MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_011206	CTGGC	2	10	2181964	2181973	0 %	20 %	40 %	40 %	198284291
41002	NC_011206	GGT	2	6	2182071	2182076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284291
41003	NC_011206	CAC	2	6	2182148	2182153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284291
41004	NC_011206	TGCAC	2	10	2182387	2182396	20 %	20 %	20 %	40 %	198284292
41005	NC_011206	TGGC	2	8	2182422	2182429	0 %	25 %	50 %	25 %	198284292
41006	NC_011206	GC	3	6	2182576	2182581	0 %	0 %	50 %	50 %	198284292
41007	NC_011206	GGC	2	6	2182587	2182592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284292
41008	NC_011206	CAT	2	6	2182621	2182626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284292
41009	NC_011206	CGG	2	6	2182662	2182667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284292
41010	NC_011206	CGG	2	6	2182683	2182688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284292
41011	NC_011206	ATT	2	6	2182851	2182856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198284293
41012	NC_011206	TGG	2	6	2182876	2182881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284293
41013	NC_011206	CG	3	6	2182906	2182911	0 %	0 %	50 %	50 %	198284293
41014	NC_011206	AGC	2	6	2182989	2182994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284293
41015	NC_011206	CAG	2	6	2183142	2183147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284293
41016	NC_011206	CTC	2	6	2183157	2183162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284293
41017	NC_011206	GCG	2	6	2183332	2183337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284293
41018	NC_011206	CGG	2	6	2183383	2183388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284293
41019	NC_011206	AG	4	8	2183413	2183420	50 %	0 %	50 %	0 %	198284293
41020	NC_011206	GCA	2	6	2183423	2183428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284293
41021	NC_011206	GAT	2	6	2183550	2183555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284293
41022	NC_011206	GAG	2	6	2183571	2183576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284293
41023	NC_011206	GTA	2	6	2183586	2183591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284293
41024	NC_011206	CGC	2	6	2183605	2183610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284293
41025	NC_011206	CG	3	6	2183618	2183623	0 %	0 %	50 %	50 %	198284293
41026	NC_011206	CTG	2	6	2183628	2183633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284293
41027	NC_011206	CTG	2	6	2183718	2183723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284293
41028	NC_011206	CTG	2	6	2183727	2183732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284293
41029	NC_011206	CAG	2	6	2183739	2183744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284293
41030	NC_011206	GCC	2	6	2183751	2183756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284293
41031	NC_011206	CCT	2	6	2183768	2183773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284293
41032	NC_011206	TGC	2	6	2183824	2183829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284293
41033	NC_011206	AGC	2	6	2183893	2183898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284293
41034	NC_011206	AGC	2	6	2183958	2183963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284293
41035	NC_011206	C	6	6	2183963	2183968	0 %	0 %	0 %	100 %	198284293
41036	NC_011206	AGA	2	6	2183978	2183983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284293
41037	NC_011206	ACG	2	6	2184013	2184018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284293
41038	NC_011206	ATT	2	6	2184030	2184035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198284293
41039	NC_011206	TCT	2	6	2184086	2184091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284293
41040	NC_011206	TAC	2	6	2184129	2184134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284293
41041	NC_011206	ACG	2	6	2184207	2184212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284293
41042	NC_011206	GAC	2	6	2184311	2184316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284294
41043	NC_011206	GCA	2	6	2184349	2184354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284294
41044	NC_011206	GATG	2	8	2184359	2184366	25 %	25 %	50 %	0 %	198284294
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41046	NC_011206	CGG	2	6	2184411	2184416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284294
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41048	NC_011206	GAG	2	6	2184516	2184521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284294
41049	NC_011206	CTG	2	6	2184540	2184545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284294
41050	NC_011206	CTG	2	6	2184633	2184638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284294
41051	NC_011206	CAG	2	6	2184664	2184669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284294
41052	NC_011206	AGC	2	6	2184675	2184680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284294
41053	NC_011206	CAC	2	6	2184742	2184747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284294
41054	NC_011206	GCC	2	6	2184798	2184803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284294
41055	NC_011206	CAC	2	6	2184805	2184810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284294
41056	NC_011206	ACGT	2	8	2184838	2184845	25 %	25 %	25 %	25 %	198284294
41057	NC_011206	CTG	2	6	2184867	2184872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284294
41058	NC_011206	CCG	2	6	2184890	2184895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284294
41059	NC_011206	CGCC	2	8	2184904	2184911	0 %	0 %	25 %	75 %	198284294
41060	NC_011206	ATC	2	6	2184912	2184917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284294
41061	NC_011206	GCA	2	6	2184929	2184934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284294
41062	NC_011206	CTG	2	6	2184975	2184980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284294
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41065	NC_011206	GC	3	6	2185037	2185042	0 %	0 %	50 %	50 %	198284294
41066	NC_011206	CCG	2	6	2185045	2185050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284294
41067	NC_011206	CTG	2	6	2185126	2185131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284294
41068	NC_011206	GGC	2	6	2185232	2185237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284294
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41072	NC_011206	GCA	2	6	2185425	2185430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284294
41073	NC_011206	GTG	2	6	2185535	2185540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284295
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41078	NC_011206	CAC	2	6	2185783	2185788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284295
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41081	NC_011206	T	7	7	2185852	2185858	0 %	100 %	0 %	0 %	198284295
41082	NC_011206	GTC	2	6	2185895	2185900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284295
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41084	NC_011206	CAA	2	6	2186029	2186034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284295
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41086	NC_011206	GCT	2	6	2186062	2186067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284295
41087	NC_011206	GGTGA	2	10	2186140	2186149	20 %	20 %	60 %	0 %	198284296
41088	NC_011206	CCG	2	6	2186153	2186158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284296
41089	NC_011206	TCC	3	9	2186207	2186215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284296
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41098	NC_011206	CTG	2	6	2186548	2186553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284296
41099	NC_011206	AAC	2	6	2186557	2186562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284296
41100	NC_011206	GATC	2	8	2186592	2186599	25 %	25 %	25 %	25 %	198284296
41101	NC_011206	CGG	2	6	2186600	2186605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284296
41102	NC_011206	TCA	2	6	2186663	2186668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284296
41103	NC_011206	AC	3	6	2186723	2186728	50 %	0 %	0 %	50 %	198284296
41104	NC_011206	GAA	2	6	2186791	2186796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284297
41105	NC_011206	ATCC	2	8	2186805	2186812	25 %	25 %	0 %	50 %	198284297
41106	NC_011206	TCT	2	6	2186830	2186835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284297
41107	NC_011206	TTC	2	6	2186895	2186900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284297
41108	NC_011206	GGC	3	9	2186931	2186939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284297
41109	NC_011206	ACCGC	2	10	2186957	2186966	20 %	0 %	20 %	60 %	198284297
41110	NC_011206	TCAT	2	8	2187032	2187039	25 %	50 %	0 %	25 %	198284297
41111	NC_011206	GAAGC	2	10	2187079	2187088	40 %	0 %	40 %	20 %	198284297
41112	NC_011206	GCT	2	6	2187138	2187143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284297
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41115	NC_011206	ACGG	2	8	2187414	2187421	25 %	0 %	50 %	25 %	198284298
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41219	NC_011206	GCA	2	6	2192069	2192074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284302
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41231	NC_011206	T	6	6	2192864	2192869	0 %	100 %	0 %	0 %	198284304
41232	NC_011206	CCG	2	6	2192935	2192940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284304
41233	NC_011206	GAAG	2	8	2192998	2193005	50 %	0 %	50 %	0 %	198284304
41234	NC_011206	ATC	2	6	2193011	2193016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284304
41235	NC_011206	CAA	2	6	2193091	2193096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284304
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41348	NC_011206	GCC	2	6	2199924	2199929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284314
41349	NC_011206	GC	3	6	2199945	2199950	0 %	0 %	50 %	50 %	198284314
41350	NC_011206	GATG	2	8	2199991	2199998	25 %	25 %	50 %	0 %	198284314
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41405	NC_011206	TGA	2	6	2202083	2202088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284315
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41446	NC_011206	CTG	2	6	2203927	2203932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284318
41447	NC_011206	CTA	2	6	2203947	2203952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284318
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41450	NC_011206	GAAG	2	8	2204055	2204062	50 %	0 %	50 %	0 %	198284318
41451	NC_011206	GAG	2	6	2204092	2204097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284318
41452	NC_011206	G	6	6	2204097	2204102	0 %	0 %	100 %	0 %	198284318
41453	NC_011206	TGG	2	6	2204123	2204128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284318
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41459	NC_011206	GCC	2	6	2204317	2204322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284318
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41462	NC_011206	TCT	2	6	2204381	2204386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284318
41463	NC_011206	TCC	2	6	2204442	2204447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284318
41464	NC_011206	GAG	3	9	2204578	2204586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284319
41465	NC_011206	TGG	2	6	2204618	2204623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284319
41466	NC_011206	CGA	2	6	2204691	2204696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284319
41467	NC_011206	CGGA	2	8	2204703	2204710	25 %	0 %	50 %	25 %	198284319
41468	NC_011206	CTG	2	6	2204740	2204745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284319
41469	NC_011206	GTC	2	6	2204767	2204772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284319
41470	NC_011206	TGCCC	2	10	2204775	2204784	0 %	20 %	20 %	60 %	198284319
41471	NC_011206	TGG	2	6	2204798	2204803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284319
41472	NC_011206	CGA	2	6	2204871	2204876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284319
41473	NC_011206	TCC	2	6	2205008	2205013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284319
41474	NC_011206	GAA	2	6	2205034	2205039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284319
41475	NC_011206	C	7	7	2205050	2205056	0 %	0 %	0 %	100 %	198284319
41476	NC_011206	GGC	2	6	2205064	2205069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284319
41477	NC_011206	AAC	2	6	2205095	2205100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284319
41478	NC_011206	CTC	2	6	2205133	2205138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284319
41479	NC_011206	TAA	2	6	2205649	2205654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198284320
41480	NC_011206	AAT	2	6	2205657	2205662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198284320
41481	NC_011206	ATG	2	6	2205724	2205729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284320
41482	NC_011206	CTG	2	6	2205744	2205749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284320
41483	NC_011206	GGT	2	6	2205792	2205797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284320
41484	NC_011206	TC	3	6	2205860	2205865	0 %	50 %	0 %	50 %	198284320
41485	NC_011206	CAA	2	6	2205888	2205893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284320
41486	NC_011206	TCG	2	6	2205928	2205933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284320
41487	NC_011206	A	6	6	2206014	2206019	100 %	0 %	0 %	0 %	198284320
41488	NC_011206	GGT	2	6	2206065	2206070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284320
41489	NC_011206	TCA	2	6	2206075	2206080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284320
41490	NC_011206	AGA	2	6	2206094	2206099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284320
41491	NC_011206	GT	3	6	2206128	2206133	0 %	50 %	50 %	0 %	198284320
41492	NC_011206	ATT	2	6	2206172	2206177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198284320
41493	NC_011206	CGG	2	6	2206433	2206438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284321
41494	NC_011206	TG	3	6	2206453	2206458	0 %	50 %	50 %	0 %	198284321
41495	NC_011206	TGC	2	6	2206544	2206549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284321
41496	NC_011206	CTG	2	6	2206638	2206643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284322
41497	NC_011206	ATC	2	6	2206677	2206682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284322
41498	NC_011206	AAG	2	6	2206722	2206727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284322
41499	NC_011206	CTG	2	6	2206829	2206834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284322
41500	NC_011206	GAA	2	6	2206889	2206894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284322

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