GTCA	2	8	241002	241009	25 %	25 %	25 %	25 %	209693815
3560	NC_011312	CTA	2	6	241017	241022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693815
3561	NC_011312	TCA	2	6	241051	241056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693815
3562	NC_011312	TCA	2	6	241099	241104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693815
3563	NC_011312	GCCTA	2	10	241162	241171	20 %	20 %	20 %	40 %	209693815
3564	NC_011312	TG	3	6	241182	241187	0 %	50 %	50 %	0 %	209693815
3565	NC_011312	TTG	2	6	241230	241235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693815
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3569	NC_011312	GAA	2	6	241627	241632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693815
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3571	NC_011312	A	7	7	241717	241723	100 %	0 %	0 %	0 %	209693815
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3574	NC_011312	CAATC	2	10	244589	244598	40 %	20 %	0 %	40 %	209693816
3575	NC_011312	ACC	2	6	244599	244604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693816
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3578	NC_011312	GAT	2	6	244815	244820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693816
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3592	NC_011312	GGC	2	6	246015	246020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693817
3593	NC_011312	ACG	2	6	246040	246045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693817
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3609	NC_011312	TCA	2	6	246986	246991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693818
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3613	NC_011312	AT	3	6	247190	247195	50 %	50 %	0 %	0 %	209693818
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3622	NC_011312	CCA	2	6	247533	247538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693818
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3627	NC_011312	CTG	2	6	247903	247908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693819
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3635	NC_011312	CTT	2	6	248242	248247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693819
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3731	NC_011312	CAT	2	6	255243	255248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693826
3732	NC_011312	TCTG	2	8	255380	255387	0 %	50 %	25 %	25 %	209693826
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3736	NC_011312	GTT	2	6	255767	255772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693826
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3742	NC_011312	TAA	2	6	255954	255959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693826
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3744	NC_011312	GCAT	2	8	256148	256155	25 %	25 %	25 %	25 %	209693826
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3866	NC_011312	TCC	2	6	262233	262238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209693833
3867	NC_011312	GAA	2	6	262246	262251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693833
3868	NC_011312	ATG	2	6	262256	262261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693833
3869	NC_011312	TTA	2	6	262423	262428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693833
3870	NC_011312	CA	5	10	262451	262460	50 %	0 %	0 %	50 %	209693833
3871	NC_011312	ATT	2	6	262461	262466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693833
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3873	NC_011312	TATGG	2	10	262513	262522	20 %	40 %	40 %	0 %	209693833
3874	NC_011312	TAT	2	6	262528	262533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693833
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3878	NC_011312	ACTG	2	8	262680	262687	25 %	25 %	25 %	25 %	209693833
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3887	NC_011312	TAAA	2	8	263006	263013	75 %	25 %	0 %	0 %	209693833
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3890	NC_011312	GCTT	2	8	263126	263133	0 %	50 %	25 %	25 %	209693833
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3895	NC_011312	CGAG	2	8	263343	263350	25 %	0 %	50 %	25 %	209693833
3896	NC_011312	TAT	2	6	263577	263582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693833
3897	NC_011312	TAA	2	6	263586	263591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693833
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3984	NC_011312	AGC	2	6	268274	268279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693835
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3986	NC_011312	AGC	2	6	268533	268538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693836
3987	NC_011312	GAA	2	6	268613	268618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693836
3988	NC_011312	TTA	2	6	268656	268661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693836
3989	NC_011312	TGA	2	6	268899	268904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693836
3990	NC_011312	TATG	2	8	268941	268948	25 %	50 %	25 %	0 %	209693836
3991	NC_011312	TCAAA	2	10	269020	269029	60 %	20 %	0 %	20 %	209693836
3992	NC_011312	AACGGC	2	12	269062	269073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693836
3993	NC_011312	TGA	2	6	269074	269079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693836
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3995	NC_011312	GTC	2	6	269103	269108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693836
3996	NC_011312	CAGT	2	8	269190	269197	25 %	25 %	25 %	25 %	209693836
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3999	NC_011312	AAG	2	6	269358	269363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693836
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