MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011206	CTG	2	6	207466	207471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282365
4002	NC_011206	GCG	2	6	207504	207509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282365
4003	NC_011206	CGC	2	6	207570	207575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282365
4004	NC_011206	TGC	2	6	207645	207650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282365
4005	NC_011206	TCGC	2	8	207665	207672	0 %	25 %	25 %	50 %	198282365
4006	NC_011206	CAT	2	6	207688	207693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282365
4007	NC_011206	AAC	2	6	207763	207768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282365
4008	NC_011206	ACT	2	6	207773	207778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282365
4009	NC_011206	AAT	2	6	207787	207792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282365
4010	NC_011206	GCT	2	6	207808	207813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282365
4011	NC_011206	CT	4	8	207931	207938	0 %	50 %	0 %	50 %	198282365
4012	NC_011206	CTG	2	6	207961	207966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282365
4013	NC_011206	CTT	2	6	207967	207972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282365
4014	NC_011206	GGT	2	6	208016	208021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282365
4015	NC_011206	ACGC	2	8	208033	208040	25 %	0 %	25 %	50 %	198282365
4016	NC_011206	C	6	6	208040	208045	0 %	0 %	0 %	100 %	198282365
4017	NC_011206	AAT	2	6	208068	208073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282365
4018	NC_011206	GC	3	6	208094	208099	0 %	0 %	50 %	50 %	198282365
4019	NC_011206	CGG	2	6	208186	208191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282365
4020	NC_011206	GTC	2	6	208221	208226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282365
4021	NC_011206	TCC	2	6	208267	208272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282365
4022	NC_011206	ACC	2	6	208312	208317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282365
4023	NC_011206	CCA	2	6	208318	208323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282365
4024	NC_011206	GCC	2	6	208393	208398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282365
4025	NC_011206	TCT	2	6	208442	208447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282365
4026	NC_011206	GCA	2	6	208460	208465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282365
4027	NC_011206	GAG	2	6	208486	208491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282365
4028	NC_011206	CGG	2	6	208501	208506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282365
4029	NC_011206	ATG	2	6	208541	208546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282365
4030	NC_011206	TAGC	2	8	208557	208564	25 %	25 %	25 %	25 %	198282365
4031	NC_011206	CCT	2	6	208566	208571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282365
4032	NC_011206	GAGC	2	8	208602	208609	25 %	0 %	50 %	25 %	198282365
4033	NC_011206	CCA	2	6	208671	208676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282365
4034	NC_011206	TCCAC	2	10	208704	208713	20 %	20 %	0 %	60 %	198282365
4035	NC_011206	CGC	2	6	208918	208923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282366
4036	NC_011206	CAA	2	6	209024	209029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282366
4037	NC_011206	CTT	2	6	209039	209044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282366
4038	NC_011206	CCA	2	6	209052	209057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282366
4039	NC_011206	AT	3	6	209116	209121	50 %	50 %	0 %	0 %	198282366
4040	NC_011206	CGC	2	6	209195	209200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282366
4041	NC_011206	TCA	2	6	209241	209246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282366
4042	NC_011206	CGT	2	6	209311	209316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282366
4043	NC_011206	ATC	2	6	209374	209379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282366
4044	NC_011206	GTG	2	6	209419	209424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282366
4045	NC_011206	GACA	2	8	209455	209462	50 %	0 %	25 %	25 %	198282366
4046	NC_011206	CTT	2	6	209532	209537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282366
4047	NC_011206	GC	3	6	209545	209550	0 %	0 %	50 %	50 %	198282366
4048	NC_011206	GAA	2	6	209736	209741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282367
4049	NC_011206	ATAG	2	8	209750	209757	50 %	25 %	25 %	0 %	198282367
4050	NC_011206	CCA	2	6	209815	209820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282367
4051	NC_011206	GAT	2	6	209852	209857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282367
4052	NC_011206	TAGC	2	8	209881	209888	25 %	25 %	25 %	25 %	198282367
4053	NC_011206	CCG	2	6	209901	209906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282367
4054	NC_011206	ACA	2	6	209950	209955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282367
4055	NC_011206	CAA	2	6	209968	209973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282367
4056	NC_011206	TTC	2	6	209990	209995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282367
4057	NC_011206	GTT	2	6	210051	210056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282367
4058	NC_011206	TAT	2	6	210165	210170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282368
4059	NC_011206	TAG	2	6	210263	210268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282368
4060	NC_011206	ATT	2	6	210416	210421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282368
4061	NC_011206	ATA	2	6	210428	210433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282368
4062	NC_011206	ATC	2	6	210454	210459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282368
4063	NC_011206	T	8	8	210652	210659	0 %	100 %	0 %	0 %	198282369
4064	NC_011206	ATCA	2	8	210803	210810	50 %	25 %	0 %	25 %	198282369
4065	NC_011206	CCA	2	6	210823	210828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282369
4066	NC_011206	CAT	2	6	210833	210838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282369
4067	NC_011206	T	6	6	210865	210870	0 %	100 %	0 %	0 %	198282369
4068	NC_011206	A	6	6	210993	210998	100 %	0 %	0 %	0 %	198282369
4069	NC_011206	TCA	2	6	211023	211028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282369
4070	NC_011206	ATT	2	6	211065	211070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282369
4071	NC_011206	TCT	2	6	211151	211156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282369
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4073	NC_011206	TCAT	2	8	211285	211292	25 %	50 %	0 %	25 %	198282370
4074	NC_011206	GTT	2	6	211372	211377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282370
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4080	NC_011206	TGC	2	6	211821	211826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282370
4081	NC_011206	TCGG	2	8	211871	211878	0 %	25 %	50 %	25 %	198282370
4082	NC_011206	GGTAGA	2	12	211880	211891	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	198282370
4083	NC_011206	GCT	2	6	211909	211914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282370
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4087	NC_011206	TGG	2	6	212148	212153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282370
4088	NC_011206	T	7	7	212159	212165	0 %	100 %	0 %	0 %	198282370
4089	NC_011206	TGC	2	6	212202	212207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282370
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4091	NC_011206	TGAT	2	8	212261	212268	25 %	50 %	25 %	0 %	198282370
4092	NC_011206	GGC	2	6	212284	212289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282370
4093	NC_011206	TCT	2	6	212319	212324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282370
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4103	NC_011206	TGG	2	6	212808	212813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282370
4104	NC_011206	AGG	2	6	213041	213046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282370
4105	NC_011206	CGG	2	6	213090	213095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282370
4106	NC_011206	TAG	2	6	213104	213109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282370
4107	NC_011206	GCC	2	6	213124	213129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282370
4108	NC_011206	GGC	2	6	213148	213153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282370
4109	NC_011206	GATG	2	8	213265	213272	25 %	25 %	50 %	0 %	198282370
4110	NC_011206	TGG	2	6	213279	213284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282370
4111	NC_011206	CGA	2	6	213372	213377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282370
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4113	NC_011206	CAGC	2	8	213509	213516	25 %	0 %	25 %	50 %	198282370
4114	NC_011206	TTCA	2	8	213559	213566	25 %	50 %	0 %	25 %	198282370
4115	NC_011206	AGG	2	6	213606	213611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282371
4116	NC_011206	TCG	2	6	213624	213629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282371
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4119	NC_011206	CGGGAA	2	12	213728	213739	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	198282371
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4121	NC_011206	TA	3	6	213836	213841	50 %	50 %	0 %	0 %	198282371
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4243	NC_011206	TGG	2	6	221110	221115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282379
4244	NC_011206	CGGG	2	8	221217	221224	0 %	0 %	75 %	25 %	198282379
4245	NC_011206	CG	4	8	221252	221259	0 %	0 %	50 %	50 %	198282379
4246	NC_011206	GGC	2	6	221288	221293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282379
4247	NC_011206	GGC	3	9	221303	221311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282379
4248	NC_011206	AACCGC	2	12	221358	221369	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	198282379
4249	NC_011206	ATC	2	6	221667	221672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282379
4250	NC_011206	GGC	2	6	221691	221696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282379
4251	NC_011206	GCGG	2	8	221714	221721	0 %	0 %	75 %	25 %	198282379
4252	NC_011206	GGAC	2	8	221765	221772	25 %	0 %	50 %	25 %	198282379
4253	NC_011206	C	6	6	221842	221847	0 %	0 %	0 %	100 %	198282379
4254	NC_011206	CTCC	2	8	221908	221915	0 %	25 %	0 %	75 %	198282379
4255	NC_011206	CCG	2	6	221992	221997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282379
4256	NC_011206	TCA	2	6	222038	222043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282379
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4258	NC_011206	ATCGC	2	10	222106	222115	20 %	20 %	20 %	40 %	198282379
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4260	NC_011206	GCA	2	6	222250	222255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282379
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4263	NC_011206	ATG	2	6	222777	222782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282379
4264	NC_011206	GAT	2	6	222804	222809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282379
4265	NC_011206	ATC	2	6	222819	222824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282379
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4267	NC_011206	CCG	2	6	222907	222912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282379
4268	NC_011206	GCGA	2	8	222946	222953	25 %	0 %	50 %	25 %	198282379
4269	NC_011206	ACT	2	6	223019	223024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282379
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4272	NC_011206	GGT	2	6	223415	223420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282379
4273	NC_011206	GGC	2	6	223455	223460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282379
4274	NC_011206	AGG	2	6	223483	223488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282379
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4276	NC_011206	A	6	6	223732	223737	100 %	0 %	0 %	0 %	198282379
4277	NC_011206	GC	3	6	223743	223748	0 %	0 %	50 %	50 %	198282379
4278	NC_011206	CGGGCG	2	12	223782	223793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282379
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4280	NC_011206	TGGT	2	8	223855	223862	0 %	50 %	50 %	0 %	198282379
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4300	NC_011206	TGG	2	6	224734	224739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282379
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4347	NC_011206	GCACT	2	10	227529	227538	20 %	20 %	20 %	40 %	198282384
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4350	NC_011206	C	6	6	227819	227824	0 %	0 %	0 %	100 %	198282384
4351	NC_011206	GCA	2	6	227889	227894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282384
4352	NC_011206	ATG	2	6	227944	227949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282384
4353	NC_011206	AGA	2	6	227950	227955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282384
4354	NC_011206	CG	3	6	227994	227999	0 %	0 %	50 %	50 %	198282384
4355	NC_011206	CACG	2	8	228090	228097	25 %	0 %	25 %	50 %	198282384
4356	NC_011206	ATG	2	6	228151	228156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282384
4357	NC_011206	TCCA	2	8	228176	228183	25 %	25 %	0 %	50 %	198282384
4358	NC_011206	GA	3	6	228223	228228	50 %	0 %	50 %	0 %	198282384
4359	NC_011206	CAGC	2	8	228273	228280	25 %	0 %	25 %	50 %	198282384
4360	NC_011206	GCA	2	6	228344	228349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282384
4361	NC_011206	GCC	2	6	228422	228427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282384
4362	NC_011206	CCG	2	6	228456	228461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282384
4363	NC_011206	GGTGAC	2	12	228518	228529	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198282384
4364	NC_011206	CG	3	6	228534	228539	0 %	0 %	50 %	50 %	198282384
4365	NC_011206	GCC	2	6	228603	228608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282384
4366	NC_011206	TGC	2	6	228782	228787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282384
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4369	NC_011206	G	6	6	229079	229084	0 %	0 %	100 %	0 %	198282385
4370	NC_011206	CTG	2	6	229165	229170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282385
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4484	NC_011206	CTG	2	6	234259	234264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282391
4485	NC_011206	CGT	2	6	234402	234407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282391
4486	NC_011206	CCG	2	6	234511	234516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282391
4487	NC_011206	CCG	2	6	234626	234631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282391
4488	NC_011206	GGT	2	6	234639	234644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282391
4489	NC_011206	CGT	2	6	234723	234728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282391
4490	NC_011206	CCG	2	6	234737	234742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282391
4491	NC_011206	CTT	2	6	234783	234788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282391
4492	NC_011206	CCG	2	6	234879	234884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282391
4493	NC_011206	TGA	2	6	234968	234973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282391
4494	NC_011206	CTG	2	6	235003	235008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282391
4495	NC_011206	TGGG	2	8	235208	235215	0 %	25 %	75 %	0 %	198282391
4496	NC_011206	T	6	6	235252	235257	0 %	100 %	0 %	0 %	198282391
4497	NC_011206	GCA	2	6	235266	235271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282391
4498	NC_011206	GAT	2	6	235276	235281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282391
4499	NC_011206	GGC	2	6	235290	235295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282391
4500	NC_011206	TGGCC	2	10	235386	235395	0 %	20 %	40 %	40 %	198282391

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