MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011206	GCG	3	9	650340	650348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282832
12502	NC_011206	GC	3	6	650416	650421	0 %	0 %	50 %	50 %	198282833
12503	NC_011206	CAC	2	6	650428	650433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282833
12504	NC_011206	GCA	2	6	650463	650468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282833
12505	NC_011206	CGGC	2	8	650490	650497	0 %	0 %	50 %	50 %	198282833
12506	NC_011206	AC	3	6	650522	650527	50 %	0 %	0 %	50 %	198282833
12507	NC_011206	GTC	2	6	650554	650559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282833
12508	NC_011206	CGC	2	6	650583	650588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282833
12509	NC_011206	ACC	2	6	650671	650676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282833
12510	NC_011206	CTT	2	6	650679	650684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282833
12511	NC_011206	CCA	2	6	650685	650690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282833
12512	NC_011206	GAC	2	6	650691	650696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282833
12513	NC_011206	ACC	2	6	650738	650743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282833
12514	NC_011206	GCC	2	6	650749	650754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282833
12515	NC_011206	CCA	2	6	650763	650768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282833
12516	NC_011206	CGA	2	6	650775	650780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282833
12517	NC_011206	GCG	2	6	650788	650793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282833
12518	NC_011206	TCG	2	6	650801	650806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282833
12519	NC_011206	CGC	2	6	650846	650851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282833
12520	NC_011206	CAG	2	6	650866	650871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282833
12521	NC_011206	GC	3	6	650879	650884	0 %	0 %	50 %	50 %	198282833
12522	NC_011206	TCC	2	6	651047	651052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282833
12523	NC_011206	CGC	3	9	651065	651073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282833
12524	NC_011206	CCGC	2	8	651245	651252	0 %	0 %	25 %	75 %	198282833
12525	NC_011206	GAT	2	6	651283	651288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282833
12526	NC_011206	GCG	2	6	651310	651315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282833
12527	NC_011206	GGCC	2	8	651345	651352	0 %	0 %	50 %	50 %	198282833
12528	NC_011206	GTC	2	6	651389	651394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282833
12529	NC_011206	TGG	2	6	651462	651467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282833
12530	NC_011206	GCA	3	9	651483	651491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282833
12531	NC_011206	CG	3	6	651494	651499	0 %	0 %	50 %	50 %	198282833
12532	NC_011206	CCCG	2	8	651506	651513	0 %	0 %	25 %	75 %	198282833
12533	NC_011206	GCA	2	6	651609	651614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282833
12534	NC_011206	CGG	3	9	651648	651656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282833
12535	NC_011206	TAG	2	6	651704	651709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282833
12536	NC_011206	CG	3	6	651714	651719	0 %	0 %	50 %	50 %	198282833
12537	NC_011206	GTCG	2	8	651751	651758	0 %	25 %	50 %	25 %	198282833
12538	NC_011206	CCG	2	6	651768	651773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282833
12539	NC_011206	CAG	2	6	651781	651786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282833
12540	NC_011206	G	6	6	651828	651833	0 %	0 %	100 %	0 %	198282833
12541	NC_011206	GCC	2	6	651869	651874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282833
12542	NC_011206	GC	3	6	651927	651932	0 %	0 %	50 %	50 %	198282833
12543	NC_011206	GC	3	6	652042	652047	0 %	0 %	50 %	50 %	198282833
12544	NC_011206	ATGGGC	2	12	652070	652081	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198282833
12545	NC_011206	CGG	2	6	652177	652182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282834
12546	NC_011206	GC	4	8	652210	652217	0 %	0 %	50 %	50 %	198282834
12547	NC_011206	GCC	2	6	652221	652226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282834
12548	NC_011206	CCA	2	6	652255	652260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282834
12549	NC_011206	GCCG	2	8	652270	652277	0 %	0 %	50 %	50 %	198282834
12550	NC_011206	CGC	2	6	652283	652288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282834
12551	NC_011206	GGT	2	6	652328	652333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282834
12552	NC_011206	TGC	2	6	652630	652635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282834
12553	NC_011206	GCC	2	6	652924	652929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282835
12554	NC_011206	ACC	2	6	652933	652938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282835
12555	NC_011206	GCC	2	6	652942	652947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282835
12556	NC_011206	GCC	3	9	652951	652959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282835
12557	NC_011206	CGC	2	6	652974	652979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282835
12558	NC_011206	GTC	2	6	652987	652992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282835
12559	NC_011206	TTC	2	6	652994	652999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282835
12560	NC_011206	GTG	2	6	653024	653029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282835
12561	NC_011206	ATC	2	6	653030	653035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282835
12562	NC_011206	GGTCG	2	10	653083	653092	0 %	20 %	60 %	20 %	198282835
12563	NC_011206	TCG	2	6	653123	653128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282835
12564	NC_011206	GTAGCC	2	12	653140	653151	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	198282835
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12566	NC_011206	CGA	2	6	653208	653213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282835
12567	NC_011206	GAT	2	6	653245	653250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282835
12568	NC_011206	CCG	3	9	653327	653335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282835
12569	NC_011206	CTT	2	6	653346	653351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282835
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12574	NC_011206	CTG	2	6	653557	653562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282835
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12591	NC_011206	TGA	2	6	654048	654053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282835
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12600	NC_011206	CTT	2	6	654345	654350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282835
12601	NC_011206	GC	3	6	654360	654365	0 %	0 %	50 %	50 %	198282835
12602	NC_011206	TGG	2	6	654429	654434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282835
12603	NC_011206	CAC	2	6	654457	654462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282835
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12606	NC_011206	ATG	2	6	654639	654644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282836
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12617	NC_011206	GCGG	2	8	655152	655159	0 %	0 %	75 %	25 %	198282837
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12738	NC_011206	TGT	2	6	661454	661459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282841
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12741	NC_011206	TTG	2	6	661594	661599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282841
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12975	NC_011206	GGCA	2	8	673803	673810	25 %	0 %	50 %	25 %	198282849
12976	NC_011206	CCA	2	6	673843	673848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282849
12977	NC_011206	GTG	2	6	673873	673878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282849
12978	NC_011206	CAG	2	6	673964	673969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282849
12979	NC_011206	GCG	2	6	674031	674036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282849
12980	NC_011206	TGC	2	6	674041	674046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282849
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12982	NC_011206	GGA	2	6	674053	674058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282849
12983	NC_011206	ATGC	2	8	674063	674070	25 %	25 %	25 %	25 %	198282849
12984	NC_011206	TCA	2	6	674164	674169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282850
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12987	NC_011206	CAG	2	6	674224	674229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282850
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12989	NC_011206	GGC	2	6	674278	674283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282850
12990	NC_011206	CATA	2	8	674300	674307	50 %	25 %	0 %	25 %	198282850
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12993	NC_011206	GC	3	6	674447	674452	0 %	0 %	50 %	50 %	198282850
12994	NC_011206	GGCCG	2	10	674556	674565	0 %	0 %	60 %	40 %	198282850
12995	NC_011206	CCATGT	2	12	674588	674599	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	198282850
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12997	NC_011206	CAG	2	6	674780	674785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282851
12998	NC_011206	CGC	2	6	674868	674873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282851
12999	NC_011206	GAC	2	6	674875	674880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282851
13000	NC_011206	GCC	2	6	674907	674912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282851

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