MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 4

Total Repeats: 2645

< Previous123456Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009349	CCA	2	6	158300	158305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301377
2502	NC_009349	TGA	3	9	158407	158415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301378
2503	NC_009349	GGC	2	6	158444	158449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301378
2504	NC_009349	GGA	2	6	158510	158515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301378
2505	NC_009349	CT	3	6	158538	158543	0 %	50 %	0 %	50 %	145301378
2506	NC_009349	TGG	2	6	158635	158640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301378
2507	NC_009349	GAA	2	6	158762	158767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301379
2508	NC_009349	GAT	2	6	158816	158821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301379
2509	NC_009349	TGA	2	6	158870	158875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301379
2510	NC_009349	CCT	2	6	158902	158907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301379
2511	NC_009349	CTG	2	6	158914	158919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301379
2512	NC_009349	AGTC	2	8	158950	158957	25 %	25 %	25 %	25 %	145301379
2513	NC_009349	CCA	2	6	159003	159008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301379
2514	NC_009349	GTC	2	6	159015	159020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301379
2515	NC_009349	CTA	2	6	159094	159099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301379
2516	NC_009349	GCC	2	6	159416	159421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301380
2517	NC_009349	G	6	6	159461	159466	0 %	0 %	100 %	0 %	145301380
2518	NC_009349	CTGA	2	8	159653	159660	25 %	25 %	25 %	25 %	145301380
2519	NC_009349	GA	3	6	159662	159667	50 %	0 %	50 %	0 %	145301380
2520	NC_009349	TTC	2	6	159707	159712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301380
2521	NC_009349	TCA	2	6	159804	159809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301380
2522	NC_009349	GCT	2	6	159871	159876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301380
2523	NC_009349	GAG	2	6	159950	159955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301380
2524	NC_009349	GGC	2	6	160051	160056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301380
2525	NC_009349	TGG	2	6	160072	160077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301380
2526	NC_009349	CTG	2	6	160133	160138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301380
2527	NC_009349	TGC	2	6	160142	160147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301380
2528	NC_009349	ATG	2	6	160148	160153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301380
2529	NC_009349	G	6	6	160158	160163	0 %	0 %	100 %	0 %	145301380
2530	NC_009349	TGAT	2	8	160203	160210	25 %	50 %	25 %	0 %	145301380
2531	NC_009349	AGC	2	6	160215	160220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301380
2532	NC_009349	A	7	7	160311	160317	100 %	0 %	0 %	0 %	145301380
2533	NC_009349	CTG	2	6	160346	160351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301380
2534	NC_009349	CTT	2	6	160402	160407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301380
2535	NC_009349	ATC	2	6	160409	160414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301380
2536	NC_009349	CA	3	6	160430	160435	50 %	0 %	0 %	50 %	145301380
2537	NC_009349	GCA	2	6	160477	160482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301380
2538	NC_009349	AGC	2	6	160496	160501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301380
2539	NC_009349	GAC	2	6	160535	160540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301380
2540	NC_009349	CGCC	2	8	160555	160562	0 %	0 %	25 %	75 %	145301380
2541	NC_009349	CTGG	2	8	160570	160577	0 %	25 %	50 %	25 %	145301380
2542	NC_009349	CAC	2	6	160623	160628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301380
2543	NC_009349	ATC	2	6	160645	160650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301380
2544	NC_009349	GC	3	6	160780	160785	0 %	0 %	50 %	50 %	145301380
2545	NC_009349	CTG	2	6	160843	160848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301380
2546	NC_009349	TTG	2	6	161046	161051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301380
2547	NC_009349	A	7	7	161074	161080	100 %	0 %	0 %	0 %	145301380
2548	NC_009349	CAA	2	6	161087	161092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301380
2549	NC_009349	TGG	2	6	161142	161147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301380
2550	NC_009349	A	8	8	161175	161182	100 %	0 %	0 %	0 %	145301380
2551	NC_009349	TAA	2	6	161187	161192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301380
2552	NC_009349	ACC	2	6	161200	161205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301380
2553	NC_009349	T	6	6	161210	161215	0 %	100 %	0 %	0 %	145301380
2554	NC_009349	TAA	2	6	161218	161223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301380
2555	NC_009349	GGC	2	6	161234	161239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301380
2556	NC_009349	TGA	2	6	161247	161252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301380
2557	NC_009349	CTG	2	6	161273	161278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301380
2558	NC_009349	GCT	2	6	161365	161370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301380
2559	NC_009349	CAG	2	6	161460	161465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301380
2560	NC_009349	AGCC	2	8	161507	161514	25 %	0 %	25 %	50 %	145301380
2561	NC_009349	TTC	2	6	161622	161627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301380
2562	NC_009349	TCCTC	2	10	161655	161664	0 %	40 %	0 %	60 %	145301380
2563	NC_009349	ACA	2	6	161742	161747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301380
2564	NC_009349	GGA	2	6	161824	161829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301380
2565	NC_009349	A	6	6	161868	161873	100 %	0 %	0 %	0 %	145301380
2566	NC_009349	GCT	2	6	161884	161889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301380
2567	NC_009349	TGC	2	6	161953	161958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301380
2568	NC_009349	GCT	2	6	162002	162007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301380
2569	NC_009349	GCC	2	6	162168	162173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301381
2570	NC_009349	GCT	2	6	162219	162224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301381
2571	NC_009349	TCG	2	6	162248	162253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301381
2572	NC_009349	AAT	2	6	162343	162348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301381
2573	NC_009349	TGA	2	6	162408	162413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301381
2574	NC_009349	CACGC	2	10	162433	162442	20 %	0 %	20 %	60 %	145301381
2575	NC_009349	CGA	2	6	162501	162506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301381
2576	NC_009349	GCC	2	6	162536	162541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301381
2577	NC_009349	CAG	2	6	162568	162573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301381
2578	NC_009349	TTG	2	6	162587	162592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301381
2579	NC_009349	TC	3	6	162715	162720	0 %	50 %	0 %	50 %	145301381
2580	NC_009349	AT	3	6	162750	162755	50 %	50 %	0 %	0 %	145301381
2581	NC_009349	CCA	2	6	162830	162835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301381
2582	NC_009349	GCT	2	6	162942	162947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301381
2583	NC_009349	TGG	2	6	162962	162967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301381
2584	NC_009349	CAATC	2	10	163013	163022	40 %	20 %	0 %	40 %	145301381
2585	NC_009349	CGA	2	6	163026	163031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301381
2586	NC_009349	ATC	2	6	163039	163044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301381
2587	NC_009349	AAG	2	6	163064	163069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301381
2588	NC_009349	ATC	2	6	163141	163146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301381
2589	NC_009349	CAA	2	6	163245	163250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301381
2590	NC_009349	CAC	2	6	163266	163271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301381
2591	NC_009349	CTCG	2	8	163319	163326	0 %	25 %	25 %	50 %	145301381
2592	NC_009349	TGA	2	6	163371	163376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301381
2593	NC_009349	GGT	2	6	163461	163466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301381
2594	NC_009349	GCC	2	6	163491	163496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301381
2595	NC_009349	GTTC	2	8	163576	163583	0 %	50 %	25 %	25 %	145301381
2596	NC_009349	CTG	2	6	163588	163593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301381
2597	NC_009349	ATCA	2	8	163606	163613	50 %	25 %	0 %	25 %	145301381
2598	NC_009349	GGGC	2	8	163617	163624	0 %	0 %	75 %	25 %	145301381
2599	NC_009349	GGA	2	6	163666	163671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301381
2600	NC_009349	TCA	2	6	163763	163768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301381
2601	NC_009349	CCA	2	6	163853	163858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301381
2602	NC_009349	CAGT	2	8	163880	163887	25 %	25 %	25 %	25 %	145301381
2603	NC_009349	CCTT	2	8	163972	163979	0 %	50 %	0 %	50 %	145301381
2604	NC_009349	AGA	2	6	164036	164041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301381
2605	NC_009349	AAC	2	6	164042	164047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301381
2606	NC_009349	T	6	6	164233	164238	0 %	100 %	0 %	0 %	145301382
2607	NC_009349	AAC	2	6	164240	164245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301382
2608	NC_009349	CAGATC	2	12	164324	164335	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145301382
2609	NC_009349	TCAGG	2	10	164350	164359	20 %	20 %	40 %	20 %	145301382
2610	NC_009349	GTT	2	6	164389	164394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301382
2611	NC_009349	GCT	2	6	164440	164445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301382
2612	NC_009349	CGA	2	6	164511	164516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301382
2613	NC_009349	AT	3	6	164549	164554	50 %	50 %	0 %	0 %	145301382
2614	NC_009349	GCA	2	6	164562	164567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301382
2615	NC_009349	TTC	2	6	164734	164739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301382
2616	NC_009349	AGG	2	6	164891	164896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301382
2617	NC_009349	CAA	2	6	164975	164980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301382
2618	NC_009349	AAGAC	2	10	165077	165086	60 %	0 %	20 %	20 %	145301382
2619	NC_009349	TCA	2	6	165110	165115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301382
2620	NC_009349	AGC	2	6	165182	165187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301382
2621	NC_009349	GA	3	6	165234	165239	50 %	0 %	50 %	0 %	145301382
2622	NC_009349	CAC	2	6	165280	165285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301382
2623	NC_009349	TGGA	2	8	165290	165297	25 %	25 %	50 %	0 %	145301382
2624	NC_009349	TAC	2	6	165324	165329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301382
2625	NC_009349	GTT	2	6	165337	165342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301382
2626	NC_009349	A	8	8	165345	165352	100 %	0 %	0 %	0 %	145301382
2627	NC_009349	AAT	2	6	165358	165363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301382
2628	NC_009349	TAA	2	6	165367	165372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301382
2629	NC_009349	CCA	2	6	165703	165708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301383
2630	NC_009349	CCCA	2	8	165919	165926	25 %	0 %	0 %	75 %	145301383
2631	NC_009349	TCA	2	6	165931	165936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301383
2632	NC_009349	G	6	6	165943	165948	0 %	0 %	100 %	0 %	145301383
2633	NC_009349	TGC	2	6	166006	166011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301383
2634	NC_009349	GAC	2	6	166023	166028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301383
2635	NC_009349	C	6	6	166106	166111	0 %	0 %	0 %	100 %	145301383
2636	NC_009349	C	6	6	166134	166139	0 %	0 %	0 %	100 %	145301383
2637	NC_009349	TCA	2	6	166242	166247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301384
2638	NC_009349	TCG	2	6	166259	166264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301384
2639	NC_009349	AGC	2	6	166341	166346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301384
2640	NC_009349	CTTGG	2	10	166379	166388	0 %	40 %	40 %	20 %	145301384
2641	NC_009349	GTC	2	6	166429	166434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301384
2642	NC_009349	CTG	2	6	166500	166505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301384
2643	NC_009349	CCAG	2	8	166584	166591	25 %	0 %	25 %	50 %	145301384
2644	NC_009349	GTGGC	2	10	166593	166602	0 %	20 %	60 %	20 %	145301384
2645	NC_009349	ATCA	2	8	166619	166626	50 %	25 %	0 %	25 %	145301384

< Previous123456Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.