MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47004	NC_011206	CGC	2	6	2495873	2495878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284609
47005	NC_011206	GGCC	2	8	2495937	2495944	0 %	0 %	50 %	50 %	198284609
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47012	NC_011206	TGCCC	2	10	2496186	2496195	0 %	20 %	20 %	60 %	198284609
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47116	NC_011206	GGC	2	6	2501698	2501703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284615
47117	NC_011206	ATCT	2	8	2501724	2501731	25 %	50 %	0 %	25 %	198284615
47118	NC_011206	GCA	2	6	2501776	2501781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284615
47119	NC_011206	CGGG	2	8	2501839	2501846	0 %	0 %	75 %	25 %	198284615
47120	NC_011206	AAGATC	2	12	2501853	2501864	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	198284615
47121	NC_011206	CCG	2	6	2501881	2501886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284615
47122	NC_011206	GGA	2	6	2501891	2501896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284615
47123	NC_011206	AGG	2	6	2501950	2501955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284615
47124	NC_011206	GGT	2	6	2501987	2501992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284616
47125	NC_011206	GTG	2	6	2502094	2502099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284616
47126	NC_011206	GCG	3	9	2502104	2502112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284616
47127	NC_011206	ATG	2	6	2502113	2502118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284616
47128	NC_011206	CAGC	2	8	2502153	2502160	25 %	0 %	25 %	50 %	198284616
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47130	NC_011206	GCCAGC	2	12	2502325	2502336	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	198284617
47131	NC_011206	GA	3	6	2502359	2502364	50 %	0 %	50 %	0 %	198284617
47132	NC_011206	TGA	2	6	2502365	2502370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284617
47133	NC_011206	CCG	2	6	2502419	2502424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284617
47134	NC_011206	CT	3	6	2502450	2502455	0 %	50 %	0 %	50 %	198284617
47135	NC_011206	CGC	2	6	2502456	2502461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284617
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47137	NC_011206	GC	3	6	2502643	2502648	0 %	0 %	50 %	50 %	198284617
47138	NC_011206	GC	3	6	2502650	2502655	0 %	0 %	50 %	50 %	198284617
47139	NC_011206	GGTA	2	8	2502656	2502663	25 %	25 %	50 %	0 %	198284617
47140	NC_011206	GAT	2	6	2502687	2502692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284617
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47142	NC_011206	GAT	3	9	2502810	2502818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284617
47143	NC_011206	ATG	2	6	2502922	2502927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284617
47144	NC_011206	GGC	2	6	2502928	2502933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284617
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47146	NC_011206	GCA	2	6	2502983	2502988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284617
47147	NC_011206	CGC	2	6	2502999	2503004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284617
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47151	NC_011206	CA	3	6	2503102	2503107	50 %	0 %	0 %	50 %	198284617
47152	NC_011206	GTG	2	6	2503116	2503121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284617
47153	NC_011206	GCC	2	6	2503144	2503149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284617
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47182	NC_011206	TCAA	2	8	2504452	2504459	50 %	25 %	0 %	25 %	198284618
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47188	NC_011206	CGC	2	6	2504781	2504786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284618
47189	NC_011206	C	7	7	2504794	2504800	0 %	0 %	0 %	100 %	198284618
47190	NC_011206	AGC	2	6	2504806	2504811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284618
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47200	NC_011206	TGC	2	6	2505424	2505429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284619
47201	NC_011206	CATGG	2	10	2505681	2505690	20 %	20 %	40 %	20 %	198284619
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47203	NC_011206	TGG	2	6	2505737	2505742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284619
47204	NC_011206	CGCC	2	8	2505772	2505779	0 %	0 %	25 %	75 %	198284619
47205	NC_011206	ATCC	2	8	2505813	2505820	25 %	25 %	0 %	50 %	198284619
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47207	NC_011206	CGA	2	6	2505857	2505862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284619
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47211	NC_011206	TGA	2	6	2506127	2506132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284619
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47217	NC_011206	GCC	2	6	2506294	2506299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284619
47218	NC_011206	CGC	2	6	2506338	2506343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284619
47219	NC_011206	TTC	2	6	2506350	2506355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284619
47220	NC_011206	CCGCGC	2	12	2506362	2506373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284619
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47222	NC_011206	TGA	2	6	2506406	2506411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284619
47223	NC_011206	AAT	2	6	2506421	2506426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198284619
47224	NC_011206	CGG	2	6	2506448	2506453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284619
47225	NC_011206	GC	3	6	2506465	2506470	0 %	0 %	50 %	50 %	198284619
47226	NC_011206	GTC	2	6	2506476	2506481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284619
47227	NC_011206	TGC	2	6	2506525	2506530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284619
47228	NC_011206	AGT	2	6	2507030	2507035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284620
47229	NC_011206	T	7	7	2507073	2507079	0 %	100 %	0 %	0 %	198284620
47230	NC_011206	GCT	2	6	2507086	2507091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284620
47231	NC_011206	TGG	2	6	2507187	2507192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284620
47232	NC_011206	ACT	2	6	2507238	2507243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284620
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47234	NC_011206	CTG	2	6	2507321	2507326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284620
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47238	NC_011206	GCT	2	6	2507449	2507454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284620
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47260	NC_011206	CGGC	2	8	2508225	2508232	0 %	0 %	50 %	50 %	198284620
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47299	NC_011206	CGGCTG	2	12	2511132	2511143	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	198284624
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47304	NC_011206	TGA	2	6	2511416	2511421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284624
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47311	NC_011206	ATC	3	9	2512000	2512008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284625
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47314	NC_011206	TGA	2	6	2512094	2512099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284625
47315	NC_011206	TGC	2	6	2512142	2512147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284625
47316	NC_011206	CT	3	6	2512207	2512212	0 %	50 %	0 %	50 %	198284625
47317	NC_011206	CGT	2	6	2512281	2512286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284625
47318	NC_011206	TCC	2	6	2512316	2512321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284625
47319	NC_011206	CGC	2	6	2512335	2512340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284625
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47322	NC_011206	CGCC	2	8	2512394	2512401	0 %	0 %	25 %	75 %	198284625
47323	NC_011206	CGG	2	6	2512442	2512447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284625
47324	NC_011206	TTG	2	6	2512474	2512479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198284625
47325	NC_011206	GAT	2	6	2512532	2512537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284625
47326	NC_011206	ATC	2	6	2512671	2512676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284626
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47328	NC_011206	GC	4	8	2512753	2512760	0 %	0 %	50 %	50 %	198284626
47329	NC_011206	CGC	2	6	2512944	2512949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284626
47330	NC_011206	CTG	2	6	2512997	2513002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284626
47331	NC_011206	GCG	2	6	2513071	2513076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284626
47332	NC_011206	CTGG	2	8	2513137	2513144	0 %	25 %	50 %	25 %	198284626
47333	NC_011206	CTG	2	6	2513168	2513173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284626
47334	NC_011206	CGG	2	6	2513174	2513179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284626
47335	NC_011206	CCG	2	6	2513205	2513210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284626
47336	NC_011206	CCGGG	2	10	2513282	2513291	0 %	0 %	60 %	40 %	198284626
47337	NC_011206	CGC	2	6	2513314	2513319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284626
47338	NC_011206	C	7	7	2513335	2513341	0 %	0 %	0 %	100 %	198284626
47339	NC_011206	CGC	2	6	2513357	2513362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284626
47340	NC_011206	GTC	2	6	2513363	2513368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284626
47341	NC_011206	AGC	2	6	2513377	2513382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284626
47342	NC_011206	GGC	2	6	2513413	2513418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284626
47343	NC_011206	ACG	2	6	2513515	2513520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284626
47344	NC_011206	TC	3	6	2513548	2513553	0 %	50 %	0 %	50 %	198284626
47345	NC_011206	CGCCAC	2	12	2513554	2513565	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	198284626
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47352	NC_011206	CTG	2	6	2513870	2513875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284626
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47461	NC_011206	CCA	2	6	2518131	2518136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284627
47462	NC_011206	CATC	2	8	2518140	2518147	25 %	25 %	0 %	50 %	198284627
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47464	NC_011206	CTG	2	6	2518168	2518173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284627
47465	NC_011206	GCA	2	6	2518230	2518235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284627
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47468	NC_011206	CTG	2	6	2518351	2518356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284627
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47497	NC_011206	CTT	3	9	2519529	2519537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284627
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47499	NC_011206	GGCT	2	8	2519706	2519713	0 %	25 %	50 %	25 %	198284628
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