MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acinetobacter baumannii SDF plasmid p2ABSDF

Total Repeats: 400

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010396	ATCAA	2	10	516	525	60 %	20 %	0 %	20 %	169786834
2	NC_010396	A	6	6	597	602	100 %	0 %	0 %	0 %	169786834
3	NC_010396	GAT	2	6	616	621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786834
4	NC_010396	A	6	6	671	676	100 %	0 %	0 %	0 %	169786834
5	NC_010396	AAGG	2	8	694	701	50 %	0 %	50 %	0 %	169786834
6	NC_010396	TGA	2	6	741	746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786834
7	NC_010396	AAG	2	6	773	778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786834
8	NC_010396	ATCTA	2	10	843	852	40 %	40 %	0 %	20 %	169786834
9	NC_010396	AATA	2	8	894	901	75 %	25 %	0 %	0 %	169786834
10	NC_010396	TAT	2	6	1128	1133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786834
11	NC_010396	T	6	6	1133	1138	0 %	100 %	0 %	0 %	169786834
12	NC_010396	AAAGA	2	10	1144	1153	80 %	0 %	20 %	0 %	169786834
13	NC_010396	TCA	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786834
14	NC_010396	ATG	2	6	1289	1294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786834
15	NC_010396	GA	3	6	1323	1328	50 %	0 %	50 %	0 %	169786834
16	NC_010396	A	6	6	1362	1367	100 %	0 %	0 %	0 %	169786834
17	NC_010396	TGC	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786835
18	NC_010396	A	6	6	1498	1503	100 %	0 %	0 %	0 %	169786835
19	NC_010396	A	6	6	1530	1535	100 %	0 %	0 %	0 %	169786835
20	NC_010396	ATG	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786835
21	NC_010396	TGG	2	6	1608	1613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786835
22	NC_010396	ATA	2	6	1676	1681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786835
23	NC_010396	GTT	2	6	1684	1689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786835
24	NC_010396	GATT	2	8	1704	1711	25 %	50 %	25 %	0 %	169786835
25	NC_010396	T	6	6	1710	1715	0 %	100 %	0 %	0 %	169786835
26	NC_010396	AGA	2	6	1737	1742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786835
27	NC_010396	CCA	2	6	1801	1806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786835
28	NC_010396	AGC	2	6	1832	1837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786835
29	NC_010396	A	7	7	1872	1878	100 %	0 %	0 %	0 %	169786835
30	NC_010396	ACT	2	6	1897	1902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786835
31	NC_010396	A	6	6	1952	1957	100 %	0 %	0 %	0 %	169786835
32	NC_010396	T	6	6	1974	1979	0 %	100 %	0 %	0 %	169786835
33	NC_010396	TAAT	2	8	2181	2188	50 %	50 %	0 %	0 %	169786836
34	NC_010396	CTT	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786836
35	NC_010396	TCA	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786836
36	NC_010396	CT	3	6	2272	2277	0 %	50 %	0 %	50 %	169786836
37	NC_010396	TTC	2	6	2289	2294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786836
38	NC_010396	TTC	2	6	2296	2301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786836
39	NC_010396	AT	3	6	2420	2425	50 %	50 %	0 %	0 %	169786836
40	NC_010396	T	7	7	2445	2451	0 %	100 %	0 %	0 %	169786836
41	NC_010396	TA	3	6	2465	2470	50 %	50 %	0 %	0 %	169786836
42	NC_010396	ATG	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786836
43	NC_010396	TCT	2	6	2612	2617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786836
44	NC_010396	CTC	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169786836
45	NC_010396	TTTA	2	8	2731	2738	25 %	75 %	0 %	0 %	169786836
46	NC_010396	A	6	6	2802	2807	100 %	0 %	0 %	0 %	169786836
47	NC_010396	AGCTA	2	10	2818	2827	40 %	20 %	20 %	20 %	169786836
48	NC_010396	GGT	2	6	2864	2869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786836
49	NC_010396	T	6	6	3005	3010	0 %	100 %	0 %	0 %	169786836
50	NC_010396	AAG	2	6	3031	3036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786836
51	NC_010396	AAT	2	6	3069	3074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786836
52	NC_010396	CAT	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786836
53	NC_010396	AAT	2	6	3143	3148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786837
54	NC_010396	CTG	2	6	3211	3216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786837
55	NC_010396	GTT	2	6	3475	3480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786837
56	NC_010396	TC	3	6	3540	3545	0 %	50 %	0 %	50 %	169786837
57	NC_010396	CTTTT	2	10	3556	3565	0 %	80 %	0 %	20 %	169786837
58	NC_010396	ATG	2	6	3636	3641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786837
59	NC_010396	AAC	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786837
60	NC_010396	CTT	2	6	3673	3678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786837
61	NC_010396	ATAA	2	8	3777	3784	75 %	25 %	0 %	0 %	169786837
62	NC_010396	AAT	2	6	3851	3856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786837
63	NC_010396	CTG	2	6	3901	3906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786837
64	NC_010396	AAT	2	6	3943	3948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786837
65	NC_010396	TTC	2	6	4018	4023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786837
66	NC_010396	AGAC	2	8	4085	4092	50 %	0 %	25 %	25 %	169786837
67	NC_010396	ATC	2	6	4095	4100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786837
68	NC_010396	TGT	3	9	4107	4115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786837
69	NC_010396	TGT	2	6	4166	4171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786837
70	NC_010396	ATC	2	6	4207	4212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786838
71	NC_010396	TCT	2	6	4268	4273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786838
72	NC_010396	TAT	2	6	4305	4310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786838
73	NC_010396	AATG	2	8	4507	4514	50 %	25 %	25 %	0 %	169786838
74	NC_010396	TTA	2	6	4526	4531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786838
75	NC_010396	ATG	2	6	4532	4537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786838
76	NC_010396	ACC	2	6	4546	4551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786838
77	NC_010396	CAT	2	6	4683	4688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786839
78	NC_010396	TGC	2	6	4692	4697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786839
79	NC_010396	AAG	2	6	4706	4711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786839
80	NC_010396	AAG	2	6	4721	4726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786839
81	NC_010396	ATCC	2	8	4765	4772	25 %	25 %	0 %	50 %	169786839
82	NC_010396	ATT	2	6	4786	4791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786839
83	NC_010396	GA	3	6	4902	4907	50 %	0 %	50 %	0 %	169786839
84	NC_010396	GAG	2	6	5011	5016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169786839
85	NC_010396	ATC	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786839
86	NC_010396	ATTA	2	8	5161	5168	50 %	50 %	0 %	0 %	169786839
87	NC_010396	AAAGC	2	10	5199	5208	60 %	0 %	20 %	20 %	169786839
88	NC_010396	TGA	2	6	5222	5227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786839
89	NC_010396	T	8	8	5243	5250	0 %	100 %	0 %	0 %	169786839
90	NC_010396	ATTC	2	8	5625	5632	25 %	50 %	0 %	25 %	169786840
91	NC_010396	A	7	7	6357	6363	100 %	0 %	0 %	0 %	169786841
92	NC_010396	A	6	6	6408	6413	100 %	0 %	0 %	0 %	169786841
93	NC_010396	GAAT	2	8	6521	6528	50 %	25 %	25 %	0 %	169786841
94	NC_010396	A	6	6	6558	6563	100 %	0 %	0 %	0 %	169786841
95	NC_010396	AATT	2	8	6581	6588	50 %	50 %	0 %	0 %	169786841
96	NC_010396	A	8	8	6594	6601	100 %	0 %	0 %	0 %	169786841
97	NC_010396	ATT	2	6	6765	6770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786841
98	NC_010396	CAC	2	6	6814	6819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786841
99	NC_010396	AAG	2	6	6904	6909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786841
100	NC_010396	AAG	2	6	6915	6920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786841
101	NC_010396	TGC	2	6	6944	6949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786841
102	NC_010396	TA	3	6	6963	6968	50 %	50 %	0 %	0 %	169786841
103	NC_010396	AGA	2	6	7010	7015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786841
104	NC_010396	GAA	2	6	7029	7034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786841
105	NC_010396	A	6	6	7086	7091	100 %	0 %	0 %	0 %	169786841
106	NC_010396	ATC	2	6	7127	7132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786842
107	NC_010396	AAT	2	6	7139	7144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786842
108	NC_010396	TG	3	6	7270	7275	0 %	50 %	50 %	0 %	169786842
109	NC_010396	TTG	2	6	7320	7325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786842
110	NC_010396	TCAT	2	8	7432	7439	25 %	50 %	0 %	25 %	169786842
111	NC_010396	GGAT	2	8	7444	7451	25 %	25 %	50 %	0 %	169786842
112	NC_010396	A	6	6	7482	7487	100 %	0 %	0 %	0 %	169786842
113	NC_010396	GGAAT	2	10	7498	7507	40 %	20 %	40 %	0 %	169786842
114	NC_010396	T	6	6	7565	7570	0 %	100 %	0 %	0 %	169786842
115	NC_010396	TCT	2	6	7642	7647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786842
116	NC_010396	T	6	6	7733	7738	0 %	100 %	0 %	0 %	169786842
117	NC_010396	TTC	2	6	7740	7745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786842
118	NC_010396	GAT	2	6	7839	7844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786842
119	NC_010396	AGG	2	6	8017	8022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169786843
120	NC_010396	TCC	2	6	8044	8049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169786843
121	NC_010396	CAA	2	6	8149	8154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786843
122	NC_010396	ATA	2	6	8160	8165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786843
123	NC_010396	GAAT	2	8	8208	8215	50 %	25 %	25 %	0 %	169786843
124	NC_010396	TAA	2	6	8221	8226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786843
125	NC_010396	TGA	3	9	8254	8262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786843
126	NC_010396	GAT	3	9	8279	8287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786843
127	NC_010396	GAA	2	6	8291	8296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786843
128	NC_010396	GAT	2	6	8297	8302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786843
129	NC_010396	TAACTG	2	12	8311	8322	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	169786843
130	NC_010396	ATG	2	6	8331	8336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786843
131	NC_010396	ATCATG	2	12	8337	8348	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	169786843
132	NC_010396	TCA	2	6	8421	8426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786844
133	NC_010396	TTA	2	6	8620	8625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786844
134	NC_010396	TTG	2	6	8687	8692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786844
135	NC_010396	GAT	2	6	8722	8727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786844
136	NC_010396	AAT	2	6	8728	8733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786844
137	NC_010396	GAAT	2	8	8742	8749	50 %	25 %	25 %	0 %	169786844
138	NC_010396	TAA	2	6	8760	8765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786844
139	NC_010396	A	6	6	8818	8823	100 %	0 %	0 %	0 %	169786844
140	NC_010396	CAC	2	6	8840	8845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786844
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142	NC_010396	A	6	6	8891	8896	100 %	0 %	0 %	0 %	169786844
143	NC_010396	ACTG	2	8	8946	8953	25 %	25 %	25 %	25 %	169786844
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168	NC_010396	G	6	6	9929	9934	0 %	0 %	100 %	0 %	169786845
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255	NC_010396	ACTA	2	8	16284	16291	50 %	25 %	0 %	25 %	169786851
256	NC_010396	TA	3	6	16298	16303	50 %	50 %	0 %	0 %	169786851
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263	NC_010396	A	7	7	16493	16499	100 %	0 %	0 %	0 %	169786851
264	NC_010396	TAA	2	6	16521	16526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786851
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397	NC_010396	TAAA	2	8	23891	23898	75 %	25 %	0 %	0 %	169786862
398	NC_010396	TTG	2	6	23967	23972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786863
399	NC_010396	GAT	2	6	24108	24113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786863
400	NC_010396	AAG	2	6	24144	24149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786863

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.