MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_008340	CAG	2	6	1062739	1062744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320099
24002	NC_008340	CGC	3	9	1062779	1062787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320099
24003	NC_008340	TGC	2	6	1062801	1062806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320099
24004	NC_008340	CCA	2	6	1062954	1062959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320099
24005	NC_008340	GCCG	2	8	1063029	1063036	0 %	0 %	50 %	50 %	114320099
24006	NC_008340	TCG	2	6	1063049	1063054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320099
24007	NC_008340	CCA	2	6	1063071	1063076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320099
24008	NC_008340	ATC	2	6	1063121	1063126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320099
24009	NC_008340	CCA	3	9	1063131	1063139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320099
24010	NC_008340	GCG	2	6	1063142	1063147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320099
24011	NC_008340	GGCC	2	8	1063167	1063174	0 %	0 %	50 %	50 %	114320099
24012	NC_008340	GCC	2	6	1063180	1063185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320099
24013	NC_008340	CAC	3	9	1063198	1063206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320099
24014	NC_008340	GAG	2	6	1063208	1063213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320099
24015	NC_008340	GGT	2	6	1063227	1063232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320099
24016	NC_008340	GTG	2	6	1063283	1063288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320099
24017	NC_008340	CCT	2	6	1063302	1063307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320099
24018	NC_008340	GCC	2	6	1063331	1063336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320099
24019	NC_008340	TCC	2	6	1063364	1063369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320099
24020	NC_008340	TCA	2	6	1063374	1063379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320099
24021	NC_008340	GGC	2	6	1063387	1063392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320099
24022	NC_008340	C	6	6	1063406	1063411	0 %	0 %	0 %	100 %	114320099
24023	NC_008340	CCA	2	6	1063413	1063418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320099
24024	NC_008340	GCA	3	9	1063419	1063427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320099
24025	NC_008340	GGC	2	6	1063447	1063452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320099
24026	NC_008340	GGT	2	6	1063479	1063484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320099
24027	NC_008340	GCC	2	6	1063514	1063519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320099
24028	NC_008340	CGA	2	6	1063569	1063574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320099
24029	NC_008340	CACCG	2	10	1063594	1063603	20 %	0 %	20 %	60 %	114320099
24030	NC_008340	GAT	2	6	1063606	1063611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320099
24031	NC_008340	CGC	2	6	1063661	1063666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320099
24032	NC_008340	GTC	2	6	1063678	1063683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320099
24033	NC_008340	CTC	2	6	1063731	1063736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320100
24034	NC_008340	GGC	2	6	1063742	1063747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320100
24035	NC_008340	TCC	2	6	1063816	1063821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320100
24036	NC_008340	CCT	2	6	1063850	1063855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320100
24037	NC_008340	GGT	2	6	1063889	1063894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320100
24038	NC_008340	ACCC	2	8	1063959	1063966	25 %	0 %	0 %	75 %	114320100
24039	NC_008340	GCT	2	6	1064043	1064048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320100
24040	NC_008340	CTC	2	6	1064058	1064063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320100
24041	NC_008340	GCG	2	6	1064088	1064093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320100
24042	NC_008340	TTGC	2	8	1064154	1064161	0 %	50 %	25 %	25 %	114320100
24043	NC_008340	CTG	2	6	1064222	1064227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320101
24044	NC_008340	CGC	2	6	1064252	1064257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320101
24045	NC_008340	CTC	2	6	1064261	1064266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320101
24046	NC_008340	TGG	2	6	1064283	1064288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320101
24047	NC_008340	TC	3	6	1064326	1064331	0 %	50 %	0 %	50 %	114320101
24048	NC_008340	CTC	2	6	1064363	1064368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320101
24049	NC_008340	GCC	3	9	1064370	1064378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320101
24050	NC_008340	TCA	2	6	1064422	1064427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320101
24051	NC_008340	TGC	2	6	1064463	1064468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320101
24052	NC_008340	GTC	2	6	1064513	1064518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320101
24053	NC_008340	GC	3	6	1065085	1065090	0 %	0 %	50 %	50 %	114320102
24054	NC_008340	AGC	2	6	1065116	1065121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320102
24055	NC_008340	CCA	2	6	1065156	1065161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320102
24056	NC_008340	TCG	2	6	1065167	1065172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320102
24057	NC_008340	TGA	2	6	1065174	1065179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320102
24058	NC_008340	CGG	2	6	1065243	1065248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320102
24059	NC_008340	GCT	2	6	1065264	1065269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320102
24060	NC_008340	ACC	2	6	1065287	1065292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320102
24061	NC_008340	ATC	2	6	1065323	1065328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320102
24062	NC_008340	GCCTT	2	10	1065404	1065413	0 %	40 %	20 %	40 %	114320102
24063	NC_008340	GAT	2	6	1065562	1065567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320102
24064	NC_008340	CGC	3	9	1065618	1065626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320102
24065	NC_008340	TGC	2	6	1065659	1065664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320102
24066	NC_008340	TCC	2	6	1065665	1065670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320102
24067	NC_008340	GCT	2	6	1065684	1065689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320102
24068	NC_008340	CTG	2	6	1065700	1065705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320102
24069	NC_008340	GGC	2	6	1065738	1065743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320102
24070	NC_008340	CGC	2	6	1065804	1065809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320102
24071	NC_008340	GTC	2	6	1065835	1065840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320102
24072	NC_008340	GAT	2	6	1066069	1066074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320102
24073	NC_008340	GAT	2	6	1066171	1066176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320102
24074	NC_008340	CCCG	2	8	1066200	1066207	0 %	0 %	25 %	75 %	114320102
24075	NC_008340	GCCGAT	2	12	1066219	1066230	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114320102
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24081	NC_008340	ACC	2	6	1066511	1066516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320102
24082	NC_008340	CAGGGC	2	12	1066534	1066545	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114320102
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24084	NC_008340	GCA	3	9	1066599	1066607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320102
24085	NC_008340	CGC	2	6	1066641	1066646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320102
24086	NC_008340	CGA	2	6	1066671	1066676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320102
24087	NC_008340	TTG	2	6	1066807	1066812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114320102
24088	NC_008340	CGA	2	6	1066824	1066829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320102
24089	NC_008340	GGT	2	6	1066831	1066836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320102
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24091	NC_008340	CATGGG	2	12	1067074	1067085	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114320103
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24096	NC_008340	TGG	2	6	1067259	1067264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320103
24097	NC_008340	AGC	2	6	1067283	1067288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320103
24098	NC_008340	TGC	2	6	1067307	1067312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320103
24099	NC_008340	GCTC	2	8	1067409	1067416	0 %	25 %	25 %	50 %	114320103
24100	NC_008340	GCT	2	6	1067437	1067442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320103
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24102	NC_008340	GAG	2	6	1067456	1067461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320103
24103	NC_008340	GCA	2	6	1067469	1067474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320103
24104	NC_008340	CCA	2	6	1067488	1067493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320103
24105	NC_008340	CGA	2	6	1067497	1067502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320103
24106	NC_008340	CTT	2	6	1067515	1067520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114320103
24107	NC_008340	GGC	2	6	1067537	1067542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320103
24108	NC_008340	GGC	2	6	1067548	1067553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320103
24109	NC_008340	GCC	2	6	1067557	1067562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320103
24110	NC_008340	CAA	2	6	1067575	1067580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114320103
24111	NC_008340	GCC	2	6	1067583	1067588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320103
24112	NC_008340	GTG	2	6	1067591	1067596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320103
24113	NC_008340	CAT	2	6	1067662	1067667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320103
24114	NC_008340	GAT	2	6	1067710	1067715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320103
24115	NC_008340	TGC	2	6	1067724	1067729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320103
24116	NC_008340	TCA	2	6	1067829	1067834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320103
24117	NC_008340	TGG	2	6	1067838	1067843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320103
24118	NC_008340	CGG	3	9	1067907	1067915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320103
24119	NC_008340	CGG	2	6	1068068	1068073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320104
24120	NC_008340	GC	3	6	1068108	1068113	0 %	0 %	50 %	50 %	114320104
24121	NC_008340	GGC	2	6	1068114	1068119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320104
24122	NC_008340	GCT	3	9	1068143	1068151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320104
24123	NC_008340	GCA	2	6	1068158	1068163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320104
24124	NC_008340	GGT	2	6	1068171	1068176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320104
24125	NC_008340	GCC	2	6	1068187	1068192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320104
24126	NC_008340	CG	3	6	1068221	1068226	0 %	0 %	50 %	50 %	114320104
24127	NC_008340	CCT	2	6	1068290	1068295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114320104
24128	NC_008340	GCG	2	6	1068343	1068348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320104
24129	NC_008340	GGT	2	6	1068381	1068386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320104
24130	NC_008340	GCC	2	6	1068390	1068395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320104
24131	NC_008340	C	6	6	1068433	1068438	0 %	0 %	0 %	100 %	114320104
24132	NC_008340	GCC	2	6	1068488	1068493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320104
24133	NC_008340	GCC	2	6	1068529	1068534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320104
24134	NC_008340	GGCG	2	8	1068554	1068561	0 %	0 %	75 %	25 %	114320104
24135	NC_008340	CTG	2	6	1068708	1068713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320104
24136	NC_008340	GCT	2	6	1068716	1068721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320104
24137	NC_008340	GAGCTG	2	12	1068906	1068917	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114320104
24138	NC_008340	GCG	2	6	1068979	1068984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320104
24139	NC_008340	GC	3	6	1068996	1069001	0 %	0 %	50 %	50 %	114320104
24140	NC_008340	CAC	2	6	1069044	1069049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320104
24141	NC_008340	GCG	2	6	1069108	1069113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320104
24142	NC_008340	TCG	2	6	1069171	1069176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320104
24143	NC_008340	GCA	2	6	1069235	1069240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320104
24144	NC_008340	GC	5	10	1069248	1069257	0 %	0 %	50 %	50 %	114320104
24145	NC_008340	CGG	2	6	1069271	1069276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320104
24146	NC_008340	GC	3	6	1069281	1069286	0 %	0 %	50 %	50 %	114320104
24147	NC_008340	GGC	2	6	1069344	1069349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320104
24148	NC_008340	ACG	2	6	1069357	1069362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320104
24149	NC_008340	CAG	2	6	1069365	1069370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320104
24150	NC_008340	CAG	2	6	1069380	1069385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320104
24151	NC_008340	TTC	2	6	1069387	1069392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114320104
24152	NC_008340	TGC	2	6	1069422	1069427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320104
24153	NC_008340	TGGA	2	8	1069567	1069574	25 %	25 %	50 %	0 %	114320105
24154	NC_008340	TCG	2	6	1069618	1069623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320105
24155	NC_008340	CGA	2	6	1069658	1069663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320105
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24179	NC_008340	GTC	2	6	1071029	1071034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320106
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24183	NC_008340	GGGT	2	8	1071198	1071205	0 %	25 %	75 %	0 %	114320106
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24200	NC_008340	ATG	2	6	1072114	1072119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320108
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24202	NC_008340	CTG	2	6	1072192	1072197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320108
24203	NC_008340	TGC	2	6	1072262	1072267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320108
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24212	NC_008340	GCGT	2	8	1072613	1072620	0 %	25 %	50 %	25 %	114320108
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24217	NC_008340	GGT	2	6	1072746	1072751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320108
24218	NC_008340	GGA	2	6	1072788	1072793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320108
24219	NC_008340	TCA	2	6	1072814	1072819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114320108
24220	NC_008340	CCG	2	6	1072823	1072828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320108
24221	NC_008340	GCG	2	6	1072833	1072838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320108
24222	NC_008340	GC	3	6	1072842	1072847	0 %	0 %	50 %	50 %	114320108
24223	NC_008340	GCC	2	6	1072915	1072920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320108
24224	NC_008340	GC	3	6	1072930	1072935	0 %	0 %	50 %	50 %	114320108
24225	NC_008340	TGG	2	6	1072949	1072954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320108
24226	NC_008340	CCG	2	6	1072964	1072969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320108
24227	NC_008340	CCGCGA	2	12	1072989	1073000	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114320108
24228	NC_008340	CGA	2	6	1073058	1073063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320108
24229	NC_008340	AGG	2	6	1073078	1073083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320108
24230	NC_008340	AGC	2	6	1073126	1073131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320108
24231	NC_008340	CGCCGA	2	12	1073166	1073177	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114320108
24232	NC_008340	CTG	2	6	1073203	1073208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114320108
24233	NC_008340	GC	3	6	1073244	1073249	0 %	0 %	50 %	50 %	114320108
24234	NC_008340	GCC	2	6	1073271	1073276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320108
24235	NC_008340	ACGAGC	2	12	1073321	1073332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114320108
24236	NC_008340	CGC	2	6	1073355	1073360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114320108
24237	NC_008340	ACC	2	6	1073437	1073442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114320108
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24241	NC_008340	GGA	2	6	1073559	1073564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114320108
24242	NC_008340	GCG	2	6	1079659	1079664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114320109
24243	NC_008340	CG	3	6	1079663	1079668	0 %	0 %	50 %	50 %	114320109
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24345	NC_008340	TTG	2	6	1085798	1085803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114320115
24346	NC_008340	GTCC	2	8	1085809	1085816	0 %	25 %	25 %	50 %	114320115
24347	NC_008340	TGG	2	6	1085819	1085824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320115
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24350	NC_008340	TGA	2	6	1086139	1086144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114320115
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24353	NC_008340	TGG	2	6	1086285	1086290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114320115
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