MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_008340	TCT	2	6	2040399	2040404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114320936
46002	NC_008340	ATT	2	6	2040447	2040452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114320937
46003	NC_008340	ACC	2	6	2040482	2040487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320937
46004	NC_008340	TCT	2	6	2040491	2040496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114320937
46005	NC_008340	GCG	2	6	2040535	2040540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320937
46006	NC_008340	GGC	2	6	2040584	2040589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320937
46007	NC_008340	CAA	2	6	2040619	2040624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114320937
46008	NC_008340	GCTT	2	8	2040680	2040687	0 %	50 %	25 %	25 %	114320937
46009	NC_008340	ATCC	2	8	2040747	2040754	25 %	25 %	0 %	50 %	114320938
46010	NC_008340	TGA	2	6	2040863	2040868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320938
46011	NC_008340	TTGG	2	8	2040872	2040879	0 %	50 %	50 %	0 %	114320938
46012	NC_008340	CGG	2	6	2040887	2040892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320938
46013	NC_008340	TCAA	2	8	2040898	2040905	50 %	25 %	0 %	25 %	114320938
46014	NC_008340	TGC	2	6	2040917	2040922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320938
46015	NC_008340	GC	3	6	2040921	2040926	0 %	0 %	50 %	50 %	114320938
46016	NC_008340	CAG	2	6	2041040	2041045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320939
46017	NC_008340	CTTGC	2	10	2041133	2041142	0 %	40 %	20 %	40 %	114320939
46018	NC_008340	GCCA	2	8	2041229	2041236	25 %	0 %	25 %	50 %	114320939
46019	NC_008340	CCG	3	9	2041308	2041316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320940
46020	NC_008340	GCT	2	6	2041371	2041376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320940
46021	NC_008340	TCA	2	6	2041396	2041401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320940
46022	NC_008340	GTT	2	6	2041421	2041426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114320940
46023	NC_008340	GTT	2	6	2041490	2041495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114320940
46024	NC_008340	T	6	6	2041516	2041521	0 %	100 %	0 %	0 %	114320940
46025	NC_008340	TGATC	2	10	2041543	2041552	20 %	40 %	20 %	20 %	114320940
46026	NC_008340	CGTT	2	8	2041593	2041600	0 %	50 %	25 %	25 %	114320940
46027	NC_008340	TGA	2	6	2041616	2041621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320940
46028	NC_008340	TCC	2	6	2041635	2041640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320940
46029	NC_008340	TTG	2	6	2041724	2041729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114320940
46030	NC_008340	TCG	3	9	2041755	2041763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320940
46031	NC_008340	AGG	2	6	2041787	2041792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320940
46032	NC_008340	AAGT	2	8	2041805	2041812	50 %	25 %	25 %	0 %	114320940
46033	NC_008340	CTT	2	6	2041918	2041923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114320940
46034	NC_008340	TCC	2	6	2041932	2041937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320940
46035	NC_008340	GC	3	6	2041949	2041954	0 %	0 %	50 %	50 %	114320940
46036	NC_008340	ACC	2	6	2041956	2041961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320940
46037	NC_008340	CATT	2	8	2041975	2041982	25 %	50 %	0 %	25 %	114320940
46038	NC_008340	GGT	2	6	2041987	2041992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320940
46039	NC_008340	CAT	2	6	2042047	2042052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320940
46040	NC_008340	GTA	2	6	2042141	2042146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320940
46041	NC_008340	GATA	2	8	2042161	2042168	50 %	25 %	25 %	0 %	114320940
46042	NC_008340	TACA	2	8	2042279	2042286	50 %	25 %	0 %	25 %	114320940
46043	NC_008340	GCA	2	6	2042293	2042298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320940
46044	NC_008340	CAG	2	6	2042336	2042341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320940
46045	NC_008340	TCAT	2	8	2042397	2042404	25 %	50 %	0 %	25 %	114320940
46046	NC_008340	GTC	2	6	2042432	2042437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320940
46047	NC_008340	AGCG	2	8	2042469	2042476	25 %	0 %	50 %	25 %	114320940
46048	NC_008340	GCC	2	6	2042480	2042485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320940
46049	NC_008340	CAGC	2	8	2042536	2042543	25 %	0 %	25 %	50 %	114320940
46050	NC_008340	CGCC	2	8	2042574	2042581	0 %	0 %	25 %	75 %	114320940
46051	NC_008340	TCA	2	6	2042590	2042595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320940
46052	NC_008340	CGA	2	6	2042614	2042619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320940
46053	NC_008340	ACC	2	6	2042628	2042633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320940
46054	NC_008340	GGC	2	6	2042681	2042686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320940
46055	NC_008340	GAA	2	6	2042735	2042740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114320940
46056	NC_008340	GGT	2	6	2042750	2042755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320940
46057	NC_008340	GCA	2	6	2042764	2042769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320940
46058	NC_008340	ATG	2	6	2042775	2042780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320940
46059	NC_008340	CTT	2	6	2042785	2042790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114320940
46060	NC_008340	GAA	2	6	2042938	2042943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114320940
46061	NC_008340	GGC	2	6	2042996	2043001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320940
46062	NC_008340	GCC	2	6	2043006	2043011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320940
46063	NC_008340	CGC	2	6	2043058	2043063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320940
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46067	NC_008340	GCC	2	6	2043209	2043214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320940
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46069	NC_008340	TCT	2	6	2043253	2043258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114320940
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46085	NC_008340	GCA	2	6	2044135	2044140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320940
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46091	NC_008340	GCCA	2	8	2044385	2044392	25 %	0 %	25 %	50 %	114320940
46092	NC_008340	ATGG	2	8	2044473	2044480	25 %	25 %	50 %	0 %	114320941
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46098	NC_008340	GGA	2	6	2044893	2044898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320941
46099	NC_008340	TTTC	2	8	2044906	2044913	0 %	75 %	0 %	25 %	114320941
46100	NC_008340	CAT	2	6	2044936	2044941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320941
46101	NC_008340	TTC	2	6	2045062	2045067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114320942
46102	NC_008340	AGCGA	2	10	2045101	2045110	40 %	0 %	40 %	20 %	114320942
46103	NC_008340	TC	3	6	2045112	2045117	0 %	50 %	0 %	50 %	114320942
46104	NC_008340	AGA	2	6	2045267	2045272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114320942
46105	NC_008340	AAATA	2	10	2045273	2045282	80 %	20 %	0 %	0 %	114320942
46106	NC_008340	CTGCA	2	10	2045328	2045337	20 %	20 %	20 %	40 %	114320942
46107	NC_008340	AC	3	6	2045341	2045346	50 %	0 %	0 %	50 %	114320942
46108	NC_008340	GTC	2	6	2045469	2045474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320942
46109	NC_008340	TA	3	6	2045488	2045493	50 %	50 %	0 %	0 %	114320942
46110	NC_008340	CCAG	2	8	2045610	2045617	25 %	0 %	25 %	50 %	114320942
46111	NC_008340	GC	3	6	2045717	2045722	0 %	0 %	50 %	50 %	114320942
46112	NC_008340	GCGG	2	8	2045746	2045753	0 %	0 %	75 %	25 %	114320942
46113	NC_008340	TCT	2	6	2045754	2045759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114320942
46114	NC_008340	GCG	2	6	2045779	2045784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320942
46115	NC_008340	CCGA	2	8	2045858	2045865	25 %	0 %	25 %	50 %	114320942
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46117	NC_008340	CTT	2	6	2045931	2045936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114320942
46118	NC_008340	AAC	2	6	2045950	2045955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114320942
46119	NC_008340	CGC	2	6	2046048	2046053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320942
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46122	NC_008340	TCA	2	6	2046194	2046199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320942
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46234	NC_008340	CCG	2	6	2053577	2053582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320949
46235	NC_008340	CTC	2	6	2053611	2053616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320949
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46337	NC_008340	CAT	2	6	2058657	2058662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320951
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46341	NC_008340	AGG	2	6	2058731	2058736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320951
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46348	NC_008340	CGG	2	6	2059103	2059108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320951
46349	NC_008340	AAG	2	6	2059114	2059119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114320951
46350	NC_008340	GGA	2	6	2059143	2059148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320951
46351	NC_008340	GCCA	2	8	2059171	2059178	25 %	0 %	25 %	50 %	114320951
46352	NC_008340	GCT	2	6	2059206	2059211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320951
46353	NC_008340	GAG	2	6	2059216	2059221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320951
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46355	NC_008340	GCG	2	6	2059298	2059303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320951
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46357	NC_008340	GAT	2	6	2059470	2059475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320951
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46360	NC_008340	GCA	2	6	2059604	2059609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320951
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46367	NC_008340	CTG	3	9	2059972	2059980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320952
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46371	NC_008340	CGA	2	6	2060052	2060057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320952
46372	NC_008340	GC	3	6	2060084	2060089	0 %	0 %	50 %	50 %	114320952
46373	NC_008340	CTG	2	6	2060206	2060211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320952
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46378	NC_008340	CTG	2	6	2060422	2060427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320952
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46380	NC_008340	TGG	2	6	2060765	2060770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320953
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46455	NC_008340	GAT	2	6	2063923	2063928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320955
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46460	NC_008340	GGCC	2	8	2064186	2064193	0 %	0 %	50 %	50 %	114320955
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46462	NC_008340	TTG	2	6	2064236	2064241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114320955
46463	NC_008340	GGTCAT	2	12	2064253	2064264	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114320955
46464	NC_008340	GCCTCG	2	12	2064532	2064543	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114320956
46465	NC_008340	GCT	2	6	2064587	2064592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320956
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46481	NC_008340	TCG	2	6	2065213	2065218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320956
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