MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_011206	TGC	2	6	2544534	2544539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284653
48002	NC_011206	GCC	2	6	2544580	2544585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284653
48003	NC_011206	GGT	2	6	2544594	2544599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284653
48004	NC_011206	GC	3	6	2544600	2544605	0 %	0 %	50 %	50 %	198284653
48005	NC_011206	GC	3	6	2544647	2544652	0 %	0 %	50 %	50 %	198284653
48006	NC_011206	CGT	2	6	2544723	2544728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284653
48007	NC_011206	CCG	2	6	2544749	2544754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284653
48008	NC_011206	TCA	2	6	2544776	2544781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284653
48009	NC_011206	TCG	2	6	2544842	2544847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284653
48010	NC_011206	CAC	2	6	2544888	2544893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284653
48011	NC_011206	GTC	2	6	2544961	2544966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284653
48012	NC_011206	CAT	2	6	2545000	2545005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284653
48013	NC_011206	GTG	2	6	2545024	2545029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284653
48014	NC_011206	GGA	2	6	2545182	2545187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284653
48015	NC_011206	CGA	2	6	2545203	2545208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284653
48016	NC_011206	A	6	6	2545228	2545233	100 %	0 %	0 %	0 %	198284653
48017	NC_011206	TGG	2	6	2545345	2545350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284654
48018	NC_011206	ATC	2	6	2545386	2545391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284654
48019	NC_011206	CAG	2	6	2545466	2545471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284654
48020	NC_011206	GCA	2	6	2545492	2545497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284654
48021	NC_011206	ATG	2	6	2545551	2545556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284654
48022	NC_011206	CAG	2	6	2545646	2545651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284654
48023	NC_011206	CTG	2	6	2545662	2545667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284654
48024	NC_011206	ACA	2	6	2545702	2545707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284654
48025	NC_011206	GC	3	6	2545733	2545738	0 %	0 %	50 %	50 %	198284654
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48027	NC_011206	A	6	6	2545783	2545788	100 %	0 %	0 %	0 %	198284654
48028	NC_011206	ATGA	2	8	2545809	2545816	50 %	25 %	25 %	0 %	198284654
48029	NC_011206	CGC	2	6	2545901	2545906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284654
48030	NC_011206	CAGCTC	2	12	2545956	2545967	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	198284654
48031	NC_011206	CGC	2	6	2546012	2546017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284654
48032	NC_011206	TTC	2	6	2546020	2546025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284654
48033	NC_011206	TGC	2	6	2546056	2546061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284654
48034	NC_011206	CGG	2	6	2546117	2546122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284654
48035	NC_011206	GGC	2	6	2546201	2546206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284654
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48039	NC_011206	CAT	2	6	2546452	2546457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284655
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48042	NC_011206	AAC	2	6	2546709	2546714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284655
48043	NC_011206	GA	3	6	2546892	2546897	50 %	0 %	50 %	0 %	198284655
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48050	NC_011206	GGT	2	6	2547319	2547324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284655
48051	NC_011206	TGC	2	6	2547357	2547362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284655
48052	NC_011206	GGC	2	6	2547371	2547376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284655
48053	NC_011206	TG	3	6	2547443	2547448	0 %	50 %	50 %	0 %	198284655
48054	NC_011206	TAC	2	6	2547467	2547472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284655
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48056	NC_011206	ATG	2	6	2547551	2547556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284655
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48083	NC_011206	GC	4	8	2549354	2549361	0 %	0 %	50 %	50 %	198284658
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48115	NC_011206	GTG	2	6	2551371	2551376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284659
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48223	NC_011206	A	6	6	2557653	2557658	100 %	0 %	0 %	0 %	198284663
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48229	NC_011206	CAA	2	6	2558008	2558013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284663
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48340	NC_011206	A	6	6	2563721	2563726	100 %	0 %	0 %	0 %	198284667
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48349	NC_011206	GCT	2	6	2564099	2564104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284668
48350	NC_011206	AACC	2	8	2564229	2564236	50 %	0 %	0 %	50 %	198284668
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48464	NC_011206	TGC	2	6	2570316	2570321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284674
48465	NC_011206	TGG	2	6	2570328	2570333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284674
48466	NC_011206	CGG	2	6	2570358	2570363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284674
48467	NC_011206	GCT	2	6	2570365	2570370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284674
48468	NC_011206	TGC	2	6	2570460	2570465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284674
48469	NC_011206	GC	3	6	2570549	2570554	0 %	0 %	50 %	50 %	198284674
48470	NC_011206	TGC	2	6	2570562	2570567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284674
48471	NC_011206	GGCG	2	8	2570575	2570582	0 %	0 %	75 %	25 %	198284674
48472	NC_011206	CGT	2	6	2570599	2570604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284674
48473	NC_011206	GC	3	6	2570646	2570651	0 %	0 %	50 %	50 %	198284674
48474	NC_011206	GGC	2	6	2570689	2570694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284674
48475	NC_011206	GC	3	6	2570693	2570698	0 %	0 %	50 %	50 %	198284674
48476	NC_011206	GGC	2	6	2570755	2570760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284674
48477	NC_011206	GCC	2	6	2570765	2570770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284674
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48480	NC_011206	CTG	2	6	2570913	2570918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284675
48481	NC_011206	GCG	2	6	2570941	2570946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284675
48482	NC_011206	GT	3	6	2570959	2570964	0 %	50 %	50 %	0 %	198284675
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48485	NC_011206	TCCC	2	8	2571059	2571066	0 %	25 %	0 %	75 %	198284675
48486	NC_011206	GCC	2	6	2571103	2571108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284675
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48489	NC_011206	TGA	2	6	2571748	2571753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284676
48490	NC_011206	TTAT	2	8	2571796	2571803	25 %	75 %	0 %	0 %	198284677
48491	NC_011206	GC	3	6	2571904	2571909	0 %	0 %	50 %	50 %	198284677
48492	NC_011206	ACT	2	6	2572035	2572040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284677
48493	NC_011206	ATC	3	9	2572100	2572108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284677
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48495	NC_011206	GC	3	6	2572150	2572155	0 %	0 %	50 %	50 %	198284677
48496	NC_011206	CAAG	2	8	2572168	2572175	50 %	0 %	25 %	25 %	198284677
48497	NC_011206	AAT	2	6	2572401	2572406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198284678
48498	NC_011206	AAT	2	6	2572451	2572456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198284678
48499	NC_011206	CCCG	2	8	2572696	2572703	0 %	0 %	25 %	75 %	198284678
48500	NC_011206	CCA	2	6	2572711	2572716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284678

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