MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_008340	CTG	2	6	2132293	2132298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321021
48002	NC_008340	GCT	2	6	2132316	2132321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321021
48003	NC_008340	CCG	2	6	2132325	2132330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321021
48004	NC_008340	GGC	2	6	2132358	2132363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321021
48005	NC_008340	CTG	2	6	2132392	2132397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321021
48006	NC_008340	GAC	2	6	2132419	2132424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321021
48007	NC_008340	GAT	2	6	2132460	2132465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321021
48008	NC_008340	TGG	2	6	2132480	2132485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321021
48009	NC_008340	CGT	2	6	2132507	2132512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321021
48010	NC_008340	CGG	2	6	2132528	2132533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321021
48011	NC_008340	GCG	2	6	2132546	2132551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321021
48012	NC_008340	TGC	3	9	2132582	2132590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321021
48013	NC_008340	ACC	2	6	2132591	2132596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321021
48014	NC_008340	TCG	2	6	2132705	2132710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321021
48015	NC_008340	GC	3	6	2132721	2132726	0 %	0 %	50 %	50 %	114321021
48016	NC_008340	AGG	2	6	2132741	2132746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321021
48017	NC_008340	ATC	2	6	2132755	2132760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321021
48018	NC_008340	GC	3	6	2132766	2132771	0 %	0 %	50 %	50 %	114321021
48019	NC_008340	GGC	2	6	2132784	2132789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321021
48020	NC_008340	AGG	2	6	2132816	2132821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321021
48021	NC_008340	TGC	2	6	2132873	2132878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321021
48022	NC_008340	TGG	2	6	2132879	2132884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321021
48023	NC_008340	CG	3	6	2132952	2132957	0 %	0 %	50 %	50 %	114321021
48024	NC_008340	CTG	2	6	2133067	2133072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321021
48025	NC_008340	GCAG	2	8	2133219	2133226	25 %	0 %	50 %	25 %	114321021
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48027	NC_008340	CAT	2	6	2133312	2133317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321021
48028	NC_008340	CAG	2	6	2133384	2133389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321021
48029	NC_008340	TGGA	2	8	2133397	2133404	25 %	25 %	50 %	0 %	114321021
48030	NC_008340	CGG	2	6	2133418	2133423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321021
48031	NC_008340	CCT	2	6	2133441	2133446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321021
48032	NC_008340	GAG	2	6	2133451	2133456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321021
48033	NC_008340	GC	3	6	2133457	2133462	0 %	0 %	50 %	50 %	114321021
48034	NC_008340	CGG	2	6	2133463	2133468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321021
48035	NC_008340	TGC	2	6	2133470	2133475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321021
48036	NC_008340	ACA	2	6	2133500	2133505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321021
48037	NC_008340	GCT	2	6	2133516	2133521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321021
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48039	NC_008340	CCGC	2	8	2133675	2133682	0 %	0 %	25 %	75 %	114321022
48040	NC_008340	GCG	2	6	2133691	2133696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321022
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48042	NC_008340	CCAG	2	8	2133735	2133742	25 %	0 %	25 %	50 %	114321022
48043	NC_008340	GGT	2	6	2133765	2133770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321022
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48045	NC_008340	GCA	2	6	2133825	2133830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321022
48046	NC_008340	CGA	2	6	2133903	2133908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321022
48047	NC_008340	GCT	2	6	2133951	2133956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321022
48048	NC_008340	GCC	2	6	2134061	2134066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321022
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48050	NC_008340	CTG	2	6	2134120	2134125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321022
48051	NC_008340	GGC	2	6	2134144	2134149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321022
48052	NC_008340	GGC	2	6	2134207	2134212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321022
48053	NC_008340	GC	3	6	2134211	2134216	0 %	0 %	50 %	50 %	114321022
48054	NC_008340	CCA	2	6	2134239	2134244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321022
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48071	NC_008340	GGCG	2	8	2135073	2135080	0 %	0 %	75 %	25 %	114321022
48072	NC_008340	CGGG	2	8	2135180	2135187	0 %	0 %	75 %	25 %	114321023
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48098	NC_008340	GGTCCA	2	12	2136071	2136082	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321024
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48101	NC_008340	CGC	2	6	2136114	2136119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321024
48102	NC_008340	TCC	2	6	2136199	2136204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321024
48103	NC_008340	CG	3	6	2136296	2136301	0 %	0 %	50 %	50 %	114321024
48104	NC_008340	CAG	2	6	2136393	2136398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321024
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48111	NC_008340	CA	3	6	2136487	2136492	50 %	0 %	0 %	50 %	114321024
48112	NC_008340	GGT	2	6	2136546	2136551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321024
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48116	NC_008340	GCC	3	9	2136682	2136690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321024
48117	NC_008340	GCAGCG	2	12	2136709	2136720	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321024
48118	NC_008340	AACC	2	8	2136777	2136784	50 %	0 %	0 %	50 %	114321024
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48201	NC_008340	GTC	2	6	2140386	2140391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321027
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48207	NC_008340	TCG	2	6	2140620	2140625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321028
48208	NC_008340	TCACCG	2	12	2140684	2140695	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321028
48209	NC_008340	ATG	2	6	2140701	2140706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321028
48210	NC_008340	CCCG	2	8	2140715	2140722	0 %	0 %	25 %	75 %	114321028
48211	NC_008340	CCGG	2	8	2140741	2140748	0 %	0 %	50 %	50 %	114321028
48212	NC_008340	TTG	2	6	2140812	2140817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321028
48213	NC_008340	GCA	2	6	2140888	2140893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321028
48214	NC_008340	ATCGC	2	10	2140912	2140921	20 %	20 %	20 %	40 %	114321028
48215	NC_008340	CAG	2	6	2140955	2140960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321028
48216	NC_008340	GTACC	2	10	2141030	2141039	20 %	20 %	20 %	40 %	114321028
48217	NC_008340	CA	4	8	2141159	2141166	50 %	0 %	0 %	50 %	114321028
48218	NC_008340	TCA	2	6	2141250	2141255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321028
48219	NC_008340	AAC	2	6	2141478	2141483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321028
48220	NC_008340	CTT	2	6	2141558	2141563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321028
48221	NC_008340	TGG	2	6	2141569	2141574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321028
48222	NC_008340	TCCA	2	8	2141595	2141602	25 %	25 %	0 %	50 %	114321028
48223	NC_008340	CAC	2	6	2141646	2141651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321028
48224	NC_008340	GGC	2	6	2141653	2141658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321028
48225	NC_008340	GAA	2	6	2141672	2141677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321028
48226	NC_008340	AGC	2	6	2141690	2141695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321028
48227	NC_008340	GAT	2	6	2141696	2141701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321028
48228	NC_008340	CAG	2	6	2141702	2141707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321028
48229	NC_008340	GTA	2	6	2141825	2141830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321028
48230	NC_008340	CAG	2	6	2141837	2141842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321028
48231	NC_008340	C	6	6	2141879	2141884	0 %	0 %	0 %	100 %	114321028
48232	NC_008340	TC	3	6	2141887	2141892	0 %	50 %	0 %	50 %	114321028
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48340	NC_008340	C	6	6	2147038	2147043	0 %	0 %	0 %	100 %	114321035
48341	NC_008340	TGG	2	6	2147059	2147064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321035
48342	NC_008340	CCCA	2	8	2147074	2147081	25 %	0 %	0 %	75 %	114321035
48343	NC_008340	GC	4	8	2147175	2147182	0 %	0 %	50 %	50 %	114321035
48344	NC_008340	CGGTG	2	10	2147205	2147214	0 %	20 %	60 %	20 %	114321035
48345	NC_008340	CCCCCA	2	12	2147215	2147226	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	114321035
48346	NC_008340	CA	3	6	2147225	2147230	50 %	0 %	0 %	50 %	114321035
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48348	NC_008340	GAC	2	6	2147269	2147274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321035
48349	NC_008340	GAG	2	6	2147350	2147355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321035
48350	NC_008340	GCC	2	6	2147383	2147388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321035
48351	NC_008340	GCTG	2	8	2147399	2147406	0 %	25 %	50 %	25 %	114321035
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48451	NC_008340	CAT	2	6	2151407	2151412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321039
48452	NC_008340	TAA	2	6	2151501	2151506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114321040
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48454	NC_008340	GAT	2	6	2151533	2151538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321040
48455	NC_008340	TGG	2	6	2151541	2151546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321040
48456	NC_008340	TGG	3	9	2151565	2151573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321040
48457	NC_008340	CG	4	8	2151614	2151621	0 %	0 %	50 %	50 %	114321040
48458	NC_008340	GCC	2	6	2151670	2151675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321040
48459	NC_008340	CCA	2	6	2151739	2151744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321040
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48462	NC_008340	AGAT	2	8	2151825	2151832	50 %	25 %	25 %	0 %	114321040
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48464	NC_008340	AGT	2	6	2151889	2151894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321040
48465	NC_008340	CGT	3	9	2151910	2151918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321040
48466	NC_008340	TTA	2	6	2151963	2151968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114321040
48467	NC_008340	CGG	2	6	2152089	2152094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321040
48468	NC_008340	GCTG	2	8	2152144	2152151	0 %	25 %	50 %	25 %	114321040
48469	NC_008340	GTT	2	6	2152162	2152167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321040
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48472	NC_008340	CGA	2	6	2152198	2152203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321040
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48475	NC_008340	GAT	2	6	2152528	2152533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321041
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48484	NC_008340	GCA	2	6	2152858	2152863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321041
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48492	NC_008340	GCA	2	6	2153214	2153219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321041
48493	NC_008340	CGA	3	9	2153317	2153325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321041
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