MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_008340	C	6	6	1781765	1781770	0 %	0 %	0 %	100 %	114320712
40002	NC_008340	CCT	2	6	1781790	1781795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320712
40003	NC_008340	GCT	2	6	1781805	1781810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320712
40004	NC_008340	TTC	2	6	1782039	1782044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114320712
40005	NC_008340	TTC	2	6	1782211	1782216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114320713
40006	NC_008340	ACC	3	9	1782295	1782303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320713
40007	NC_008340	CCT	2	6	1782383	1782388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320713
40008	NC_008340	ACCG	2	8	1782451	1782458	25 %	0 %	25 %	50 %	114320713
40009	NC_008340	GTG	2	6	1782465	1782470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320713
40010	NC_008340	ACC	2	6	1782493	1782498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320713
40011	NC_008340	TCC	2	6	1782526	1782531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320713
40012	NC_008340	TCG	2	6	1782671	1782676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320714
40013	NC_008340	GAA	2	6	1782721	1782726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114320714
40014	NC_008340	CCA	2	6	1782798	1782803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320714
40015	NC_008340	TGG	2	6	1782834	1782839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320714
40016	NC_008340	CGT	2	6	1782855	1782860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320714
40017	NC_008340	ACGA	2	8	1782884	1782891	50 %	0 %	25 %	25 %	114320714
40018	NC_008340	GATC	2	8	1782894	1782901	25 %	25 %	25 %	25 %	114320714
40019	NC_008340	GC	3	6	1783030	1783035	0 %	0 %	50 %	50 %	114320714
40020	NC_008340	CAGCTC	2	12	1783051	1783062	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114320714
40021	NC_008340	TCC	2	6	1783109	1783114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320714
40022	NC_008340	GGA	2	6	1783128	1783133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320714
40023	NC_008340	CAC	2	6	1783165	1783170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320714
40024	NC_008340	CTG	3	9	1783180	1783188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320714
40025	NC_008340	GAT	2	6	1783240	1783245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320714
40026	NC_008340	CCT	2	6	1783254	1783259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320714
40027	NC_008340	GCA	2	6	1783317	1783322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320714
40028	NC_008340	CGC	2	6	1783389	1783394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320714
40029	NC_008340	GAT	2	6	1783471	1783476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320714
40030	NC_008340	CGA	2	6	1783523	1783528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320714
40031	NC_008340	GCCATC	2	12	1783543	1783554	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114320714
40032	NC_008340	CCT	2	6	1783632	1783637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320714
40033	NC_008340	CAG	2	6	1783651	1783656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320714
40034	NC_008340	TCA	2	6	1783703	1783708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320714
40035	NC_008340	GC	3	6	1783717	1783722	0 %	0 %	50 %	50 %	114320714
40036	NC_008340	GCG	2	6	1783745	1783750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320714
40037	NC_008340	GCA	2	6	1783773	1783778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320714
40038	NC_008340	CGG	2	6	1783868	1783873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320714
40039	NC_008340	CAG	2	6	1783879	1783884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320714
40040	NC_008340	CCA	2	6	1783902	1783907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320714
40041	NC_008340	GCT	2	6	1783953	1783958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320714
40042	NC_008340	CGT	2	6	1783992	1783997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320714
40043	NC_008340	CAT	2	6	1784028	1784033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320714
40044	NC_008340	AGA	2	6	1784067	1784072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114320714
40045	NC_008340	GTC	2	6	1784167	1784172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320714
40046	NC_008340	ACC	2	6	1784201	1784206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320714
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40049	NC_008340	CCCG	2	8	1784495	1784502	0 %	0 %	25 %	75 %	114320714
40050	NC_008340	GGC	2	6	1784534	1784539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320714
40051	NC_008340	TGA	2	6	1784652	1784657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320714
40052	NC_008340	CG	3	6	1784687	1784692	0 %	0 %	50 %	50 %	114320714
40053	NC_008340	GCC	2	6	1784768	1784773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320714
40054	NC_008340	CGG	2	6	1784793	1784798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320714
40055	NC_008340	CGC	3	9	1784859	1784867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320714
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40063	NC_008340	CCGC	2	8	1785098	1785105	0 %	0 %	25 %	75 %	114320714
40064	NC_008340	GGTG	2	8	1785159	1785166	0 %	25 %	75 %	0 %	114320714
40065	NC_008340	CCT	2	6	1785168	1785173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320714
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40068	NC_008340	CCCG	2	8	1785291	1785298	0 %	0 %	25 %	75 %	114320714
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40092	NC_008340	GGCCT	2	10	1786620	1786629	0 %	20 %	40 %	40 %	114320715
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40113	NC_008340	GC	3	6	1787506	1787511	0 %	0 %	50 %	50 %	114320716
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40115	NC_008340	GAC	2	6	1787549	1787554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320716
40116	NC_008340	GCC	2	6	1787570	1787575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320716
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40203	NC_008340	CTG	2	6	1791466	1791471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320719
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40462	NC_008340	TGG	2	6	1801926	1801931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320728
40463	NC_008340	GGC	2	6	1801934	1801939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320728
40464	NC_008340	CCA	2	6	1801954	1801959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320728
40465	NC_008340	AGGCGA	2	12	1801972	1801983	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	114320728
40466	NC_008340	GC	4	8	1802002	1802009	0 %	0 %	50 %	50 %	114320728
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40468	NC_008340	ATC	2	6	1802037	1802042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320728
40469	NC_008340	GGCT	2	8	1802049	1802056	0 %	25 %	50 %	25 %	114320728
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40472	NC_008340	GCGG	2	8	1802133	1802140	0 %	0 %	75 %	25 %	114320728
40473	NC_008340	CAC	2	6	1802144	1802149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320728
40474	NC_008340	CAG	2	6	1802177	1802182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320728
40475	NC_008340	GCG	2	6	1802205	1802210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320728
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40477	NC_008340	GCC	2	6	1802277	1802282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320728
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40481	NC_008340	GACC	2	8	1802368	1802375	25 %	0 %	25 %	50 %	114320728
40482	NC_008340	TGC	2	6	1802383	1802388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320728
40483	NC_008340	GCC	2	6	1802437	1802442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320728
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40485	NC_008340	TCC	3	9	1802526	1802534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320728
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40487	NC_008340	C	6	6	1802635	1802640	0 %	0 %	0 %	100 %	114320728
40488	NC_008340	GCG	2	6	1802688	1802693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320728
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40490	NC_008340	GCA	2	6	1802743	1802748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320728
40491	NC_008340	CAC	2	6	1802798	1802803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320728
40492	NC_008340	GAT	2	6	1802828	1802833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320728
40493	NC_008340	CCA	2	6	1802890	1802895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320728
40494	NC_008340	GCC	2	6	1802986	1802991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320728
40495	NC_008340	CCG	2	6	1803013	1803018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320728
40496	NC_008340	GCG	2	6	1803030	1803035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320728
40497	NC_008340	CCA	2	6	1803037	1803042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320728
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40500	NC_008340	GTC	2	6	1803155	1803160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320728

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