MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46009	NC_011206	GGA	2	6	2443841	2443846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284559
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46115	NC_011206	GGA	2	6	2448252	2448257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284564
46116	NC_011206	CAG	2	6	2448271	2448276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284564
46117	NC_011206	GCG	2	6	2448315	2448320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284564
46118	NC_011206	TGC	3	9	2448392	2448400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284564
46119	NC_011206	CGA	2	6	2448402	2448407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284564
46120	NC_011206	CG	3	6	2448432	2448437	0 %	0 %	50 %	50 %	198284564
46121	NC_011206	TGA	2	6	2448510	2448515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284564
46122	NC_011206	CGA	2	6	2448528	2448533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284564
46123	NC_011206	ATC	2	6	2448535	2448540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284564
46124	NC_011206	AAGA	2	8	2448565	2448572	75 %	0 %	25 %	0 %	198284564
46125	NC_011206	GC	3	6	2448590	2448595	0 %	0 %	50 %	50 %	198284564
46126	NC_011206	GCT	2	6	2448608	2448613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284564
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46129	NC_011206	GC	3	6	2448812	2448817	0 %	0 %	50 %	50 %	198284564
46130	NC_011206	GCA	2	6	2448826	2448831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284564
46131	NC_011206	ACC	2	6	2448844	2448849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284564
46132	NC_011206	CCACC	2	10	2448869	2448878	20 %	0 %	0 %	80 %	198284564
46133	NC_011206	TTC	2	6	2448955	2448960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284564
46134	NC_011206	CTG	2	6	2449021	2449026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284564
46135	NC_011206	ACG	2	6	2449051	2449056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284564
46136	NC_011206	TCC	2	6	2449087	2449092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284564
46137	NC_011206	CGG	2	6	2449223	2449228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284564
46138	NC_011206	CGG	2	6	2449249	2449254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284564
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46142	NC_011206	TGC	2	6	2449367	2449372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284564
46143	NC_011206	CGA	2	6	2449395	2449400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284564
46144	NC_011206	GC	3	6	2449426	2449431	0 %	0 %	50 %	50 %	198284564
46145	NC_011206	CAC	2	6	2449488	2449493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284564
46146	NC_011206	GTGC	2	8	2449579	2449586	0 %	25 %	50 %	25 %	198284564
46147	NC_011206	GCCATC	2	12	2449746	2449757	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	198284565
46148	NC_011206	CTG	2	6	2449779	2449784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284565
46149	NC_011206	CGT	2	6	2449835	2449840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284565
46150	NC_011206	CGG	2	6	2449855	2449860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284565
46151	NC_011206	GGC	2	6	2449878	2449883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284565
46152	NC_011206	GGCA	2	8	2449939	2449946	25 %	0 %	50 %	25 %	198284565
46153	NC_011206	GCC	2	6	2449996	2450001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284565
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46157	NC_011206	GC	3	6	2450117	2450122	0 %	0 %	50 %	50 %	198284565
46158	NC_011206	ATC	2	6	2450145	2450150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284565
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46164	NC_011206	CTG	2	6	2450475	2450480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284565
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46173	NC_011206	CA	3	6	2450776	2450781	50 %	0 %	0 %	50 %	198284565
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46177	NC_011206	CAG	2	6	2451017	2451022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284566
46178	NC_011206	CTG	3	9	2451119	2451127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284566
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46202	NC_011206	ACT	2	6	2452055	2452060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284567
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46217	NC_011206	T	6	6	2452962	2452967	0 %	100 %	0 %	0 %	198284569
46218	NC_011206	AGATC	2	10	2453110	2453119	40 %	20 %	20 %	20 %	198284570
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46220	NC_011206	TGC	2	6	2453197	2453202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284570
46221	NC_011206	TCG	2	6	2453221	2453226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284570
46222	NC_011206	GA	3	6	2453237	2453242	50 %	0 %	50 %	0 %	198284570
46223	NC_011206	GGA	2	6	2453254	2453259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284570
46224	NC_011206	CTG	2	6	2453321	2453326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284570
46225	NC_011206	GAG	2	6	2453396	2453401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284570
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46229	NC_011206	GCAGC	2	10	2453513	2453522	20 %	0 %	40 %	40 %	198284570
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46347	NC_011206	TGG	2	6	2461870	2461875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284577
46348	NC_011206	CGA	2	6	2461883	2461888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284577
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46433	NC_011206	TGG	2	6	2467203	2467208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284585
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46454	NC_011206	TTGTAT	2	12	2468771	2468782	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	198284588
46455	NC_011206	CT	3	6	2468866	2468871	0 %	50 %	0 %	50 %	198284588
46456	NC_011206	CAC	2	6	2468946	2468951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284588
46457	NC_011206	ATG	2	6	2468960	2468965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284588
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46460	NC_011206	GAA	2	6	2469028	2469033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284588
46461	NC_011206	CCTC	2	8	2469089	2469096	0 %	25 %	0 %	75 %	198284589
46462	NC_011206	CAA	2	6	2469116	2469121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284589
46463	NC_011206	CGTT	2	8	2469137	2469144	0 %	50 %	25 %	25 %	198284589
46464	NC_011206	ACCTCA	2	12	2469171	2469182	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	198284589
46465	NC_011206	GTC	2	6	2469185	2469190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284589
46466	NC_011206	ACGG	2	8	2469233	2469240	25 %	0 %	50 %	25 %	198284589
46467	NC_011206	TGC	2	6	2469325	2469330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284590
46468	NC_011206	CACC	2	8	2469363	2469370	25 %	0 %	0 %	75 %	198284590
46469	NC_011206	A	7	7	2469371	2469377	100 %	0 %	0 %	0 %	198284590
46470	NC_011206	ACG	2	6	2469409	2469414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284590
46471	NC_011206	CAC	2	6	2469430	2469435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284590
46472	NC_011206	GGC	2	6	2469461	2469466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284590
46473	NC_011206	TCC	2	6	2469481	2469486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284590
46474	NC_011206	A	6	6	2469532	2469537	100 %	0 %	0 %	0 %	198284590
46475	NC_011206	CA	3	6	2469562	2469567	50 %	0 %	0 %	50 %	198284590
46476	NC_011206	TCAG	2	8	2469651	2469658	25 %	25 %	25 %	25 %	198284591
46477	NC_011206	CGG	2	6	2469695	2469700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284591
46478	NC_011206	ATC	2	6	2469702	2469707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284591
46479	NC_011206	CTGG	2	8	2469764	2469771	0 %	25 %	50 %	25 %	198284591
46480	NC_011206	GCA	2	6	2469773	2469778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284591
46481	NC_011206	AG	3	6	2469783	2469788	50 %	0 %	50 %	0 %	198284591
46482	NC_011206	ATTG	2	8	2469812	2469819	25 %	50 %	25 %	0 %	198284591
46483	NC_011206	TG	3	6	2469822	2469827	0 %	50 %	50 %	0 %	198284591
46484	NC_011206	GCT	2	6	2470124	2470129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284592
46485	NC_011206	CTG	2	6	2470206	2470211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284592
46486	NC_011206	CCTG	2	8	2470347	2470354	0 %	25 %	25 %	50 %	198284592
46487	NC_011206	GAC	2	6	2470380	2470385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284592
46488	NC_011206	GCCCAT	2	12	2470386	2470397	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	198284592
46489	NC_011206	GGT	2	6	2470481	2470486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284592
46490	NC_011206	CGG	2	6	2470499	2470504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284592
46491	NC_011206	CGC	2	6	2470526	2470531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284592
46492	NC_011206	CGA	2	6	2470565	2470570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284592
46493	NC_011206	ACCA	2	8	2470575	2470582	50 %	0 %	0 %	50 %	198284592
46494	NC_011206	CTG	2	6	2470620	2470625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284592
46495	NC_011206	TCAC	2	8	2470651	2470658	25 %	25 %	0 %	50 %	198284592
46496	NC_011206	CAT	2	6	2470691	2470696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284592
46497	NC_011206	TAC	2	6	2470714	2470719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284592
46498	NC_011206	GCG	2	6	2470785	2470790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284592
46499	NC_011206	AGG	2	6	2470822	2470827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284592
46500	NC_011206	GCC	2	6	2470873	2470878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284592

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