MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_011206	ATG	2	6	2287756	2287761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284400
43002	NC_011206	GCC	2	6	2287767	2287772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284400
43003	NC_011206	CG	4	8	2288030	2288037	0 %	0 %	50 %	50 %	198284400
43004	NC_011206	TGA	2	6	2288081	2288086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284400
43005	NC_011206	CGG	2	6	2288121	2288126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284400
43006	NC_011206	GGCG	2	8	2288219	2288226	0 %	0 %	75 %	25 %	198284400
43007	NC_011206	ACC	2	6	2288232	2288237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284400
43008	NC_011206	CGG	2	6	2288322	2288327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284400
43009	NC_011206	GCC	2	6	2288425	2288430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284400
43010	NC_011206	A	6	6	2288465	2288470	100 %	0 %	0 %	0 %	198284400
43011	NC_011206	GAC	2	6	2288513	2288518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284401
43012	NC_011206	CCA	2	6	2288586	2288591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284401
43013	NC_011206	ACA	2	6	2288598	2288603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284401
43014	NC_011206	GCG	2	6	2288675	2288680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284401
43015	NC_011206	CGGGCA	2	12	2288744	2288755	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	198284401
43016	NC_011206	GCGG	2	8	2288779	2288786	0 %	0 %	75 %	25 %	198284401
43017	NC_011206	TCC	2	6	2288801	2288806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284401
43018	NC_011206	CTGC	2	8	2289024	2289031	0 %	25 %	25 %	50 %	198284401
43019	NC_011206	CGG	3	9	2289147	2289155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284401
43020	NC_011206	CGG	2	6	2289166	2289171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284401
43021	NC_011206	GCGCT	2	10	2289283	2289292	0 %	20 %	40 %	40 %	198284401
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43028	NC_011206	TTG	2	6	2289785	2289790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198284401
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43033	NC_011206	CGG	2	6	2289963	2289968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284401
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43036	NC_011206	T	6	6	2290100	2290105	0 %	100 %	0 %	0 %	198284401
43037	NC_011206	CCGC	2	8	2290107	2290114	0 %	0 %	25 %	75 %	198284401
43038	NC_011206	GCCTGT	7	42	2290118	2290159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284401
43039	NC_011206	GCCTGA	6	36	2290160	2290195	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	198284401
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43052	NC_011206	TTG	2	6	2290947	2290952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198284402
43053	NC_011206	AG	3	6	2291173	2291178	50 %	0 %	50 %	0 %	198284402
43054	NC_011206	CGA	2	6	2291186	2291191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284402
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43064	NC_011206	CGA	2	6	2291660	2291665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284402
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43085	NC_011206	GGCGAT	2	12	2292121	2292132	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198284403
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43087	NC_011206	TGA	2	6	2292207	2292212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284403
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43100	NC_011206	CAGC	2	8	2292936	2292943	25 %	0 %	25 %	50 %	198284403
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43331	NC_011206	CG	3	6	2302221	2302226	0 %	0 %	50 %	50 %	198284411
43332	NC_011206	CGA	2	6	2302238	2302243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284411
43333	NC_011206	GAT	2	6	2302283	2302288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284411
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43335	NC_011206	TCG	2	6	2302440	2302445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284411
43336	NC_011206	TGA	2	6	2302456	2302461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284411
43337	NC_011206	GCAGAT	2	12	2302603	2302614	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	198284411
43338	NC_011206	CTG	2	6	2302625	2302630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284411
43339	NC_011206	CTG	2	6	2302640	2302645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284411
43340	NC_011206	GC	3	6	2302681	2302686	0 %	0 %	50 %	50 %	198284411
43341	NC_011206	GTC	2	6	2302697	2302702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284411
43342	NC_011206	TCC	2	6	2302716	2302721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284412
43343	NC_011206	GCC	2	6	2302858	2302863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284412
43344	NC_011206	CAC	3	9	2302984	2302992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284412
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43346	NC_011206	T	7	7	2303040	2303046	0 %	100 %	0 %	0 %	198284412
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43462	NC_011206	GC	3	6	2307005	2307010	0 %	0 %	50 %	50 %	198284416
43463	NC_011206	CCCAGA	2	12	2307013	2307024	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	198284416
43464	NC_011206	CCA	2	6	2307080	2307085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284416
43465	NC_011206	TGA	2	6	2307095	2307100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284416
43466	NC_011206	CGC	2	6	2307105	2307110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284416
43467	NC_011206	CGCC	2	8	2307176	2307183	0 %	0 %	25 %	75 %	198284416
43468	NC_011206	CCA	2	6	2307185	2307190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284416
43469	NC_011206	GCA	2	6	2307209	2307214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284416
43470	NC_011206	GCG	3	9	2307226	2307234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284416
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43473	NC_011206	GC	3	6	2307260	2307265	0 %	0 %	50 %	50 %	198284416
43474	NC_011206	GCA	2	6	2307290	2307295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284416
43475	NC_011206	C	6	6	2307368	2307373	0 %	0 %	0 %	100 %	198284416
43476	NC_011206	TCC	2	6	2307400	2307405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284416
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43478	NC_011206	CAT	2	6	2307905	2307910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284417
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43480	NC_011206	GGT	2	6	2307956	2307961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284417
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43483	NC_011206	GTC	2	6	2308032	2308037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284417
43484	NC_011206	G	6	6	2308231	2308236	0 %	0 %	100 %	0 %	198284418
43485	NC_011206	CGG	2	6	2308295	2308300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284418
43486	NC_011206	CGG	2	6	2308370	2308375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284418
43487	NC_011206	GAC	2	6	2308377	2308382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284418
43488	NC_011206	TGG	2	6	2308466	2308471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284418
43489	NC_011206	GAG	2	6	2308497	2308502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284418
43490	NC_011206	CAG	2	6	2308584	2308589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284418
43491	NC_011206	GACGC	2	10	2308638	2308647	20 %	0 %	40 %	40 %	198284418
43492	NC_011206	GGC	2	6	2308734	2308739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284418
43493	NC_011206	CGG	2	6	2308781	2308786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284418
43494	NC_011206	TGC	2	6	2308819	2308824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284418
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43496	NC_011206	CGG	2	6	2309035	2309040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284418
43497	NC_011206	CAG	2	6	2309165	2309170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284418
43498	NC_011206	CGG	2	6	2309176	2309181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284418
43499	NC_011206	ATT	2	6	2309250	2309255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198284418
43500	NC_011206	GGC	2	6	2309276	2309281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284418

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