MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY04

Total Repeats: 590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009470	CTTC	2	8	1001	1008	0 %	50 %	0 %	50 %	148244056
2	NC_009470	TCCGG	2	10	1009	1018	0 %	20 %	40 %	40 %	148244056
3	NC_009470	GCC	2	6	1051	1056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244056
4	NC_009470	GCCG	2	8	1074	1081	0 %	0 %	50 %	50 %	148244056
5	NC_009470	GCG	2	6	1083	1088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244056
6	NC_009470	CGAT	2	8	1232	1239	25 %	25 %	25 %	25 %	148244056
7	NC_009470	GC	4	8	1267	1274	0 %	0 %	50 %	50 %	148244056
8	NC_009470	GCC	2	6	1306	1311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244056
9	NC_009470	TCC	2	6	2529	2534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244057
10	NC_009470	CCT	2	6	2549	2554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244057
11	NC_009470	GAG	2	6	2585	2590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244057
12	NC_009470	CCT	2	6	2602	2607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244057
13	NC_009470	GGC	2	6	2615	2620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244057
14	NC_009470	CCG	2	6	2638	2643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244057
15	NC_009470	AGG	2	6	2681	2686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244057
16	NC_009470	TAT	2	6	2932	2937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244058
17	NC_009470	TC	3	6	2949	2954	0 %	50 %	0 %	50 %	148244058
18	NC_009470	ATTG	2	8	2964	2971	25 %	50 %	25 %	0 %	148244058
19	NC_009470	GAA	2	6	3044	3049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244058
20	NC_009470	CG	3	6	3107	3112	0 %	0 %	50 %	50 %	148244058
21	NC_009470	GTT	2	6	3136	3141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244058
22	NC_009470	ACA	2	6	3154	3159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244058
23	NC_009470	CG	3	6	3235	3240	0 %	0 %	50 %	50 %	148244058
24	NC_009470	GTC	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244058
25	NC_009470	TGG	2	6	4273	4278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244059
26	NC_009470	ACC	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244059
27	NC_009470	CAC	2	6	4341	4346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244059
28	NC_009470	GCC	2	6	4504	4509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244059
29	NC_009470	CGC	2	6	4566	4571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244059
30	NC_009470	CCG	2	6	4595	4600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244059
31	NC_009470	GTC	2	6	4620	4625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244059
32	NC_009470	CTT	2	6	4643	4648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244059
33	NC_009470	CGT	3	9	4649	4657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244059
34	NC_009470	CATC	2	8	4676	4683	25 %	25 %	0 %	50 %	148244059
35	NC_009470	CCG	2	6	4726	4731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
36	NC_009470	GCG	2	6	4742	4747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244060
37	NC_009470	GCC	2	6	4765	4770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
38	NC_009470	TGC	2	6	4785	4790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244060
39	NC_009470	GCC	2	6	4878	4883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
40	NC_009470	CGC	2	6	4924	4929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
41	NC_009470	CGC	2	6	4934	4939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
42	NC_009470	TCGC	3	12	4971	4982	0 %	25 %	25 %	50 %	148244060
43	NC_009470	CAA	2	6	4990	4995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244060
44	NC_009470	CGC	2	6	5073	5078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
45	NC_009470	CAT	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244060
46	NC_009470	GCCTGG	2	12	5220	5231	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148244060
47	NC_009470	GCT	2	6	5275	5280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244060
48	NC_009470	CGC	2	6	5307	5312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
49	NC_009470	TCC	2	6	5374	5379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244060
50	NC_009470	G	7	7	5454	5460	0 %	0 %	100 %	0 %	148244060
51	NC_009470	TCC	2	6	5487	5492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244060
52	NC_009470	GC	4	8	5514	5521	0 %	0 %	50 %	50 %	148244060
53	NC_009470	TCC	2	6	5532	5537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244060
54	NC_009470	TC	3	6	5552	5557	0 %	50 %	0 %	50 %	148244060
55	NC_009470	CCG	2	6	5576	5581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
56	NC_009470	CTTC	2	8	5641	5648	0 %	50 %	0 %	50 %	148244060
57	NC_009470	GCT	2	6	5653	5658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244060
58	NC_009470	TCGC	2	8	5778	5785	0 %	25 %	25 %	50 %	148244060
59	NC_009470	CCGT	2	8	5802	5809	0 %	25 %	25 %	50 %	148244060
60	NC_009470	GCC	2	6	5819	5824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
61	NC_009470	CGC	2	6	5828	5833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
62	NC_009470	GCC	2	6	5854	5859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
63	NC_009470	CGC	2	6	5987	5992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
64	NC_009470	CTG	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244060
65	NC_009470	TCA	2	6	6076	6081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244060
66	NC_009470	TC	3	6	6091	6096	0 %	50 %	0 %	50 %	148244060
67	NC_009470	CG	3	6	6167	6172	0 %	0 %	50 %	50 %	148244060
68	NC_009470	GCTC	2	8	6256	6263	0 %	25 %	25 %	50 %	148244060
69	NC_009470	TGC	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244060
70	NC_009470	AAC	2	6	6359	6364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244060
71	NC_009470	TGGC	2	8	6370	6377	0 %	25 %	50 %	25 %	148244060
72	NC_009470	CA	3	6	6443	6448	50 %	0 %	0 %	50 %	148244060
73	NC_009470	CGC	2	6	6475	6480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244060
74	NC_009470	AT	3	6	6492	6497	50 %	50 %	0 %	0 %	148244060
75	NC_009470	CG	3	6	6530	6535	0 %	0 %	50 %	50 %	148244060
76	NC_009470	C	7	7	6543	6549	0 %	0 %	0 %	100 %	148244060
77	NC_009470	GGC	2	6	6678	6683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244061
78	NC_009470	ACG	2	6	6718	6723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244061
79	NC_009470	CGG	2	6	6734	6739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244061
80	NC_009470	CGC	2	6	6749	6754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244061
81	NC_009470	GCC	3	9	6791	6799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244061
82	NC_009470	CCGC	2	8	6807	6814	0 %	0 %	25 %	75 %	148244061
83	NC_009470	TCGG	2	8	6815	6822	0 %	25 %	50 %	25 %	148244061
84	NC_009470	CCTGA	2	10	6829	6838	20 %	20 %	20 %	40 %	148244061
85	NC_009470	GGT	2	6	6844	6849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244061
86	NC_009470	GCT	2	6	7143	7148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244062
87	NC_009470	GAA	2	6	7185	7190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244062
88	NC_009470	ATC	2	6	7218	7223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244062
89	NC_009470	CG	3	6	7254	7259	0 %	0 %	50 %	50 %	148244062
90	NC_009470	ATTC	2	8	7267	7274	25 %	50 %	0 %	25 %	148244062
91	NC_009470	GAA	2	6	7298	7303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244062
92	NC_009470	AAG	2	6	7350	7355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244062
93	NC_009470	A	6	6	7377	7382	100 %	0 %	0 %	0 %	148244062
94	NC_009470	TCAG	2	8	7397	7404	25 %	25 %	25 %	25 %	148244062
95	NC_009470	GCC	2	6	7421	7426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244062
96	NC_009470	CAAGCA	2	12	7499	7510	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148244063
97	NC_009470	GAT	2	6	7542	7547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244063
98	NC_009470	GCA	2	6	7630	7635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244063
99	NC_009470	ATC	2	6	7639	7644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244063
100	NC_009470	TCG	2	6	7727	7732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244063
101	NC_009470	CTA	2	6	7764	7769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244063
102	NC_009470	CAC	2	6	7821	7826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244063
103	NC_009470	TCA	2	6	7865	7870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244063
104	NC_009470	GC	3	6	7925	7930	0 %	0 %	50 %	50 %	148244063
105	NC_009470	GCCGC	2	10	7972	7981	0 %	0 %	40 %	60 %	148244063
106	NC_009470	GTCG	2	8	8010	8017	0 %	25 %	50 %	25 %	148244063
107	NC_009470	T	6	6	8106	8111	0 %	100 %	0 %	0 %	148244063
108	NC_009470	TA	3	6	8143	8148	50 %	50 %	0 %	0 %	148244063
109	NC_009470	A	7	7	8148	8154	100 %	0 %	0 %	0 %	148244063
110	NC_009470	GCG	2	6	8183	8188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244063
111	NC_009470	TTG	2	6	8224	8229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244063
112	NC_009470	A	6	6	8408	8413	100 %	0 %	0 %	0 %	148244063
113	NC_009470	TGGA	2	8	8438	8445	25 %	25 %	50 %	0 %	148244063
114	NC_009470	AAC	2	6	8473	8478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244063
115	NC_009470	GGCT	2	8	8638	8645	0 %	25 %	50 %	25 %	148244063
116	NC_009470	TCA	2	6	8648	8653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244063
117	NC_009470	CGA	2	6	8661	8666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244063
118	NC_009470	GCT	2	6	8676	8681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244063
119	NC_009470	TCG	2	6	8690	8695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244063
120	NC_009470	GCCG	2	8	8754	8761	0 %	0 %	50 %	50 %	148244063
121	NC_009470	CCG	2	6	8769	8774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244063
122	NC_009470	CGG	2	6	8856	8861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244063
123	NC_009470	TGT	2	6	8863	8868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244063
124	NC_009470	TGT	2	6	8955	8960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244063
125	NC_009470	GAA	2	6	8989	8994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244063
126	NC_009470	GCT	2	6	9003	9008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244063
127	NC_009470	CCAA	2	8	9119	9126	50 %	0 %	0 %	50 %	148244063
128	NC_009470	CGC	2	6	9215	9220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244063
129	NC_009470	TGG	2	6	9389	9394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244064
130	NC_009470	CTG	2	6	9398	9403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244064
131	NC_009470	CAACA	2	10	9457	9466	60 %	0 %	0 %	40 %	148244064
132	NC_009470	GGC	2	6	9490	9495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244064
133	NC_009470	CCA	2	6	9503	9508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244064
134	NC_009470	AGC	2	6	9544	9549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244064
135	NC_009470	GGCA	2	8	9563	9570	25 %	0 %	50 %	25 %	148244064
136	NC_009470	AAG	2	6	9614	9619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244064
137	NC_009470	A	6	6	9656	9661	100 %	0 %	0 %	0 %	148244064
138	NC_009470	GCCC	2	8	9717	9724	0 %	0 %	25 %	75 %	148244064
139	NC_009470	GTG	2	6	9740	9745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244064
140	NC_009470	GC	3	6	9814	9819	0 %	0 %	50 %	50 %	148244064
141	NC_009470	TGG	2	6	9825	9830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244064
142	NC_009470	TGG	2	6	10087	10092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244065
143	NC_009470	GATG	2	8	10142	10149	25 %	25 %	50 %	0 %	148244065
144	NC_009470	GTC	2	6	10263	10268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244065
145	NC_009470	TGA	2	6	10319	10324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244065
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147	NC_009470	GCCG	3	12	10382	10393	0 %	0 %	50 %	50 %	148244065
148	NC_009470	TCA	2	6	10441	10446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244065
149	NC_009470	CGGC	2	8	10499	10506	0 %	0 %	50 %	50 %	148244065
150	NC_009470	ATG	2	6	10512	10517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244065
151	NC_009470	GCA	2	6	10567	10572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244065
152	NC_009470	GGC	2	6	10596	10601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244065
153	NC_009470	TTG	2	6	10668	10673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244065
154	NC_009470	TCC	2	6	10768	10773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244066
155	NC_009470	GCC	2	6	10774	10779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244066
156	NC_009470	CTG	2	6	10797	10802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244066
157	NC_009470	CGA	2	6	10811	10816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244066
158	NC_009470	CTG	2	6	10887	10892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244066
159	NC_009470	CAA	2	6	10893	10898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244066
160	NC_009470	GCC	2	6	10927	10932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244066
161	NC_009470	G	8	8	11031	11038	0 %	0 %	100 %	0 %	148244066
162	NC_009470	CAAC	2	8	11085	11092	50 %	0 %	0 %	50 %	148244066
163	NC_009470	CCAG	2	8	11123	11130	25 %	0 %	25 %	50 %	148244066
164	NC_009470	GGA	2	6	11136	11141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244066
165	NC_009470	GC	3	6	11223	11228	0 %	0 %	50 %	50 %	148244066
166	NC_009470	TCCC	2	8	11249	11256	0 %	25 %	0 %	75 %	148244066
167	NC_009470	CCG	2	6	11544	11549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244067
168	NC_009470	GGTC	2	8	11695	11702	0 %	25 %	50 %	25 %	148244067
169	NC_009470	CTG	2	6	11708	11713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244067
170	NC_009470	TCA	2	6	11745	11750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244067
171	NC_009470	TGA	2	6	11799	11804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244067
172	NC_009470	CGC	2	6	11867	11872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244067
173	NC_009470	GAT	2	6	11884	11889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244067
174	NC_009470	GATC	2	8	11929	11936	25 %	25 %	25 %	25 %	148244067
175	NC_009470	TGA	2	6	11961	11966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244067
176	NC_009470	CGC	2	6	12031	12036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244067
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262	NC_009470	CCA	2	6	16228	16233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244070
263	NC_009470	CT	3	6	16299	16304	0 %	50 %	0 %	50 %	148244070
264	NC_009470	CGG	2	6	16415	16420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244070
265	NC_009470	CCA	2	6	16503	16508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244070
266	NC_009470	GAA	2	6	16513	16518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244070
267	NC_009470	CGC	2	6	16522	16527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244070
268	NC_009470	GTGG	2	8	16688	16695	0 %	25 %	75 %	0 %	148244071
269	NC_009470	GA	3	6	16809	16814	50 %	0 %	50 %	0 %	148244071
270	NC_009470	GAG	2	6	16820	16825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244071
271	NC_009470	GT	3	6	16882	16887	0 %	50 %	50 %	0 %	148244071
272	NC_009470	GAT	2	6	16895	16900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244071
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274	NC_009470	TTG	2	6	17022	17027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244071
275	NC_009470	CCAG	2	8	17065	17072	25 %	0 %	25 %	50 %	148244071
276	NC_009470	GGC	2	6	17147	17152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244071
277	NC_009470	CGGC	2	8	17256	17263	0 %	0 %	50 %	50 %	148244071
278	NC_009470	ATC	2	6	17265	17270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244071
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280	NC_009470	CGC	2	6	17398	17403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244071
281	NC_009470	GGC	2	6	17430	17435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244071
282	NC_009470	TGA	2	6	17445	17450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244071
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284	NC_009470	GA	3	6	17532	17537	50 %	0 %	50 %	0 %	148244071
285	NC_009470	CCG	2	6	17607	17612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244071
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288	NC_009470	GCG	2	6	17664	17669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244071
289	NC_009470	GGC	2	6	17698	17703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244071
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293	NC_009470	GCG	2	6	17856	17861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244071
294	NC_009470	CAG	2	6	17924	17929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244071
295	NC_009470	AGC	2	6	18054	18059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244071
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297	NC_009470	AGTC	2	8	18136	18143	25 %	25 %	25 %	25 %	148244071
298	NC_009470	CTC	2	6	18209	18214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244071
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301	NC_009470	GC	3	6	18411	18416	0 %	0 %	50 %	50 %	148244071
302	NC_009470	CG	3	6	18428	18433	0 %	0 %	50 %	50 %	148244071
303	NC_009470	ACG	2	6	18439	18444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244071
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339	NC_009470	CGA	2	6	19939	19944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244072
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363	NC_009470	CCA	2	6	21289	21294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244073
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383	NC_009470	CCG	2	6	22905	22910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244074
384	NC_009470	AGG	2	6	22920	22925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244074
385	NC_009470	CAT	2	6	22932	22937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244074
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387	NC_009470	CG	3	6	22978	22983	0 %	0 %	50 %	50 %	148244075
388	NC_009470	GGC	2	6	22988	22993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244075
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390	NC_009470	CTG	2	6	23035	23040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244075
391	NC_009470	CCTG	2	8	23061	23068	0 %	25 %	25 %	50 %	148244075
392	NC_009470	CCGC	2	8	23146	23153	0 %	0 %	25 %	75 %	148244075
393	NC_009470	GCC	2	6	23164	23169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244075
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424	NC_009470	GGGCC	2	10	25306	25315	0 %	0 %	60 %	40 %	148244077
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500	NC_009470	TGC	2	6	30816	30821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244082

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