MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome

Total Repeats: 37925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_009053	CGT	2	6	648775	648780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126208057
11003	NC_009053	AG	3	6	648839	648844	50 %	0 %	50 %	0 %	126208057
11004	NC_009053	CGA	2	6	648858	648863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126208057
11005	NC_009053	ACC	2	6	648894	648899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126208057
11006	NC_009053	CCG	2	6	648948	648953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208057
11007	NC_009053	TAA	2	6	649088	649093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208057
11008	NC_009053	GCC	2	6	649107	649112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208057
11009	NC_009053	CGGC	2	8	649152	649159	0 %	0 %	50 %	50 %	126208057
11010	NC_009053	TAA	2	6	649160	649165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208057
11011	NC_009053	TTG	2	6	649181	649186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126208057
11012	NC_009053	CAA	2	6	649515	649520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126208058
11013	NC_009053	ATC	2	6	649525	649530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208058
11014	NC_009053	ACC	2	6	649549	649554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126208058
11015	NC_009053	CAA	2	6	649593	649598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126208058
11016	NC_009053	AG	4	8	649619	649626	50 %	0 %	50 %	0 %	126208058
11017	NC_009053	TTTA	2	8	649654	649661	25 %	75 %	0 %	0 %	126208058
11018	NC_009053	TAAA	2	8	649681	649688	75 %	25 %	0 %	0 %	126208058
11019	NC_009053	AAG	2	6	649716	649721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126208058
11020	NC_009053	ACA	2	6	649796	649801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126208058
11021	NC_009053	GTT	2	6	649849	649854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126208058
11022	NC_009053	CAT	2	6	649929	649934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208058
11023	NC_009053	TAA	2	6	649979	649984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208058
11024	NC_009053	ATC	2	6	650071	650076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208058
11025	NC_009053	CGC	2	6	650196	650201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208058
11026	NC_009053	CTT	2	6	650244	650249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208058
11027	NC_009053	GTA	2	6	650250	650255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208058
11028	NC_009053	ACGA	2	8	650266	650273	50 %	0 %	25 %	25 %	126208058
11029	NC_009053	CTT	2	6	650280	650285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208058
11030	NC_009053	CGA	2	6	650347	650352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126208058
11031	NC_009053	AAG	2	6	650405	650410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126208058
11032	NC_009053	TTG	2	6	650518	650523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126208059
11033	NC_009053	CTT	2	6	650541	650546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208059
11034	NC_009053	TTA	2	6	650576	650581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208059
11035	NC_009053	CGAT	2	8	650615	650622	25 %	25 %	25 %	25 %	126208059
11036	NC_009053	ACT	2	6	650627	650632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208059
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11038	NC_009053	CTT	2	6	650718	650723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208059
11039	NC_009053	ACC	2	6	650725	650730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126208059
11040	NC_009053	AACG	2	8	650740	650747	50 %	0 %	25 %	25 %	126208059
11041	NC_009053	ACTTCA	2	12	650795	650806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208059
11042	NC_009053	CGC	2	6	650842	650847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208059
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11044	NC_009053	CGT	2	6	650880	650885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126208059
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11050	NC_009053	TCT	3	9	651239	651247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208059
11051	NC_009053	CCG	2	6	651276	651281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208059
11052	NC_009053	GAA	3	9	651341	651349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126208059
11053	NC_009053	TAC	2	6	651373	651378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208059
11054	NC_009053	TTC	2	6	651397	651402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208059
11055	NC_009053	ACG	2	6	651460	651465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126208059
11056	NC_009053	AAT	2	6	651562	651567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208059
11057	NC_009053	AAT	2	6	651727	651732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208059
11058	NC_009053	CACG	2	8	651738	651745	25 %	0 %	25 %	50 %	126208059
11059	NC_009053	TAA	2	6	651765	651770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208059
11060	NC_009053	GATAC	2	10	651877	651886	40 %	20 %	20 %	20 %	126208059
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11062	NC_009053	TTG	3	9	652018	652026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126208059
11063	NC_009053	TGA	2	6	652028	652033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208059
11064	NC_009053	TTC	2	6	652060	652065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208059
11065	NC_009053	AGAA	2	8	652066	652073	75 %	0 %	25 %	0 %	126208059
11066	NC_009053	CTA	2	6	652119	652124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208059
11067	NC_009053	T	6	6	652143	652148	0 %	100 %	0 %	0 %	126208059
11068	NC_009053	CGC	2	6	652201	652206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208059
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11071	NC_009053	GACG	2	8	652403	652410	25 %	0 %	50 %	25 %	126208059
11072	NC_009053	GAA	2	6	652423	652428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126208059
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11081	NC_009053	ATTG	2	8	653262	653269	25 %	50 %	25 %	0 %	126208060
11082	NC_009053	G	6	6	653285	653290	0 %	0 %	100 %	0 %	126208060
11083	NC_009053	TAT	2	6	653360	653365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208060
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11087	NC_009053	GGT	2	6	653592	653597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126208060
11088	NC_009053	TCAA	2	8	653680	653687	50 %	25 %	0 %	25 %	126208060
11089	NC_009053	TGCG	2	8	653690	653697	0 %	25 %	50 %	25 %	126208060
11090	NC_009053	A	6	6	653704	653709	100 %	0 %	0 %	0 %	126208060
11091	NC_009053	CGCAA	2	10	653778	653787	40 %	0 %	20 %	40 %	126208060
11092	NC_009053	A	6	6	653797	653802	100 %	0 %	0 %	0 %	126208060
11093	NC_009053	TGG	2	6	653810	653815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126208060
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11099	NC_009053	TAC	2	6	654033	654038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126208060
11100	NC_009053	TGA	2	6	654104	654109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208060
11101	NC_009053	TGA	2	6	654126	654131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208060
11102	NC_009053	AGA	2	6	654252	654257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126208060
11103	NC_009053	TGA	2	6	654300	654305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208060
11104	NC_009053	A	6	6	654352	654357	100 %	0 %	0 %	0 %	126208060
11105	NC_009053	TTG	2	6	654407	654412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126208060
11106	NC_009053	AAGCGA	2	12	654422	654433	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	126208060
11107	NC_009053	TGC	2	6	654857	654862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126208060
11108	NC_009053	CGC	2	6	654863	654868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126208060
11109	NC_009053	AATT	2	8	654869	654876	50 %	50 %	0 %	0 %	126208060
11110	NC_009053	AGT	2	6	654910	654915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126208060
11111	NC_009053	GGC	2	6	655002	655007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126208060
11112	NC_009053	AAG	2	6	655010	655015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126208060
11113	NC_009053	TTGC	2	8	655024	655031	0 %	50 %	25 %	25 %	126208060
11114	NC_009053	TTA	2	6	655036	655041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208060
11115	NC_009053	GTTT	2	8	655068	655075	0 %	75 %	25 %	0 %	126208060
11116	NC_009053	ATT	2	6	655200	655205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126208060
11117	NC_009053	TCT	2	6	655415	655420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208061
11118	NC_009053	GCCTT	2	10	655425	655434	0 %	40 %	20 %	40 %	126208061
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11483	NC_009053	ATAC	2	8	676415	676422	50 %	25 %	0 %	25 %	126208074
11484	NC_009053	TTC	2	6	676443	676448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208074
11485	NC_009053	ACC	2	6	676464	676469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126208074
11486	NC_009053	TTC	2	6	676509	676514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126208074
11487	NC_009053	ACG	2	6	676563	676568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126208074
11488	NC_009053	AAAATT	2	12	676603	676614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126208074
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11490	NC_009053	CTTT	2	8	677111	677118	0 %	75 %	0 %	25 %	126208075
11491	NC_009053	TACG	2	8	677136	677143	25 %	25 %	25 %	25 %	126208075
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11493	NC_009053	TGG	2	6	677222	677227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126208075
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