MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome

Total Repeats: 37925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37502	NC_009053	T	7	7	2245800	2245806	0 %	100 %	0 %	0 %	126209472
37503	NC_009053	AGA	2	6	2246225	2246230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126209473
37504	NC_009053	GCG	2	6	2246273	2246278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126209473
37505	NC_009053	GAAC	2	8	2246292	2246299	50 %	0 %	25 %	25 %	126209473
37506	NC_009053	TGA	2	6	2246352	2246357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126209473
37507	NC_009053	GTG	2	6	2246386	2246391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126209473
37508	NC_009053	GAA	2	6	2246422	2246427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126209473
37509	NC_009053	GTC	2	6	2246438	2246443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126209473
37510	NC_009053	A	6	6	2246456	2246461	100 %	0 %	0 %	0 %	126209473
37511	NC_009053	A	6	6	2246470	2246475	100 %	0 %	0 %	0 %	126209473
37512	NC_009053	CGG	2	6	2246493	2246498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126209473
37513	NC_009053	CCA	2	6	2246573	2246578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126209473
37514	NC_009053	CTTA	2	8	2246637	2246644	25 %	50 %	0 %	25 %	126209473
37515	NC_009053	CCG	2	6	2246669	2246674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126209473
37516	NC_009053	GAAGTG	2	12	2246740	2246751	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	126209473
37517	NC_009053	ACA	2	6	2246850	2246855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126209473
37518	NC_009053	GCG	2	6	2246857	2246862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126209473
37519	NC_009053	TGC	2	6	2246879	2246884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126209473
37520	NC_009053	CGCT	2	8	2246954	2246961	0 %	25 %	25 %	50 %	126209473
37521	NC_009053	AAC	2	6	2247026	2247031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126209473
37522	NC_009053	GAAA	2	8	2247033	2247040	75 %	0 %	25 %	0 %	126209473
37523	NC_009053	AAC	3	9	2247237	2247245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126209474
37524	NC_009053	AAG	2	6	2247249	2247254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126209474
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37526	NC_009053	ATT	2	6	2247346	2247351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126209474
37527	NC_009053	GCGT	2	8	2247537	2247544	0 %	25 %	50 %	25 %	126209474
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37529	NC_009053	TGCT	2	8	2247627	2247634	0 %	50 %	25 %	25 %	126209474
37530	NC_009053	A	6	6	2247659	2247664	100 %	0 %	0 %	0 %	126209474
37531	NC_009053	GCG	2	6	2247710	2247715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126209474
37532	NC_009053	TG	3	6	2247720	2247725	0 %	50 %	50 %	0 %	126209474
37533	NC_009053	CGGGC	2	10	2247817	2247826	0 %	0 %	60 %	40 %	126209474
37534	NC_009053	AGTGTT	2	12	2247910	2247921	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	126209474
37535	NC_009053	A	6	6	2248078	2248083	100 %	0 %	0 %	0 %	126209474
37536	NC_009053	TAG	2	6	2248179	2248184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126209474
37537	NC_009053	ACCA	2	8	2248289	2248296	50 %	0 %	0 %	50 %	126209474
37538	NC_009053	GCTTAG	2	12	2248335	2248346	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126209474
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37541	NC_009053	CT	3	6	2248631	2248636	0 %	50 %	0 %	50 %	126209475
37542	NC_009053	A	6	6	2248639	2248644	100 %	0 %	0 %	0 %	126209475
37543	NC_009053	TG	3	6	2248699	2248704	0 %	50 %	50 %	0 %	126209475
37544	NC_009053	GAAT	2	8	2248714	2248721	50 %	25 %	25 %	0 %	126209475
37545	NC_009053	CAGC	2	8	2248781	2248788	25 %	0 %	25 %	50 %	126209475
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37549	NC_009053	TG	3	6	2249056	2249061	0 %	50 %	50 %	0 %	126209475
37550	NC_009053	AAC	2	6	2249069	2249074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126209475
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37552	NC_009053	TGG	3	9	2249145	2249153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126209475
37553	NC_009053	TTGCG	2	10	2249264	2249273	0 %	40 %	40 %	20 %	126209475
37554	NC_009053	GAA	2	6	2249291	2249296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126209475
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37602	NC_009053	TTTG	2	8	2253411	2253418	0 %	75 %	25 %	0 %	126209479
37603	NC_009053	AC	3	6	2253462	2253467	50 %	0 %	0 %	50 %	126209479
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37614	NC_009053	GTG	2	6	2254356	2254361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126209480
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.