MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome

Total Repeats: 37925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_009053	GCA	2	6	1239642	1239647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126208543
21002	NC_009053	ATT	2	6	1239659	1239664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208543
21003	NC_009053	CAT	2	6	1239673	1239678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208543
21004	NC_009053	TTC	2	6	1239716	1239721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208543
21005	NC_009053	GGT	2	6	1239799	1239804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126208543
21006	NC_009053	TTA	2	6	1239875	1239880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208543
21007	NC_009053	ATT	2	6	1239896	1239901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208543
21008	NC_009053	CGG	2	6	1239990	1239995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126208543
21009	NC_009053	CGG	2	6	1240002	1240007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126208543
21010	NC_009053	TTA	2	6	1240055	1240060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208543
21011	NC_009053	TTA	2	6	1240133	1240138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208543
21012	NC_009053	GAT	2	6	1240169	1240174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208543
21013	NC_009053	TCG	2	6	1240176	1240181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126208543
21014	NC_009053	GT	3	6	1240199	1240204	0 %	50 %	50 %	0 %	126208543
21015	NC_009053	TAT	2	6	1240243	1240248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208543
21016	NC_009053	A	6	6	1240298	1240303	100 %	0 %	0 %	0 %	126208543
21017	NC_009053	CGGTA	2	10	1240312	1240321	20 %	20 %	40 %	20 %	126208543
21018	NC_009053	TAG	2	6	1240338	1240343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208543
21019	NC_009053	AATCT	2	10	1240366	1240375	40 %	40 %	0 %	20 %	126208543
21020	NC_009053	A	6	6	1240431	1240436	100 %	0 %	0 %	0 %	126208544
21021	NC_009053	CAAAT	2	10	1240441	1240450	60 %	20 %	0 %	20 %	126208544
21022	NC_009053	TAA	2	6	1240456	1240461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208544
21023	NC_009053	CTG	2	6	1240540	1240545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126208544
21024	NC_009053	TCT	2	6	1240618	1240623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208544
21025	NC_009053	TCACT	2	10	1240629	1240638	20 %	40 %	0 %	40 %	126208544
21026	NC_009053	CTTG	2	8	1240656	1240663	0 %	50 %	25 %	25 %	126208544
21027	NC_009053	CCG	2	6	1240794	1240799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208544
21028	NC_009053	TTC	2	6	1240856	1240861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208544
21029	NC_009053	GCG	2	6	1240908	1240913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126208544
21030	NC_009053	TCA	2	6	1240916	1240921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208544
21031	NC_009053	T	6	6	1240958	1240963	0 %	100 %	0 %	0 %	126208544
21032	NC_009053	TTA	2	6	1241009	1241014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208544
21033	NC_009053	AT	4	8	1241169	1241176	50 %	50 %	0 %	0 %	126208545
21034	NC_009053	AAG	2	6	1241224	1241229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126208545
21035	NC_009053	ACCG	2	8	1241294	1241301	25 %	0 %	25 %	50 %	126208545
21036	NC_009053	TACCG	2	10	1241313	1241322	20 %	20 %	20 %	40 %	126208545
21037	NC_009053	GTG	2	6	1241370	1241375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126208545
21038	NC_009053	CGG	2	6	1241383	1241388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126208545
21039	NC_009053	AGT	2	6	1241390	1241395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208545
21040	NC_009053	TTC	2	6	1241586	1241591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208545
21041	NC_009053	GCA	2	6	1241592	1241597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126208545
21042	NC_009053	CAA	2	6	1241607	1241612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126208545
21043	NC_009053	AGTAA	2	10	1241896	1241905	60 %	20 %	20 %	0 %	126208546
21044	NC_009053	TCA	2	6	1242000	1242005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208546
21045	NC_009053	TTC	2	6	1242008	1242013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208546
21046	NC_009053	ATA	2	6	1242033	1242038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208546
21047	NC_009053	TTG	2	6	1242092	1242097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126208546
21048	NC_009053	TCCT	2	8	1242167	1242174	0 %	50 %	0 %	50 %	126208546
21049	NC_009053	ATC	2	6	1242257	1242262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208546
21050	NC_009053	AAT	2	6	1242287	1242292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208546
21051	NC_009053	CGTG	2	8	1242304	1242311	0 %	25 %	50 %	25 %	126208546
21052	NC_009053	GCAC	2	8	1242450	1242457	25 %	0 %	25 %	50 %	126208546
21053	NC_009053	CAT	2	6	1242458	1242463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208546
21054	NC_009053	TG	3	6	1242556	1242561	0 %	50 %	50 %	0 %	126208546
21055	NC_009053	AAG	2	6	1242636	1242641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126208546
21056	NC_009053	CGAAT	2	10	1242692	1242701	40 %	20 %	20 %	20 %	126208546
21057	NC_009053	ATA	2	6	1242718	1242723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208546
21058	NC_009053	TCT	2	6	1242726	1242731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208546
21059	NC_009053	TCAATA	2	12	1242798	1242809	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126208546
21060	NC_009053	CCAC	2	8	1242873	1242880	25 %	0 %	0 %	75 %	126208546
21061	NC_009053	AACG	2	8	1242897	1242904	50 %	0 %	25 %	25 %	126208546
21062	NC_009053	ACGC	2	8	1242932	1242939	25 %	0 %	25 %	50 %	126208546
21063	NC_009053	TCA	2	6	1242960	1242965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208546
21064	NC_009053	GTA	2	6	1243005	1243010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208546
21065	NC_009053	TTC	2	6	1243019	1243024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208546
21066	NC_009053	CTT	2	6	1243084	1243089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208546
21067	NC_009053	GCAC	2	8	1243101	1243108	25 %	0 %	25 %	50 %	126208546
21068	NC_009053	TAA	3	9	1243246	1243254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208546
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21070	NC_009053	CGC	2	6	1243559	1243564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208547
21071	NC_009053	TTC	2	6	1243574	1243579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208547
21072	NC_009053	CGC	2	6	1243658	1243663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208547
21073	NC_009053	AACC	2	8	1243815	1243822	50 %	0 %	0 %	50 %	126208547
21074	NC_009053	GAC	2	6	1243834	1243839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126208547
21075	NC_009053	TCA	2	6	1243890	1243895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208547
21076	NC_009053	AAT	2	6	1243896	1243901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208547
21077	NC_009053	GTG	2	6	1243905	1243910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126208547
21078	NC_009053	ATA	2	6	1243947	1243952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208547
21079	NC_009053	ACC	2	6	1244003	1244008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126208547
21080	NC_009053	GTA	2	6	1244013	1244018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208547
21081	NC_009053	CTT	2	6	1244101	1244106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208547
21082	NC_009053	GTT	2	6	1244127	1244132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126208547
21083	NC_009053	CCA	2	6	1244140	1244145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126208547
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21085	NC_009053	GTA	2	6	1244216	1244221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208547
21086	NC_009053	GTA	2	6	1244240	1244245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208547
21087	NC_009053	CTT	2	6	1244278	1244283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208547
21088	NC_009053	AAAT	2	8	1244288	1244295	75 %	25 %	0 %	0 %	126208547
21089	NC_009053	CGC	2	6	1244384	1244389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208547
21090	NC_009053	CG	3	6	1244394	1244399	0 %	0 %	50 %	50 %	126208547
21091	NC_009053	GAA	2	6	1244422	1244427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126208547
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21093	NC_009053	CAC	2	6	1244525	1244530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126208547
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21099	NC_009053	CAT	2	6	1244987	1244992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208548
21100	NC_009053	CGG	2	6	1245127	1245132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126208548
21101	NC_009053	TTC	2	6	1245135	1245140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208548
21102	NC_009053	CAC	2	6	1245158	1245163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126208548
21103	NC_009053	AAT	2	6	1245185	1245190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208548
21104	NC_009053	TTC	2	6	1245200	1245205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208548
21105	NC_009053	GCA	2	6	1245234	1245239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126208548
21106	NC_009053	CG	3	6	1245245	1245250	0 %	0 %	50 %	50 %	126208548
21107	NC_009053	CGC	2	6	1245388	1245393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208548
21108	NC_009053	CAC	2	6	1245493	1245498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126208548
21109	NC_009053	TAA	2	6	1245557	1245562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208548
21110	NC_009053	T	6	6	1245566	1245571	0 %	100 %	0 %	0 %	126208548
21111	NC_009053	ACC	2	6	1245681	1245686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126208548
21112	NC_009053	TTA	2	6	1245714	1245719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208548
21113	NC_009053	A	6	6	1245777	1245782	100 %	0 %	0 %	0 %	126208548
21114	NC_009053	TAA	3	9	1245803	1245811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208548
21115	NC_009053	ATT	2	6	1245819	1245824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208548
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21117	NC_009053	AAC	2	6	1245907	1245912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126208549
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21467	NC_009053	TAC	2	6	1265693	1265698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208566
21468	NC_009053	ATG	2	6	1265705	1265710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208566
21469	NC_009053	CTTA	2	8	1265711	1265718	25 %	50 %	0 %	25 %	126208566
21470	NC_009053	GAT	2	6	1265725	1265730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208566
21471	NC_009053	T	6	6	1265798	1265803	0 %	100 %	0 %	0 %	126208566
21472	NC_009053	T	6	6	1265850	1265855	0 %	100 %	0 %	0 %	126208566
21473	NC_009053	T	6	6	1265871	1265876	0 %	100 %	0 %	0 %	126208566
21474	NC_009053	TCA	2	6	1265943	1265948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208566
21475	NC_009053	A	6	6	1265971	1265976	100 %	0 %	0 %	0 %	126208566
21476	NC_009053	A	6	6	1266007	1266012	100 %	0 %	0 %	0 %	126208566
21477	NC_009053	ATA	2	6	1266038	1266043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208566
21478	NC_009053	AAG	2	6	1266062	1266067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126208566
21479	NC_009053	TACT	2	8	1266192	1266199	25 %	50 %	0 %	25 %	126208566
21480	NC_009053	ATTG	2	8	1266235	1266242	25 %	50 %	25 %	0 %	126208566
21481	NC_009053	TAAAT	2	10	1266255	1266264	60 %	40 %	0 %	0 %	126208566
21482	NC_009053	CAT	2	6	1266265	1266270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208566
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21484	NC_009053	GAT	2	6	1266333	1266338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208567
21485	NC_009053	GCC	2	6	1266535	1266540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208567
21486	NC_009053	CCG	3	9	1266616	1266624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208567
21487	NC_009053	TGAG	2	8	1266798	1266805	25 %	25 %	50 %	0 %	126208567
21488	NC_009053	CTA	2	6	1266878	1266883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208567
21489	NC_009053	ATAC	2	8	1266924	1266931	50 %	25 %	0 %	25 %	126208567
21490	NC_009053	CCG	2	6	1266941	1266946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208567
21491	NC_009053	CCG	2	6	1266952	1266957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208567
21492	NC_009053	CCG	2	6	1267010	1267015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208567
21493	NC_009053	AAG	2	6	1267054	1267059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126208567
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21495	NC_009053	CTA	2	6	1267301	1267306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208567
21496	NC_009053	A	6	6	1267585	1267590	100 %	0 %	0 %	0 %	126208568
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21498	NC_009053	ATT	2	6	1267608	1267613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208568
21499	NC_009053	TC	3	6	1267626	1267631	0 %	50 %	0 %	50 %	126208568
21500	NC_009053	A	6	6	1267672	1267677	100 %	0 %	0 %	0 %	126208568

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