MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 54558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011312	TAA	2	6	123592	123597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693716
1502	NC_011312	GAT	2	6	123671	123676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693716
1503	NC_011312	ATC	2	6	123771	123776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693716
1504	NC_011312	G	6	6	123833	123838	0 %	0 %	100 %	0 %	209693716
1505	NC_011312	TC	3	6	123849	123854	0 %	50 %	0 %	50 %	209693716
1506	NC_011312	CAT	2	6	123871	123876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693716
1507	NC_011312	TCT	2	6	123889	123894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693716
1508	NC_011312	TGA	2	6	123904	123909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693716
1509	NC_011312	AC	3	6	123936	123941	50 %	0 %	0 %	50 %	209693716
1510	NC_011312	GTTT	2	8	124008	124015	0 %	75 %	25 %	0 %	209693716
1511	NC_011312	GTT	2	6	124094	124099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693716
1512	NC_011312	AGA	2	6	124288	124293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693716
1513	NC_011312	AAG	2	6	124305	124310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693716
1514	NC_011312	ATG	2	6	124337	124342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693716
1515	NC_011312	GAAGAT	2	12	124352	124363	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	209693716
1516	NC_011312	TGCA	2	8	124392	124399	25 %	25 %	25 %	25 %	209693716
1517	NC_011312	AGA	2	6	124441	124446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693716
1518	NC_011312	TGA	2	6	124474	124479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693716
1519	NC_011312	AGA	3	9	124489	124497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693716
1520	NC_011312	CGT	2	6	124499	124504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693716
1521	NC_011312	A	7	7	124531	124537	100 %	0 %	0 %	0 %	209693716
1522	NC_011312	CGT	2	6	124565	124570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693716
1523	NC_011312	T	6	6	124606	124611	0 %	100 %	0 %	0 %	209693716
1524	NC_011312	AGA	2	6	124612	124617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693716
1525	NC_011312	GAT	2	6	124628	124633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693716
1526	NC_011312	A	6	6	124649	124654	100 %	0 %	0 %	0 %	209693716
1527	NC_011312	AAG	2	6	124668	124673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693716
1528	NC_011312	AG	3	6	124672	124677	50 %	0 %	50 %	0 %	209693716
1529	NC_011312	A	6	6	124724	124729	100 %	0 %	0 %	0 %	209693716
1530	NC_011312	GCA	2	6	124861	124866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693717
1531	NC_011312	TCA	3	9	124873	124881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693717
1532	NC_011312	GCATT	2	10	124910	124919	20 %	40 %	20 %	20 %	209693717
1533	NC_011312	GAG	2	6	124970	124975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209693717
1534	NC_011312	CTG	2	6	124982	124987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693717
1535	NC_011312	GGTT	2	8	125076	125083	0 %	50 %	50 %	0 %	209693717
1536	NC_011312	CAA	2	6	125087	125092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693717
1537	NC_011312	GCA	2	6	125167	125172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693717
1538	NC_011312	GCA	2	6	125197	125202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693717
1539	NC_011312	CGA	2	6	125210	125215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693717
1540	NC_011312	TGC	3	9	128557	128565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693718
1541	NC_011312	ATG	2	6	128586	128591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693718
1542	NC_011312	TACGT	2	10	128752	128761	20 %	40 %	20 %	20 %	209693718
1543	NC_011312	GAT	2	6	128801	128806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693718
1544	NC_011312	TGA	2	6	128887	128892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693718
1545	NC_011312	TTC	2	6	128934	128939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693718
1546	NC_011312	TAAAGA	2	12	129001	129012	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	209693718
1547	NC_011312	TGT	2	6	129073	129078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693718
1548	NC_011312	TGC	2	6	129202	129207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693718
1549	NC_011312	CTT	2	6	129209	129214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693718
1550	NC_011312	CAAT	2	8	129390	129397	50 %	25 %	0 %	25 %	209693718
1551	NC_011312	TCC	2	6	129457	129462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209693718
1552	NC_011312	ATG	2	6	129477	129482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693718
1553	NC_011312	A	6	6	129509	129514	100 %	0 %	0 %	0 %	209693718
1554	NC_011312	TGA	2	6	129525	129530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693718
1555	NC_011312	AAG	2	6	129531	129536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693718
1556	NC_011312	ATG	2	6	129566	129571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693718
1557	NC_011312	ATG	2	6	129594	129599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693718
1558	NC_011312	GCA	2	6	129620	129625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693718
1559	NC_011312	TGTT	2	8	129697	129704	0 %	75 %	25 %	0 %	209693718
1560	NC_011312	ATG	3	9	129713	129721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693718
1561	NC_011312	AGA	2	6	129742	129747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693718
1562	NC_011312	GAA	2	6	129788	129793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693718
1563	NC_011312	ATT	2	6	129822	129827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693718
1564	NC_011312	ACG	2	6	129927	129932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693718
1565	NC_011312	GTT	2	6	130040	130045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693718
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1567	NC_011312	TTGG	2	8	130296	130303	0 %	50 %	50 %	0 %	209693719
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1569	NC_011312	TTA	2	6	130387	130392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693719
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1581	NC_011312	GCAAAA	2	12	130854	130865	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	209693719
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1585	NC_011312	GTGG	2	8	130932	130939	0 %	25 %	75 %	0 %	209693719
1586	NC_011312	TGG	2	6	130957	130962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693719
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1589	NC_011312	ATC	2	6	131215	131220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693720
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1604	NC_011312	ATTAGT	2	12	132022	132033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	209693720
1605	NC_011312	GA	3	6	132073	132078	50 %	0 %	50 %	0 %	209693720
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1607	NC_011312	ATA	2	6	132435	132440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693721
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1609	NC_011312	GTTT	2	8	132564	132571	0 %	75 %	25 %	0 %	209693721
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1616	NC_011312	GGTT	2	8	132764	132771	0 %	50 %	50 %	0 %	209693721
1617	NC_011312	CTT	2	6	132895	132900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693721
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1989	NC_011312	AATCC	2	10	150895	150904	40 %	20 %	0 %	40 %	209693739
1990	NC_011312	ATC	3	9	151001	151009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693739
1991	NC_011312	ATT	2	6	151286	151291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693740
1992	NC_011312	CAG	2	6	151312	151317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693740
1993	NC_011312	ATTTTA	2	12	151403	151414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693740
1994	NC_011312	T	7	7	151527	151533	0 %	100 %	0 %	0 %	209693740
1995	NC_011312	ATC	2	6	151585	151590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693740
1996	NC_011312	A	7	7	151593	151599	100 %	0 %	0 %	0 %	209693740
1997	NC_011312	CAT	2	6	151652	151657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693740
1998	NC_011312	TGAG	2	8	151661	151668	25 %	25 %	50 %	0 %	209693740
1999	NC_011312	GTTGT	2	10	151669	151678	0 %	60 %	40 %	0 %	209693740
2000	NC_011312	T	7	7	151716	151722	0 %	100 %	0 %	0 %	209693740

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