MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acinetobacter baumannii SDF plasmid p3ABSDF

Total Repeats: 400

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010398	GAA	2	6	562	567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786865
2	NC_010398	AACAG	2	10	622	631	60 %	0 %	20 %	20 %	169786865
3	NC_010398	CAT	2	6	649	654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786865
4	NC_010398	CAGGG	2	10	669	678	20 %	0 %	60 %	20 %	169786865
5	NC_010398	GTT	2	6	727	732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786865
6	NC_010398	AAG	2	6	768	773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786865
7	NC_010398	T	6	6	870	875	0 %	100 %	0 %	0 %	169786865
8	NC_010398	TGA	2	6	880	885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786865
9	NC_010398	TGT	2	6	919	924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786865
10	NC_010398	AGA	2	6	943	948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786865
11	NC_010398	AAGT	2	8	991	998	50 %	25 %	25 %	0 %	169786865
12	NC_010398	CTA	2	6	1002	1007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786865
13	NC_010398	CTT	2	6	1019	1024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786865
14	NC_010398	A	6	6	1202	1207	100 %	0 %	0 %	0 %	169786865
15	NC_010398	T	6	6	1295	1300	0 %	100 %	0 %	0 %	169786865
16	NC_010398	ATTT	2	8	1326	1333	25 %	75 %	0 %	0 %	169786865
17	NC_010398	CAA	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786865
18	NC_010398	AG	3	6	1445	1450	50 %	0 %	50 %	0 %	169786865
19	NC_010398	CAGC	2	8	1481	1488	25 %	0 %	25 %	50 %	169786865
20	NC_010398	TA	3	6	1564	1569	50 %	50 %	0 %	0 %	169786866
21	NC_010398	AAG	2	6	1617	1622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786866
22	NC_010398	A	6	6	1694	1699	100 %	0 %	0 %	0 %	169786866
23	NC_010398	A	6	6	1777	1782	100 %	0 %	0 %	0 %	169786866
24	NC_010398	TGG	2	6	1879	1884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786866
25	NC_010398	TATT	2	8	1896	1903	25 %	75 %	0 %	0 %	169786866
26	NC_010398	AAC	2	6	1927	1932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786866
27	NC_010398	ACA	2	6	1954	1959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786866
28	NC_010398	GGAAA	2	10	1986	1995	60 %	0 %	40 %	0 %	169786866
29	NC_010398	TGG	2	6	2033	2038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786866
30	NC_010398	TG	3	6	2049	2054	0 %	50 %	50 %	0 %	169786866
31	NC_010398	AAT	2	6	2065	2070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786866
32	NC_010398	A	6	6	2278	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	169786867
33	NC_010398	TCT	2	6	2284	2289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786867
34	NC_010398	TA	3	6	2295	2300	50 %	50 %	0 %	0 %	169786867
35	NC_010398	TAAAT	2	10	2344	2353	60 %	40 %	0 %	0 %	169786867
36	NC_010398	T	8	8	2356	2363	0 %	100 %	0 %	0 %	169786867
37	NC_010398	AATTA	2	10	2364	2373	60 %	40 %	0 %	0 %	169786867
38	NC_010398	CAC	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786867
39	NC_010398	CAA	2	6	2396	2401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786867
40	NC_010398	T	7	7	2414	2420	0 %	100 %	0 %	0 %	169786867
41	NC_010398	TCA	2	6	2428	2433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786867
42	NC_010398	A	7	7	2433	2439	100 %	0 %	0 %	0 %	169786867
43	NC_010398	AGA	2	6	2448	2453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786867
44	NC_010398	T	6	6	2467	2472	0 %	100 %	0 %	0 %	169786867
45	NC_010398	ATC	2	6	2487	2492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786867
46	NC_010398	TAAA	2	8	2496	2503	75 %	25 %	0 %	0 %	169786867
47	NC_010398	ATT	2	6	2544	2549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786867
48	NC_010398	GTA	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786867
49	NC_010398	AT	3	6	2601	2606	50 %	50 %	0 %	0 %	169786867
50	NC_010398	AAT	2	6	2643	2648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786867
51	NC_010398	TTA	2	6	2656	2661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786867
52	NC_010398	T	6	6	2700	2705	0 %	100 %	0 %	0 %	169786867
53	NC_010398	AT	3	6	2720	2725	50 %	50 %	0 %	0 %	169786867
54	NC_010398	ATC	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786867
55	NC_010398	AAAT	2	8	2775	2782	75 %	25 %	0 %	0 %	169786867
56	NC_010398	T	6	6	2784	2789	0 %	100 %	0 %	0 %	169786867
57	NC_010398	AAT	2	6	2837	2842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786867
58	NC_010398	A	8	8	2883	2890	100 %	0 %	0 %	0 %	169786867
59	NC_010398	AAG	2	6	2927	2932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786867
60	NC_010398	TAA	2	6	2946	2951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786867
61	NC_010398	TAA	2	6	2955	2960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786867
62	NC_010398	TAT	2	6	2969	2974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786867
63	NC_010398	T	8	8	3221	3228	0 %	100 %	0 %	0 %	169786868
64	NC_010398	AT	3	6	3257	3262	50 %	50 %	0 %	0 %	169786868
65	NC_010398	ATTTT	2	10	3293	3302	20 %	80 %	0 %	0 %	169786868
66	NC_010398	T	6	6	3299	3304	0 %	100 %	0 %	0 %	169786868
67	NC_010398	TCAT	2	8	3311	3318	25 %	50 %	0 %	25 %	169786868
68	NC_010398	CCA	2	6	3344	3349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786868
69	NC_010398	ACA	2	6	3371	3376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786868
70	NC_010398	ATA	2	6	3406	3411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786868
71	NC_010398	TCA	2	6	3419	3424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786868
72	NC_010398	TAA	2	6	3448	3453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786868
73	NC_010398	CCA	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786868
74	NC_010398	ATC	2	6	3487	3492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786868
75	NC_010398	TAA	2	6	3511	3516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786868
76	NC_010398	AC	3	6	3522	3527	50 %	0 %	0 %	50 %	169786868
77	NC_010398	AT	3	6	3536	3541	50 %	50 %	0 %	0 %	169786868
78	NC_010398	CT	3	6	3563	3568	0 %	50 %	0 %	50 %	169786869
79	NC_010398	T	6	6	3623	3628	0 %	100 %	0 %	0 %	169786869
80	NC_010398	T	7	7	3702	3708	0 %	100 %	0 %	0 %	169786869
81	NC_010398	CCAA	2	8	3768	3775	50 %	0 %	0 %	50 %	169786869
82	NC_010398	T	6	6	3789	3794	0 %	100 %	0 %	0 %	169786869
83	NC_010398	T	7	7	3850	3856	0 %	100 %	0 %	0 %	169786869
84	NC_010398	T	6	6	3897	3902	0 %	100 %	0 %	0 %	169786869
85	NC_010398	ATA	2	6	3903	3908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786869
86	NC_010398	ATC	2	6	3918	3923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786869
87	NC_010398	CCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786869
88	NC_010398	TTAA	2	8	3943	3950	50 %	50 %	0 %	0 %	169786869
89	NC_010398	TGT	2	6	3954	3959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786869
90	NC_010398	AT	3	6	3984	3989	50 %	50 %	0 %	0 %	169786869
91	NC_010398	T	7	7	4048	4054	0 %	100 %	0 %	0 %	169786869
92	NC_010398	A	6	6	4084	4089	100 %	0 %	0 %	0 %	169786869
93	NC_010398	T	8	8	4123	4130	0 %	100 %	0 %	0 %	169786869
94	NC_010398	CAT	2	6	4166	4171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786869
95	NC_010398	CTT	2	6	4205	4210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786869
96	NC_010398	AT	3	6	4274	4279	50 %	50 %	0 %	0 %	169786869
97	NC_010398	T	6	6	4290	4295	0 %	100 %	0 %	0 %	169786869
98	NC_010398	TATTT	2	10	4332	4341	20 %	80 %	0 %	0 %	169786869
99	NC_010398	T	6	6	4339	4344	0 %	100 %	0 %	0 %	169786869
100	NC_010398	TTA	2	6	4346	4351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786869
101	NC_010398	T	6	6	4399	4404	0 %	100 %	0 %	0 %	169786869
102	NC_010398	TCA	2	6	4426	4431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786869
103	NC_010398	AGT	2	6	4437	4442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786869
104	NC_010398	TTA	2	6	4447	4452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786869
105	NC_010398	GAG	2	6	4514	4519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169786869
106	NC_010398	TAT	2	6	4532	4537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786869
107	NC_010398	CTT	2	6	4607	4612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786869
108	NC_010398	TC	3	6	4646	4651	0 %	50 %	0 %	50 %	169786869
109	NC_010398	TCTTG	2	10	4697	4706	0 %	60 %	20 %	20 %	169786869
110	NC_010398	TAG	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786869
111	NC_010398	TTA	2	6	4963	4968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786869
112	NC_010398	T	8	8	4969	4976	0 %	100 %	0 %	0 %	169786869
113	NC_010398	ATT	2	6	5025	5030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786869
114	NC_010398	CAA	2	6	5036	5041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786869
115	NC_010398	TCA	2	6	5140	5145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786870
116	NC_010398	AAT	2	6	5179	5184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786870
117	NC_010398	CTT	2	6	5201	5206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786870
118	NC_010398	TCT	2	6	5230	5235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786870
119	NC_010398	ATT	2	6	5241	5246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786870
120	NC_010398	T	7	7	5301	5307	0 %	100 %	0 %	0 %	169786870
121	NC_010398	TCA	2	6	5311	5316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786870
122	NC_010398	AAC	2	6	5418	5423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786870
123	NC_010398	GCC	2	6	5430	5435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786870
124	NC_010398	CAT	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786870
125	NC_010398	TGA	2	6	5504	5509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786870
126	NC_010398	GCCA	2	8	5523	5530	25 %	0 %	25 %	50 %	169786870
127	NC_010398	GAT	2	6	5609	5614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786871
128	NC_010398	ATTG	2	8	5642	5649	25 %	50 %	25 %	0 %	169786871
129	NC_010398	CAT	2	6	5783	5788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786871
130	NC_010398	AGA	2	6	5813	5818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786871
131	NC_010398	TTA	2	6	5871	5876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786871
132	NC_010398	TCA	2	6	5899	5904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786871
133	NC_010398	ATTCC	2	10	5953	5962	20 %	40 %	0 %	40 %	169786871
134	NC_010398	CTT	2	6	5972	5977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786871
135	NC_010398	AGT	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786871
136	NC_010398	CAA	2	6	6165	6170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786871
137	NC_010398	CAC	2	6	6298	6303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786871
138	NC_010398	AATTA	2	10	6313	6322	60 %	40 %	0 %	0 %	169786871
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399	NC_010398	T	6	6	24623	24628	0 %	100 %	0 %	0 %	169786888
400	NC_010398	TCA	2	6	24697	24702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786888

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.