MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY01

Total Repeats: 3729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009467	CT	3	6	167	172	0 %	50 %	0 %	50 %	148243636
2	NC_009467	ACGC	2	8	197	204	25 %	0 %	25 %	50 %	148243636
3	NC_009467	CGG	2	6	240	245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243636
4	NC_009467	GC	3	6	264	269	0 %	0 %	50 %	50 %	148243636
5	NC_009467	ATT	2	6	287	292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148243636
6	NC_009467	TGG	2	6	342	347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243636
7	NC_009467	GAG	2	6	360	365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243636
8	NC_009467	CTG	2	6	455	460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243636
9	NC_009467	AGGCA	2	10	466	475	40 %	0 %	40 %	20 %	148243636
10	NC_009467	TTC	2	6	476	481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243636
11	NC_009467	CCG	2	6	498	503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243636
12	NC_009467	ATC	2	6	506	511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243636
13	NC_009467	TGT	2	6	538	543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243636
14	NC_009467	CGT	2	6	598	603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243636
15	NC_009467	GGCA	2	8	682	689	25 %	0 %	50 %	25 %	148243636
16	NC_009467	CTGG	2	8	739	746	0 %	25 %	50 %	25 %	148243636
17	NC_009467	AAGC	2	8	784	791	50 %	0 %	25 %	25 %	148243636
18	NC_009467	ACGG	2	8	868	875	25 %	0 %	50 %	25 %	148243636
19	NC_009467	GCG	2	6	1034	1039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243636
20	NC_009467	GCGGT	2	10	1062	1071	0 %	20 %	60 %	20 %	148243636
21	NC_009467	GCGTG	2	10	1121	1130	0 %	20 %	60 %	20 %	148243636
22	NC_009467	CG	3	6	1202	1207	0 %	0 %	50 %	50 %	148243636
23	NC_009467	CGG	2	6	1252	1257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243636
24	NC_009467	GCCG	2	8	1304	1311	0 %	0 %	50 %	50 %	148243636
25	NC_009467	GC	4	8	1320	1327	0 %	0 %	50 %	50 %	148243636
26	NC_009467	CTGCA	2	10	1365	1374	20 %	20 %	20 %	40 %	148243636
27	NC_009467	GGC	2	6	1450	1455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243636
28	NC_009467	TCG	2	6	1512	1517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243636
29	NC_009467	CGG	2	6	1524	1529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243636
30	NC_009467	ACG	2	6	1613	1618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243636
31	NC_009467	CGCA	2	8	1815	1822	25 %	0 %	25 %	50 %	148243636
32	NC_009467	TCG	2	6	1890	1895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243636
33	NC_009467	GCC	2	6	1907	1912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243636
34	NC_009467	TGC	2	6	1926	1931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243636
35	NC_009467	CGG	2	6	2088	2093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243636
36	NC_009467	TGCC	2	8	2097	2104	0 %	25 %	25 %	50 %	148243636
37	NC_009467	GCC	2	6	2123	2128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243636
38	NC_009467	GCA	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243636
39	NC_009467	TCG	2	6	2225	2230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243637
40	NC_009467	CGG	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243637
41	NC_009467	GA	3	6	2309	2314	50 %	0 %	50 %	0 %	148243637
42	NC_009467	CGCC	2	8	2328	2335	0 %	0 %	25 %	75 %	148243637
43	NC_009467	CGG	2	6	2337	2342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243637
44	NC_009467	ATT	2	6	2353	2358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148243637
45	NC_009467	CAT	2	6	2364	2369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243637
46	NC_009467	CGA	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243637
47	NC_009467	CGG	2	6	2410	2415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243637
48	NC_009467	CCG	2	6	2429	2434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243637
49	NC_009467	GCT	2	6	2532	2537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243637
50	NC_009467	GCG	2	6	2559	2564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243637
51	NC_009467	CG	3	6	2571	2576	0 %	0 %	50 %	50 %	148243637
52	NC_009467	GTT	2	6	2688	2693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243637
53	NC_009467	CGC	2	6	2698	2703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243637
54	NC_009467	CGT	2	6	2775	2780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243637
55	NC_009467	GAC	2	6	2815	2820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243637
56	NC_009467	CGC	2	6	2830	2835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243637
57	NC_009467	CGTGG	2	10	2851	2860	0 %	20 %	60 %	20 %	148243637
58	NC_009467	GGC	2	6	2881	2886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243637
59	NC_009467	CTG	2	6	2969	2974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243638
60	NC_009467	GC	4	8	3003	3010	0 %	0 %	50 %	50 %	148243638
61	NC_009467	CAGG	2	8	3016	3023	25 %	0 %	50 %	25 %	148243638
62	NC_009467	CGCC	2	8	3055	3062	0 %	0 %	25 %	75 %	148243638
63	NC_009467	GCG	2	6	3069	3074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243638
64	NC_009467	TCCG	2	8	3082	3089	0 %	25 %	25 %	50 %	148243638
65	NC_009467	GAGC	2	8	3116	3123	25 %	0 %	50 %	25 %	148243638
66	NC_009467	ATC	2	6	3195	3200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243638
67	NC_009467	CAT	2	6	3210	3215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243638
68	NC_009467	GCG	2	6	3249	3254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243638
69	NC_009467	TGC	2	6	3300	3305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243638
70	NC_009467	ATCGCC	2	12	3308	3319	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243638
71	NC_009467	CCT	2	6	3337	3342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243638
72	NC_009467	ATC	2	6	3386	3391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243638
73	NC_009467	CCG	2	6	3516	3521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243638
74	NC_009467	CGC	2	6	3526	3531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243638
75	NC_009467	TCCT	2	8	3575	3582	0 %	50 %	0 %	50 %	148243638
76	NC_009467	GCG	2	6	3645	3650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243638
77	NC_009467	CCT	2	6	3754	3759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243638
78	NC_009467	CCG	2	6	3795	3800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243638
79	NC_009467	GGC	2	6	3859	3864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243638
80	NC_009467	CCGC	2	8	3885	3892	0 %	0 %	25 %	75 %	148243638
81	NC_009467	TCC	2	6	3930	3935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243638
82	NC_009467	TGG	2	6	3954	3959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243638
83	NC_009467	ACCGGC	2	12	3977	3988	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148243638
84	NC_009467	CG	3	6	4114	4119	0 %	0 %	50 %	50 %	148243638
85	NC_009467	CGG	2	6	4129	4134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243638
86	NC_009467	CG	3	6	4163	4168	0 %	0 %	50 %	50 %	148243638
87	NC_009467	CAC	2	6	4222	4227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243638
88	NC_009467	TGG	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243638
89	NC_009467	CG	3	6	4252	4257	0 %	0 %	50 %	50 %	148243638
90	NC_009467	GAA	2	6	4363	4368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243639
91	NC_009467	CTTGCG	2	12	4412	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243639
92	NC_009467	GCC	2	6	4497	4502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243639
93	NC_009467	CGA	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243639
94	NC_009467	CG	3	6	4554	4559	0 %	0 %	50 %	50 %	148243639
95	NC_009467	TCG	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243639
96	NC_009467	CGC	2	6	4627	4632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243639
97	NC_009467	CGC	2	6	4639	4644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243639
98	NC_009467	GGC	2	6	4648	4653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243639
99	NC_009467	GAC	2	6	4657	4662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243639
100	NC_009467	CAG	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243639
101	NC_009467	CCTTC	2	10	4722	4731	0 %	40 %	0 %	60 %	148243639
102	NC_009467	TCA	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243639
103	NC_009467	CGC	3	9	4798	4806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243639
104	NC_009467	CG	3	6	4825	4830	0 %	0 %	50 %	50 %	148243639
105	NC_009467	GCA	2	6	4863	4868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243639
106	NC_009467	GCT	2	6	4882	4887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243639
107	NC_009467	GC	3	6	4925	4930	0 %	0 %	50 %	50 %	148243639
108	NC_009467	TGCT	2	8	4989	4996	0 %	50 %	25 %	25 %	148243639
109	NC_009467	GGC	2	6	5023	5028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243639
110	NC_009467	CGG	3	9	5112	5120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243639
111	NC_009467	TTCA	2	8	5140	5147	25 %	50 %	0 %	25 %	148243639
112	NC_009467	GCC	2	6	5167	5172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243639
113	NC_009467	CGC	2	6	5182	5187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243639
114	NC_009467	GTC	2	6	5222	5227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243639
115	NC_009467	CG	3	6	5246	5251	0 %	0 %	50 %	50 %	148243639
116	NC_009467	TC	3	6	5261	5266	0 %	50 %	0 %	50 %	148243639
117	NC_009467	CAG	2	6	5282	5287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243639
118	NC_009467	CGCTGC	2	12	5358	5369	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148243639
119	NC_009467	GCG	2	6	5426	5431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243639
120	NC_009467	GC	4	8	5513	5520	0 %	0 %	50 %	50 %	148243639
121	NC_009467	CTC	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243639
122	NC_009467	CCGC	2	8	5541	5548	0 %	0 %	25 %	75 %	148243639
123	NC_009467	CAG	2	6	5621	5626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243639
124	NC_009467	AGC	2	6	5738	5743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243640
125	NC_009467	AGC	2	6	5842	5847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243640
126	NC_009467	TCA	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243640
127	NC_009467	GATC	2	8	5916	5923	25 %	25 %	25 %	25 %	148243640
128	NC_009467	TCA	2	6	5933	5938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243640
129	NC_009467	CGCCCG	2	12	5997	6008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243640
130	NC_009467	GCA	2	6	6051	6056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243640
131	NC_009467	GC	3	6	6118	6123	0 %	0 %	50 %	50 %	148243640
132	NC_009467	GCC	2	6	6130	6135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243640
133	NC_009467	GCG	2	6	6142	6147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243640
134	NC_009467	GCAG	2	8	6210	6217	25 %	0 %	50 %	25 %	148243640
135	NC_009467	GCCG	2	8	6237	6244	0 %	0 %	50 %	50 %	148243640
136	NC_009467	CG	3	6	6388	6393	0 %	0 %	50 %	50 %	148243640
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139	NC_009467	CTG	2	6	6607	6612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243640
140	NC_009467	CGG	2	6	6627	6632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243640
141	NC_009467	ACG	2	6	6650	6655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243640
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143	NC_009467	TCG	3	9	6710	6718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243641
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149	NC_009467	CATC	2	8	6945	6952	25 %	25 %	0 %	50 %	148243641
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153	NC_009467	GAGC	2	8	7011	7018	25 %	0 %	50 %	25 %	148243641
154	NC_009467	CCGG	2	8	7033	7040	0 %	0 %	50 %	50 %	148243641
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156	NC_009467	GCACT	2	10	7079	7088	20 %	20 %	20 %	40 %	148243641
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158	NC_009467	TC	3	6	7249	7254	0 %	50 %	0 %	50 %	148243641
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259	NC_009467	GC	3	6	11523	11528	0 %	0 %	50 %	50 %	148243643
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261	NC_009467	GGC	2	6	11946	11951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243644
262	NC_009467	GGC	2	6	11958	11963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243644
263	NC_009467	GTG	2	6	12049	12054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243644
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265	NC_009467	TCG	2	6	12123	12128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243644
266	NC_009467	GTT	2	6	12159	12164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243644
267	NC_009467	CGT	2	6	12218	12223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243644
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270	NC_009467	GGC	2	6	12297	12302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243644
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273	NC_009467	CGC	2	6	12383	12388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243644
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299	NC_009467	GCCC	2	8	13901	13908	0 %	0 %	25 %	75 %	148243646
300	NC_009467	GCC	2	6	14169	14174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243647
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370	NC_009467	TGATCG	2	12	19030	19041	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148243652
371	NC_009467	CAGC	2	8	19260	19267	25 %	0 %	25 %	50 %	148243652
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375	NC_009467	CCAG	2	8	19350	19357	25 %	0 %	25 %	50 %	148243652
376	NC_009467	CAGTC	2	10	19438	19447	20 %	20 %	20 %	40 %	148243652
377	NC_009467	GGC	2	6	19484	19489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243652
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379	NC_009467	GAC	2	6	19499	19504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243652
380	NC_009467	GTCG	2	8	19586	19593	0 %	25 %	50 %	25 %	148243652
381	NC_009467	ACG	2	6	19599	19604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243652
382	NC_009467	TGC	2	6	19614	19619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243652
383	NC_009467	TGC	2	6	19632	19637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243652
384	NC_009467	CCT	2	6	19671	19676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243652
385	NC_009467	CCA	2	6	19699	19704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243652
386	NC_009467	CAC	2	6	19730	19735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243652
387	NC_009467	GAA	3	9	19763	19771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243652
388	NC_009467	TCA	2	6	19777	19782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243652
389	NC_009467	CGT	2	6	19786	19791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243652
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391	NC_009467	CAC	2	6	19933	19938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243652
392	NC_009467	TG	4	8	19990	19997	0 %	50 %	50 %	0 %	148243652
393	NC_009467	TGC	2	6	20013	20018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243652
394	NC_009467	AGC	2	6	22322	22327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243653
395	NC_009467	CCG	2	6	22346	22351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243653
396	NC_009467	CGA	2	6	22358	22363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243653
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400	NC_009467	AG	3	6	22673	22678	50 %	0 %	50 %	0 %	148243654
401	NC_009467	GAG	2	6	22685	22690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243654
402	NC_009467	AAG	2	6	22697	22702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243654
403	NC_009467	AGC	2	6	22722	22727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243654
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408	NC_009467	GGCT	2	8	23046	23053	0 %	25 %	50 %	25 %	148243654
409	NC_009467	GAAC	2	8	23065	23072	50 %	0 %	25 %	25 %	148243654
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418	NC_009467	CCTG	2	8	23395	23402	0 %	25 %	25 %	50 %	148243654
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420	NC_009467	GC	3	6	23453	23458	0 %	0 %	50 %	50 %	148243654
421	NC_009467	GCGA	2	8	23462	23469	25 %	0 %	50 %	25 %	148243654
422	NC_009467	GCA	2	6	23488	23493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243654
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424	NC_009467	CGG	2	6	23590	23595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243654
425	NC_009467	GATC	2	8	23667	23674	25 %	25 %	25 %	25 %	148243654
426	NC_009467	CGTC	2	8	23704	23711	0 %	25 %	25 %	50 %	148243654
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433	NC_009467	CCT	2	6	23946	23951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243655
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488	NC_009467	CCG	2	6	27124	27129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243659
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499	NC_009467	ATGCCG	2	12	28135	28146	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148243661
500	NC_009467	CTCG	2	8	28179	28186	0 %	25 %	25 %	50 %	148243661

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