MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 54252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011206	GCTC	2	8	235409	235416	0 %	25 %	25 %	50 %	198282391
4502	NC_011206	GCT	2	6	235422	235427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282391
4503	NC_011206	GAT	2	6	235431	235436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282391
4504	NC_011206	GCT	2	6	235497	235502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282391
4505	NC_011206	TGA	2	6	235568	235573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282391
4506	NC_011206	CGG	2	6	235575	235580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282391
4507	NC_011206	CGG	2	6	235583	235588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282391
4508	NC_011206	CTG	2	6	235612	235617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282391
4509	NC_011206	ACCC	2	8	235656	235663	25 %	0 %	0 %	75 %	198282391
4510	NC_011206	GAA	2	6	235746	235751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282391
4511	NC_011206	CGC	2	6	235755	235760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282391
4512	NC_011206	CGT	2	6	235761	235766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282391
4513	NC_011206	CA	3	6	235773	235778	50 %	0 %	0 %	50 %	198282391
4514	NC_011206	CGA	2	6	235835	235840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282391
4515	NC_011206	CCA	2	6	235865	235870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282391
4516	NC_011206	TGG	3	9	235928	235936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282391
4517	NC_011206	ACT	2	6	235955	235960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282391
4518	NC_011206	GCA	2	6	236076	236081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282391
4519	NC_011206	TGGG	2	8	236139	236146	0 %	25 %	75 %	0 %	198282391
4520	NC_011206	GCG	2	6	236251	236256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282392
4521	NC_011206	CGC	2	6	236291	236296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282392
4522	NC_011206	TCC	2	6	236379	236384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282392
4523	NC_011206	GCA	2	6	236450	236455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282392
4524	NC_011206	GCC	2	6	236460	236465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282392
4525	NC_011206	TC	3	6	236495	236500	0 %	50 %	0 %	50 %	198282392
4526	NC_011206	GAC	2	6	236562	236567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282392
4527	NC_011206	CGGG	2	8	236587	236594	0 %	0 %	75 %	25 %	198282392
4528	NC_011206	TGA	2	6	236677	236682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282392
4529	NC_011206	GCCA	2	8	236691	236698	25 %	0 %	25 %	50 %	198282392
4530	NC_011206	CGG	2	6	236782	236787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282392
4531	NC_011206	CTG	2	6	236805	236810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282392
4532	NC_011206	GCA	2	6	236822	236827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282392
4533	NC_011206	GCC	2	6	236835	236840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282392
4534	NC_011206	TC	3	6	236915	236920	0 %	50 %	0 %	50 %	198282392
4535	NC_011206	GAT	2	6	236946	236951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282392
4536	NC_011206	CCA	2	6	237055	237060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282392
4537	NC_011206	CAG	2	6	237075	237080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282392
4538	NC_011206	GGC	2	6	237153	237158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282392
4539	NC_011206	CGG	2	6	237181	237186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282392
4540	NC_011206	GGGC	2	8	237200	237207	0 %	0 %	75 %	25 %	198282392
4541	NC_011206	GCCCGC	2	12	237479	237490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282393
4542	NC_011206	CAG	2	6	237558	237563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282393
4543	NC_011206	GAC	2	6	237587	237592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282393
4544	NC_011206	CG	3	6	237674	237679	0 %	0 %	50 %	50 %	198282393
4545	NC_011206	TGG	2	6	237694	237699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282393
4546	NC_011206	TCC	2	6	237822	237827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282393
4547	NC_011206	GAC	2	6	237848	237853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282393
4548	NC_011206	GGC	2	6	237893	237898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282393
4549	NC_011206	CAC	2	6	238007	238012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282393
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4551	NC_011206	AGG	2	6	238111	238116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282393
4552	NC_011206	AAC	2	6	238146	238151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282393
4553	NC_011206	GAT	3	9	238174	238182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282394
4554	NC_011206	A	6	6	238184	238189	100 %	0 %	0 %	0 %	198282394
4555	NC_011206	TAT	2	6	238259	238264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282394
4556	NC_011206	GCA	2	6	238277	238282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282394
4557	NC_011206	GAA	2	6	238339	238344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282394
4558	NC_011206	GGC	2	6	238381	238386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282394
4559	NC_011206	CGG	2	6	238402	238407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282394
4560	NC_011206	AAC	2	6	238412	238417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282394
4561	NC_011206	TGC	2	6	238425	238430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282394
4562	NC_011206	TTC	2	6	238570	238575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282395
4563	NC_011206	CGG	2	6	238597	238602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282395
4564	NC_011206	GGC	2	6	238625	238630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282395
4565	NC_011206	ATC	2	6	238701	238706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282395
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4567	NC_011206	GTG	2	6	238713	238718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282395
4568	NC_011206	T	7	7	238727	238733	0 %	100 %	0 %	0 %	198282395
4569	NC_011206	CTG	2	6	238740	238745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282395
4570	NC_011206	CAT	2	6	238772	238777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282395
4571	NC_011206	GCC	2	6	238890	238895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282395
4572	NC_011206	CAG	2	6	238979	238984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282395
4573	NC_011206	CCT	2	6	239012	239017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282395
4574	NC_011206	CTG	2	6	239034	239039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282395
4575	NC_011206	CGG	3	9	239132	239140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282395
4576	NC_011206	GCT	2	6	239336	239341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282395
4577	NC_011206	TCT	2	6	239372	239377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282395
4578	NC_011206	CGG	2	6	239399	239404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282395
4579	NC_011206	AAGG	2	8	239415	239422	50 %	0 %	50 %	0 %	198282395
4580	NC_011206	GAT	2	6	239426	239431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282395
4581	NC_011206	GCT	2	6	239457	239462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282395
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4583	NC_011206	GCGG	2	8	239484	239491	0 %	0 %	75 %	25 %	198282395
4584	NC_011206	G	6	6	239490	239495	0 %	0 %	100 %	0 %	198282395
4585	NC_011206	CGC	2	6	239498	239503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282395
4586	NC_011206	TGG	2	6	239504	239509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282395
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4588	NC_011206	GGC	3	9	239568	239576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282395
4589	NC_011206	GCG	2	6	239586	239591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282395
4590	NC_011206	GGC	2	6	239624	239629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282395
4591	NC_011206	CGG	2	6	239719	239724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282395
4592	NC_011206	GTG	2	6	239725	239730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282395
4593	NC_011206	CGC	2	6	239920	239925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282395
4594	NC_011206	CGG	2	6	239998	240003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282395
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4597	NC_011206	GGCT	2	8	240382	240389	0 %	25 %	50 %	25 %	198282396
4598	NC_011206	GCTACG	2	12	240407	240418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	198282396
4599	NC_011206	GCAA	2	8	240419	240426	50 %	0 %	25 %	25 %	198282396
4600	NC_011206	GCT	2	6	240438	240443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282396
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4604	NC_011206	TGG	2	6	240685	240690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282397
4605	NC_011206	GGT	2	6	240854	240859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282397
4606	NC_011206	CAA	2	6	240878	240883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282397
4607	NC_011206	CA	3	6	240905	240910	50 %	0 %	0 %	50 %	198282397
4608	NC_011206	TTG	2	6	240942	240947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282397
4609	NC_011206	CAT	2	6	241279	241284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282398
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4611	NC_011206	GCT	2	6	241363	241368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282398
4612	NC_011206	CT	3	6	241434	241439	0 %	50 %	0 %	50 %	198282398
4613	NC_011206	GAA	3	9	241521	241529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282398
4614	NC_011206	TTC	2	6	241593	241598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282398
4615	NC_011206	AAGC	2	8	241653	241660	50 %	0 %	25 %	25 %	198282398
4616	NC_011206	TGA	2	6	241712	241717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282398
4617	NC_011206	GATC	2	8	241767	241774	25 %	25 %	25 %	25 %	198282398
4618	NC_011206	GTT	2	6	241835	241840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282398
4619	NC_011206	AG	3	6	241851	241856	50 %	0 %	50 %	0 %	198282398
4620	NC_011206	GCT	2	6	241877	241882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282398
4621	NC_011206	CTG	2	6	241902	241907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282398
4622	NC_011206	TCG	2	6	241932	241937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282398
4623	NC_011206	CAC	2	6	241989	241994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282398
4624	NC_011206	TGG	2	6	242009	242014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282398
4625	NC_011206	GCTG	2	8	242025	242032	0 %	25 %	50 %	25 %	198282398
4626	NC_011206	CTT	3	9	242066	242074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282398
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4632	NC_011206	ATTCA	2	10	242589	242598	40 %	40 %	0 %	20 %	198282399
4633	NC_011206	CGA	2	6	242605	242610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282399
4634	NC_011206	GAT	2	6	242625	242630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282399
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4636	NC_011206	CTG	2	6	242675	242680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282399
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4642	NC_011206	TTCAA	2	10	242920	242929	40 %	40 %	0 %	20 %	198282399
4643	NC_011206	TCC	2	6	242972	242977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282399
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4659	NC_011206	TCCT	2	8	244190	244197	0 %	50 %	0 %	50 %	198282401
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4725	NC_011206	GCCG	2	8	248470	248477	0 %	0 %	50 %	50 %	198282405
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4738	NC_011206	TGGCT	2	10	249173	249182	0 %	40 %	40 %	20 %	198282406
4739	NC_011206	GCG	2	6	249253	249258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282406
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4742	NC_011206	GAA	3	9	249292	249300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282406
4743	NC_011206	GGAGAA	2	12	249304	249315	50 %	0 %	50 %	0 %	198282406
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4745	NC_011206	TCG	2	6	249393	249398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282406
4746	NC_011206	CCACT	2	10	249411	249420	20 %	20 %	0 %	60 %	198282406
4747	NC_011206	CCCGA	2	10	249457	249466	20 %	0 %	20 %	60 %	198282406
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4759	NC_011206	ATG	2	6	250034	250039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282406
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4838	NC_011206	C	6	6	255214	255219	0 %	0 %	0 %	100 %	198282410
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4850	NC_011206	GCAT	2	8	257448	257455	25 %	25 %	25 %	25 %	198282412
4851	NC_011206	ATC	2	6	257553	257558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282412
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4855	NC_011206	GA	3	6	257686	257691	50 %	0 %	50 %	0 %	198282412
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4859	NC_011206	GAT	2	6	258029	258034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282412
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4863	NC_011206	CTT	2	6	258601	258606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282413
4864	NC_011206	AGC	2	6	258638	258643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282413
4865	NC_011206	GCCC	2	8	258644	258651	0 %	0 %	25 %	75 %	198282413
4866	NC_011206	CTG	2	6	258731	258736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282413
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4872	NC_011206	CTG	2	6	259183	259188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282414
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4884	NC_011206	GTC	2	6	259980	259985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282414
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4983	NC_011206	GCC	2	6	266605	266610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282423
4984	NC_011206	ACA	2	6	266623	266628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282423
4985	NC_011206	CTG	2	6	266652	266657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282423
4986	NC_011206	TCC	2	6	266695	266700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282423
4987	NC_011206	GCCC	2	8	266755	266762	0 %	0 %	25 %	75 %	198282423
4988	NC_011206	GA	3	6	266773	266778	50 %	0 %	50 %	0 %	198282423
4989	NC_011206	GAT	2	6	266826	266831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282423
4990	NC_011206	TGG	2	6	266840	266845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282423
4991	NC_011206	CTTGGC	2	12	266877	266888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282423
4992	NC_011206	ACC	2	6	266902	266907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282423
4993	NC_011206	ATCC	2	8	266939	266946	25 %	25 %	0 %	50 %	198282423
4994	NC_011206	CGG	2	6	266958	266963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282423
4995	NC_011206	TGCCT	2	10	266971	266980	0 %	40 %	20 %	40 %	198282423
4996	NC_011206	GCG	2	6	267023	267028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282423
4997	NC_011206	TCA	2	6	267049	267054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282423
4998	NC_011206	GAT	2	6	267207	267212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282423
4999	NC_011206	ATG	2	6	267268	267273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282423
5000	NC_011206	GTG	2	6	267276	267281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282423

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