MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acinetobacter baumannii AYE plasmid p2ABAYE

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010402	GA	3	6	664	669	50 %	0 %	50 %	0 %	169302981
2	NC_010402	ACTTAG	2	12	711	722	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	169302981
3	NC_010402	AAC	2	6	726	731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302981
4	NC_010402	TTG	2	6	750	755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302981
5	NC_010402	ATCA	2	8	821	828	50 %	25 %	0 %	25 %	169302981
6	NC_010402	CG	3	6	889	894	0 %	0 %	50 %	50 %	169302981
7	NC_010402	A	6	6	914	919	100 %	0 %	0 %	0 %	169302981
8	NC_010402	CTG	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302981
9	NC_010402	GAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302981
10	NC_010402	TAG	2	6	1075	1080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302981
11	NC_010402	TAG	2	6	1084	1089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302981
12	NC_010402	AGAA	2	8	1172	1179	75 %	0 %	25 %	0 %	169302981
13	NC_010402	AAAT	2	8	1254	1261	75 %	25 %	0 %	0 %	169302981
14	NC_010402	AGA	3	9	1341	1349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302981
15	NC_010402	T	6	6	1392	1397	0 %	100 %	0 %	0 %	169302981
16	NC_010402	A	7	7	1561	1567	100 %	0 %	0 %	0 %	169302981
17	NC_010402	A	6	6	1635	1640	100 %	0 %	0 %	0 %	169302982
18	NC_010402	A	6	6	1765	1770	100 %	0 %	0 %	0 %	169302982
19	NC_010402	ATC	2	6	1775	1780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302982
20	NC_010402	AAG	2	6	1786	1791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302982
21	NC_010402	TGA	2	6	1793	1798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302982
22	NC_010402	A	7	7	1805	1811	100 %	0 %	0 %	0 %	169302982
23	NC_010402	A	6	6	1839	1844	100 %	0 %	0 %	0 %	169302982
24	NC_010402	GAA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302982
25	NC_010402	CAA	2	6	1872	1877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302982
26	NC_010402	CAG	2	6	1927	1932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302982
27	NC_010402	CAC	2	6	1933	1938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302982
28	NC_010402	ACA	2	6	1983	1988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302982
29	NC_010402	CAA	2	6	1989	1994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302982
30	NC_010402	AAT	2	6	2013	2018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302982
31	NC_010402	CACAA	2	10	2119	2128	60 %	0 %	0 %	40 %	169302982
32	NC_010402	A	6	6	2127	2132	100 %	0 %	0 %	0 %	169302982
33	NC_010402	ATT	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302983
34	NC_010402	GCT	2	6	2244	2249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302983
35	NC_010402	GAA	2	6	2295	2300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302983
36	NC_010402	AAAAAG	2	12	2318	2329	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	169302983
37	NC_010402	ATT	2	6	2343	2348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302983
38	NC_010402	ATT	2	6	2818	2823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302984
39	NC_010402	AAT	2	6	2831	2836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302984
40	NC_010402	TGC	2	6	2858	2863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302984
41	NC_010402	CAT	2	6	2875	2880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302984
42	NC_010402	ATG	2	6	2909	2914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302984
43	NC_010402	AAC	2	6	2947	2952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302984
44	NC_010402	GTA	2	6	2973	2978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302984
45	NC_010402	AGT	2	6	2996	3001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302984
46	NC_010402	CTT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302984
47	NC_010402	TCT	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302984
48	NC_010402	AATT	2	8	3208	3215	50 %	50 %	0 %	0 %	169302984
49	NC_010402	ATCA	2	8	3266	3273	50 %	25 %	0 %	25 %	169302984
50	NC_010402	CAA	2	6	3340	3345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302984
51	NC_010402	GTAG	2	8	3402	3409	25 %	25 %	50 %	0 %	169302984
52	NC_010402	GTAC	2	8	3486	3493	25 %	25 %	25 %	25 %	169302984
53	NC_010402	ACC	2	6	3536	3541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302984
54	NC_010402	T	6	6	3639	3644	0 %	100 %	0 %	0 %	169302984
55	NC_010402	TGA	2	6	3647	3652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302984
56	NC_010402	CAA	2	6	3664	3669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302984
57	NC_010402	TGAA	2	8	3703	3710	50 %	25 %	25 %	0 %	169302984
58	NC_010402	T	7	7	3714	3720	0 %	100 %	0 %	0 %	169302984
59	NC_010402	TAA	2	6	3802	3807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302984
60	NC_010402	T	6	6	3836	3841	0 %	100 %	0 %	0 %	169302984
61	NC_010402	ATA	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302984
62	NC_010402	ATA	2	6	3903	3908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302984
63	NC_010402	T	6	6	4346	4351	0 %	100 %	0 %	0 %	169302985
64	NC_010402	AGAC	2	8	4468	4475	50 %	0 %	25 %	25 %	169302985
65	NC_010402	GAA	2	6	4487	4492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302985
66	NC_010402	TGG	2	6	4536	4541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169302985
67	NC_010402	TGA	2	6	4555	4560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302985
68	NC_010402	ATC	2	6	4574	4579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302985
69	NC_010402	GCAAG	2	10	4592	4601	40 %	0 %	40 %	20 %	169302985
70	NC_010402	CA	3	6	4645	4650	50 %	0 %	0 %	50 %	169302986
71	NC_010402	GCTT	2	8	4699	4706	0 %	50 %	25 %	25 %	169302986
72	NC_010402	TGA	2	6	4724	4729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302986
73	NC_010402	CAA	2	6	4812	4817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302986
74	NC_010402	CTTG	2	8	4845	4852	0 %	50 %	25 %	25 %	169302986
75	NC_010402	ATGA	2	8	4887	4894	50 %	25 %	25 %	0 %	169302986
76	NC_010402	ATGCT	2	10	4906	4915	20 %	40 %	20 %	20 %	169302986
77	NC_010402	A	6	6	4925	4930	100 %	0 %	0 %	0 %	169302986
78	NC_010402	TCA	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302986
79	NC_010402	TAAA	2	8	5072	5079	75 %	25 %	0 %	0 %	169302987
80	NC_010402	TAC	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302987
81	NC_010402	TGA	2	6	5184	5189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302987
82	NC_010402	ATTC	2	8	5305	5312	25 %	50 %	0 %	25 %	169302987
83	NC_010402	TAT	2	6	5343	5348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302987
84	NC_010402	AGGA	2	8	5357	5364	50 %	0 %	50 %	0 %	169302987
85	NC_010402	AAT	2	6	5386	5391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
86	NC_010402	GTG	2	6	5477	5482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169302987
87	NC_010402	TAC	2	6	5583	5588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302987
88	NC_010402	CAG	2	6	5627	5632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302987
89	NC_010402	CTC	2	6	5708	5713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169302987
90	NC_010402	AGA	2	6	5742	5747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302987
91	NC_010402	ATA	2	6	5846	5851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
92	NC_010402	ATG	2	6	5882	5887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302987
93	NC_010402	A	6	6	5970	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	169302987
94	NC_010402	TAT	2	6	5986	5991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302987
95	NC_010402	GATG	2	8	6000	6007	25 %	25 %	50 %	0 %	169302987
96	NC_010402	ATTA	2	8	6016	6023	50 %	50 %	0 %	0 %	169302987
97	NC_010402	TCA	2	6	6045	6050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302987
98	NC_010402	TC	3	6	6077	6082	0 %	50 %	0 %	50 %	169302987
99	NC_010402	ATG	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302987
100	NC_010402	TA	3	6	6184	6189	50 %	50 %	0 %	0 %	169302987
101	NC_010402	ATT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302987
102	NC_010402	T	6	6	6232	6237	0 %	100 %	0 %	0 %	169302987
103	NC_010402	ATA	2	6	6329	6334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
104	NC_010402	AAG	2	6	6359	6364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302987
105	NC_010402	ACC	2	6	6370	6375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302987
106	NC_010402	CAG	2	6	6388	6393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302987
107	NC_010402	ACTTT	2	10	6458	6467	20 %	60 %	0 %	20 %	169302987
108	NC_010402	A	6	6	6521	6526	100 %	0 %	0 %	0 %	169302987
109	NC_010402	TAA	2	6	6552	6557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
110	NC_010402	A	7	7	6578	6584	100 %	0 %	0 %	0 %	169302987
111	NC_010402	TAA	2	6	6585	6590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
112	NC_010402	AAGA	2	8	6722	6729	75 %	0 %	25 %	0 %	169302987
113	NC_010402	CTA	2	6	6773	6778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302987
114	NC_010402	AAT	2	6	6823	6828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
115	NC_010402	GAT	2	6	6853	6858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302987
116	NC_010402	TACT	2	8	6879	6886	25 %	50 %	0 %	25 %	169302987
117	NC_010402	TA	4	8	6904	6911	50 %	50 %	0 %	0 %	169302987
118	NC_010402	CTG	2	6	6992	6997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302987
119	NC_010402	CT	3	6	7056	7061	0 %	50 %	0 %	50 %	169302987
120	NC_010402	CCT	2	6	7180	7185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169302987
121	NC_010402	TGA	2	6	7218	7223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302987
122	NC_010402	ATA	2	6	7268	7273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
123	NC_010402	CA	3	6	7348	7353	50 %	0 %	0 %	50 %	169302987
124	NC_010402	AAT	2	6	7378	7383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
125	NC_010402	AT	3	6	7425	7430	50 %	50 %	0 %	0 %	169302987
126	NC_010402	GAA	2	6	7442	7447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302987
127	NC_010402	TTTAG	2	10	7450	7459	20 %	60 %	20 %	0 %	169302987
128	NC_010402	AGATA	2	10	7478	7487	60 %	20 %	20 %	0 %	169302987
129	NC_010402	CT	3	6	7800	7805	0 %	50 %	0 %	50 %	169302988
130	NC_010402	CAA	2	6	7820	7825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302988
131	NC_010402	A	9	9	7824	7832	100 %	0 %	0 %	0 %	169302988
132	NC_010402	AAC	2	6	7845	7850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302988
133	NC_010402	ACT	2	6	7909	7914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302988
134	NC_010402	ATG	2	6	7995	8000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302988
135	NC_010402	TGA	2	6	8032	8037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302988
136	NC_010402	GCA	2	6	8066	8071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302988
137	NC_010402	TCA	2	6	8144	8149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302988
138	NC_010402	TGA	2	6	8164	8169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302988
139	NC_010402	TTGAT	2	10	8226	8235	20 %	60 %	20 %	0 %	169302988
140	NC_010402	TCA	2	6	8593	8598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302989
141	NC_010402	CA	3	6	8651	8656	50 %	0 %	0 %	50 %	169302989
142	NC_010402	AAT	2	6	8724	8729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302989
143	NC_010402	ACT	2	6	8740	8745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302989
144	NC_010402	ATC	2	6	8762	8767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302990
145	NC_010402	CAT	2	6	8843	8848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302990
146	NC_010402	ATC	2	6	8909	8914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302990
147	NC_010402	AAT	2	6	9009	9014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302990
148	NC_010402	A	7	7	9391	9397	100 %	0 %	0 %	0 %	169302991
149	NC_010402	A	6	6	9430	9435	100 %	0 %	0 %	0 %	169302991
150	NC_010402	GTG	2	6	9487	9492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169302991
151	NC_010402	TG	3	6	9491	9496	0 %	50 %	50 %	0 %	169302991
152	NC_010402	A	7	7	9499	9505	100 %	0 %	0 %	0 %	169302991
153	NC_010402	TTGGA	2	10	9525	9534	20 %	40 %	40 %	0 %	169302991
154	NC_010402	A	6	6	9579	9584	100 %	0 %	0 %	0 %	169302991
155	NC_010402	TATT	2	8	9586	9593	25 %	75 %	0 %	0 %	169302991
156	NC_010402	A	6	6	9613	9618	100 %	0 %	0 %	0 %	169302991
157	NC_010402	T	6	6	9623	9628	0 %	100 %	0 %	0 %	169302991

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.