MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome

Total Repeats: 37925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_009053	GAA	2	6	178303	178308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207648
3003	NC_009053	AAT	2	6	178336	178341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207648
3004	NC_009053	TGAT	2	8	178343	178350	25 %	50 %	25 %	0 %	126207648
3005	NC_009053	CCG	2	6	178386	178391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207648
3006	NC_009053	T	7	7	178435	178441	0 %	100 %	0 %	0 %	126207648
3007	NC_009053	ATA	2	6	178499	178504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207648
3008	NC_009053	T	6	6	178505	178510	0 %	100 %	0 %	0 %	126207648
3009	NC_009053	CTG	2	6	178551	178556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207648
3010	NC_009053	CAT	2	6	178618	178623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207648
3011	NC_009053	CTG	2	6	178665	178670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207648
3012	NC_009053	TTG	2	6	178736	178741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207648
3013	NC_009053	GAT	2	6	178747	178752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207648
3014	NC_009053	TGA	2	6	178835	178840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207648
3015	NC_009053	CGC	2	6	179060	179065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207649
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3017	NC_009053	ATT	2	6	179178	179183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207649
3018	NC_009053	TTG	2	6	179209	179214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207649
3019	NC_009053	AGA	2	6	179226	179231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207649
3020	NC_009053	TTA	2	6	179236	179241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207649
3021	NC_009053	A	6	6	179257	179262	100 %	0 %	0 %	0 %	126207649
3022	NC_009053	AGA	2	6	179289	179294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207649
3023	NC_009053	AAG	2	6	179297	179302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207649
3024	NC_009053	GAT	2	6	179341	179346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207649
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3027	NC_009053	TTGG	2	8	179400	179407	0 %	50 %	50 %	0 %	126207649
3028	NC_009053	GGA	2	6	179457	179462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126207649
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3030	NC_009053	TGT	2	6	179502	179507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207649
3031	NC_009053	AAGTG	2	10	179532	179541	40 %	20 %	40 %	0 %	126207649
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3033	NC_009053	ATTG	2	8	179713	179720	25 %	50 %	25 %	0 %	126207649
3034	NC_009053	AGA	2	6	179817	179822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207649
3035	NC_009053	GAA	2	6	179863	179868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207649
3036	NC_009053	ATT	2	6	179874	179879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207649
3037	NC_009053	A	6	6	179885	179890	100 %	0 %	0 %	0 %	126207649
3038	NC_009053	GAA	2	6	179896	179901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207649
3039	NC_009053	TAT	2	6	180000	180005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207650
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3041	NC_009053	GTG	2	6	180169	180174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126207650
3042	NC_009053	CT	3	6	180219	180224	0 %	50 %	0 %	50 %	126207650
3043	NC_009053	ATT	2	6	180251	180256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207650
3044	NC_009053	GAT	2	6	180364	180369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207650
3045	NC_009053	TAT	2	6	180404	180409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207650
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3048	NC_009053	AACC	2	8	180516	180523	50 %	0 %	0 %	50 %	126207650
3049	NC_009053	CT	3	6	180737	180742	0 %	50 %	0 %	50 %	126207651
3050	NC_009053	GA	4	8	180753	180760	50 %	0 %	50 %	0 %	126207651
3051	NC_009053	AG	3	6	180790	180795	50 %	0 %	50 %	0 %	126207651
3052	NC_009053	AGC	2	6	180925	180930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207651
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3054	NC_009053	TGC	2	6	181016	181021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207651
3055	NC_009053	GCC	2	6	181088	181093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207651
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3057	NC_009053	CCG	2	6	181252	181257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207651
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3059	NC_009053	CGG	2	6	181390	181395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207651
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3061	NC_009053	CAT	2	6	181456	181461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207651
3062	NC_009053	CGG	2	6	181477	181482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207651
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3065	NC_009053	CGC	2	6	181618	181623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207651
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3067	NC_009053	AGCG	2	8	181685	181692	25 %	0 %	50 %	25 %	126207651
3068	NC_009053	TGAT	2	8	181706	181713	25 %	50 %	25 %	0 %	126207651
3069	NC_009053	TTC	2	6	181742	181747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207651
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3071	NC_009053	TAC	2	6	181811	181816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207651
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3073	NC_009053	TTG	2	6	182033	182038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207651
3074	NC_009053	GGT	2	6	182041	182046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126207651
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3079	NC_009053	CGATT	2	10	182327	182336	20 %	40 %	20 %	20 %	126207651
3080	NC_009053	TTC	2	6	182360	182365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207651
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3090	NC_009053	TAGG	2	8	182700	182707	25 %	25 %	50 %	0 %	126207652
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3092	NC_009053	CGC	2	6	182828	182833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207652
3093	NC_009053	TATT	2	8	182866	182873	25 %	75 %	0 %	0 %	126207652
3094	NC_009053	T	6	6	182893	182898	0 %	100 %	0 %	0 %	126207652
3095	NC_009053	AAG	2	6	182977	182982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207652
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3102	NC_009053	GCG	2	6	183849	183854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207653
3103	NC_009053	GGC	3	9	183905	183913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207653
3104	NC_009053	CGG	2	6	183958	183963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207653
3105	NC_009053	GATTGC	2	12	184045	184056	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207654
3106	NC_009053	TCG	2	6	184094	184099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207654
3107	NC_009053	TCG	2	6	184128	184133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207654
3108	NC_009053	GTT	2	6	184147	184152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207654
3109	NC_009053	TG	3	6	184238	184243	0 %	50 %	50 %	0 %	126207654
3110	NC_009053	TGG	2	6	184260	184265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126207654
3111	NC_009053	ACA	2	6	184507	184512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207654
3112	NC_009053	GGT	2	6	184564	184569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126207654
3113	NC_009053	A	6	6	184589	184594	100 %	0 %	0 %	0 %	126207654
3114	NC_009053	CGGG	2	8	184687	184694	0 %	0 %	75 %	25 %	126207655
3115	NC_009053	GGGC	2	8	184795	184802	0 %	0 %	75 %	25 %	126207655
3116	NC_009053	TCCG	2	8	184937	184944	0 %	25 %	25 %	50 %	126207655
3117	NC_009053	ATT	2	6	184965	184970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207655
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3119	NC_009053	CCGA	2	8	185003	185010	25 %	0 %	25 %	50 %	126207655
3120	NC_009053	T	6	6	185018	185023	0 %	100 %	0 %	0 %	126207655
3121	NC_009053	GCGGT	2	10	185083	185092	0 %	20 %	60 %	20 %	126207655
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3493	NC_009053	CAC	2	6	207902	207907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126207675
3494	NC_009053	ATT	2	6	208143	208148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207675
3495	NC_009053	ACAA	2	8	208176	208183	75 %	0 %	0 %	25 %	126207675
3496	NC_009053	TTC	2	6	208190	208195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207675
3497	NC_009053	GCG	2	6	208385	208390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207676
3498	NC_009053	AGCG	2	8	208397	208404	25 %	0 %	50 %	25 %	126207676
3499	NC_009053	TGCG	2	8	208515	208522	0 %	25 %	50 %	25 %	126207676
3500	NC_009053	TCG	2	6	208589	208594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207676

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