MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_011206	TTC	2	6	267402	267407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282423
5003	NC_011206	CGC	2	6	267441	267446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282423
5004	NC_011206	CTG	3	9	267558	267566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282423
5005	NC_011206	GCCTT	2	10	267598	267607	0 %	40 %	20 %	40 %	198282423
5006	NC_011206	CAG	2	6	267635	267640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282423
5007	NC_011206	CGGT	2	8	267646	267653	0 %	25 %	50 %	25 %	198282423
5008	NC_011206	TCC	2	6	267685	267690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282423
5009	NC_011206	GGC	2	6	267702	267707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282423
5010	NC_011206	GTA	2	6	267735	267740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282423
5011	NC_011206	TCT	2	6	267764	267769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282423
5012	NC_011206	GAC	2	6	267822	267827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282423
5013	NC_011206	CG	3	6	267888	267893	0 %	0 %	50 %	50 %	198282423
5014	NC_011206	GCCA	2	8	267988	267995	25 %	0 %	25 %	50 %	198282423
5015	NC_011206	TGCGT	2	10	267998	268007	0 %	40 %	40 %	20 %	198282423
5016	NC_011206	CCA	2	6	268043	268048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282423
5017	NC_011206	GAC	2	6	268083	268088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282423
5018	NC_011206	GAC	2	6	268090	268095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282423
5019	NC_011206	CTT	2	6	268155	268160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282423
5020	NC_011206	TCT	2	6	268202	268207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282423
5021	NC_011206	GTG	2	6	268219	268224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282423
5022	NC_011206	CAT	2	6	268229	268234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282423
5023	NC_011206	AT	3	6	268268	268273	50 %	50 %	0 %	0 %	198282423
5024	NC_011206	CGG	2	6	268292	268297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282423
5025	NC_011206	TCA	2	6	268400	268405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282423
5026	NC_011206	GCCT	2	8	268631	268638	0 %	25 %	25 %	50 %	198282424
5027	NC_011206	ATG	2	6	268645	268650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282424
5028	NC_011206	TC	3	6	268703	268708	0 %	50 %	0 %	50 %	198282424
5029	NC_011206	TTC	2	6	268835	268840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282424
5030	NC_011206	GAT	2	6	268943	268948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282425
5031	NC_011206	GAT	2	6	268955	268960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282425
5032	NC_011206	CTG	2	6	268983	268988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282425
5033	NC_011206	AAG	2	6	269041	269046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282425
5034	NC_011206	ACT	2	6	269140	269145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282425
5035	NC_011206	CTG	2	6	269166	269171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282425
5036	NC_011206	TCACC	2	10	269226	269235	20 %	20 %	0 %	60 %	198282425
5037	NC_011206	CTG	2	6	269255	269260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282425
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5039	NC_011206	GCA	2	6	269421	269426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282425
5040	NC_011206	GCT	2	6	270104	270109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282426
5041	NC_011206	GCT	3	9	270112	270120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282426
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5043	NC_011206	T	6	6	270165	270170	0 %	100 %	0 %	0 %	198282426
5044	NC_011206	GTT	2	6	270214	270219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282426
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5049	NC_011206	A	6	6	270444	270449	100 %	0 %	0 %	0 %	198282426
5050	NC_011206	GTG	2	6	270476	270481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282426
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5052	NC_011206	GA	3	6	270722	270727	50 %	0 %	50 %	0 %	198282427
5053	NC_011206	TGG	2	6	270758	270763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282427
5054	NC_011206	GCAG	2	8	270846	270853	25 %	0 %	50 %	25 %	198282427
5055	NC_011206	CTG	2	6	270880	270885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282427
5056	NC_011206	ATC	2	6	270902	270907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282427
5057	NC_011206	CTA	2	6	270942	270947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282427
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5060	NC_011206	GTA	2	6	271283	271288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282427
5061	NC_011206	AGC	2	6	271419	271424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282427
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5069	NC_011206	TTA	2	6	271791	271796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282427
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5073	NC_011206	AC	3	6	272064	272069	50 %	0 %	0 %	50 %	198282428
5074	NC_011206	ATGGGA	2	12	272109	272120	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	198282428
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5091	NC_011206	GAT	2	6	273524	273529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282429
5092	NC_011206	GA	3	6	273580	273585	50 %	0 %	50 %	0 %	198282429
5093	NC_011206	ACG	2	6	273591	273596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282429
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5104	NC_011206	A	6	6	274261	274266	100 %	0 %	0 %	0 %	198282430
5105	NC_011206	GCACT	2	10	274282	274291	20 %	20 %	20 %	40 %	198282430
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5121	NC_011206	AAT	2	6	275312	275317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282430
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5242	NC_011206	CG	3	6	283043	283048	0 %	0 %	50 %	50 %	198282435
5243	NC_011206	TTC	2	6	283072	283077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282435
5244	NC_011206	CGG	2	6	283088	283093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282435
5245	NC_011206	GCT	2	6	283541	283546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282436
5246	NC_011206	TC	3	6	283562	283567	0 %	50 %	0 %	50 %	198282436
5247	NC_011206	GCA	2	6	283586	283591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282436
5248	NC_011206	TCC	2	6	283647	283652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282436
5249	NC_011206	TCG	2	6	283785	283790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282436
5250	NC_011206	GAA	2	6	283977	283982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282437
5251	NC_011206	GCA	2	6	284099	284104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282437
5252	NC_011206	TGA	2	6	284126	284131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282437
5253	NC_011206	ATC	2	6	284305	284310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282438
5254	NC_011206	CGG	2	6	284512	284517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282438
5255	NC_011206	TCT	2	6	284591	284596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282438
5256	NC_011206	GCG	2	6	284600	284605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282438
5257	NC_011206	GCT	2	6	284613	284618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282438
5258	NC_011206	GGT	2	6	284622	284627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282438
5259	NC_011206	TGG	2	6	284639	284644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282438
5260	NC_011206	CGA	2	6	284796	284801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282439
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5262	NC_011206	GAT	2	6	284887	284892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282439
5263	NC_011206	CCA	2	6	284895	284900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282439
5264	NC_011206	CGC	2	6	284910	284915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282439
5265	NC_011206	GGA	2	6	284925	284930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282439
5266	NC_011206	GTC	2	6	284983	284988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282439
5267	NC_011206	TGGGCG	2	12	285035	285046	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	198282439
5268	NC_011206	TTC	3	9	285091	285099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282439
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5270	NC_011206	CGA	3	9	285167	285175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282440
5271	NC_011206	TCC	2	6	285235	285240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282440
5272	NC_011206	GCGTT	2	10	285262	285271	0 %	40 %	40 %	20 %	198282440
5273	NC_011206	CTG	2	6	285282	285287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282440
5274	NC_011206	CGGG	2	8	285296	285303	0 %	0 %	75 %	25 %	198282440
5275	NC_011206	CAC	2	6	285324	285329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282440
5276	NC_011206	CAG	2	6	285396	285401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282440
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5278	NC_011206	GCC	2	6	285480	285485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282440
5279	NC_011206	TGCGG	2	10	285499	285508	0 %	20 %	60 %	20 %	198282440
5280	NC_011206	GC	4	8	285530	285537	0 %	0 %	50 %	50 %	198282440
5281	NC_011206	CGC	2	6	285555	285560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282440
5282	NC_011206	GTT	2	6	285612	285617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282440
5283	NC_011206	ATCA	2	8	285657	285664	50 %	25 %	0 %	25 %	198282440
5284	NC_011206	CAA	2	6	285705	285710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282440
5285	NC_011206	CG	4	8	285727	285734	0 %	0 %	50 %	50 %	198282440
5286	NC_011206	GCG	2	6	285763	285768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282440
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5288	NC_011206	GCGG	2	8	285840	285847	0 %	0 %	75 %	25 %	198282440
5289	NC_011206	TGA	2	6	285854	285859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282440
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5291	NC_011206	GC	3	6	285936	285941	0 %	0 %	50 %	50 %	198282441
5292	NC_011206	GCCC	2	8	285953	285960	0 %	0 %	25 %	75 %	198282441
5293	NC_011206	CTG	2	6	285993	285998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282441
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5299	NC_011206	GCG	2	6	286234	286239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282441
5300	NC_011206	GCG	2	6	286375	286380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282441
5301	NC_011206	ATGCC	2	10	286405	286414	20 %	20 %	20 %	40 %	198282441
5302	NC_011206	GCTGGA	2	12	286424	286435	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198282441
5303	NC_011206	GCG	2	6	286459	286464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282441
5304	NC_011206	TGC	2	6	286498	286503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282441
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5307	NC_011206	CGGA	2	8	286572	286579	25 %	0 %	50 %	25 %	198282441
5308	NC_011206	AATC	2	8	286580	286587	50 %	25 %	0 %	25 %	198282441
5309	NC_011206	CGC	2	6	286616	286621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282441
5310	NC_011206	ATC	2	6	286681	286686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282441
5311	NC_011206	GC	3	6	286709	286714	0 %	0 %	50 %	50 %	198282441
5312	NC_011206	TAT	2	6	286716	286721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282441
5313	NC_011206	CCA	2	6	286724	286729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282441
5314	NC_011206	CTGG	2	8	286730	286737	0 %	25 %	50 %	25 %	198282441
5315	NC_011206	TGA	2	6	286798	286803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282441
5316	NC_011206	TGG	2	6	286861	286866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282441
5317	NC_011206	AAT	2	6	286935	286940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282441
5318	NC_011206	CTGA	2	8	287141	287148	25 %	25 %	25 %	25 %	198282442
5319	NC_011206	TCCA	2	8	287173	287180	25 %	25 %	0 %	50 %	198282442
5320	NC_011206	GAAA	2	8	287221	287228	75 %	0 %	25 %	0 %	198282442
5321	NC_011206	TCA	3	9	287231	287239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282442
5322	NC_011206	CAA	2	6	287259	287264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282442
5323	NC_011206	CAT	2	6	287346	287351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282442
5324	NC_011206	GCA	2	6	287474	287479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282442
5325	NC_011206	CGTT	2	8	287612	287619	0 %	50 %	25 %	25 %	198282442
5326	NC_011206	T	6	6	287618	287623	0 %	100 %	0 %	0 %	198282442
5327	NC_011206	ATCA	2	8	287625	287632	50 %	25 %	0 %	25 %	198282442
5328	NC_011206	GTG	2	6	287660	287665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282442
5329	NC_011206	TCA	2	6	287759	287764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282442
5330	NC_011206	CAA	2	6	287774	287779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282442
5331	NC_011206	TAG	2	6	287854	287859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282442
5332	NC_011206	TCA	2	6	287903	287908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282442
5333	NC_011206	CAG	2	6	287943	287948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282442
5334	NC_011206	CGC	2	6	288007	288012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282442
5335	NC_011206	ACT	2	6	288018	288023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282442
5336	NC_011206	AT	3	6	288034	288039	50 %	50 %	0 %	0 %	198282442
5337	NC_011206	TCACA	2	10	288553	288562	40 %	20 %	0 %	40 %	198282443
5338	NC_011206	AGCC	2	8	288569	288576	25 %	0 %	25 %	50 %	198282443
5339	NC_011206	CAT	2	6	288645	288650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282443
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5344	NC_011206	CCG	2	6	288896	288901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282443
5345	NC_011206	CTG	2	6	288907	288912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282443
5346	NC_011206	CCG	2	6	289037	289042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282443
5347	NC_011206	TTTC	2	8	289214	289221	0 %	75 %	0 %	25 %	198282443
5348	NC_011206	AGC	2	6	289252	289257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282443
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5350	NC_011206	GCC	2	6	289338	289343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282443
5351	NC_011206	GCGTC	2	10	289430	289439	0 %	20 %	40 %	40 %	198282443
5352	NC_011206	GCT	2	6	289487	289492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282443
5353	NC_011206	CCA	2	6	289606	289611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282443
5354	NC_011206	GTC	2	6	289695	289700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282443
5355	NC_011206	CCG	2	6	289702	289707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282443
5356	NC_011206	CCG	2	6	289777	289782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282443
5357	NC_011206	C	6	6	289841	289846	0 %	0 %	0 %	100 %	198282443
5358	NC_011206	GAC	2	6	290040	290045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282444
5359	NC_011206	CTG	2	6	290056	290061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282444
5360	NC_011206	CAT	2	6	290101	290106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282444
5361	NC_011206	ACC	2	6	290116	290121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282444
5362	NC_011206	CT	3	6	290134	290139	0 %	50 %	0 %	50 %	198282444
5363	NC_011206	ATG	2	6	290167	290172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282444
5364	NC_011206	CGC	2	6	290250	290255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282444
5365	NC_011206	CAG	2	6	290663	290668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282445
5366	NC_011206	GGGC	2	8	290740	290747	0 %	0 %	75 %	25 %	198282445
5367	NC_011206	GGCT	2	8	290749	290756	0 %	25 %	50 %	25 %	198282445
5368	NC_011206	TGG	2	6	290766	290771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282445
5369	NC_011206	GCG	2	6	290799	290804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282445
5370	NC_011206	TGA	2	6	290836	290841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282445
5371	NC_011206	GGC	2	6	290845	290850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282445
5372	NC_011206	GCA	2	6	290851	290856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282445
5373	NC_011206	TCG	2	6	290862	290867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282445
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5375	NC_011206	GACC	2	8	290959	290966	25 %	0 %	25 %	50 %	198282445
5376	NC_011206	ATGGCG	2	12	290967	290978	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198282445
5377	NC_011206	CCT	2	6	291121	291126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282445
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5379	NC_011206	GC	3	6	291362	291367	0 %	0 %	50 %	50 %	198282445
5380	NC_011206	AGTG	2	8	291386	291393	25 %	25 %	50 %	0 %	198282445
5381	NC_011206	CCG	2	6	291427	291432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282445
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5383	NC_011206	GC	4	8	291508	291515	0 %	0 %	50 %	50 %	198282445
5384	NC_011206	ATC	2	6	291545	291550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282445
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5386	NC_011206	GTCAT	2	10	291594	291603	20 %	40 %	20 %	20 %	198282445
5387	NC_011206	CGG	2	6	291606	291611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282445
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5389	NC_011206	GC	3	6	291675	291680	0 %	0 %	50 %	50 %	198282445
5390	NC_011206	GTG	2	6	291731	291736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282445
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5392	NC_011206	AG	4	8	291804	291811	50 %	0 %	50 %	0 %	198282445
5393	NC_011206	GC	3	6	291841	291846	0 %	0 %	50 %	50 %	198282445
5394	NC_011206	G	6	6	291883	291888	0 %	0 %	100 %	0 %	198282445
5395	NC_011206	CGG	2	6	291930	291935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282445
5396	NC_011206	TGGG	2	8	291963	291970	0 %	25 %	75 %	0 %	198282445
5397	NC_011206	GCC	2	6	292057	292062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282446
5398	NC_011206	GCT	2	6	292103	292108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282446
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5402	NC_011206	TGCCC	2	10	292232	292241	0 %	20 %	20 %	60 %	198282446
5403	NC_011206	CGA	2	6	292247	292252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282446
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5486	NC_011206	G	6	6	297202	297207	0 %	0 %	100 %	0 %	198282451
5487	NC_011206	GCA	2	6	297274	297279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282451
5488	NC_011206	CGG	2	6	297300	297305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282451
5489	NC_011206	CGC	2	6	297331	297336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282451
5490	NC_011206	GCAG	2	8	297400	297407	25 %	0 %	50 %	25 %	198282451
5491	NC_011206	GC	3	6	297429	297434	0 %	0 %	50 %	50 %	198282451
5492	NC_011206	CGC	2	6	297504	297509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282451
5493	NC_011206	GGCG	2	8	297542	297549	0 %	0 %	75 %	25 %	198282451
5494	NC_011206	CAA	2	6	297599	297604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282451
5495	NC_011206	CCCA	2	8	297627	297634	25 %	0 %	0 %	75 %	198282451
5496	NC_011206	CAG	3	9	297647	297655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282451
5497	NC_011206	GCGG	2	8	297656	297663	0 %	0 %	75 %	25 %	198282451
5498	NC_011206	CTG	2	6	297730	297735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282451
5499	NC_011206	GAT	4	12	297834	297845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282452
5500	NC_011206	GGT	2	6	297866	297871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282452

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