MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011206	TCA	2	6	179108	179113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282331
3502	NC_011206	CAC	2	6	179187	179192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282331
3503	NC_011206	CGG	2	6	179252	179257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282331
3504	NC_011206	ACG	2	6	179260	179265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282331
3505	NC_011206	AGC	2	6	179266	179271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282331
3506	NC_011206	ACG	3	9	179272	179280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282331
3507	NC_011206	GAT	2	6	179283	179288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282331
3508	NC_011206	AGG	2	6	179305	179310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282331
3509	NC_011206	CGC	2	6	179363	179368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282331
3510	NC_011206	GCAT	2	8	179373	179380	25 %	25 %	25 %	25 %	198282331
3511	NC_011206	TCG	2	6	179402	179407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282331
3512	NC_011206	GGC	2	6	179485	179490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282332
3513	NC_011206	CGT	2	6	179551	179556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282332
3514	NC_011206	GCA	2	6	179584	179589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282332
3515	NC_011206	TGG	2	6	179598	179603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282332
3516	NC_011206	GGC	2	6	179609	179614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282332
3517	NC_011206	CA	5	10	179646	179655	50 %	0 %	0 %	50 %	198282332
3518	NC_011206	CAG	2	6	179675	179680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282332
3519	NC_011206	GTG	2	6	179694	179699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282332
3520	NC_011206	AGC	2	6	179706	179711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282332
3521	NC_011206	TGA	2	6	179752	179757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282332
3522	NC_011206	GGT	2	6	179834	179839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282332
3523	NC_011206	CCA	2	6	180204	180209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282333
3524	NC_011206	GGC	2	6	180226	180231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282333
3525	NC_011206	CTT	2	6	180273	180278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282333
3526	NC_011206	GGC	2	6	180307	180312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282333
3527	NC_011206	GCGG	2	8	180325	180332	0 %	0 %	75 %	25 %	198282333
3528	NC_011206	GGC	2	6	180337	180342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282333
3529	NC_011206	CGG	2	6	180349	180354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282333
3530	NC_011206	GGA	2	6	180361	180366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282333
3531	NC_011206	CAA	2	6	180397	180402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282333
3532	NC_011206	G	6	6	180435	180440	0 %	0 %	100 %	0 %	198282333
3533	NC_011206	GCG	2	6	180442	180447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282333
3534	NC_011206	CGG	2	6	180462	180467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282333
3535	NC_011206	GCTG	2	8	180498	180505	0 %	25 %	50 %	25 %	198282333
3536	NC_011206	TGC	2	6	180531	180536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282333
3537	NC_011206	GCG	3	9	180569	180577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282333
3538	NC_011206	CCG	2	6	180586	180591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282333
3539	NC_011206	CAA	2	6	180622	180627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282333
3540	NC_011206	CGC	2	6	180661	180666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282333
3541	NC_011206	CATG	2	8	180691	180698	25 %	25 %	25 %	25 %	198282333
3542	NC_011206	GCC	2	6	180704	180709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282333
3543	NC_011206	CCT	2	6	180757	180762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282333
3544	NC_011206	GGAA	2	8	180820	180827	50 %	0 %	50 %	0 %	198282333
3545	NC_011206	AGG	2	6	180936	180941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282333
3546	NC_011206	GCA	2	6	180967	180972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282333
3547	NC_011206	CTG	2	6	181019	181024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282333
3548	NC_011206	TC	3	6	181066	181071	0 %	50 %	0 %	50 %	198282333
3549	NC_011206	CTC	2	6	181097	181102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282333
3550	NC_011206	GCC	3	9	181103	181111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282333
3551	NC_011206	CGC	2	6	181120	181125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282333
3552	NC_011206	GCGG	2	8	181148	181155	0 %	0 %	75 %	25 %	198282333
3553	NC_011206	GTGA	2	8	181163	181170	25 %	25 %	50 %	0 %	198282333
3554	NC_011206	GCG	2	6	181178	181183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282333
3555	NC_011206	TGCGT	2	10	181213	181222	0 %	40 %	40 %	20 %	198282333
3556	NC_011206	GCG	2	6	181265	181270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282333
3557	NC_011206	CGC	2	6	181282	181287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282333
3558	NC_011206	GGC	2	6	181290	181295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282333
3559	NC_011206	CGC	2	6	181323	181328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282334
3560	NC_011206	CCGC	2	8	181352	181359	0 %	0 %	25 %	75 %	198282334
3561	NC_011206	CGG	2	6	181414	181419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282334
3562	NC_011206	G	6	6	181418	181423	0 %	0 %	100 %	0 %	198282334
3563	NC_011206	GGT	2	6	181454	181459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282334
3564	NC_011206	CCG	2	6	181464	181469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282334
3565	NC_011206	GGA	2	6	181476	181481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282334
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3567	NC_011206	TCAAG	2	10	181533	181542	40 %	20 %	20 %	20 %	198282334
3568	NC_011206	CCGA	2	8	181595	181602	25 %	0 %	25 %	50 %	198282334
3569	NC_011206	GGCT	2	8	181705	181712	0 %	25 %	50 %	25 %	198282334
3570	NC_011206	GCG	2	6	181760	181765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282334
3571	NC_011206	CTT	2	6	181809	181814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282334
3572	NC_011206	TCC	2	6	181859	181864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282334
3573	NC_011206	TGG	2	6	181931	181936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282334
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3576	NC_011206	CG	3	6	182173	182178	0 %	0 %	50 %	50 %	198282335
3577	NC_011206	CGG	2	6	182196	182201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282335
3578	NC_011206	TGA	2	6	182246	182251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282335
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3580	NC_011206	GGCG	2	8	182291	182298	0 %	0 %	75 %	25 %	198282335
3581	NC_011206	GCC	2	6	182351	182356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282335
3582	NC_011206	CAGC	2	8	182385	182392	25 %	0 %	25 %	50 %	198282335
3583	NC_011206	TCG	2	6	182431	182436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282335
3584	NC_011206	GC	5	10	182496	182505	0 %	0 %	50 %	50 %	198282335
3585	NC_011206	CGC	2	6	182514	182519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282335
3586	NC_011206	CGG	3	9	182528	182536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282335
3587	NC_011206	GCG	3	9	182555	182563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282335
3588	NC_011206	GATA	2	8	182630	182637	50 %	25 %	25 %	0 %	198282335
3589	NC_011206	GCAG	2	8	182698	182705	25 %	0 %	50 %	25 %	198282335
3590	NC_011206	TCC	2	6	182948	182953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282336
3591	NC_011206	TGAC	2	8	183032	183039	25 %	25 %	25 %	25 %	198282336
3592	NC_011206	TCAT	2	8	183041	183048	25 %	50 %	0 %	25 %	198282336
3593	NC_011206	CTA	2	6	183141	183146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282336
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3598	NC_011206	TGG	2	6	183358	183363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282337
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3601	NC_011206	GCG	2	6	183412	183417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282337
3602	NC_011206	C	6	6	183448	183453	0 %	0 %	0 %	100 %	198282337
3603	NC_011206	GAA	2	6	183498	183503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282337
3604	NC_011206	CAG	2	6	183507	183512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282337
3605	NC_011206	GGAT	2	8	183548	183555	25 %	25 %	50 %	0 %	198282338
3606	NC_011206	TGG	2	6	183607	183612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282338
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3610	NC_011206	GGA	2	6	183732	183737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282338
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3612	NC_011206	GCT	2	6	183852	183857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282338
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3616	NC_011206	GAA	2	6	183997	184002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282338
3617	NC_011206	GC	3	6	184065	184070	0 %	0 %	50 %	50 %	198282338
3618	NC_011206	CGT	2	6	184071	184076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282338
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3620	NC_011206	CATGGG	2	12	184313	184324	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198282339
3621	NC_011206	ATG	2	6	184326	184331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282339
3622	NC_011206	A	7	7	184332	184338	100 %	0 %	0 %	0 %	198282339
3623	NC_011206	GCG	2	6	184360	184365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282339
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3982	NC_011206	CAT	2	6	205939	205944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282363
3983	NC_011206	GAT	2	6	206170	206175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282364
3984	NC_011206	TCAA	2	8	206214	206221	50 %	25 %	0 %	25 %	198282364
3985	NC_011206	AAC	2	6	206362	206367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282364
3986	NC_011206	GAA	2	6	206413	206418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282364
3987	NC_011206	GAA	2	6	206621	206626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282365
3988	NC_011206	CTG	2	6	206648	206653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282365
3989	NC_011206	CGTTCT	2	12	206714	206725	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	198282365
3990	NC_011206	TCAG	2	8	206792	206799	25 %	25 %	25 %	25 %	198282365
3991	NC_011206	CCT	2	6	206916	206921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282365
3992	NC_011206	TTC	2	6	206948	206953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282365
3993	NC_011206	AAT	2	6	206992	206997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282365
3994	NC_011206	ATC	2	6	207002	207007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282365
3995	NC_011206	CCT	2	6	207180	207185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282365
3996	NC_011206	TCA	2	6	207278	207283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282365
3997	NC_011206	TCCA	2	8	207296	207303	25 %	25 %	0 %	50 %	198282365
3998	NC_011206	TAT	2	6	207327	207332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282365
3999	NC_011206	CAC	2	6	207393	207398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282365
4000	NC_011206	CGC	2	6	207413	207418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282365

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