MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_011206	ACA	2	6	2336363	2336368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284449
44003	NC_011206	GCG	2	6	2336396	2336401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284449
44004	NC_011206	TTC	3	9	2336453	2336461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284449
44005	NC_011206	TCG	2	6	2336856	2336861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284450
44006	NC_011206	CTG	2	6	2336954	2336959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284450
44007	NC_011206	GCC	2	6	2336966	2336971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284450
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44009	NC_011206	CAT	2	6	2337097	2337102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284450
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44011	NC_011206	CCG	2	6	2337192	2337197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284450
44012	NC_011206	GAA	2	6	2337218	2337223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284450
44013	NC_011206	CTG	2	6	2337236	2337241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284450
44014	NC_011206	CGC	2	6	2337268	2337273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284450
44015	NC_011206	TGC	2	6	2337300	2337305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284450
44016	NC_011206	GCG	2	6	2337317	2337322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284450
44017	NC_011206	AC	3	6	2337359	2337364	50 %	0 %	0 %	50 %	198284450
44018	NC_011206	GCGCG	2	10	2337442	2337451	0 %	0 %	60 %	40 %	198284450
44019	NC_011206	GCA	2	6	2337471	2337476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284450
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44022	NC_011206	TGA	3	9	2337591	2337599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284450
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44031	NC_011206	GC	3	6	2338057	2338062	0 %	0 %	50 %	50 %	198284452
44032	NC_011206	GCC	2	6	2338071	2338076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284452
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44052	NC_011206	GCA	2	6	2339205	2339210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284453
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44054	NC_011206	GCCA	2	8	2339288	2339295	25 %	0 %	25 %	50 %	198284453
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44104	NC_011206	GCG	2	6	2341014	2341019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284455
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44116	NC_011206	TTG	2	6	2341716	2341721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198284457
44117	NC_011206	T	6	6	2341742	2341747	0 %	100 %	0 %	0 %	198284457
44118	NC_011206	GTC	2	6	2341812	2341817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284457
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44120	NC_011206	ATG	2	6	2341837	2341842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284457
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44123	NC_011206	CCTGGG	2	12	2342045	2342056	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	198284457
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44127	NC_011206	TCA	2	6	2342285	2342290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284457
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44133	NC_011206	CAGC	2	8	2342741	2342748	25 %	0 %	25 %	50 %	198284458
44134	NC_011206	CAG	2	6	2342801	2342806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284458
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44142	NC_011206	CCA	2	6	2343172	2343177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284458
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44144	NC_011206	GCC	2	6	2343267	2343272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284458
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44146	NC_011206	GGC	3	9	2343305	2343313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284458
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44173	NC_011206	ACCA	2	8	2344507	2344514	50 %	0 %	0 %	50 %	198284460
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44200	NC_011206	CTG	2	6	2345810	2345815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284461
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44203	NC_011206	GAC	2	6	2345882	2345887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284461
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44210	NC_011206	CTG	2	6	2346210	2346215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284462
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44213	NC_011206	CG	3	6	2346323	2346328	0 %	0 %	50 %	50 %	198284462
44214	NC_011206	TGA	2	6	2346346	2346351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284462
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44216	NC_011206	GCC	2	6	2346400	2346405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284462
44217	NC_011206	G	8	8	2346407	2346414	0 %	0 %	100 %	0 %	198284462
44218	NC_011206	GTG	2	6	2346438	2346443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284462
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44220	NC_011206	GC	3	6	2346611	2346616	0 %	0 %	50 %	50 %	198284463
44221	NC_011206	GT	3	6	2346651	2346656	0 %	50 %	50 %	0 %	198284463
44222	NC_011206	CAA	2	6	2346794	2346799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284464
44223	NC_011206	TCC	2	6	2346843	2346848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284464
44224	NC_011206	CTG	2	6	2346872	2346877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284464
44225	NC_011206	CTT	2	6	2346934	2346939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284464
44226	NC_011206	CTG	2	6	2346965	2346970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284464
44227	NC_011206	CAC	2	6	2347073	2347078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284464
44228	NC_011206	CAT	2	6	2347109	2347114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284464
44229	NC_011206	CCGC	2	8	2347153	2347160	0 %	0 %	25 %	75 %	198284464
44230	NC_011206	ATG	2	6	2347167	2347172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284464
44231	NC_011206	CCA	2	6	2347237	2347242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284464
44232	NC_011206	CTG	2	6	2347253	2347258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284464
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44235	NC_011206	CGT	2	6	2347334	2347339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284464
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44242	NC_011206	CG	3	6	2347665	2347670	0 %	0 %	50 %	50 %	198284464
44243	NC_011206	GCA	3	9	2347672	2347680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284464
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44258	NC_011206	GCG	2	6	2348416	2348421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284464
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44301	NC_011206	GAT	2	6	2350556	2350561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284467
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44317	NC_011206	CAC	2	6	2351153	2351158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284467
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44324	NC_011206	CGCTGC	2	12	2351347	2351358	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	198284467
44325	NC_011206	TGA	2	6	2351359	2351364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284467
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44328	NC_011206	GCCG	2	8	2351436	2351443	0 %	0 %	50 %	50 %	198284467
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44332	NC_011206	CGT	2	6	2351733	2351738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284468
44333	NC_011206	CAC	2	6	2351774	2351779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284468
44334	NC_011206	CCT	2	6	2351815	2351820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284468
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44338	NC_011206	GC	3	6	2351862	2351867	0 %	0 %	50 %	50 %	198284468
44339	NC_011206	CCA	2	6	2351968	2351973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284468
44340	NC_011206	CGCC	2	8	2351990	2351997	0 %	0 %	25 %	75 %	198284468
44341	NC_011206	GCA	2	6	2352037	2352042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284468
44342	NC_011206	ACC	2	6	2352060	2352065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284468
44343	NC_011206	TC	3	6	2352176	2352181	0 %	50 %	0 %	50 %	198284468
44344	NC_011206	CCA	2	6	2352208	2352213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284468
44345	NC_011206	GCA	2	6	2352294	2352299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284468
44346	NC_011206	GCA	2	6	2352373	2352378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284468
44347	NC_011206	CCGGC	2	10	2352391	2352400	0 %	0 %	40 %	60 %	198284468
44348	NC_011206	CCG	3	9	2352412	2352420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284468
44349	NC_011206	TGACC	2	10	2352436	2352445	20 %	20 %	20 %	40 %	198284468
44350	NC_011206	GAT	2	6	2352464	2352469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284468
44351	NC_011206	GCC	2	6	2352617	2352622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284468
44352	NC_011206	GCA	2	6	2352708	2352713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284468
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44356	NC_011206	CCG	2	6	2352963	2352968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284469
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44448	NC_011206	TCAC	2	8	2358148	2358155	25 %	25 %	0 %	50 %	198284474
44449	NC_011206	GCA	3	9	2358214	2358222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284474
44450	NC_011206	ACT	2	6	2358246	2358251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284474
44451	NC_011206	TGA	2	6	2358257	2358262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284474
44452	NC_011206	T	6	6	2358333	2358338	0 %	100 %	0 %	0 %	198284474
44453	NC_011206	TGG	2	6	2358422	2358427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284474
44454	NC_011206	TCG	2	6	2358460	2358465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284474
44455	NC_011206	GCA	2	6	2358500	2358505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284474
44456	NC_011206	CTG	2	6	2358561	2358566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284474
44457	NC_011206	GC	4	8	2358605	2358612	0 %	0 %	50 %	50 %	198284474
44458	NC_011206	TAA	2	6	2358750	2358755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198284474
44459	NC_011206	CATG	2	8	2358847	2358854	25 %	25 %	25 %	25 %	198284474
44460	NC_011206	TGG	2	6	2358891	2358896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284474
44461	NC_011206	GAG	2	6	2359105	2359110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284475
44462	NC_011206	ATG	2	6	2359111	2359116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284475
44463	NC_011206	CT	3	6	2359118	2359123	0 %	50 %	0 %	50 %	198284475
44464	NC_011206	CAG	2	6	2359244	2359249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284476
44465	NC_011206	GGC	2	6	2359590	2359595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284477
44466	NC_011206	TGC	2	6	2359710	2359715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284477
44467	NC_011206	ACC	2	6	2359735	2359740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284477
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44469	NC_011206	ATC	2	6	2359986	2359991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284478
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44471	NC_011206	ATG	2	6	2360002	2360007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284478
44472	NC_011206	A	7	7	2360070	2360076	100 %	0 %	0 %	0 %	198284478
44473	NC_011206	T	6	6	2360344	2360349	0 %	100 %	0 %	0 %	198284479
44474	NC_011206	TGA	2	6	2360380	2360385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284479
44475	NC_011206	CAA	2	6	2360439	2360444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284479
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44477	NC_011206	CGG	3	9	2360496	2360504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284479
44478	NC_011206	TCACA	2	10	2361640	2361649	40 %	20 %	0 %	40 %	198284480
44479	NC_011206	AGCC	2	8	2361656	2361663	25 %	0 %	25 %	50 %	198284480
44480	NC_011206	CAT	2	6	2361732	2361737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284480
44481	NC_011206	CTC	2	6	2361810	2361815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284480
44482	NC_011206	GCC	2	6	2361825	2361830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284480
44483	NC_011206	GCC	2	6	2361883	2361888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284480
44484	NC_011206	AAT	2	6	2361909	2361914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198284480
44485	NC_011206	CCG	2	6	2361983	2361988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284480
44486	NC_011206	CTG	2	6	2361994	2361999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284480
44487	NC_011206	CCG	2	6	2362124	2362129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284480
44488	NC_011206	TTTC	2	8	2362301	2362308	0 %	75 %	0 %	25 %	198284480
44489	NC_011206	AGC	2	6	2362339	2362344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284480
44490	NC_011206	GCC	2	6	2362377	2362382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284480
44491	NC_011206	GCC	2	6	2362425	2362430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284480
44492	NC_011206	GCGTC	2	10	2362517	2362526	0 %	20 %	40 %	40 %	198284480
44493	NC_011206	GCT	2	6	2362574	2362579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284480
44494	NC_011206	CCA	2	6	2362693	2362698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284480
44495	NC_011206	GTC	2	6	2362782	2362787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284480
44496	NC_011206	CCG	2	6	2362789	2362794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284480
44497	NC_011206	CCG	2	6	2362864	2362869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284480
44498	NC_011206	C	6	6	2362928	2362933	0 %	0 %	0 %	100 %	198284480
44499	NC_011206	GAC	2	6	2363127	2363132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284481
44500	NC_011206	CTG	2	6	2363143	2363148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284481

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