MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_011206	ACG	2	6	1281031	1281036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283441
24502	NC_011206	ATG	2	6	1281053	1281058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283441
24503	NC_011206	GCG	2	6	1281106	1281111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283441
24504	NC_011206	AGAA	2	8	1281123	1281130	75 %	0 %	25 %	0 %	198283441
24505	NC_011206	A	6	6	1281143	1281148	100 %	0 %	0 %	0 %	198283441
24506	NC_011206	TGC	2	6	1281259	1281264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283442
24507	NC_011206	T	6	6	1281297	1281302	0 %	100 %	0 %	0 %	198283442
24508	NC_011206	TA	3	6	1282128	1282133	50 %	50 %	0 %	0 %	198283443
24509	NC_011206	TGGTCG	2	12	1282168	1282179	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	198283443
24510	NC_011206	TTG	2	6	1282180	1282185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198283443
24511	NC_011206	GCT	2	6	1282196	1282201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283443
24512	NC_011206	CAT	2	6	1282301	1282306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283444
24513	NC_011206	GC	3	6	1282307	1282312	0 %	0 %	50 %	50 %	198283444
24514	NC_011206	A	6	6	1282392	1282397	100 %	0 %	0 %	0 %	198283444
24515	NC_011206	AGGA	2	8	1282404	1282411	50 %	0 %	50 %	0 %	198283444
24516	NC_011206	ATC	2	6	1282485	1282490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283444
24517	NC_011206	CAA	2	6	1282554	1282559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198283444
24518	NC_011206	TCC	2	6	1282619	1282624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198283444
24519	NC_011206	ATC	2	6	1282629	1282634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283444
24520	NC_011206	GC	3	6	1282657	1282662	0 %	0 %	50 %	50 %	198283444
24521	NC_011206	GC	3	6	1282871	1282876	0 %	0 %	50 %	50 %	198283444
24522	NC_011206	CCA	2	6	1282880	1282885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283444
24523	NC_011206	GCCA	2	8	1282956	1282963	25 %	0 %	25 %	50 %	198283444
24524	NC_011206	AAC	2	6	1283029	1283034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198283444
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24526	NC_011206	AAAG	2	8	1283521	1283528	75 %	0 %	25 %	0 %	198283445
24527	NC_011206	TCG	2	6	1283562	1283567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283445
24528	NC_011206	ACGG	2	8	1283638	1283645	25 %	0 %	50 %	25 %	198283445
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24530	NC_011206	T	7	7	1283742	1283748	0 %	100 %	0 %	0 %	198283446
24531	NC_011206	T	6	6	1283776	1283781	0 %	100 %	0 %	0 %	198283446
24532	NC_011206	GAT	2	6	1283860	1283865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283446
24533	NC_011206	CAT	2	6	1283898	1283903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283446
24534	NC_011206	CAA	2	6	1283907	1283912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198283446
24535	NC_011206	A	6	6	1283915	1283920	100 %	0 %	0 %	0 %	198283446
24536	NC_011206	ATT	2	6	1283965	1283970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198283446
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24541	NC_011206	CCAGG	2	10	1284202	1284211	20 %	0 %	40 %	40 %	198283446
24542	NC_011206	GGC	2	6	1284261	1284266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283446
24543	NC_011206	CAT	2	6	1284318	1284323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283446
24544	NC_011206	GGA	2	6	1284345	1284350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283446
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24548	NC_011206	CAGC	2	8	1284598	1284605	25 %	0 %	25 %	50 %	198283446
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24551	NC_011206	TCA	2	6	1284696	1284701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283446
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24554	NC_011206	GGC	2	6	1284783	1284788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283446
24555	NC_011206	GC	3	6	1284894	1284899	0 %	0 %	50 %	50 %	198283446
24556	NC_011206	ACGGG	2	10	1284980	1284989	20 %	0 %	60 %	20 %	198283446
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24559	NC_011206	CGC	2	6	1285090	1285095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283446
24560	NC_011206	CTT	2	6	1285113	1285118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198283446
24561	NC_011206	GA	3	6	1285140	1285145	50 %	0 %	50 %	0 %	198283446
24562	NC_011206	GGCG	2	8	1285203	1285210	0 %	0 %	75 %	25 %	198283446
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24565	NC_011206	GCA	2	6	1285293	1285298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283446
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24601	NC_011206	CGT	2	6	1288343	1288348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283454
24602	NC_011206	GACG	2	8	1288368	1288375	25 %	0 %	50 %	25 %	198283454
24603	NC_011206	C	6	6	1288408	1288413	0 %	0 %	0 %	100 %	198283454
24604	NC_011206	TCG	2	6	1288501	1288506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283454
24605	NC_011206	TGG	2	6	1288564	1288569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283454
24606	NC_011206	AC	3	6	1288612	1288617	50 %	0 %	0 %	50 %	198283454
24607	NC_011206	CAT	2	6	1288640	1288645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283454
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24734	NC_011206	AAC	2	6	1295200	1295205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198283462
24735	NC_011206	TGC	2	6	1295213	1295218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283462
24736	NC_011206	TTCG	2	8	1295301	1295308	0 %	50 %	25 %	25 %	198283463
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24844	NC_011206	TC	3	6	1303215	1303220	0 %	50 %	0 %	50 %	198283469
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24966	NC_011206	A	6	6	1309991	1309996	100 %	0 %	0 %	0 %	198283474
24967	NC_011206	GTC	2	6	1310001	1310006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283474
24968	NC_011206	CGCCCG	2	12	1310031	1310042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283474
24969	NC_011206	GC	3	6	1310043	1310048	0 %	0 %	50 %	50 %	198283474
24970	NC_011206	CGG	2	6	1310150	1310155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283474
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24972	NC_011206	CAT	2	6	1310190	1310195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283474
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24975	NC_011206	GCT	2	6	1310743	1310748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283475
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24979	NC_011206	CTG	2	6	1311022	1311027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283475
24980	NC_011206	GT	3	6	1311128	1311133	0 %	50 %	50 %	0 %	198283475
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24985	NC_011206	GGA	2	6	1311569	1311574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283476
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24988	NC_011206	ATC	2	6	1311791	1311796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283476
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24993	NC_011206	CGG	2	6	1312087	1312092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283476
24994	NC_011206	CTG	2	6	1312181	1312186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283476
24995	NC_011206	CAGC	2	8	1312222	1312229	25 %	0 %	25 %	50 %	198283476
24996	NC_011206	CGAT	2	8	1312256	1312263	25 %	25 %	25 %	25 %	198283476
24997	NC_011206	GTACG	2	10	1312355	1312364	20 %	20 %	40 %	20 %	198283476
24998	NC_011206	CA	3	6	1312413	1312418	50 %	0 %	0 %	50 %	198283476
24999	NC_011206	TGCA	2	8	1312423	1312430	25 %	25 %	25 %	25 %	198283476
25000	NC_011206	CG	3	6	1312475	1312480	0 %	0 %	50 %	50 %	198283476

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