MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 4

Total Repeats: 2645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009349	TTG	2	6	32921	32926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301247
502	NC_009349	GT	4	8	33098	33105	0 %	50 %	50 %	0 %	145301247
503	NC_009349	ACC	2	6	33127	33132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301247
504	NC_009349	GGC	2	6	33291	33296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301247
505	NC_009349	CTG	2	6	33322	33327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301247
506	NC_009349	AGG	2	6	33347	33352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301247
507	NC_009349	GGC	2	6	33378	33383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301247
508	NC_009349	AAC	2	6	33467	33472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301248
509	NC_009349	CGC	2	6	33513	33518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301248
510	NC_009349	GTG	2	6	33625	33630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301248
511	NC_009349	TCA	2	6	33644	33649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301248
512	NC_009349	TCG	2	6	33672	33677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301248
513	NC_009349	AGC	2	6	34041	34046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301249
514	NC_009349	TGC	2	6	34049	34054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301249
515	NC_009349	TGG	2	6	34055	34060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301249
516	NC_009349	GGGAG	2	10	34085	34094	20 %	0 %	80 %	0 %	145301249
517	NC_009349	CAT	2	6	34109	34114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301249
518	NC_009349	CGA	2	6	34134	34139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301249
519	NC_009349	CGC	2	6	34194	34199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301249
520	NC_009349	GTC	2	6	34243	34248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301249
521	NC_009349	TC	3	6	34247	34252	0 %	50 %	0 %	50 %	145301249
522	NC_009349	CAG	2	6	34358	34363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301249
523	NC_009349	TCCT	2	8	34377	34384	0 %	50 %	0 %	50 %	145301249
524	NC_009349	CCA	2	6	34457	34462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301249
525	NC_009349	AGC	2	6	34531	34536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301249
526	NC_009349	CAG	2	6	34570	34575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301249
527	NC_009349	AGG	2	6	34591	34596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301249
528	NC_009349	TGA	2	6	34679	34684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301249
529	NC_009349	AACGAT	2	12	34721	34732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	145301249
530	NC_009349	AAT	2	6	34739	34744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301249
531	NC_009349	CTG	2	6	34833	34838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301250
532	NC_009349	TGG	2	6	34841	34846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301250
533	NC_009349	CAG	2	6	34892	34897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301250
534	NC_009349	CGT	2	6	35009	35014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301250
535	NC_009349	CCAG	2	8	35035	35042	25 %	0 %	25 %	50 %	145301250
536	NC_009349	CCAC	2	8	35061	35068	25 %	0 %	0 %	75 %	145301250
537	NC_009349	TGG	3	9	35138	35146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301250
538	NC_009349	GCC	2	6	35222	35227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301250
539	NC_009349	AGC	2	6	35297	35302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301250
540	NC_009349	TGA	2	6	35335	35340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301250
541	NC_009349	CGGC	2	8	35342	35349	0 %	0 %	50 %	50 %	145301250
542	NC_009349	TCG	2	6	35352	35357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301250
543	NC_009349	GCAA	2	8	35403	35410	50 %	0 %	25 %	25 %	145301250
544	NC_009349	TGG	2	6	35433	35438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301250
545	NC_009349	GTG	2	6	35492	35497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301250
546	NC_009349	CGG	2	6	35563	35568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301250
547	NC_009349	ACTT	2	8	35615	35622	25 %	50 %	0 %	25 %	145301250
548	NC_009349	GA	3	6	35710	35715	50 %	0 %	50 %	0 %	145301250
549	NC_009349	GGC	2	6	35821	35826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301250
550	NC_009349	C	6	6	35905	35910	0 %	0 %	0 %	100 %	145301251
551	NC_009349	GCA	2	6	35914	35919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301251
552	NC_009349	CAG	2	6	35948	35953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301251
553	NC_009349	CAT	2	6	36005	36010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301251
554	NC_009349	CTC	2	6	36027	36032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301251
555	NC_009349	C	6	6	36089	36094	0 %	0 %	0 %	100 %	145301251
556	NC_009349	TCA	2	6	36148	36153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301251
557	NC_009349	TCA	2	6	36155	36160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301251
558	NC_009349	TCC	2	6	36186	36191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301251
559	NC_009349	TCC	2	6	36193	36198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301251
560	NC_009349	CGGG	2	8	36284	36291	0 %	0 %	75 %	25 %	145301251
561	NC_009349	CAC	2	6	36309	36314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301251
562	NC_009349	GCA	2	6	36338	36343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301251
563	NC_009349	CTT	2	6	36363	36368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301251
564	NC_009349	ACC	2	6	36385	36390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301251
565	NC_009349	AGCCA	2	10	36412	36421	40 %	0 %	20 %	40 %	145301251
566	NC_009349	GCA	2	6	36452	36457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301251
567	NC_009349	GCA	2	6	36464	36469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301251
568	NC_009349	CTT	3	9	36495	36503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301251
569	NC_009349	CTT	2	6	36530	36535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301251
570	NC_009349	TCT	2	6	36539	36544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301251
571	NC_009349	CAG	2	6	36549	36554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301251
572	NC_009349	TCT	2	6	36581	36586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301251
573	NC_009349	GCT	2	6	36734	36739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301251
574	NC_009349	CAC	3	9	36872	36880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301252
575	NC_009349	GCC	2	6	36926	36931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301252
576	NC_009349	CTTTC	2	10	36944	36953	0 %	60 %	0 %	40 %	145301252
577	NC_009349	GAT	2	6	37062	37067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301252
578	NC_009349	GAT	2	6	37086	37091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301252
579	NC_009349	C	6	6	37148	37153	0 %	0 %	0 %	100 %	145301252
580	NC_009349	CCA	2	6	37275	37280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301252
581	NC_009349	CGG	2	6	37303	37308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301252
582	NC_009349	TCA	2	6	37376	37381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301252
583	NC_009349	GCC	2	6	37391	37396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301253
584	NC_009349	GAT	2	6	37423	37428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301253
585	NC_009349	AGT	2	6	37521	37526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301253
586	NC_009349	TCA	2	6	37530	37535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301253
587	NC_009349	CCA	2	6	37633	37638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301253
588	NC_009349	CGAG	2	8	37683	37690	25 %	0 %	50 %	25 %	145301253
589	NC_009349	TCA	2	6	37720	37725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301253
590	NC_009349	TGG	2	6	37737	37742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301253
591	NC_009349	CCTG	2	8	37771	37778	0 %	25 %	25 %	50 %	145301253
592	NC_009349	CTT	2	6	37903	37908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301253
593	NC_009349	AGTTC	2	10	37915	37924	20 %	40 %	20 %	20 %	145301253
594	NC_009349	TC	3	6	37934	37939	0 %	50 %	0 %	50 %	145301254
595	NC_009349	TCA	2	6	37985	37990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301254
596	NC_009349	GTT	2	6	38027	38032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301254
597	NC_009349	AGA	2	6	38051	38056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301254
598	NC_009349	AG	3	6	38071	38076	50 %	0 %	50 %	0 %	145301254
599	NC_009349	TCA	2	6	38098	38103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301254
600	NC_009349	CCA	2	6	38135	38140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301254
601	NC_009349	AGT	2	6	38165	38170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301254
602	NC_009349	GCC	2	6	38239	38244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301254
603	NC_009349	ATC	2	6	38295	38300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301254
604	NC_009349	AAG	2	6	38877	38882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301255
605	NC_009349	GGC	2	6	38964	38969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301255
606	NC_009349	GCT	2	6	38982	38987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301255
607	NC_009349	CAT	2	6	39039	39044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301255
608	NC_009349	GGGAG	2	10	39058	39067	20 %	0 %	80 %	0 %	145301255
609	NC_009349	ACT	2	6	39097	39102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301255
610	NC_009349	GCT	2	6	39173	39178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301255
611	NC_009349	GTC	2	6	39196	39201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301255
612	NC_009349	CAC	2	6	39204	39209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301255
613	NC_009349	TGC	2	6	39235	39240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301255
614	NC_009349	GCTTC	2	10	39275	39284	0 %	40 %	20 %	40 %	145301255
615	NC_009349	CAA	2	6	39288	39293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301255
616	NC_009349	CTTCA	2	10	39298	39307	20 %	40 %	0 %	40 %	145301255
617	NC_009349	GGT	2	6	39313	39318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301255
618	NC_009349	GTC	2	6	39346	39351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301255
619	NC_009349	AAC	2	6	39360	39365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301255
620	NC_009349	AAG	2	6	39384	39389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301255
621	NC_009349	GCG	2	6	39410	39415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301255
622	NC_009349	CCA	2	6	39573	39578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301255
623	NC_009349	CTTGA	2	10	39735	39744	20 %	40 %	20 %	20 %	145301255
624	NC_009349	CCA	2	6	39855	39860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301255
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626	NC_009349	GAA	2	6	39979	39984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301256
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