MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY02

Total Repeats: 3447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009468	AT	3	6	98	103	50 %	50 %	0 %	0 %	148243808
2	NC_009468	CG	3	6	128	133	0 %	0 %	50 %	50 %	148243808
3	NC_009468	CG	3	6	155	160	0 %	0 %	50 %	50 %	148243808
4	NC_009468	GAC	2	6	240	245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243808
5	NC_009468	ATG	2	6	298	303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243808
6	NC_009468	TGA	2	6	371	376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243808
7	NC_009468	CGG	2	6	425	430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243808
8	NC_009468	TC	3	6	483	488	0 %	50 %	0 %	50 %	148243808
9	NC_009468	CT	3	6	501	506	0 %	50 %	0 %	50 %	148243808
10	NC_009468	ACC	2	6	562	567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243808
11	NC_009468	CGC	2	6	569	574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243808
12	NC_009468	CAGT	2	8	578	585	25 %	25 %	25 %	25 %	148243808
13	NC_009468	TCG	2	6	670	675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243808
14	NC_009468	CGAG	2	8	709	716	25 %	0 %	50 %	25 %	148243808
15	NC_009468	TCGGCC	2	12	739	750	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148243808
16	NC_009468	GCG	2	6	783	788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243808
17	NC_009468	ATC	2	6	795	800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243808
18	NC_009468	GGT	2	6	815	820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243808
19	NC_009468	GCT	2	6	829	834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243808
20	NC_009468	CAG	2	6	1038	1043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243808
21	NC_009468	GTG	2	6	1065	1070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243808
22	NC_009468	AGG	2	6	1082	1087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243808
23	NC_009468	AGG	2	6	1109	1114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243808
24	NC_009468	CCG	2	6	1243	1248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243808
25	NC_009468	ACC	2	6	1402	1407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243808
26	NC_009468	GC	3	6	1541	1546	0 %	0 %	50 %	50 %	148243808
27	NC_009468	ATC	2	6	1588	1593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243808
28	NC_009468	CGG	2	6	1613	1618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243808
29	NC_009468	TGG	2	6	1622	1627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243808
30	NC_009468	AAG	2	6	1659	1664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243808
31	NC_009468	GTC	2	6	1740	1745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243808
32	NC_009468	GAT	2	6	1758	1763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243808
33	NC_009468	CCG	2	6	1834	1839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243808
34	NC_009468	TGC	2	6	1843	1848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243808
35	NC_009468	GATC	2	8	1886	1893	25 %	25 %	25 %	25 %	148243808
36	NC_009468	GGC	2	6	1904	1909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243808
37	NC_009468	GCG	2	6	2083	2088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243808
38	NC_009468	TC	3	6	2129	2134	0 %	50 %	0 %	50 %	148243808
39	NC_009468	GGT	2	6	2167	2172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243808
40	NC_009468	CAG	2	6	2205	2210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243808
41	NC_009468	GATC	2	8	2225	2232	25 %	25 %	25 %	25 %	148243808
42	NC_009468	GCC	2	6	2269	2274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243808
43	NC_009468	GAC	2	6	2397	2402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243808
44	NC_009468	GTG	2	6	2473	2478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243808
45	NC_009468	TCG	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243808
46	NC_009468	CGGC	2	8	2606	2613	0 %	0 %	50 %	50 %	148243808
47	NC_009468	CCG	2	6	2643	2648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243808
48	NC_009468	CGT	2	6	2657	2662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243808
49	NC_009468	GCG	2	6	2709	2714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243808
50	NC_009468	CGT	2	6	2735	2740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243808
51	NC_009468	CAC	2	6	2745	2750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243808
52	NC_009468	GC	4	8	2764	2771	0 %	0 %	50 %	50 %	148243808
53	NC_009468	GGC	2	6	2867	2872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243808
54	NC_009468	CCA	2	6	2942	2947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243808
55	NC_009468	GCC	2	6	2979	2984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243808
56	NC_009468	CAG	2	6	3003	3008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243808
57	NC_009468	CAG	2	6	3051	3056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243808
58	NC_009468	CGA	2	6	3089	3094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243808
59	NC_009468	GC	3	6	3130	3135	0 %	0 %	50 %	50 %	148243808
60	NC_009468	TCG	2	6	3211	3216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243808
61	NC_009468	CAC	2	6	3227	3232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243808
62	NC_009468	GTGCA	2	10	3253	3262	20 %	20 %	40 %	20 %	148243808
63	NC_009468	CCCG	2	8	3348	3355	0 %	0 %	25 %	75 %	148243809
64	NC_009468	TCGC	2	8	3368	3375	0 %	25 %	25 %	50 %	148243809
65	NC_009468	AAT	2	6	3397	3402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148243809
66	NC_009468	CCA	2	6	3434	3439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243809
67	NC_009468	GTCC	2	8	3460	3467	0 %	25 %	25 %	50 %	148243809
68	NC_009468	CGG	2	6	3483	3488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243809
69	NC_009468	CGG	2	6	3512	3517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243809
70	NC_009468	GCA	2	6	3562	3567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243809
71	NC_009468	CGG	2	6	3611	3616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243809
72	NC_009468	CGC	2	6	3623	3628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243809
73	NC_009468	TCGC	2	8	3657	3664	0 %	25 %	25 %	50 %	148243809
74	NC_009468	CGC	2	6	3691	3696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243809
75	NC_009468	AGC	2	6	3756	3761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243809
76	NC_009468	GCG	2	6	3798	3803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243809
77	NC_009468	GATC	2	8	3835	3842	25 %	25 %	25 %	25 %	148243809
78	NC_009468	CG	3	6	3963	3968	0 %	0 %	50 %	50 %	148243809
79	NC_009468	CGC	2	6	4097	4102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243809
80	NC_009468	GC	3	6	4182	4187	0 %	0 %	50 %	50 %	148243809
81	NC_009468	ATC	2	6	4242	4247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243809
82	NC_009468	GGC	2	6	4265	4270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243809
83	NC_009468	CG	3	6	4294	4299	0 %	0 %	50 %	50 %	148243809
84	NC_009468	CGA	2	6	4315	4320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243809
85	NC_009468	GCC	2	6	4356	4361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243809
86	NC_009468	C	6	6	4360	4365	0 %	0 %	0 %	100 %	148243809
87	NC_009468	GCA	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243809
88	NC_009468	GCC	2	6	4461	4466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243809
89	NC_009468	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243809
90	NC_009468	CAA	2	6	4507	4512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243809
91	NC_009468	GTG	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243809
92	NC_009468	GGT	2	6	4734	4739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243809
93	NC_009468	GC	3	6	4788	4793	0 %	0 %	50 %	50 %	148243809
94	NC_009468	ATCG	3	12	4807	4818	25 %	25 %	25 %	25 %	148243809
95	NC_009468	GAC	2	6	4841	4846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243809
96	NC_009468	ACC	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243810
97	NC_009468	GTC	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243810
98	NC_009468	GC	3	6	5945	5950	0 %	0 %	50 %	50 %	148243810
99	NC_009468	GCT	2	6	5952	5957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243810
100	NC_009468	CGC	2	6	6040	6045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243810
101	NC_009468	TGA	2	6	6053	6058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243810
102	NC_009468	GAT	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243810
103	NC_009468	CCG	2	6	6090	6095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243810
104	NC_009468	GGGC	2	8	6161	6168	0 %	0 %	75 %	25 %	148243810
105	NC_009468	GCT	2	6	6192	6197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243810
106	NC_009468	CCG	2	6	6260	6265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243810
107	NC_009468	TGA	2	6	6269	6274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243810
108	NC_009468	CGA	2	6	6302	6307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243810
109	NC_009468	ACG	2	6	6312	6317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243810
110	NC_009468	GAT	2	6	6382	6387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243810
111	NC_009468	CGG	2	6	6552	6557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243810
112	NC_009468	CGA	2	6	6579	6584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243810
113	NC_009468	CGG	2	6	6636	6641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243810
114	NC_009468	CGA	2	6	6663	6668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243810
115	NC_009468	GTG	2	6	6692	6697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243810
116	NC_009468	CGG	2	6	6740	6745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243810
117	NC_009468	ATC	2	6	6751	6756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243810
118	NC_009468	CCA	2	6	6779	6784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243810
119	NC_009468	CGA	2	6	6897	6902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243810
120	NC_009468	TCG	2	6	6923	6928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243810
121	NC_009468	CAG	2	6	6970	6975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243810
122	NC_009468	GCG	2	6	7004	7009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243810
123	NC_009468	CG	3	6	7127	7132	0 %	0 %	50 %	50 %	148243810
124	NC_009468	GCC	2	6	7219	7224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243810
125	NC_009468	CCG	2	6	7258	7263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243810
126	NC_009468	CCG	2	6	7353	7358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243810
127	NC_009468	ACG	2	6	7388	7393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243810
128	NC_009468	CCA	2	6	7499	7504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243810
129	NC_009468	CTC	2	6	7525	7530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243810
130	NC_009468	TC	3	6	7548	7553	0 %	50 %	0 %	50 %	148243810
131	NC_009468	CGT	2	6	7605	7610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243810
132	NC_009468	GAG	2	6	7660	7665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243810
133	NC_009468	CGC	2	6	7669	7674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243810
134	NC_009468	GAT	2	6	7705	7710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243810
135	NC_009468	TGA	2	6	7718	7723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243810
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259	NC_009468	CCAG	2	8	12101	12108	25 %	0 %	25 %	50 %	148243815
260	NC_009468	GCCT	2	8	12152	12159	0 %	25 %	25 %	50 %	148243815
261	NC_009468	CGG	2	6	12165	12170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243815
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263	NC_009468	CGC	2	6	12600	12605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243816
264	NC_009468	GGC	2	6	12625	12630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243816
265	NC_009468	CTG	2	6	12670	12675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243816
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268	NC_009468	CGC	2	6	12759	12764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243816
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382	NC_009468	GGCC	2	8	19636	19643	0 %	0 %	50 %	50 %	148243822
383	NC_009468	GC	3	6	19651	19656	0 %	0 %	50 %	50 %	148243822
384	NC_009468	CGC	2	6	19661	19666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243822
385	NC_009468	CGT	2	6	19706	19711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243822
386	NC_009468	CTC	2	6	19736	19741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243822
387	NC_009468	CGG	2	6	19746	19751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243822
388	NC_009468	CG	3	6	19755	19760	0 %	0 %	50 %	50 %	148243822
389	NC_009468	GCCTC	2	10	19768	19777	0 %	20 %	20 %	60 %	148243822
390	NC_009468	GCC	2	6	19818	19823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243822
391	NC_009468	CTG	2	6	19835	19840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243822
392	NC_009468	TCG	2	6	19858	19863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243822
393	NC_009468	CGA	2	6	19866	19871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243822
394	NC_009468	GCT	2	6	19876	19881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243822
395	NC_009468	GA	3	6	19953	19958	50 %	0 %	50 %	0 %	148243822
396	NC_009468	CGA	2	6	19975	19980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243822
397	NC_009468	CG	3	6	19987	19992	0 %	0 %	50 %	50 %	148243822
398	NC_009468	CGG	2	6	19998	20003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243822
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400	NC_009468	CGC	2	6	20117	20122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243822
401	NC_009468	CCT	2	6	20149	20154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243822
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410	NC_009468	CGA	2	6	21371	21376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243823
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424	NC_009468	TTC	2	6	22340	22345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243824
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431	NC_009468	TATCT	2	10	22857	22866	20 %	60 %	0 %	20 %	148243824
432	NC_009468	GCC	3	9	22874	22882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243824
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498	NC_009468	CGC	2	6	26649	26654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243829
499	NC_009468	GTTC	2	8	26661	26668	0 %	50 %	25 %	25 %	148243829
500	NC_009468	CCA	2	6	26704	26709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243829

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