MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY01

Total Repeats: 3729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009467	GAG	2	6	28192	28197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243661
502	NC_009467	CG	3	6	28278	28283	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
503	NC_009467	CGT	2	6	28289	28294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243661
504	NC_009467	CAT	2	6	28296	28301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243661
505	NC_009467	GC	3	6	28335	28340	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
506	NC_009467	GCT	2	6	28407	28412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243661
507	NC_009467	TGT	2	6	28420	28425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243661
508	NC_009467	GC	3	6	28455	28460	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
509	NC_009467	GCG	2	6	28471	28476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243661
510	NC_009467	GCG	2	6	28510	28515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243661
511	NC_009467	TGC	2	6	28532	28537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243661
512	NC_009467	ATC	2	6	28545	28550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243661
513	NC_009467	CGG	2	6	28586	28591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243661
514	NC_009467	TCG	2	6	28645	28650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243661
515	NC_009467	CGCGC	2	10	28709	28718	0 %	0 %	40 %	60 %	148243661
516	NC_009467	ACC	2	6	28723	28728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243661
517	NC_009467	GTG	2	6	28729	28734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243661
518	NC_009467	CG	3	6	28757	28762	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
519	NC_009467	CCG	2	6	28894	28899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243661
520	NC_009467	ATG	2	6	28900	28905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243661
521	NC_009467	TGC	2	6	28923	28928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243661
522	NC_009467	TCG	2	6	28940	28945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243661
523	NC_009467	CG	3	6	28999	29004	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
524	NC_009467	CGT	2	6	29042	29047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243661
525	NC_009467	A	7	7	29089	29095	100 %	0 %	0 %	0 %	148243661
526	NC_009467	GC	3	6	29166	29171	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
527	NC_009467	GA	3	6	29190	29195	50 %	0 %	50 %	0 %	148243661
528	NC_009467	CG	4	8	29252	29259	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
529	NC_009467	GAT	2	6	29265	29270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243661
530	NC_009467	GACC	2	8	29283	29290	25 %	0 %	25 %	50 %	148243661
531	NC_009467	CG	3	6	29353	29358	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
532	NC_009467	CCGG	2	8	29380	29387	0 %	0 %	50 %	50 %	148243661
533	NC_009467	GAAG	2	8	29462	29469	50 %	0 %	50 %	0 %	148243661
534	NC_009467	TCG	2	6	29476	29481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243661
535	NC_009467	GAT	2	6	29605	29610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243662
536	NC_009467	ATC	3	9	29616	29624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243662
537	NC_009467	AGCC	2	8	29664	29671	25 %	0 %	25 %	50 %	148243662
538	NC_009467	TGG	2	6	29721	29726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243662
539	NC_009467	CG	3	6	29755	29760	0 %	0 %	50 %	50 %	148243662
540	NC_009467	GTACG	2	10	29840	29849	20 %	20 %	40 %	20 %	148243662
541	NC_009467	CG	3	6	29851	29856	0 %	0 %	50 %	50 %	148243662
542	NC_009467	GAA	2	6	29867	29872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243662
543	NC_009467	TCGC	2	8	30030	30037	0 %	25 %	25 %	50 %	148243662
544	NC_009467	CAG	2	6	30137	30142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243662
545	NC_009467	CCA	2	6	30406	30411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243662
546	NC_009467	CAG	2	6	30425	30430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243662
547	NC_009467	ATA	2	6	30497	30502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148243662
548	NC_009467	TGC	2	6	30544	30549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243662
549	NC_009467	CGTG	2	8	30593	30600	0 %	25 %	50 %	25 %	148243662
550	NC_009467	GCC	2	6	30741	30746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243662
551	NC_009467	TGC	2	6	30747	30752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243662
552	NC_009467	GGC	2	6	30839	30844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243663
553	NC_009467	TTC	2	6	30925	30930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243663
554	NC_009467	CGC	2	6	31128	31133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243663
555	NC_009467	CAT	2	6	31177	31182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243663
556	NC_009467	GCA	2	6	31200	31205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243663
557	NC_009467	CCG	2	6	31262	31267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243663
558	NC_009467	CGG	2	6	31377	31382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243663
559	NC_009467	CG	3	6	31407	31412	0 %	0 %	50 %	50 %	148243663
560	NC_009467	GGA	2	6	31417	31422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243663
561	NC_009467	CAC	2	6	31427	31432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243663
562	NC_009467	GTA	2	6	31438	31443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243663
563	NC_009467	TGC	2	6	31497	31502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243663
564	NC_009467	GTC	2	6	31531	31536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243663
565	NC_009467	ATG	2	6	31567	31572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243663
566	NC_009467	CGGC	2	8	31587	31594	0 %	0 %	50 %	50 %	148243663
567	NC_009467	ATC	2	6	31624	31629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243663
568	NC_009467	CGC	2	6	31642	31647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243663
569	NC_009467	CCG	2	6	31658	31663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243663
570	NC_009467	AAT	2	6	31722	31727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148243663
571	NC_009467	CTG	2	6	31732	31737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243663
572	NC_009467	GGTTC	2	10	31758	31767	0 %	40 %	40 %	20 %	148243663
573	NC_009467	GAA	2	6	31780	31785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243663
574	NC_009467	GGA	2	6	31918	31923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243663
575	NC_009467	CAG	2	6	31975	31980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243663
576	NC_009467	AGA	2	6	32016	32021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243663
577	NC_009467	CTCA	2	8	32032	32039	25 %	25 %	0 %	50 %	148243663
578	NC_009467	TCGG	2	8	32256	32263	0 %	25 %	50 %	25 %	148243664
579	NC_009467	GAT	2	6	32283	32288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243664
580	NC_009467	CGAT	2	8	32312	32319	25 %	25 %	25 %	25 %	148243664
581	NC_009467	AAG	2	6	32323	32328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243664
582	NC_009467	GC	3	6	32412	32417	0 %	0 %	50 %	50 %	148243664
583	NC_009467	GCC	2	6	32439	32444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243664
584	NC_009467	GCT	2	6	32505	32510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243664
585	NC_009467	GAT	2	6	32540	32545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243664
586	NC_009467	CTCG	2	8	32628	32635	0 %	25 %	25 %	50 %	148243664
587	NC_009467	GC	3	6	32658	32663	0 %	0 %	50 %	50 %	148243664
588	NC_009467	CCAG	2	8	32696	32703	25 %	0 %	25 %	50 %	148243664
589	NC_009467	GC	3	6	32729	32734	0 %	0 %	50 %	50 %	148243664
590	NC_009467	ATCCG	2	10	32784	32793	20 %	20 %	20 %	40 %	148243664
591	NC_009467	GAT	2	6	32930	32935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243664
592	NC_009467	CGT	2	6	32936	32941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243664
593	NC_009467	GCA	2	6	32951	32956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243664
594	NC_009467	AGC	2	6	32959	32964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243664
595	NC_009467	GC	3	6	32975	32980	0 %	0 %	50 %	50 %	148243664
596	NC_009467	CGA	2	6	32987	32992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243664
597	NC_009467	AGT	2	6	33008	33013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243664
598	NC_009467	TGC	2	6	33056	33061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243664
599	NC_009467	AGA	2	6	33175	33180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243664
600	NC_009467	CTC	2	6	33243	33248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243664
601	NC_009467	AAG	2	6	33252	33257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243664
602	NC_009467	GCC	2	6	33288	33293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243664
603	NC_009467	CGG	2	6	33342	33347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243664
604	NC_009467	CGC	2	6	33389	33394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243664
605	NC_009467	CGTGAA	2	12	33401	33412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148243664
606	NC_009467	GA	3	6	33473	33478	50 %	0 %	50 %	0 %	148243664
607	NC_009467	TCTCGC	2	12	33508	33519	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148243664
608	NC_009467	GCGCC	2	10	33530	33539	0 %	0 %	40 %	60 %	148243664
609	NC_009467	GCC	2	6	33555	33560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243664
610	NC_009467	ATA	2	6	33564	33569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148243664
611	NC_009467	TCA	2	6	33616	33621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243664
612	NC_009467	CGA	2	6	33638	33643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243664
613	NC_009467	CCA	2	6	33751	33756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243664
614	NC_009467	GAT	3	9	33768	33776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243664
615	NC_009467	CGT	2	6	33779	33784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243664
616	NC_009467	TGC	2	6	33787	33792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243664
617	NC_009467	GTG	2	6	33858	33863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243665
618	NC_009467	ACG	2	6	33867	33872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243665
619	NC_009467	GCCA	2	8	33891	33898	25 %	0 %	25 %	50 %	148243665
620	NC_009467	CGG	2	6	33901	33906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243665
621	NC_009467	CAG	2	6	33956	33961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243665
622	NC_009467	ATTG	2	8	33998	34005	25 %	50 %	25 %	0 %	148243665
623	NC_009467	CAT	2	6	34079	34084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243665
624	NC_009467	GCC	2	6	34094	34099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243665
625	NC_009467	GC	3	6	34179	34184	0 %	0 %	50 %	50 %	148243665
626	NC_009467	CGC	2	6	34201	34206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243665
627	NC_009467	GCC	2	6	34227	34232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243665
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