MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acinetobacter baumannii AYE plasmid p1ABAYE

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010401	TGAA	2	8	626	633	50 %	25 %	25 %	0 %	169302973
2	NC_010401	AAC	2	6	667	672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302973
3	NC_010401	A	6	6	726	731	100 %	0 %	0 %	0 %	169302973
4	NC_010401	CAA	2	6	806	811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302973
5	NC_010401	TGA	2	6	817	822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302973
6	NC_010401	A	7	7	871	877	100 %	0 %	0 %	0 %	169302973
7	NC_010401	TAG	2	6	879	884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302973
8	NC_010401	A	6	6	1043	1048	100 %	0 %	0 %	0 %	169302973
9	NC_010401	A	7	7	1066	1072	100 %	0 %	0 %	0 %	169302973
10	NC_010401	ACT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302973
11	NC_010401	A	8	8	1103	1110	100 %	0 %	0 %	0 %	169302973
12	NC_010401	A	6	6	1117	1122	100 %	0 %	0 %	0 %	169302973
13	NC_010401	A	6	6	1274	1279	100 %	0 %	0 %	0 %	169302973
14	NC_010401	TGT	2	6	1288	1293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302973
15	NC_010401	GAAA	2	8	1312	1319	75 %	0 %	25 %	0 %	169302973
16	NC_010401	AG	3	6	1517	1522	50 %	0 %	50 %	0 %	169302973
17	NC_010401	ATT	2	6	1710	1715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302974
18	NC_010401	A	6	6	1734	1739	100 %	0 %	0 %	0 %	169302974
19	NC_010401	A	6	6	1767	1772	100 %	0 %	0 %	0 %	169302974
20	NC_010401	AGA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302974
21	NC_010401	GAT	2	6	1822	1827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302974
22	NC_010401	CCA	2	6	2072	2077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302975
23	NC_010401	TTA	2	6	2154	2159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302975
24	NC_010401	TATTAA	2	12	2197	2208	50 %	50 %	0 %	0 %	169302975
25	NC_010401	TA	3	6	2233	2238	50 %	50 %	0 %	0 %	169302975
26	NC_010401	TCA	2	6	2337	2342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302975
27	NC_010401	TGC	2	6	2393	2398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302975
28	NC_010401	CTG	2	6	2413	2418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302975
29	NC_010401	TAA	2	6	2531	2536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302975
30	NC_010401	A	6	6	2545	2550	100 %	0 %	0 %	0 %	169302975
31	NC_010401	GATA	2	8	2842	2849	50 %	25 %	25 %	0 %	169302976
32	NC_010401	TGA	2	6	2913	2918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302976
33	NC_010401	AAGAA	2	10	2940	2949	80 %	0 %	20 %	0 %	169302976
34	NC_010401	GTA	2	6	2962	2967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302976
35	NC_010401	AAT	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302976
36	NC_010401	AAAAC	2	10	3073	3082	80 %	0 %	0 %	20 %	169302976
37	NC_010401	AG	3	6	3085	3090	50 %	0 %	50 %	0 %	169302976
38	NC_010401	TTGA	2	8	3091	3098	25 %	50 %	25 %	0 %	169302976
39	NC_010401	AT	3	6	3145	3150	50 %	50 %	0 %	0 %	169302977
40	NC_010401	TGA	2	6	3289	3294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302977
41	NC_010401	ATCTTT	2	12	3459	3470	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169302978
42	NC_010401	TTC	2	6	3480	3485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302978
43	NC_010401	TCA	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302978
44	NC_010401	GTTT	2	8	3557	3564	0 %	75 %	25 %	0 %	169302978
45	NC_010401	ATC	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302978
46	NC_010401	T	7	7	3631	3637	0 %	100 %	0 %	0 %	169302978
47	NC_010401	AGC	2	6	3642	3647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302978
48	NC_010401	TTC	2	6	3684	3689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302978
49	NC_010401	T	6	6	3701	3706	0 %	100 %	0 %	0 %	169302978
50	NC_010401	CAAAA	2	10	3930	3939	80 %	0 %	0 %	20 %	169302979
51	NC_010401	AT	3	6	3945	3950	50 %	50 %	0 %	0 %	169302979
52	NC_010401	TAG	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302979
53	NC_010401	TGC	2	6	4004	4009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302979
54	NC_010401	A	8	8	4067	4074	100 %	0 %	0 %	0 %	169302979
55	NC_010401	AAATAC	2	12	4109	4120	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	169302979
56	NC_010401	CGAA	2	8	4166	4173	50 %	0 %	25 %	25 %	169302979
57	NC_010401	A	6	6	4278	4283	100 %	0 %	0 %	0 %	169302979
58	NC_010401	GCT	2	6	4302	4307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302979
59	NC_010401	ACAG	2	8	4323	4330	50 %	0 %	25 %	25 %	169302979
60	NC_010401	TGA	2	6	4337	4342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302979
61	NC_010401	CA	3	6	4357	4362	50 %	0 %	0 %	50 %	169302979
62	NC_010401	CAC	2	6	4370	4375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302979
63	NC_010401	A	7	7	4409	4415	100 %	0 %	0 %	0 %	169302979
64	NC_010401	GA	3	6	4463	4468	50 %	0 %	50 %	0 %	169302979
65	NC_010401	CAC	2	6	4491	4496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302979
66	NC_010401	TGA	2	6	4514	4519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302979
67	NC_010401	ATG	2	6	4639	4644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302979
68	NC_010401	A	6	6	4774	4779	100 %	0 %	0 %	0 %	169302979
69	NC_010401	GAA	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302979
70	NC_010401	AAC	2	6	4826	4831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302979
71	NC_010401	A	6	6	4872	4877	100 %	0 %	0 %	0 %	169302979
72	NC_010401	T	6	6	4887	4892	0 %	100 %	0 %	0 %	169302979
73	NC_010401	ATCA	2	8	4905	4912	50 %	25 %	0 %	25 %	169302979
74	NC_010401	CAACA	2	10	4932	4941	60 %	0 %	0 %	40 %	169302979
75	NC_010401	A	8	8	4987	4994	100 %	0 %	0 %	0 %	169302979
76	NC_010401	GA	3	6	4995	5000	50 %	0 %	50 %	0 %	169302979
77	NC_010401	TAAA	2	8	5014	5021	75 %	25 %	0 %	0 %	169302979
78	NC_010401	AGA	2	6	5027	5032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302979
79	NC_010401	GCT	2	6	5039	5044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302979
80	NC_010401	CGAAC	2	10	5075	5084	40 %	0 %	20 %	40 %	169302979
81	NC_010401	AAC	2	6	5095	5100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302979
82	NC_010401	ATC	2	6	5131	5136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302979
83	NC_010401	TA	3	6	5214	5219	50 %	50 %	0 %	0 %	169302979
84	NC_010401	GAA	2	6	5223	5228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302979
85	NC_010401	AAAT	2	8	5240	5247	75 %	25 %	0 %	0 %	169302979
86	NC_010401	AGA	2	6	5291	5296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302979
87	NC_010401	A	8	8	5339	5346	100 %	0 %	0 %	0 %	169302979
88	NC_010401	GCA	2	6	5360	5365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302979
89	NC_010401	A	6	6	5377	5382	100 %	0 %	0 %	0 %	169302979
90	NC_010401	CAG	2	6	5430	5435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302979
91	NC_010401	CAA	2	6	5454	5459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302979
92	NC_010401	AAC	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302979
93	NC_010401	CAA	2	6	5487	5492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302979
94	NC_010401	CAAGAA	2	12	5517	5528	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	169302979
95	NC_010401	CAG	2	6	5532	5537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302979

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.