MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52618	NC_011206	GAT	3	9	2804350	2804358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284893
52619	NC_011206	CGC	2	6	2804379	2804384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284893
52620	NC_011206	GAG	2	6	2804398	2804403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284893
52621	NC_011206	GGC	2	6	2804428	2804433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284893
52622	NC_011206	TGGTGC	2	12	2804451	2804462	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	198284893
52623	NC_011206	TGA	2	6	2804520	2804525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284893
52624	NC_011206	GAT	2	6	2804584	2804589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284893
52625	NC_011206	GC	4	8	2804628	2804635	0 %	0 %	50 %	50 %	198284893
52626	NC_011206	CAT	2	6	2804646	2804651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284893
52627	NC_011206	GAT	2	6	2804656	2804661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284893
52628	NC_011206	GCG	2	6	2804669	2804674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284893
52629	NC_011206	TGGC	2	8	2804690	2804697	0 %	25 %	50 %	25 %	198284893
52630	NC_011206	GATGGC	2	12	2804761	2804772	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198284893
52631	NC_011206	TGC	2	6	2804804	2804809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284893
52632	NC_011206	GC	3	6	2804808	2804813	0 %	0 %	50 %	50 %	198284893
52633	NC_011206	CGG	2	6	2804820	2804825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284893
52634	NC_011206	CAG	2	6	2804985	2804990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284894
52635	NC_011206	C	6	6	2805002	2805007	0 %	0 %	0 %	100 %	198284894
52636	NC_011206	GCA	2	6	2805043	2805048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284894
52637	NC_011206	CGGG	2	8	2805080	2805087	0 %	0 %	75 %	25 %	198284894
52638	NC_011206	TCA	2	6	2805174	2805179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284894
52639	NC_011206	CAT	2	6	2805244	2805249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284894
52640	NC_011206	T	6	6	2805307	2805312	0 %	100 %	0 %	0 %	198284894
52641	NC_011206	CGC	2	6	2805361	2805366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284894
52642	NC_011206	GCC	2	6	2805419	2805424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284894
52643	NC_011206	AGC	2	6	2805438	2805443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284894
52644	NC_011206	ACTGG	2	10	2805445	2805454	20 %	20 %	40 %	20 %	198284894
52645	NC_011206	T	6	6	2805473	2805478	0 %	100 %	0 %	0 %	198284894
52646	NC_011206	CTG	2	6	2805482	2805487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284894
52647	NC_011206	CGA	2	6	2805577	2805582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284894
52648	NC_011206	CGC	2	6	2805589	2805594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284894
52649	NC_011206	CTG	2	6	2805614	2805619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284894
52650	NC_011206	ATG	2	6	2805674	2805679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284894
52651	NC_011206	GGT	2	6	2805727	2805732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284894
52652	NC_011206	TGC	2	6	2805936	2805941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284895
52653	NC_011206	A	6	6	2805954	2805959	100 %	0 %	0 %	0 %	198284895
52654	NC_011206	CGG	2	6	2805981	2805986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284895
52655	NC_011206	GCC	2	6	2805997	2806002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284895
52656	NC_011206	TGC	2	6	2806227	2806232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284895
52657	NC_011206	CCA	2	6	2806234	2806239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284895
52658	NC_011206	GCT	2	6	2806327	2806332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284895
52659	NC_011206	GC	3	6	2806369	2806374	0 %	0 %	50 %	50 %	198284895
52660	NC_011206	TCA	2	6	2806383	2806388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284895
52661	NC_011206	CGC	2	6	2806399	2806404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284895
52662	NC_011206	A	6	6	2806410	2806415	100 %	0 %	0 %	0 %	198284895
52663	NC_011206	AAC	2	6	2806436	2806441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284895
52664	NC_011206	T	6	6	2806445	2806450	0 %	100 %	0 %	0 %	198284895
52665	NC_011206	CTC	2	6	2806454	2806459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284895
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52667	NC_011206	GCT	2	6	2806540	2806545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284895
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52669	NC_011206	GCA	2	6	2806597	2806602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284895
52670	NC_011206	CCA	2	6	2806632	2806637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284895
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52672	NC_011206	TGC	2	6	2806668	2806673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284895
52673	NC_011206	AAC	2	6	2806676	2806681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284895
52674	NC_011206	ATC	2	6	2806700	2806705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284895
52675	NC_011206	TGCCCC	2	12	2806767	2806778	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	198284895
52676	NC_011206	GCA	2	6	2806780	2806785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284895
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52678	NC_011206	AAGA	2	8	2806859	2806866	75 %	0 %	25 %	0 %	198284895
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52682	NC_011206	TGC	2	6	2807005	2807010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284896
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52685	NC_011206	GAA	2	6	2807166	2807171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284896
52686	NC_011206	CTGCA	2	10	2807182	2807191	20 %	20 %	20 %	40 %	198284896
52687	NC_011206	CTG	2	6	2807235	2807240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284896
52688	NC_011206	TGC	2	6	2807248	2807253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284896
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52692	NC_011206	TGCGC	2	10	2807432	2807441	0 %	20 %	40 %	40 %	198284896
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52694	NC_011206	CTG	2	6	2807472	2807477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284896
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52700	NC_011206	ATG	2	6	2807661	2807666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284896
52701	NC_011206	GTT	2	6	2807738	2807743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198284896
52702	NC_011206	CG	3	6	2807744	2807749	0 %	0 %	50 %	50 %	198284896
52703	NC_011206	T	7	7	2807769	2807775	0 %	100 %	0 %	0 %	198284896
52704	NC_011206	ATG	2	6	2807799	2807804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284897
52705	NC_011206	CAT	2	6	2807807	2807812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284897
52706	NC_011206	CTG	2	6	2807823	2807828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284897
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52708	NC_011206	CCA	2	6	2807875	2807880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284897
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52712	NC_011206	CAT	2	6	2808167	2808172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284897
52713	NC_011206	TACC	2	8	2808192	2808199	25 %	25 %	0 %	50 %	198284897
52714	NC_011206	CG	3	6	2808203	2808208	0 %	0 %	50 %	50 %	198284897
52715	NC_011206	ATG	2	6	2808265	2808270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284897
52716	NC_011206	CTG	2	6	2808303	2808308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284897
52717	NC_011206	ACT	2	6	2808323	2808328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284897
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52719	NC_011206	CTG	2	6	2808471	2808476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284897
52720	NC_011206	CAA	2	6	2808500	2808505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284897
52721	NC_011206	GGC	2	6	2808530	2808535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284897
52722	NC_011206	GCG	2	6	2808630	2808635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284897
52723	NC_011206	CGG	2	6	2808641	2808646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284897
52724	NC_011206	GCTGGT	2	12	2808647	2808658	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	198284897
52725	NC_011206	CCG	2	6	2808832	2808837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284898
52726	NC_011206	TGA	2	6	2808874	2808879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284898
52727	NC_011206	ACG	2	6	2808881	2808886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284898
52728	NC_011206	ACCT	2	8	2808902	2808909	25 %	25 %	0 %	50 %	198284898
52729	NC_011206	GC	3	6	2808922	2808927	0 %	0 %	50 %	50 %	198284898
52730	NC_011206	CG	3	6	2808938	2808943	0 %	0 %	50 %	50 %	198284898
52731	NC_011206	GTA	2	6	2809019	2809024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284898
52732	NC_011206	GCC	2	6	2809026	2809031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284898
52733	NC_011206	TGG	2	6	2809038	2809043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284898
52734	NC_011206	CGG	2	6	2809114	2809119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284898
52735	NC_011206	GCG	2	6	2809125	2809130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284898
52736	NC_011206	GACC	2	8	2809168	2809175	25 %	0 %	25 %	50 %	198284898
52737	NC_011206	GCG	2	6	2809195	2809200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284898
52738	NC_011206	GCG	2	6	2809282	2809287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284898
52739	NC_011206	GAT	2	6	2809373	2809378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284898
52740	NC_011206	AC	3	6	2809385	2809390	50 %	0 %	0 %	50 %	198284898
52741	NC_011206	T	7	7	2809402	2809408	0 %	100 %	0 %	0 %	198284898
52742	NC_011206	AGC	2	6	2809427	2809432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284898
52743	NC_011206	CGT	2	6	2809460	2809465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284898
52744	NC_011206	TTGG	2	8	2809538	2809545	0 %	50 %	50 %	0 %	198284898
52745	NC_011206	C	6	6	2809551	2809556	0 %	0 %	0 %	100 %	198284898
52746	NC_011206	TCC	2	6	2809623	2809628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284898
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52748	NC_011206	GCG	2	6	2809732	2809737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284898
52749	NC_011206	CGC	2	6	2809770	2809775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284898
52750	NC_011206	GTA	2	6	2809790	2809795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284898
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52752	NC_011206	GGC	2	6	2810429	2810434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284899
52753	NC_011206	GCA	2	6	2810455	2810460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284899
52754	NC_011206	TGG	2	6	2810461	2810466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284899
52755	NC_011206	ACC	2	6	2810474	2810479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284899
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52758	NC_011206	TGA	2	6	2810553	2810558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284899
52759	NC_011206	TCCG	2	8	2810738	2810745	0 %	25 %	25 %	50 %	198284900
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52765	NC_011206	GTC	3	9	2811194	2811202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284900
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52767	NC_011206	CTTT	2	8	2811334	2811341	0 %	75 %	0 %	25 %	198284900
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52782	NC_011206	CGG	2	6	2812127	2812132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284902
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52834	NC_011206	T	6	6	2816020	2816025	0 %	100 %	0 %	0 %	198284904
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52840	NC_011206	GCT	2	6	2816439	2816444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284904
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52844	NC_011206	CGGA	2	8	2816654	2816661	25 %	0 %	50 %	25 %	198284904
52845	NC_011206	CAA	2	6	2816703	2816708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284904
52846	NC_011206	CAT	2	6	2816794	2816799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284904
52847	NC_011206	TCG	2	6	2816810	2816815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284904
52848	NC_011206	ATG	2	6	2816869	2816874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284904
52849	NC_011206	GCA	2	6	2816970	2816975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284904
52850	NC_011206	CA	3	6	2816986	2816991	50 %	0 %	0 %	50 %	198284904
52851	NC_011206	CGT	2	6	2817036	2817041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284904
52852	NC_011206	CATCGG	2	12	2817239	2817250	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	198284904
52853	NC_011206	TAC	2	6	2817283	2817288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284904
52854	NC_011206	CGG	2	6	2817339	2817344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284904
52855	NC_011206	ACGGGT	2	12	2817349	2817360	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198284904
52856	NC_011206	TCTCTT	2	12	2817456	2817467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284904
52857	NC_011206	CTG	2	6	2817475	2817480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284904
52858	NC_011206	CCA	2	6	2817483	2817488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284904
52859	NC_011206	GAT	2	6	2817594	2817599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284904
52860	NC_011206	GAT	2	6	2817691	2817696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284904
52861	NC_011206	CTA	2	6	2817720	2817725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284904
52862	NC_011206	AAT	2	6	2817748	2817753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198284904
52863	NC_011206	TTCA	2	8	2817772	2817779	25 %	50 %	0 %	25 %	198284904
52864	NC_011206	TGG	2	6	2817812	2817817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284904
52865	NC_011206	GAC	2	6	2817832	2817837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284904
52866	NC_011206	A	6	6	2817904	2817909	100 %	0 %	0 %	0 %	198284904
52867	NC_011206	ACC	2	6	2817955	2817960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284904
52868	NC_011206	GCC	2	6	2817978	2817983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284904
52869	NC_011206	TGC	2	6	2818118	2818123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284904
52870	NC_011206	GGCG	2	8	2818131	2818138	0 %	0 %	75 %	25 %	198284904
52871	NC_011206	GCT	2	6	2818251	2818256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284904
52872	NC_011206	CG	3	6	2818320	2818325	0 %	0 %	50 %	50 %	198284904
52873	NC_011206	CTT	2	6	2818613	2818618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284905
52874	NC_011206	TGT	2	6	2819368	2819373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198284906
52875	NC_011206	GCAGG	2	10	2819393	2819402	20 %	0 %	60 %	20 %	198284906
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52877	NC_011206	CTG	2	6	2819560	2819565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284906
52878	NC_011206	GC	3	6	2819723	2819728	0 %	0 %	50 %	50 %	198284906
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52880	NC_011206	TGC	3	9	2819773	2819781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284906
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52882	NC_011206	GCAG	2	8	2819866	2819873	25 %	0 %	50 %	25 %	198284906
52883	NC_011206	CGA	2	6	2819885	2819890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284906
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52886	NC_011206	CAG	3	9	2820076	2820084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284907
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52962	NC_011206	CT	3	6	2823276	2823281	0 %	50 %	0 %	50 %	198284911
52963	NC_011206	CGA	2	6	2823284	2823289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284911
52964	NC_011206	TGC	2	6	2823341	2823346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284911
52965	NC_011206	GAA	2	6	2823354	2823359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284911
52966	NC_011206	T	6	6	2823406	2823411	0 %	100 %	0 %	0 %	198284911
52967	NC_011206	G	6	6	2823427	2823432	0 %	0 %	100 %	0 %	198284911
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52983	NC_011206	CGG	2	6	2824282	2824287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284913
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52986	NC_011206	CCAT	2	8	2824351	2824358	25 %	25 %	0 %	50 %	198284913
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52992	NC_011206	GC	3	6	2824699	2824704	0 %	0 %	50 %	50 %	198284914
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52999	NC_011206	CGA	2	6	2825111	2825116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284914
53000	NC_011206	GCG	2	6	2825123	2825128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284914

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