MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45003	NC_011206	GGA	2	6	2396009	2396014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284511
45004	NC_011206	GCT	2	6	2396105	2396110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284511
45005	NC_011206	ATG	2	6	2396156	2396161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284511
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45008	NC_011206	TGCG	2	8	2396302	2396309	0 %	25 %	50 %	25 %	198284512
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45011	NC_011206	ACT	2	6	2396431	2396436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284512
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45013	NC_011206	TGG	2	6	2396503	2396508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284512
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45017	NC_011206	ATG	2	6	2396614	2396619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284512
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45229	NC_011206	CGG	2	6	2408321	2408326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284527
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45231	NC_011206	CCG	2	6	2408354	2408359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284527
45232	NC_011206	ATC	2	6	2408390	2408395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284527
45233	NC_011206	TCAG	2	8	2408579	2408586	25 %	25 %	25 %	25 %	198284528
45234	NC_011206	TTC	2	6	2408612	2408617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284528
45235	NC_011206	CTG	2	6	2408621	2408626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284528
45236	NC_011206	GGC	2	6	2408657	2408662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284528
45237	NC_011206	GGC	2	6	2408666	2408671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284528
45238	NC_011206	CCG	2	6	2408788	2408793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284528
45239	NC_011206	GCC	2	6	2408814	2408819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284528
45240	NC_011206	CGC	2	6	2408821	2408826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284528
45241	NC_011206	GTC	2	6	2408855	2408860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284528
45242	NC_011206	ACC	2	6	2408865	2408870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284528
45243	NC_011206	CAAC	2	8	2408909	2408916	50 %	0 %	0 %	50 %	198284528
45244	NC_011206	GA	3	6	2408920	2408925	50 %	0 %	50 %	0 %	198284528
45245	NC_011206	CCGG	2	8	2408928	2408935	0 %	0 %	50 %	50 %	198284528
45246	NC_011206	CGG	2	6	2408992	2408997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284528
45247	NC_011206	ATC	2	6	2409050	2409055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284528
45248	NC_011206	TGC	2	6	2409155	2409160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284528
45249	NC_011206	CCCA	2	8	2409171	2409178	25 %	0 %	0 %	75 %	198284528
45250	NC_011206	GATCCA	2	12	2409229	2409240	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	198284528
45251	NC_011206	GCC	2	6	2409312	2409317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284528
45252	NC_011206	CGCA	2	8	2409392	2409399	25 %	0 %	25 %	50 %	198284528
45253	NC_011206	AAG	2	6	2409437	2409442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284528
45254	NC_011206	GTG	2	6	2409447	2409452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284528
45255	NC_011206	GCAC	2	8	2409480	2409487	25 %	0 %	25 %	50 %	198284528
45256	NC_011206	CCG	2	6	2409528	2409533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284528
45257	NC_011206	GCA	2	6	2409547	2409552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284528
45258	NC_011206	CGG	2	6	2409562	2409567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284528
45259	NC_011206	GCC	2	6	2409619	2409624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284528
45260	NC_011206	G	6	6	2409644	2409649	0 %	0 %	100 %	0 %	198284529
45261	NC_011206	GTG	2	6	2409673	2409678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284529
45262	NC_011206	GCG	2	6	2409694	2409699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284529
45263	NC_011206	CTT	3	9	2409710	2409718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284529
45264	NC_011206	T	7	7	2409717	2409723	0 %	100 %	0 %	0 %	198284529
45265	NC_011206	CGG	2	6	2409783	2409788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284529
45266	NC_011206	ATC	2	6	2409823	2409828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284529
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45268	NC_011206	GCA	2	6	2409884	2409889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284529
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45290	NC_011206	CTG	2	6	2410914	2410919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284529
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45300	NC_011206	CGC	2	6	2411406	2411411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284529
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45309	NC_011206	CGCA	2	8	2411878	2411885	25 %	0 %	25 %	50 %	198284530
45310	NC_011206	CCA	2	6	2411968	2411973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284530
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45312	NC_011206	GCCG	2	8	2412083	2412090	0 %	0 %	50 %	50 %	198284530
45313	NC_011206	GC	5	10	2412126	2412135	0 %	0 %	50 %	50 %	198284530
45314	NC_011206	CG	3	6	2412149	2412154	0 %	0 %	50 %	50 %	198284530
45315	NC_011206	GC	3	6	2412217	2412222	0 %	0 %	50 %	50 %	198284530
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45317	NC_011206	GAC	2	6	2412346	2412351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284531
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45319	NC_011206	CCG	2	6	2412525	2412530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284531
45320	NC_011206	GGC	3	9	2412601	2412609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284531
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45325	NC_011206	CGC	2	6	2412781	2412786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284531
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45328	NC_011206	TGC	2	6	2412956	2412961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284531
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45331	NC_011206	CCA	2	6	2413170	2413175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284531
45332	NC_011206	TGC	2	6	2413218	2413223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284531
45333	NC_011206	GAT	2	6	2413293	2413298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284531
45334	NC_011206	GCC	2	6	2413331	2413336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284531
45335	NC_011206	TGC	2	6	2413346	2413351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284531
45336	NC_011206	GGC	2	6	2413388	2413393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284531
45337	NC_011206	GGA	2	6	2413405	2413410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284531
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45339	NC_011206	CAT	2	6	2413702	2413707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284532
45340	NC_011206	AGT	2	6	2413786	2413791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284532
45341	NC_011206	CCTG	2	8	2413812	2413819	0 %	25 %	25 %	50 %	198284532
45342	NC_011206	CAG	2	6	2413871	2413876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284532
45343	NC_011206	GC	3	6	2413907	2413912	0 %	0 %	50 %	50 %	198284532
45344	NC_011206	GCGG	2	8	2414018	2414025	0 %	0 %	75 %	25 %	198284532
45345	NC_011206	GCA	2	6	2414056	2414061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284532
45346	NC_011206	TGAA	2	8	2414115	2414122	50 %	25 %	25 %	0 %	198284532
45347	NC_011206	TCG	3	9	2414151	2414159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284532
45348	NC_011206	CTG	2	6	2414175	2414180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284532
45349	NC_011206	CCA	2	6	2414201	2414206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284532
45350	NC_011206	TGC	2	6	2414286	2414291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284532
45351	NC_011206	CGT	2	6	2414311	2414316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284532
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45353	NC_011206	CCG	2	6	2414346	2414351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284532
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45462	NC_011206	TGG	2	6	2419531	2419536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284537
45463	NC_011206	GCC	2	6	2419584	2419589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284537
45464	NC_011206	AC	3	6	2419658	2419663	50 %	0 %	0 %	50 %	198284537
45465	NC_011206	GAT	2	6	2419730	2419735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284537
45466	NC_011206	CCA	2	6	2419783	2419788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284537
45467	NC_011206	GC	3	6	2419794	2419799	0 %	0 %	50 %	50 %	198284537
45468	NC_011206	TGG	2	6	2419819	2419824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284537
45469	NC_011206	GAA	2	6	2419835	2419840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284537
45470	NC_011206	CAACGA	2	12	2419846	2419857	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	198284537
45471	NC_011206	GAC	2	6	2419862	2419867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284537
45472	NC_011206	GAGG	2	8	2419871	2419878	25 %	0 %	75 %	0 %	198284537
45473	NC_011206	CTTG	2	8	2419902	2419909	0 %	50 %	25 %	25 %	198284538
45474	NC_011206	GAT	2	6	2419948	2419953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284538
45475	NC_011206	G	7	7	2419974	2419980	0 %	0 %	100 %	0 %	198284538
45476	NC_011206	CAT	2	6	2419986	2419991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284538
45477	NC_011206	CGA	2	6	2419992	2419997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284538
45478	NC_011206	GCCA	2	8	2420000	2420007	25 %	0 %	25 %	50 %	198284538
45479	NC_011206	GTCCG	2	10	2420047	2420056	0 %	20 %	40 %	40 %	198284538
45480	NC_011206	GAC	2	6	2420059	2420064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284538
45481	NC_011206	CGG	2	6	2420139	2420144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284538
45482	NC_011206	GCA	2	6	2420145	2420150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284538
45483	NC_011206	CAGA	2	8	2420155	2420162	50 %	0 %	25 %	25 %	198284538
45484	NC_011206	GCA	2	6	2420181	2420186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284538
45485	NC_011206	AGC	2	6	2420201	2420206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284538
45486	NC_011206	GCC	2	6	2420228	2420233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284538
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45489	NC_011206	CTG	2	6	2420431	2420436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284539
45490	NC_011206	TGC	2	6	2420454	2420459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284539
45491	NC_011206	CCG	2	6	2420576	2420581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284539
45492	NC_011206	GCA	2	6	2420748	2420753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284539
45493	NC_011206	CAG	2	6	2420857	2420862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284539
45494	NC_011206	CAC	2	6	2420929	2420934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284539
45495	NC_011206	GCA	2	6	2420952	2420957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284539
45496	NC_011206	GCTG	2	8	2420982	2420989	0 %	25 %	50 %	25 %	198284539
45497	NC_011206	AGGTC	2	10	2420991	2421000	20 %	20 %	40 %	20 %	198284539
45498	NC_011206	GCC	2	6	2421094	2421099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284539
45499	NC_011206	CCT	2	6	2421258	2421263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284539
45500	NC_011206	AAT	2	6	2421270	2421275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198284539

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