MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB2

Total Repeats: 5087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009927	TTTC	2	8	216374	216381	0 %	75 %	0 %	25 %	158340147
3002	NC_009927	TCCAA	2	10	216450	216459	40 %	20 %	0 %	40 %	158340147
3003	NC_009927	AGC	2	6	216506	216511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340147
3004	NC_009927	CTT	2	6	216529	216534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340147
3005	NC_009927	AGG	2	6	216592	216597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340147
3006	NC_009927	GGCT	2	8	216624	216631	0 %	25 %	50 %	25 %	158340147
3007	NC_009927	GCTT	2	8	216669	216676	0 %	50 %	25 %	25 %	158340147
3008	NC_009927	GTT	2	6	216720	216725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340147
3009	NC_009927	CGT	2	6	216868	216873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340147
3010	NC_009927	GTG	2	6	216884	216889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340147
3011	NC_009927	TCG	2	6	217141	217146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340147
3012	NC_009927	CCA	2	6	217191	217196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340147
3013	NC_009927	T	8	8	217221	217228	0 %	100 %	0 %	0 %	158340147
3014	NC_009927	TAC	2	6	217328	217333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340147
3015	NC_009927	ATTCG	2	10	217348	217357	20 %	40 %	20 %	20 %	158340147
3016	NC_009927	TGC	2	6	217528	217533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340147
3017	NC_009927	ACC	2	6	217547	217552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340147
3018	NC_009927	GCA	2	6	217632	217637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340147
3019	NC_009927	CTT	2	6	217682	217687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340147
3020	NC_009927	TGA	2	6	217717	217722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340147
3021	NC_009927	CTG	2	6	217846	217851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340147
3022	NC_009927	T	6	6	218185	218190	0 %	100 %	0 %	0 %	158340147
3023	NC_009927	TCC	2	6	218332	218337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340147
3024	NC_009927	TTG	2	6	218429	218434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340147
3025	NC_009927	CAGAC	2	10	218464	218473	40 %	0 %	20 %	40 %	158340147
3026	NC_009927	TCA	2	6	218524	218529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340147
3027	NC_009927	TGA	2	6	218544	218549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340147
3028	NC_009927	TGA	2	6	218606	218611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340147
3029	NC_009927	TTC	2	6	218649	218654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340147
3030	NC_009927	TTCT	2	8	218825	218832	0 %	75 %	0 %	25 %	158340147
3031	NC_009927	CAG	2	6	218873	218878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340147
3032	NC_009927	CAAA	2	8	218911	218918	75 %	0 %	0 %	25 %	158340147
3033	NC_009927	A	6	6	218916	218921	100 %	0 %	0 %	0 %	158340147
3034	NC_009927	GAT	2	6	218927	218932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340147
3035	NC_009927	GCC	2	6	219045	219050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340147
3036	NC_009927	ACC	2	6	219148	219153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340148
3037	NC_009927	T	6	6	219229	219234	0 %	100 %	0 %	0 %	158340148
3038	NC_009927	G	6	6	219237	219242	0 %	0 %	100 %	0 %	158340148
3039	NC_009927	ATC	2	6	219278	219283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340148
3040	NC_009927	CCA	2	6	219285	219290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340148
3041	NC_009927	CAC	2	6	219310	219315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340148
3042	NC_009927	CAG	2	6	219342	219347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340148
3043	NC_009927	CAC	2	6	219348	219353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340148
3044	NC_009927	C	6	6	219434	219439	0 %	0 %	0 %	100 %	158340148
3045	NC_009927	GTA	2	6	219501	219506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340148
3046	NC_009927	A	7	7	219519	219525	100 %	0 %	0 %	0 %	158340148
3047	NC_009927	AGT	2	6	219599	219604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340148
3048	NC_009927	ATT	2	6	219623	219628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340148
3049	NC_009927	CGC	2	6	219847	219852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340149
3050	NC_009927	GTC	2	6	219866	219871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340149
3051	NC_009927	TCT	2	6	219877	219882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340149
3052	NC_009927	CTGA	2	8	219946	219953	25 %	25 %	25 %	25 %	158340149
3053	NC_009927	TTG	2	6	220041	220046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340149
3054	NC_009927	G	6	6	220205	220210	0 %	0 %	100 %	0 %	158340149
3055	NC_009927	GA	3	6	220218	220223	50 %	0 %	50 %	0 %	158340149
3056	NC_009927	TTA	2	6	220233	220238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340149
3057	NC_009927	TGAA	2	8	220259	220266	50 %	25 %	25 %	0 %	158340149
3058	NC_009927	CTG	2	6	220286	220291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340149
3059	NC_009927	GGCTG	2	10	220329	220338	0 %	20 %	60 %	20 %	158340149
3060	NC_009927	GGA	2	6	220480	220485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340149
3061	NC_009927	TC	4	8	220494	220501	0 %	50 %	0 %	50 %	158340149
3062	NC_009927	TTA	2	6	220629	220634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340150
3063	NC_009927	TGT	2	6	220715	220720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340150
3064	NC_009927	T	6	6	220749	220754	0 %	100 %	0 %	0 %	158340150
3065	NC_009927	GAA	2	6	220765	220770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340150
3066	NC_009927	TCCT	2	8	220779	220786	0 %	50 %	0 %	50 %	158340150
3067	NC_009927	GGA	2	6	220817	220822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340150
3068	NC_009927	CAGG	2	8	220898	220905	25 %	0 %	50 %	25 %	158340150
3069	NC_009927	AG	3	6	220908	220913	50 %	0 %	50 %	0 %	158340150
3070	NC_009927	TTC	2	6	220920	220925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340150
3071	NC_009927	TGG	2	6	220928	220933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340150
3072	NC_009927	AAC	2	6	221076	221081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340150
3073	NC_009927	AAC	2	6	221157	221162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340150
3074	NC_009927	T	6	6	221241	221246	0 %	100 %	0 %	0 %	158340150
3075	NC_009927	CT	3	6	221261	221266	0 %	50 %	0 %	50 %	158340150
3076	NC_009927	CT	3	6	221362	221367	0 %	50 %	0 %	50 %	158340150
3077	NC_009927	GAA	2	6	221378	221383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340150
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3081	NC_009927	TAA	2	6	221720	221725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340150
3082	NC_009927	TCG	2	6	221743	221748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340150
3083	NC_009927	CTT	2	6	221751	221756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340150
3084	NC_009927	TGC	2	6	221757	221762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340150
3085	NC_009927	CCG	2	6	221771	221776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340150
3086	NC_009927	GTA	2	6	221998	222003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340150
3087	NC_009927	TCG	2	6	222038	222043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340150
3088	NC_009927	TTC	2	6	222066	222071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340150
3089	NC_009927	GAA	2	6	222085	222090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340150
3090	NC_009927	CGA	2	6	222150	222155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340150
3091	NC_009927	CGAT	2	8	222400	222407	25 %	25 %	25 %	25 %	158340152
3092	NC_009927	TGT	2	6	222435	222440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340152
3093	NC_009927	CCA	2	6	222524	222529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340152
3094	NC_009927	TGC	2	6	222552	222557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340152
3095	NC_009927	AATG	2	8	222724	222731	50 %	25 %	25 %	0 %	158340153
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3097	NC_009927	TGG	2	6	222763	222768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340153
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3099	NC_009927	TTAT	2	8	222869	222876	25 %	75 %	0 %	0 %	158340153
3100	NC_009927	ATT	2	6	222923	222928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340153
3101	NC_009927	AGA	2	6	222952	222957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340153
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3103	NC_009927	T	6	6	222992	222997	0 %	100 %	0 %	0 %	158340153
3104	NC_009927	CAC	2	6	223000	223005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340153
3105	NC_009927	T	7	7	223028	223034	0 %	100 %	0 %	0 %	158340153
3106	NC_009927	AG	3	6	223052	223057	50 %	0 %	50 %	0 %	158340153
3107	NC_009927	TCAAA	2	10	223083	223092	60 %	20 %	0 %	20 %	158340153
3108	NC_009927	TC	3	6	223106	223111	0 %	50 %	0 %	50 %	158340153
3109	NC_009927	ACA	2	6	223120	223125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340153
3110	NC_009927	T	7	7	223128	223134	0 %	100 %	0 %	0 %	158340153
3111	NC_009927	AT	3	6	223148	223153	50 %	50 %	0 %	0 %	158340153
3112	NC_009927	GTTT	2	8	223274	223281	0 %	75 %	25 %	0 %	158340153
3113	NC_009927	CT	3	6	223495	223500	0 %	50 %	0 %	50 %	158340154
3114	NC_009927	CCA	2	6	223517	223522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340154
3115	NC_009927	TCC	2	6	223588	223593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340154
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3117	NC_009927	TGA	2	6	223643	223648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340154
3118	NC_009927	T	6	6	224016	224021	0 %	100 %	0 %	0 %	158340155
3119	NC_009927	GAATA	2	10	224094	224103	60 %	20 %	20 %	0 %	158340155
3120	NC_009927	ATC	2	6	224155	224160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340155
3121	NC_009927	TA	3	6	224193	224198	50 %	50 %	0 %	0 %	158340155
3122	NC_009927	TC	3	6	224201	224206	0 %	50 %	0 %	50 %	158340155
3123	NC_009927	T	7	7	224214	224220	0 %	100 %	0 %	0 %	158340155
3124	NC_009927	TCT	2	6	224252	224257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340155
3125	NC_009927	T	7	7	224273	224279	0 %	100 %	0 %	0 %	158340155
3126	NC_009927	TTC	2	6	224308	224313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340155
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3128	NC_009927	AAT	2	6	224414	224419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340155
3129	NC_009927	GA	3	6	224446	224451	50 %	0 %	50 %	0 %	158340155
3130	NC_009927	CTT	2	6	224469	224474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340155
3131	NC_009927	TCAATA	2	12	224495	224506	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158340155
3132	NC_009927	AAT	2	6	224565	224570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340155
3133	NC_009927	CTT	2	6	224613	224618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340155
3134	NC_009927	TCT	2	6	224624	224629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340155
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3136	NC_009927	TCA	2	6	224687	224692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340155
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3138	NC_009927	GATT	2	8	224756	224763	25 %	50 %	25 %	0 %	158340155
3139	NC_009927	TGC	2	6	224848	224853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340155
3140	NC_009927	GCA	2	6	224855	224860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340155
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3142	NC_009927	GCT	2	6	224960	224965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340155
3143	NC_009927	CTG	2	6	225025	225030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340155
3144	NC_009927	AAT	2	6	225031	225036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340155
3145	NC_009927	TAC	2	6	225060	225065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340155
3146	NC_009927	ATG	2	6	225121	225126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340155
3147	NC_009927	TTTC	2	8	225147	225154	0 %	75 %	0 %	25 %	158340155
3148	NC_009927	AAC	2	6	225205	225210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340155
3149	NC_009927	TAT	2	6	225324	225329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340155
3150	NC_009927	ATCT	2	8	225339	225346	25 %	50 %	0 %	25 %	158340155
3151	NC_009927	C	6	6	225428	225433	0 %	0 %	0 %	100 %	158340155
3152	NC_009927	CCA	2	6	225554	225559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340155
3153	NC_009927	AT	5	10	225581	225590	50 %	50 %	0 %	0 %	158340155
3154	NC_009927	CTT	2	6	225648	225653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340155
3155	NC_009927	TAA	2	6	225663	225668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340155
3156	NC_009927	CAT	2	6	226096	226101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340156
3157	NC_009927	C	6	6	226104	226109	0 %	0 %	0 %	100 %	158340156
3158	NC_009927	CT	3	6	226360	226365	0 %	50 %	0 %	50 %	158340156
3159	NC_009927	TTG	2	6	226374	226379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340156
3160	NC_009927	TGA	2	6	226408	226413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340156
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3162	NC_009927	TCA	2	6	226495	226500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340156
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3228	NC_009927	TCG	2	6	231011	231016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340157
3229	NC_009927	ATC	2	6	231040	231045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340157
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3231	NC_009927	TCTGC	2	10	231066	231075	0 %	40 %	20 %	40 %	158340157
3232	NC_009927	TTC	2	6	231184	231189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340157
3233	NC_009927	TGCT	2	8	231232	231239	0 %	50 %	25 %	25 %	158340157
3234	NC_009927	CTG	2	6	231298	231303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340157
3235	NC_009927	CTG	2	6	231335	231340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340157
3236	NC_009927	AGT	2	6	231586	231591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340157
3237	NC_009927	AG	3	6	231770	231775	50 %	0 %	50 %	0 %	158340158
3238	NC_009927	AATTG	2	10	231778	231787	40 %	40 %	20 %	0 %	158340158
3239	NC_009927	AAT	2	6	231814	231819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340158
3240	NC_009927	CTG	2	6	231876	231881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340158
3241	NC_009927	GGT	2	6	231926	231931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340158
3242	NC_009927	AGCCA	2	10	231943	231952	40 %	0 %	20 %	40 %	158340158
3243	NC_009927	ACC	2	6	232570	232575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340159
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3245	NC_009927	GAAT	2	8	232731	232738	50 %	25 %	25 %	0 %	158340159
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3489	NC_009927	TTC	2	6	247076	247081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340168
3490	NC_009927	CATCCC	2	12	247171	247182	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158340168
3491	NC_009927	TCT	2	6	247318	247323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340169
3492	NC_009927	TTCT	2	8	247332	247339	0 %	75 %	0 %	25 %	158340169
3493	NC_009927	ATC	2	6	247415	247420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340169
3494	NC_009927	TCC	2	6	247559	247564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340170
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3496	NC_009927	TGT	2	6	247604	247609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340170
3497	NC_009927	ATTC	2	8	247619	247626	25 %	50 %	0 %	25 %	158340170
3498	NC_009927	TAG	2	6	247639	247644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340170
3499	NC_009927	AGCA	2	8	247841	247848	50 %	0 %	25 %	25 %	158340170
3500	NC_009927	AT	3	6	247911	247916	50 %	50 %	0 %	0 %	158340170

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