MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_011206	GATC	2	8	2206895	2206902	25 %	25 %	25 %	25 %	198284322
41502	NC_011206	GC	3	6	2206999	2207004	0 %	0 %	50 %	50 %	198284322
41503	NC_011206	TC	3	6	2207062	2207067	0 %	50 %	0 %	50 %	198284322
41504	NC_011206	GGC	2	6	2207069	2207074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284322
41505	NC_011206	TGCGC	2	10	2207101	2207110	0 %	20 %	40 %	40 %	198284322
41506	NC_011206	CCT	2	6	2207122	2207127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284322
41507	NC_011206	TGC	2	6	2207187	2207192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284322
41508	NC_011206	ATGC	2	8	2207297	2207304	25 %	25 %	25 %	25 %	198284322
41509	NC_011206	GAT	2	6	2207354	2207359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284322
41510	NC_011206	CGG	2	6	2207410	2207415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284322
41511	NC_011206	GGTA	2	8	2207539	2207546	25 %	25 %	50 %	0 %	198284322
41512	NC_011206	GCA	2	6	2207549	2207554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284322
41513	NC_011206	GC	3	6	2207627	2207632	0 %	0 %	50 %	50 %	198284323
41514	NC_011206	TGC	2	6	2207654	2207659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284323
41515	NC_011206	CCA	2	6	2207688	2207693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284323
41516	NC_011206	TG	3	6	2207746	2207751	0 %	50 %	50 %	0 %	198284323
41517	NC_011206	ACT	2	6	2207777	2207782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284323
41518	NC_011206	ATTC	2	8	2207823	2207830	25 %	50 %	0 %	25 %	198284323
41519	NC_011206	CTG	2	6	2207893	2207898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284323
41520	NC_011206	CTC	2	6	2207950	2207955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284323
41521	NC_011206	GAA	2	6	2207988	2207993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284323
41522	NC_011206	GCG	2	6	2207994	2207999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284323
41523	NC_011206	TTG	2	6	2208025	2208030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198284323
41524	NC_011206	T	6	6	2208035	2208040	0 %	100 %	0 %	0 %	198284323
41525	NC_011206	GCT	2	6	2208048	2208053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284323
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41527	NC_011206	GTC	2	6	2208129	2208134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284323
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41531	NC_011206	CGG	2	6	2208350	2208355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284323
41532	NC_011206	CT	3	6	2208412	2208417	0 %	50 %	0 %	50 %	198284323
41533	NC_011206	CAT	2	6	2208430	2208435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284323
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41535	NC_011206	CAT	2	6	2208592	2208597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284323
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41538	NC_011206	TGC	2	6	2208771	2208776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284323
41539	NC_011206	A	7	7	2208779	2208785	100 %	0 %	0 %	0 %	198284323
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41542	NC_011206	GCT	2	6	2208846	2208851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284323
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41551	NC_011206	GCA	2	6	2210149	2210154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284325
41552	NC_011206	GGC	2	6	2210180	2210185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284325
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41555	NC_011206	CGC	2	6	2210326	2210331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284326
41556	NC_011206	CGGGG	2	10	2210372	2210381	0 %	0 %	80 %	20 %	198284326
41557	NC_011206	ACGTA	2	10	2210391	2210400	40 %	20 %	20 %	20 %	198284326
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41564	NC_011206	CG	3	6	2211123	2211128	0 %	0 %	50 %	50 %	198284327
41565	NC_011206	GCC	2	6	2211174	2211179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284327
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41569	NC_011206	AGC	2	6	2211334	2211339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284327
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41585	NC_011206	GC	3	6	2212519	2212524	0 %	0 %	50 %	50 %	198284327
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41589	NC_011206	GCA	2	6	2212634	2212639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284327
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41601	NC_011206	GAAAG	2	10	2213241	2213250	60 %	0 %	40 %	0 %	198284328
41602	NC_011206	GAA	2	6	2213300	2213305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284328
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41617	NC_011206	CAA	2	6	2214125	2214130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284329
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41734	NC_011206	CGC	2	6	2220504	2220509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284335
41735	NC_011206	CAGG	2	8	2220597	2220604	25 %	0 %	50 %	25 %	198284335
41736	NC_011206	ACGGT	2	10	2220663	2220672	20 %	20 %	40 %	20 %	198284335
41737	NC_011206	GCA	2	6	2220684	2220689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284335
41738	NC_011206	GGA	2	6	2220760	2220765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284335
41739	NC_011206	AT	3	6	2220797	2220802	50 %	50 %	0 %	0 %	198284335
41740	NC_011206	GCCA	2	8	2220964	2220971	25 %	0 %	25 %	50 %	198284335
41741	NC_011206	AG	3	6	2221009	2221014	50 %	0 %	50 %	0 %	198284335
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41743	NC_011206	GCCC	2	8	2221131	2221138	0 %	0 %	25 %	75 %	198284335
41744	NC_011206	GAA	2	6	2221210	2221215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284335
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41748	NC_011206	CGA	2	6	2221341	2221346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284335
41749	NC_011206	GAT	2	6	2221375	2221380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284335
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41752	NC_011206	CGC	2	6	2221465	2221470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284335
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41754	NC_011206	A	6	6	2221834	2221839	100 %	0 %	0 %	0 %	198284335
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41760	NC_011206	GAT	2	6	2222143	2222148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284335
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41964	NC_011206	CAG	2	6	2231470	2231475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284346
41965	NC_011206	ACC	2	6	2231489	2231494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284346
41966	NC_011206	CGA	2	6	2231499	2231504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284346
41967	NC_011206	ACA	2	6	2231825	2231830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284347
41968	NC_011206	AGC	2	6	2231884	2231889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284347
41969	NC_011206	CGT	2	6	2231914	2231919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284347
41970	NC_011206	A	6	6	2231952	2231957	100 %	0 %	0 %	0 %	198284347
41971	NC_011206	CTG	3	9	2231960	2231968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284347
41972	NC_011206	A	8	8	2232005	2232012	100 %	0 %	0 %	0 %	198284347
41973	NC_011206	GC	3	6	2232015	2232020	0 %	0 %	50 %	50 %	198284347
41974	NC_011206	GTA	2	6	2232032	2232037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284347
41975	NC_011206	CAC	2	6	2232057	2232062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284347
41976	NC_011206	CCA	2	6	2232147	2232152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284347
41977	NC_011206	AAT	2	6	2232163	2232168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198284347
41978	NC_011206	ACC	2	6	2232176	2232181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284347
41979	NC_011206	CCT	2	6	2232207	2232212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284348
41980	NC_011206	GCA	2	6	2232228	2232233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284348
41981	NC_011206	CCAC	2	8	2232273	2232280	25 %	0 %	0 %	75 %	198284348
41982	NC_011206	GCG	3	9	2232315	2232323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284348
41983	NC_011206	TTG	2	6	2232324	2232329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198284348
41984	NC_011206	AGC	2	6	2232351	2232356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284348
41985	NC_011206	GCCTGT	2	12	2232420	2232431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284348
41986	NC_011206	GGTTG	2	10	2232490	2232499	0 %	40 %	60 %	0 %	198284348
41987	NC_011206	CAG	2	6	2232515	2232520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284348
41988	NC_011206	GCA	2	6	2232523	2232528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284348
41989	NC_011206	TGC	2	6	2232629	2232634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284348
41990	NC_011206	TCT	2	6	2232640	2232645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284348
41991	NC_011206	GCC	2	6	2232679	2232684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284348
41992	NC_011206	GCTT	2	8	2232764	2232771	0 %	50 %	25 %	25 %	198284348
41993	NC_011206	C	8	8	2232788	2232795	0 %	0 %	0 %	100 %	198284348
41994	NC_011206	GCT	2	6	2232806	2232811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284348
41995	NC_011206	CCT	2	6	2232817	2232822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284348
41996	NC_011206	CAC	2	6	2232860	2232865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284348
41997	NC_011206	GAA	2	6	2232895	2232900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284348
41998	NC_011206	TGAG	2	8	2232906	2232913	25 %	25 %	50 %	0 %	198284348
41999	NC_011206	GCC	2	6	2233159	2233164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284349
42000	NC_011206	CAG	2	6	2233227	2233232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284349

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