MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome

Total Repeats: 37925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_009053	TCA	2	6	1129807	1129812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208450
19002	NC_009053	CCG	2	6	1129858	1129863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208450
19003	NC_009053	TTA	2	6	1129864	1129869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208450
19004	NC_009053	TGA	2	6	1129874	1129879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208450
19005	NC_009053	CCG	2	6	1129896	1129901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208450
19006	NC_009053	CGG	2	6	1130042	1130047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126208450
19007	NC_009053	TTC	2	6	1130107	1130112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208450
19008	NC_009053	AAG	2	6	1130153	1130158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126208450
19009	NC_009053	CCG	2	6	1130162	1130167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208450
19010	NC_009053	CGG	2	6	1130277	1130282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126208450
19011	NC_009053	ATT	2	6	1130296	1130301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208450
19012	NC_009053	GGC	2	6	1130311	1130316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126208450
19013	NC_009053	AAAC	2	8	1130329	1130336	75 %	0 %	0 %	25 %	126208450
19014	NC_009053	GAT	2	6	1130373	1130378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208450
19015	NC_009053	GTA	2	6	1130416	1130421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208450
19016	NC_009053	CGG	2	6	1130430	1130435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126208450
19017	NC_009053	CGATT	2	10	1130463	1130472	20 %	40 %	20 %	20 %	126208450
19018	NC_009053	GAAA	2	8	1130478	1130485	75 %	0 %	25 %	0 %	126208450
19019	NC_009053	TTAT	2	8	1130515	1130522	25 %	75 %	0 %	0 %	126208450
19020	NC_009053	TCA	2	6	1130539	1130544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208450
19021	NC_009053	ATT	2	6	1130560	1130565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208450
19022	NC_009053	TC	3	6	1130603	1130608	0 %	50 %	0 %	50 %	126208450
19023	NC_009053	AGC	2	6	1130637	1130642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126208450
19024	NC_009053	TTA	2	6	1130773	1130778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208450
19025	NC_009053	ATG	2	6	1130800	1130805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208450
19026	NC_009053	ATTT	2	8	1130907	1130914	25 %	75 %	0 %	0 %	126208451
19027	NC_009053	TCA	2	6	1130946	1130951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208451
19028	NC_009053	ATT	2	6	1130962	1130967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208451
19029	NC_009053	TGA	2	6	1131015	1131020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208451
19030	NC_009053	TCA	2	6	1131066	1131071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208451
19031	NC_009053	A	6	6	1131109	1131114	100 %	0 %	0 %	0 %	126208451
19032	NC_009053	CCGA	2	8	1131142	1131149	25 %	0 %	25 %	50 %	126208451
19033	NC_009053	TCGC	2	8	1131246	1131253	0 %	25 %	25 %	50 %	126208451
19034	NC_009053	ACA	2	6	1131297	1131302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126208451
19035	NC_009053	CCGA	2	8	1131367	1131374	25 %	0 %	25 %	50 %	126208451
19036	NC_009053	ATCGGT	2	12	1131382	1131393	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126208451
19037	NC_009053	GAA	2	6	1131445	1131450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126208451
19038	NC_009053	TA	3	6	1131470	1131475	50 %	50 %	0 %	0 %	126208451
19039	NC_009053	TGA	2	6	1131561	1131566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208451
19040	NC_009053	CAA	2	6	1131781	1131786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126208452
19041	NC_009053	TAA	2	6	1131801	1131806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208452
19042	NC_009053	ATT	2	6	1131892	1131897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208452
19043	NC_009053	CAAT	2	8	1132091	1132098	50 %	25 %	0 %	25 %	126208452
19044	NC_009053	GTT	2	6	1132101	1132106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126208452
19045	NC_009053	AAT	2	6	1132147	1132152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208452
19046	NC_009053	ATC	2	6	1132165	1132170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208452
19047	NC_009053	AGA	2	6	1132365	1132370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126208452
19048	NC_009053	CTG	2	6	1132411	1132416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126208452
19049	NC_009053	TTG	2	6	1132423	1132428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126208452
19050	NC_009053	AAC	2	6	1132511	1132516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126208452
19051	NC_009053	ATT	2	6	1132579	1132584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208452
19052	NC_009053	CGAA	2	8	1132591	1132598	50 %	0 %	25 %	25 %	126208452
19053	NC_009053	TTA	2	6	1132736	1132741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208453
19054	NC_009053	AAT	2	6	1132789	1132794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208453
19055	NC_009053	CAT	2	6	1133020	1133025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208453
19056	NC_009053	TCA	2	6	1133030	1133035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208453
19057	NC_009053	AAAT	2	8	1133062	1133069	75 %	25 %	0 %	0 %	126208453
19058	NC_009053	TAA	2	6	1133076	1133081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208453
19059	NC_009053	ATAA	2	8	1133103	1133110	75 %	25 %	0 %	0 %	126208453
19060	NC_009053	TC	3	6	1133138	1133143	0 %	50 %	0 %	50 %	126208453
19061	NC_009053	TGT	3	9	1133216	1133224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126208453
19062	NC_009053	A	7	7	1133303	1133309	100 %	0 %	0 %	0 %	126208453
19063	NC_009053	AAC	2	6	1133347	1133352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126208453
19064	NC_009053	AAT	2	6	1133391	1133396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208453
19065	NC_009053	AAAT	2	8	1133452	1133459	75 %	25 %	0 %	0 %	126208453
19066	NC_009053	ATT	2	6	1133464	1133469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208453
19067	NC_009053	ACC	2	6	1133480	1133485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126208453
19068	NC_009053	T	7	7	1133509	1133515	0 %	100 %	0 %	0 %	126208453
19069	NC_009053	T	7	7	1133583	1133589	0 %	100 %	0 %	0 %	126208453
19070	NC_009053	T	6	6	1133620	1133625	0 %	100 %	0 %	0 %	126208453
19071	NC_009053	CAA	2	6	1133632	1133637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126208453
19072	NC_009053	TTC	2	6	1133658	1133663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208453
19073	NC_009053	TAA	2	6	1133737	1133742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208454
19074	NC_009053	AGG	2	6	1133748	1133753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126208454
19075	NC_009053	ATA	2	6	1133868	1133873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208454
19076	NC_009053	ATA	2	6	1133887	1133892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208454
19077	NC_009053	T	6	6	1133905	1133910	0 %	100 %	0 %	0 %	126208454
19078	NC_009053	CTT	2	6	1133942	1133947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208454
19079	NC_009053	A	6	6	1133991	1133996	100 %	0 %	0 %	0 %	126208454
19080	NC_009053	CAA	2	6	1134038	1134043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126208454
19081	NC_009053	CAT	2	6	1134071	1134076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208454
19082	NC_009053	CTT	2	6	1134092	1134097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208454
19083	NC_009053	ATT	2	6	1134102	1134107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208454
19084	NC_009053	GTT	2	6	1134224	1134229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126208454
19085	NC_009053	ATT	2	6	1134304	1134309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208454
19086	NC_009053	AGCTA	2	10	1134327	1134336	40 %	20 %	20 %	20 %	126208454
19087	NC_009053	ATC	2	6	1134366	1134371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208454
19088	NC_009053	GAA	2	6	1134488	1134493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126208455
19089	NC_009053	TAC	2	6	1134562	1134567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208455
19090	NC_009053	CAAG	2	8	1134629	1134636	50 %	0 %	25 %	25 %	126208455
19091	NC_009053	TAA	2	6	1134677	1134682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208455
19092	NC_009053	AATT	2	8	1134715	1134722	50 %	50 %	0 %	0 %	126208455
19093	NC_009053	ATT	2	6	1134739	1134744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208455
19094	NC_009053	ATT	2	6	1134807	1134812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208455
19095	NC_009053	TTA	2	6	1134841	1134846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208455
19096	NC_009053	A	6	6	1134864	1134869	100 %	0 %	0 %	0 %	126208455
19097	NC_009053	ATT	2	6	1134871	1134876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208455
19098	NC_009053	A	6	6	1134890	1134895	100 %	0 %	0 %	0 %	126208455
19099	NC_009053	TAC	2	6	1134905	1134910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208455
19100	NC_009053	AAT	2	6	1134921	1134926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208455
19101	NC_009053	TTAC	2	8	1134941	1134948	25 %	50 %	0 %	25 %	126208455
19102	NC_009053	TCA	2	6	1134973	1134978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208455
19103	NC_009053	ATC	2	6	1135007	1135012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208455
19104	NC_009053	ATA	2	6	1135129	1135134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208455
19105	NC_009053	T	6	6	1135163	1135168	0 %	100 %	0 %	0 %	126208455
19106	NC_009053	AAC	2	6	1135212	1135217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126208455
19107	NC_009053	CAAA	2	8	1135248	1135255	75 %	0 %	0 %	25 %	126208455
19108	NC_009053	ATT	2	6	1135264	1135269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208455
19109	NC_009053	GGT	2	6	1135314	1135319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126208455
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19113	NC_009053	A	6	6	1135520	1135525	100 %	0 %	0 %	0 %	126208455
19114	NC_009053	ATT	2	6	1135608	1135613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208456
19115	NC_009053	ACC	2	6	1135657	1135662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126208456
19116	NC_009053	CAA	2	6	1135668	1135673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126208456
19117	NC_009053	GTT	2	6	1135677	1135682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126208456
19118	NC_009053	CA	3	6	1135712	1135717	50 %	0 %	0 %	50 %	126208456
19119	NC_009053	TAT	2	6	1136318	1136323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208457
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19121	NC_009053	TTA	2	6	1136422	1136427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208457
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19222	NC_009053	ATT	2	6	1142346	1142351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208462
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19224	NC_009053	ACGGTT	2	12	1142423	1142434	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126208462
19225	NC_009053	CA	4	8	1142435	1142442	50 %	0 %	0 %	50 %	126208462
19226	NC_009053	AACG	2	8	1142464	1142471	50 %	0 %	25 %	25 %	126208462
19227	NC_009053	GAA	2	6	1142527	1142532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126208462
19228	NC_009053	GCG	2	6	1142533	1142538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126208462
19229	NC_009053	ATC	2	6	1142542	1142547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208462
19230	NC_009053	GAAGCG	2	12	1142641	1142652	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126208462
19231	NC_009053	A	6	6	1142698	1142703	100 %	0 %	0 %	0 %	126208462
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19352	NC_009053	CCGA	2	8	1150744	1150751	25 %	0 %	25 %	50 %	126208469
19353	NC_009053	TACG	2	8	1150781	1150788	25 %	25 %	25 %	25 %	126208469
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19468	NC_009053	TGC	2	6	1158070	1158075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126208472
19469	NC_009053	ATA	2	6	1158104	1158109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208472
19470	NC_009053	CGG	2	6	1158186	1158191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126208472
19471	NC_009053	CCG	2	6	1158354	1158359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208472
19472	NC_009053	ATC	2	6	1158368	1158373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208472
19473	NC_009053	TTA	2	6	1158393	1158398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208472
19474	NC_009053	ATT	2	6	1158422	1158427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208472
19475	NC_009053	T	7	7	1158426	1158432	0 %	100 %	0 %	0 %	126208472
19476	NC_009053	CT	3	6	1158476	1158481	0 %	50 %	0 %	50 %	126208472
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19479	NC_009053	TA	3	6	1158551	1158556	50 %	50 %	0 %	0 %	126208472
19480	NC_009053	CTT	2	6	1158577	1158582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208472
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19483	NC_009053	TTC	2	6	1158744	1158749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208472
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19486	NC_009053	CGT	2	6	1158845	1158850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126208472
19487	NC_009053	TAA	2	6	1158852	1158857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208472
19488	NC_009053	TAC	2	6	1158961	1158966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208472
19489	NC_009053	GCC	2	6	1159068	1159073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208472
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19493	NC_009053	CTC	2	6	1159157	1159162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126208472
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19495	NC_009053	GTT	2	6	1159228	1159233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126208472
19496	NC_009053	CCGT	2	8	1159317	1159324	0 %	25 %	25 %	50 %	126208472
19497	NC_009053	T	6	6	1159324	1159329	0 %	100 %	0 %	0 %	126208472
19498	NC_009053	ATT	2	6	1159355	1159360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208472
19499	NC_009053	TTA	2	6	1159596	1159601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208472
19500	NC_009053	TAA	2	6	1159624	1159629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208472

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