MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42004	NC_011206	CGA	2	6	2233467	2233472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284349
42005	NC_011206	CGC	2	6	2233475	2233480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284349
42006	NC_011206	GGC	2	6	2233496	2233501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284349
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42116	NC_011206	CAT	2	6	2238670	2238675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284352
42117	NC_011206	ACC	2	6	2239121	2239126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284353
42118	NC_011206	TCG	2	6	2239186	2239191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284353
42119	NC_011206	CAA	2	6	2239192	2239197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284353
42120	NC_011206	GGC	2	6	2239265	2239270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284353
42121	NC_011206	GC	4	8	2239284	2239291	0 %	0 %	50 %	50 %	198284353
42122	NC_011206	GCC	2	6	2239308	2239313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284353
42123	NC_011206	G	6	6	2239354	2239359	0 %	0 %	100 %	0 %	198284353
42124	NC_011206	GAG	2	6	2239457	2239462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284353
42125	NC_011206	CG	4	8	2239463	2239470	0 %	0 %	50 %	50 %	198284353
42126	NC_011206	CGC	2	6	2239475	2239480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284353
42127	NC_011206	GCG	2	6	2239490	2239495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284353
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42129	NC_011206	GC	3	6	2239573	2239578	0 %	0 %	50 %	50 %	198284353
42130	NC_011206	CGA	2	6	2239585	2239590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284353
42131	NC_011206	CCG	2	6	2239611	2239616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284353
42132	NC_011206	ACG	2	6	2239659	2239664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284353
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42135	NC_011206	CCG	2	6	2239917	2239922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284353
42136	NC_011206	CCGG	2	8	2239927	2239934	0 %	0 %	50 %	50 %	198284353
42137	NC_011206	CTT	2	6	2239987	2239992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284353
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42139	NC_011206	ACC	2	6	2240192	2240197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284353
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42142	NC_011206	GTGC	2	8	2240291	2240298	0 %	25 %	50 %	25 %	198284353
42143	NC_011206	TCA	2	6	2240310	2240315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284353
42144	NC_011206	CGT	2	6	2240341	2240346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284353
42145	NC_011206	CGG	2	6	2240373	2240378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284353
42146	NC_011206	GGC	2	6	2240393	2240398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284353
42147	NC_011206	CGA	2	6	2240482	2240487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284353
42148	NC_011206	CCG	3	9	2240488	2240496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284353
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42151	NC_011206	GTT	2	6	2240677	2240682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198284353
42152	NC_011206	GCA	3	9	2240788	2240796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284353
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42158	NC_011206	GC	3	6	2241059	2241064	0 %	0 %	50 %	50 %	198284353
42159	NC_011206	CCGG	2	8	2241082	2241089	0 %	0 %	50 %	50 %	198284353
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42162	NC_011206	CGTGGA	2	12	2241331	2241342	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198284353
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42178	NC_011206	CAT	2	6	2242120	2242125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284354
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42201	NC_011206	CGG	2	6	2243086	2243091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284354
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42219	NC_011206	TGC	2	6	2244798	2244803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284356
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42222	NC_011206	C	7	7	2244867	2244873	0 %	0 %	0 %	100 %	198284356
42223	NC_011206	CAA	2	6	2244958	2244963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284356
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42225	NC_011206	T	6	6	2245139	2245144	0 %	100 %	0 %	0 %	198284356
42226	NC_011206	TGT	2	6	2245146	2245151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198284356
42227	NC_011206	GGC	2	6	2245162	2245167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284356
42228	NC_011206	TTTGT	2	10	2245187	2245196	0 %	80 %	20 %	0 %	198284356
42229	NC_011206	TCA	2	6	2245212	2245217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284356
42230	NC_011206	CGC	2	6	2245255	2245260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284356
42231	NC_011206	CGG	2	6	2245342	2245347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284356
42232	NC_011206	TGC	2	6	2245350	2245355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284356
42233	NC_011206	TGG	2	6	2245362	2245367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284356
42234	NC_011206	CCG	2	6	2245392	2245397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284356
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42236	NC_011206	A	7	7	2245479	2245485	100 %	0 %	0 %	0 %	198284356
42237	NC_011206	CGG	2	6	2245556	2245561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284357
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42240	NC_011206	GCT	2	6	2245632	2245637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284357
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42242	NC_011206	GTC	2	6	2245822	2245827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284357
42243	NC_011206	GAT	2	6	2245889	2245894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284358
42244	NC_011206	TACCTA	2	12	2245925	2245936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284358
42245	NC_011206	GCAG	2	8	2245961	2245968	25 %	0 %	50 %	25 %	198284358
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42248	NC_011206	CCTGC	2	10	2246141	2246150	0 %	20 %	20 %	60 %	198284358
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42252	NC_011206	CGC	2	6	2246339	2246344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284358
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42254	NC_011206	CAT	2	6	2246504	2246509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284358
42255	NC_011206	GGA	2	6	2246585	2246590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284358
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42258	NC_011206	GCA	2	6	2247086	2247091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284359
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42260	NC_011206	CGC	2	6	2247163	2247168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284359
42261	NC_011206	GAC	2	6	2247184	2247189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284359
42262	NC_011206	AG	3	6	2247239	2247244	50 %	0 %	50 %	0 %	198284359
42263	NC_011206	GCG	2	6	2247252	2247257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284359
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42265	NC_011206	CAGA	2	8	2247275	2247282	50 %	0 %	25 %	25 %	198284359
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42303	NC_011206	TA	3	6	2252706	2252711	50 %	50 %	0 %	0 %	198284366
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42317	NC_011206	CCGC	2	8	2253245	2253252	0 %	0 %	25 %	75 %	198284367
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42320	NC_011206	CGG	2	6	2253445	2253450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284367
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42332	NC_011206	GAA	2	6	2254265	2254270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284368
42333	NC_011206	GCC	2	6	2254380	2254385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284368
42334	NC_011206	GGC	2	6	2254638	2254643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284369
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42336	NC_011206	CGGC	2	8	2254732	2254739	0 %	0 %	50 %	50 %	198284369
42337	NC_011206	GGC	2	6	2254743	2254748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284369
42338	NC_011206	GTC	2	6	2254786	2254791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284369
42339	NC_011206	GGC	2	6	2254836	2254841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284369
42340	NC_011206	GAT	2	6	2254874	2254879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284369
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42342	NC_011206	CG	3	6	2255022	2255027	0 %	0 %	50 %	50 %	198284369
42343	NC_011206	GAGCC	2	10	2255034	2255043	20 %	0 %	40 %	40 %	198284369
42344	NC_011206	T	6	6	2255067	2255072	0 %	100 %	0 %	0 %	198284369
42345	NC_011206	TGA	2	6	2255081	2255086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284369
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42347	NC_011206	GCT	2	6	2255175	2255180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284369
42348	NC_011206	AGGC	2	8	2255235	2255242	25 %	0 %	50 %	25 %	198284369
42349	NC_011206	AGC	2	6	2255288	2255293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284369
42350	NC_011206	GTA	2	6	2255298	2255303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284369
42351	NC_011206	CGC	2	6	2255327	2255332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284369
42352	NC_011206	TATCG	2	10	2255718	2255727	20 %	40 %	20 %	20 %	198284370
42353	NC_011206	GGT	2	6	2255735	2255740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284370
42354	NC_011206	CGC	2	6	2255783	2255788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284370
42355	NC_011206	CTTT	2	8	2255790	2255797	0 %	75 %	0 %	25 %	198284370
42356	NC_011206	TCA	2	6	2255830	2255835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284370
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42363	NC_011206	GCG	3	9	2256249	2256257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284372
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42365	NC_011206	CGG	2	6	2256376	2256381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284372
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42367	NC_011206	TGA	2	6	2256420	2256425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284372
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42450	NC_011206	CGGC	2	8	2260470	2260477	0 %	0 %	50 %	50 %	198284376
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42455	NC_011206	CCA	2	6	2260657	2260662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284377
42456	NC_011206	CTG	2	6	2260669	2260674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284377
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42459	NC_011206	AG	3	6	2260738	2260743	50 %	0 %	50 %	0 %	198284377
42460	NC_011206	TGC	2	6	2260794	2260799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284377
42461	NC_011206	CCATGG	2	12	2260911	2260922	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	198284377
42462	NC_011206	TCG	2	6	2260955	2260960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284377
42463	NC_011206	ACC	2	6	2261023	2261028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284377
42464	NC_011206	GACCAT	2	12	2261127	2261138	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	198284377
42465	NC_011206	TGA	2	6	2261160	2261165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284377
42466	NC_011206	AAG	2	6	2261210	2261215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284377
42467	NC_011206	GCC	2	6	2261242	2261247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284377
42468	NC_011206	TCC	2	6	2261261	2261266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284377
42469	NC_011206	AC	3	6	2261299	2261304	50 %	0 %	0 %	50 %	198284377
42470	NC_011206	CTT	2	6	2261340	2261345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284377
42471	NC_011206	GCC	2	6	2261354	2261359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284377
42472	NC_011206	CCG	3	9	2261426	2261434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284377
42473	NC_011206	C	6	6	2261473	2261478	0 %	0 %	0 %	100 %	198284377
42474	NC_011206	CCA	2	6	2261486	2261491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284377
42475	NC_011206	CCG	3	9	2261510	2261518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284377
42476	NC_011206	TCT	2	6	2261612	2261617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284377
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42479	NC_011206	CGT	2	6	2261691	2261696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284377
42480	NC_011206	GTA	2	6	2261725	2261730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284377
42481	NC_011206	TCT	2	6	2261745	2261750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284377
42482	NC_011206	CTT	2	6	2261815	2261820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284378
42483	NC_011206	CTT	2	6	2261826	2261831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284378
42484	NC_011206	CCA	2	6	2261844	2261849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284378
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42490	NC_011206	GC	4	8	2262076	2262083	0 %	0 %	50 %	50 %	198284378
42491	NC_011206	CTT	2	6	2262133	2262138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284378
42492	NC_011206	CCT	2	6	2262162	2262167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284378
42493	NC_011206	ATC	2	6	2262170	2262175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284378
42494	NC_011206	TTC	2	6	2262184	2262189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284378
42495	NC_011206	GGA	2	6	2262264	2262269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284378
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42497	NC_011206	CCG	2	6	2262429	2262434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284378
42498	NC_011206	TGG	2	6	2262465	2262470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284378
42499	NC_011206	TTC	2	6	2262473	2262478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284378
42500	NC_011206	TCA	2	6	2262492	2262497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284378

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