MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30224	NC_011206	GCA	2	6	1600823	1600828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283742
30225	NC_011206	TAA	2	6	1600833	1600838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198283742
30226	NC_011206	GTC	2	6	1600858	1600863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283742
30227	NC_011206	TGA	2	6	1601081	1601086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283743
30228	NC_011206	CCTGT	2	10	1601117	1601126	0 %	40 %	20 %	40 %	198283743
30229	NC_011206	TA	3	6	1601193	1601198	50 %	50 %	0 %	0 %	198283743
30230	NC_011206	GTT	2	6	1601213	1601218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198283743
30231	NC_011206	CTC	2	6	1601460	1601465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198283743
30232	NC_011206	CAT	2	6	1601522	1601527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283743
30233	NC_011206	GCA	3	9	1601543	1601551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283743
30234	NC_011206	GTT	2	6	1601568	1601573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198283743
30235	NC_011206	TGTT	2	8	1601653	1601660	0 %	75 %	25 %	0 %	198283743
30236	NC_011206	GAA	2	6	1601672	1601677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198283743
30237	NC_011206	CGA	3	9	1601753	1601761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283743
30238	NC_011206	TTGA	2	8	1601781	1601788	25 %	50 %	25 %	0 %	198283743
30239	NC_011206	ATC	2	6	1602026	1602031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283744
30240	NC_011206	TGC	2	6	1602051	1602056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283744
30241	NC_011206	GCC	2	6	1602176	1602181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283744
30242	NC_011206	GGT	2	6	1602187	1602192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283744
30243	NC_011206	GCC	2	6	1602249	1602254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283744
30244	NC_011206	TGG	2	6	1602387	1602392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283744
30245	NC_011206	GCTG	2	8	1602400	1602407	0 %	25 %	50 %	25 %	198283744
30246	NC_011206	A	6	6	1602408	1602413	100 %	0 %	0 %	0 %	198283744
30247	NC_011206	CTG	2	6	1602455	1602460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283744
30248	NC_011206	GAT	2	6	1602533	1602538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283744
30249	NC_011206	GGTGCT	2	12	1602562	1602573	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	198283744
30250	NC_011206	GGC	2	6	1602594	1602599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283744
30251	NC_011206	T	7	7	1602822	1602828	0 %	100 %	0 %	0 %	198283744
30252	NC_011206	TGG	2	6	1602863	1602868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283744
30253	NC_011206	TCA	2	6	1602885	1602890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283744
30254	NC_011206	CTG	2	6	1602908	1602913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283744
30255	NC_011206	TGC	2	6	1603020	1603025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283744
30256	NC_011206	ATT	2	6	1603048	1603053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198283744
30257	NC_011206	TGC	2	6	1603065	1603070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283744
30258	NC_011206	CGG	2	6	1603081	1603086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283744
30259	NC_011206	ATG	2	6	1603100	1603105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283744
30260	NC_011206	TGG	2	6	1603119	1603124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283744
30261	NC_011206	TGG	2	6	1603152	1603157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283744
30262	NC_011206	CCA	2	6	1603168	1603173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283744
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30264	NC_011206	GAA	2	6	1603274	1603279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198283744
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30266	NC_011206	GTC	2	6	1603371	1603376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283744
30267	NC_011206	GGC	2	6	1603390	1603395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283744
30268	NC_011206	T	6	6	1603401	1603406	0 %	100 %	0 %	0 %	198283744
30269	NC_011206	CCAG	2	8	1603446	1603453	25 %	0 %	25 %	50 %	198283744
30270	NC_011206	GTC	2	6	1603496	1603501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283744
30271	NC_011206	ACG	2	6	1603512	1603517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283744
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30273	NC_011206	GCC	2	6	1603541	1603546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283744
30274	NC_011206	TGA	2	6	1603552	1603557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283744
30275	NC_011206	TTG	2	6	1603607	1603612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198283744
30276	NC_011206	TGC	2	6	1603638	1603643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283744
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30301	NC_011206	GC	4	8	1605434	1605441	0 %	0 %	50 %	50 %	198283745
30302	NC_011206	TGC	2	6	1605521	1605526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283745
30303	NC_011206	AG	3	6	1605558	1605563	50 %	0 %	50 %	0 %	198283745
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30306	NC_011206	CGG	2	6	1605692	1605697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283745
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30310	NC_011206	TGA	2	6	1605828	1605833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283745
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30313	NC_011206	ACTGA	2	10	1605862	1605871	40 %	20 %	20 %	20 %	198283745
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30332	NC_011206	CCA	2	6	1607186	1607191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283746
30333	NC_011206	CACC	2	8	1607210	1607217	25 %	0 %	0 %	75 %	198283746
30334	NC_011206	CAA	2	6	1607226	1607231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198283746
30335	NC_011206	CTG	2	6	1607252	1607257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283746
30336	NC_011206	ACG	2	6	1607349	1607354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283746
30337	NC_011206	TTCT	2	8	1607388	1607395	0 %	75 %	0 %	25 %	198283746
30338	NC_011206	CTT	2	6	1607441	1607446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198283746
30339	NC_011206	TCCTTC	2	12	1607521	1607532	0 %	50 %	0 %	50 %	198283746
30340	NC_011206	CATC	2	8	1607636	1607643	25 %	25 %	0 %	50 %	198283746
30341	NC_011206	CGGT	2	8	1607671	1607678	0 %	25 %	50 %	25 %	198283746
30342	NC_011206	GCG	2	6	1607704	1607709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283746
30343	NC_011206	ATG	2	6	1607739	1607744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283746
30344	NC_011206	ATGGCG	2	12	1607776	1607787	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198283746
30345	NC_011206	CCA	2	6	1607807	1607812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283746
30346	NC_011206	CGT	2	6	1607827	1607832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283746
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30348	NC_011206	GTG	2	6	1607878	1607883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283746
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30464	NC_011206	GGCA	2	8	1613798	1613805	25 %	0 %	50 %	25 %	198283750
30465	NC_011206	CAA	2	6	1613819	1613824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198283750
30466	NC_011206	TAT	2	6	1613845	1613850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198283751
30467	NC_011206	GC	3	6	1613854	1613859	0 %	0 %	50 %	50 %	198283751
30468	NC_011206	GAT	2	6	1613871	1613876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283751
30469	NC_011206	CTGCTT	2	12	1613877	1613888	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	198283751
30470	NC_011206	TCG	2	6	1613915	1613920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283751
30471	NC_011206	TGA	2	6	1613967	1613972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283751
30472	NC_011206	TTG	2	6	1613981	1613986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198283751
30473	NC_011206	CTG	2	6	1614004	1614009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283751
30474	NC_011206	TGC	2	6	1614023	1614028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283751
30475	NC_011206	GCA	2	6	1614096	1614101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283751
30476	NC_011206	CAC	2	6	1614108	1614113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283751
30477	NC_011206	CCT	2	6	1614117	1614122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198283751
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30480	NC_011206	TCC	2	6	1614256	1614261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198283751
30481	NC_011206	CCG	2	6	1614321	1614326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283751
30482	NC_011206	GCCTGC	2	12	1614362	1614373	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	198283751
30483	NC_011206	ATC	2	6	1614445	1614450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283751
30484	NC_011206	ATC	2	6	1614469	1614474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283751
30485	NC_011206	CTG	2	6	1614558	1614563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283751
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30487	NC_011206	GACG	2	8	1614579	1614586	25 %	0 %	50 %	25 %	198283751
30488	NC_011206	GCC	2	6	1614592	1614597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283751
30489	NC_011206	GCA	2	6	1614657	1614662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283751
30490	NC_011206	CGT	2	6	1614686	1614691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283751
30491	NC_011206	GTT	2	6	1614724	1614729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198283751
30492	NC_011206	TCT	2	6	1614754	1614759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198283752
30493	NC_011206	CG	3	6	1614817	1614822	0 %	0 %	50 %	50 %	198283752
30494	NC_011206	C	6	6	1614903	1614908	0 %	0 %	0 %	100 %	198283752
30495	NC_011206	GGC	2	6	1614914	1614919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283752
30496	NC_011206	CGG	2	6	1614959	1614964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283752
30497	NC_011206	TCG	2	6	1614985	1614990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283752
30498	NC_011206	CATC	2	8	1615329	1615336	25 %	25 %	0 %	50 %	198283753
30499	NC_011206	TGG	2	6	1615414	1615419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283753
30500	NC_011206	GCT	2	6	1615420	1615425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283753

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