MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25005	NC_011206	CTGC	2	8	1312792	1312799	0 %	25 %	25 %	50 %	198283477
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25117	NC_011206	CGG	2	6	1319128	1319133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283480
25118	NC_011206	CG	3	6	1319213	1319218	0 %	0 %	50 %	50 %	198283480
25119	NC_011206	TGA	2	6	1319224	1319229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283480
25120	NC_011206	GAT	2	6	1319252	1319257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283480
25121	NC_011206	GGC	2	6	1319302	1319307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283480
25122	NC_011206	CCA	2	6	1319328	1319333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283480
25123	NC_011206	AGCG	2	8	1319339	1319346	25 %	0 %	50 %	25 %	198283480
25124	NC_011206	ATG	2	6	1319442	1319447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283480
25125	NC_011206	CATG	2	8	1319450	1319457	25 %	25 %	25 %	25 %	198283480
25126	NC_011206	GATGC	2	10	1319538	1319547	20 %	20 %	40 %	20 %	198283481
25127	NC_011206	CGG	2	6	1319561	1319566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283481
25128	NC_011206	CGACGC	2	12	1319600	1319611	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	198283481
25129	NC_011206	GCG	2	6	1319680	1319685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283481
25130	NC_011206	CGT	2	6	1319708	1319713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283481
25131	NC_011206	TAA	2	6	1319851	1319856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198283481
25132	NC_011206	CCG	2	6	1319876	1319881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283481
25133	NC_011206	GCC	2	6	1319887	1319892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283481
25134	NC_011206	AGC	2	6	1319908	1319913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283481
25135	NC_011206	TGC	2	6	1319922	1319927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283481
25136	NC_011206	TCC	2	6	1319995	1320000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198283481
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25138	NC_011206	TCC	2	6	1320076	1320081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198283481
25139	NC_011206	CAT	2	6	1320105	1320110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283481
25140	NC_011206	CGG	2	6	1320119	1320124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283481
25141	NC_011206	ATG	2	6	1320127	1320132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283481
25142	NC_011206	ATG	2	6	1320142	1320147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283481
25143	NC_011206	GCC	2	6	1320166	1320171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283481
25144	NC_011206	GCC	2	6	1320187	1320192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283481
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25147	NC_011206	CAG	2	6	1320285	1320290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283481
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25149	NC_011206	CCG	2	6	1320409	1320414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283481
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25152	NC_011206	GGGC	2	8	1320490	1320497	0 %	0 %	75 %	25 %	198283481
25153	NC_011206	CGGTT	2	10	1320542	1320551	0 %	40 %	40 %	20 %	198283481
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25165	NC_011206	CGG	2	6	1320997	1321002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283482
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25178	NC_011206	CGA	3	9	1321405	1321413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283482
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25186	NC_011206	CCG	4	12	1321681	1321692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283482
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25201	NC_011206	AGC	2	6	1322421	1322426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283483
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25205	NC_011206	GGC	2	6	1322792	1322797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283483
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25216	NC_011206	CCA	2	6	1323256	1323261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283483
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25220	NC_011206	TG	3	6	1323560	1323565	0 %	50 %	50 %	0 %	198283483
25221	NC_011206	C	6	6	1323570	1323575	0 %	0 %	0 %	100 %	198283483
25222	NC_011206	CCG	2	6	1323586	1323591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283483
25223	NC_011206	CCA	2	6	1323706	1323711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283483
25224	NC_011206	TCG	2	6	1323720	1323725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283483
25225	NC_011206	GC	3	6	1323735	1323740	0 %	0 %	50 %	50 %	198283483
25226	NC_011206	ATC	2	6	1323750	1323755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283483
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25228	NC_011206	CCG	2	6	1323897	1323902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283483
25229	NC_011206	GCA	2	6	1323937	1323942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283483
25230	NC_011206	CAG	2	6	1323995	1324000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283483
25231	NC_011206	GA	3	6	1324017	1324022	50 %	0 %	50 %	0 %	198283483
25232	NC_011206	CAT	2	6	1324058	1324063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283483
25233	NC_011206	TCC	2	6	1324089	1324094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198283483
25234	NC_011206	GTG	2	6	1324136	1324141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283483
25235	NC_011206	GGC	2	6	1324238	1324243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283483
25236	NC_011206	GGC	2	6	1324349	1324354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283483
25237	NC_011206	CTC	2	6	1324580	1324585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198283484
25238	NC_011206	CTG	2	6	1324614	1324619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283484
25239	NC_011206	CGG	2	6	1324630	1324635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283484
25240	NC_011206	G	6	6	1324638	1324643	0 %	0 %	100 %	0 %	198283484
25241	NC_011206	CAC	2	6	1324648	1324653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283484
25242	NC_011206	CGC	2	6	1324664	1324669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283484
25243	NC_011206	CAAC	2	8	1324724	1324731	50 %	0 %	0 %	50 %	198283484
25244	NC_011206	TCGC	2	8	1324735	1324742	0 %	25 %	25 %	50 %	198283484
25245	NC_011206	GGC	2	6	1324749	1324754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283484
25246	NC_011206	CAT	2	6	1324835	1324840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283484
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25248	NC_011206	CGA	2	6	1324895	1324900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283484
25249	NC_011206	GC	3	6	1324916	1324921	0 %	0 %	50 %	50 %	198283484
25250	NC_011206	TCG	2	6	1324926	1324931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283484
25251	NC_011206	GAT	2	6	1324934	1324939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283484
25252	NC_011206	CG	3	6	1324965	1324970	0 %	0 %	50 %	50 %	198283484
25253	NC_011206	ACC	2	6	1324980	1324985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283484
25254	NC_011206	GCT	2	6	1325022	1325027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283484
25255	NC_011206	TGC	2	6	1325182	1325187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283484
25256	NC_011206	AGG	2	6	1325272	1325277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283484
25257	NC_011206	GCG	2	6	1325282	1325287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283484
25258	NC_011206	GATA	2	8	1325288	1325295	50 %	25 %	25 %	0 %	198283484
25259	NC_011206	CCA	2	6	1325300	1325305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283484
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25261	NC_011206	AGA	2	6	1325665	1325670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198283485
25262	NC_011206	CACG	2	8	1325759	1325766	25 %	0 %	25 %	50 %	198283485
25263	NC_011206	GGC	2	6	1325767	1325772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283485
25264	NC_011206	CAC	2	6	1325798	1325803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283485
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25266	NC_011206	GGC	2	6	1326184	1326189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283486
25267	NC_011206	GC	3	6	1326200	1326205	0 %	0 %	50 %	50 %	198283486
25268	NC_011206	CGGAC	2	10	1326259	1326268	20 %	0 %	40 %	40 %	198283486
25269	NC_011206	CGA	2	6	1326316	1326321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283486
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25271	NC_011206	TC	3	6	1326369	1326374	0 %	50 %	0 %	50 %	198283486
25272	NC_011206	GAC	2	6	1326467	1326472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283486
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25274	NC_011206	GCCT	2	8	1326705	1326712	0 %	25 %	25 %	50 %	198283486
25275	NC_011206	GCG	2	6	1326723	1326728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283486
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25279	NC_011206	GAC	2	6	1326975	1326980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283487
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25286	NC_011206	TGCA	2	8	1327348	1327355	25 %	25 %	25 %	25 %	198283487
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25292	NC_011206	A	6	6	1327800	1327805	100 %	0 %	0 %	0 %	198283488
25293	NC_011206	TAC	2	6	1327831	1327836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283488
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25300	NC_011206	TTCG	2	8	1328080	1328087	0 %	50 %	25 %	25 %	198283488
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25321	NC_011206	CGG	2	6	1329009	1329014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283489
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25332	NC_011206	GGA	2	6	1329318	1329323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283489
25333	NC_011206	CCA	2	6	1329461	1329466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283489
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25335	NC_011206	CGGG	2	8	1329607	1329614	0 %	0 %	75 %	25 %	198283489
25336	NC_011206	TGA	2	6	1329629	1329634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283489
25337	NC_011206	AGG	2	6	1329740	1329745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283489
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25340	NC_011206	GAG	2	6	1329889	1329894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283489
25341	NC_011206	ATC	2	6	1330012	1330017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283489
25342	NC_011206	TTA	2	6	1330046	1330051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198283489
25343	NC_011206	G	6	6	1330119	1330124	0 %	0 %	100 %	0 %	198283489
25344	NC_011206	TGC	2	6	1330181	1330186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283489
25345	NC_011206	TGA	2	6	1330200	1330205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283489
25346	NC_011206	CGC	3	9	1330216	1330224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283489
25347	NC_011206	CG	3	6	1330256	1330261	0 %	0 %	50 %	50 %	198283489
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25349	NC_011206	CG	3	6	1330359	1330364	0 %	0 %	50 %	50 %	198283490
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25464	NC_011206	TGAA	2	8	1335758	1335765	50 %	25 %	25 %	0 %	198283494
25465	NC_011206	AGG	2	6	1335873	1335878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283494
25466	NC_011206	GCA	2	6	1335882	1335887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283494
25467	NC_011206	CCG	2	6	1335984	1335989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283495
25468	NC_011206	ATC	2	6	1336015	1336020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283495
25469	NC_011206	CGC	2	6	1336051	1336056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283495
25470	NC_011206	TCG	2	6	1336121	1336126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283495
25471	NC_011206	GC	4	8	1336147	1336154	0 %	0 %	50 %	50 %	198283495
25472	NC_011206	CGA	2	6	1336212	1336217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283495
25473	NC_011206	TCA	2	6	1336296	1336301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283495
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25475	NC_011206	GCA	2	6	1336383	1336388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283495
25476	NC_011206	CGC	2	6	1336391	1336396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283495
25477	NC_011206	CAC	2	6	1336417	1336422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283495
25478	NC_011206	GTG	2	6	1336424	1336429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283495
25479	NC_011206	CCA	2	6	1336443	1336448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283495
25480	NC_011206	TCG	2	6	1336451	1336456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283495
25481	NC_011206	CG	3	6	1336478	1336483	0 %	0 %	50 %	50 %	198283495
25482	NC_011206	CAT	2	6	1336660	1336665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283495
25483	NC_011206	GGC	2	6	1336684	1336689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283495
25484	NC_011206	TCG	2	6	1336706	1336711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283495
25485	NC_011206	TAA	2	6	1336724	1336729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198283495
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25487	NC_011206	CTG	2	6	1336834	1336839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283496
25488	NC_011206	CGGA	2	8	1336909	1336916	25 %	0 %	50 %	25 %	198283496
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25490	NC_011206	CTA	2	6	1336968	1336973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283496
25491	NC_011206	TGC	2	6	1336994	1336999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283496
25492	NC_011206	TTC	2	6	1337042	1337047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198283496
25493	NC_011206	CCT	2	6	1337060	1337065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198283497
25494	NC_011206	GCT	2	6	1337092	1337097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283497
25495	NC_011206	CGC	2	6	1337161	1337166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283497
25496	NC_011206	GCC	2	6	1337311	1337316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283497
25497	NC_011206	GGCG	2	8	1337415	1337422	0 %	0 %	75 %	25 %	198283497
25498	NC_011206	CCA	3	9	1337429	1337437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283497
25499	NC_011206	CGG	2	6	1337502	1337507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283497
25500	NC_011206	ACTG	2	8	1337540	1337547	25 %	25 %	25 %	25 %	198283497

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